MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015433	TATG	2	8	646246	646253	25 %	50 %	25 %	0 %	330832465
13002	NC_015433	GGC	2	6	646402	646407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330832465
13003	NC_015433	AGA	2	6	646441	646446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832465
13004	NC_015433	GCT	2	6	646502	646507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832465
13005	NC_015433	GAA	2	6	646546	646551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832465
13006	NC_015433	AAATA	2	10	646559	646568	80 %	20 %	0 %	0 %	330832465
13007	NC_015433	TAA	2	6	646634	646639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_015433	ATT	2	6	646687	646692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_015433	AAAG	2	8	646704	646711	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_015433	GAA	2	6	646724	646729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832466
13011	NC_015433	CAA	2	6	646801	646806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832466
13012	NC_015433	AATTA	2	10	646860	646869	60 %	40 %	0 %	0 %	330832466
13013	NC_015433	GAA	3	9	646897	646905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832466
13014	NC_015433	ATT	2	6	646928	646933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832466
13015	NC_015433	T	7	7	646951	646957	0 %	100 %	0 %	0 %	330832466
13016	NC_015433	TGC	2	6	647061	647066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832466
13017	NC_015433	ATT	2	6	647087	647092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832466
13018	NC_015433	TCC	2	6	647126	647131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832466
13019	NC_015433	ATCG	2	8	647150	647157	25 %	25 %	25 %	25 %	330832466
13020	NC_015433	GGT	2	6	647243	647248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832466
13021	NC_015433	AAG	2	6	647297	647302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832466
13022	NC_015433	ATG	2	6	647376	647381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832466
13023	NC_015433	TTG	2	6	647385	647390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832466
13024	NC_015433	AC	3	6	647466	647471	50 %	0 %	0 %	50 %	330832466
13025	NC_015433	GAC	2	6	647493	647498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832466
13026	NC_015433	AGA	2	6	647506	647511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832466
13027	NC_015433	ATG	2	6	647529	647534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832466
13028	NC_015433	ATT	2	6	647630	647635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832466
13029	NC_015433	AG	3	6	647642	647647	50 %	0 %	50 %	0 %	330832466
13030	NC_015433	A	7	7	647698	647704	100 %	0 %	0 %	0 %	330832466
13031	NC_015433	A	6	6	647709	647714	100 %	0 %	0 %	0 %	330832466
13032	NC_015433	ATAAA	2	10	647741	647750	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_015433	ATC	2	6	647751	647756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_015433	CAA	2	6	647883	647888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832467
13035	NC_015433	CAA	2	6	647913	647918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832467
13036	NC_015433	TAC	2	6	647938	647943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832467
13037	NC_015433	AGTG	2	8	648039	648046	25 %	25 %	50 %	0 %	330832467
13038	NC_015433	TTTC	2	8	648072	648079	0 %	75 %	0 %	25 %	330832467
13039	NC_015433	CCA	2	6	648153	648158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832467
13040	NC_015433	ATT	2	6	648159	648164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832467
13041	NC_015433	CAT	2	6	648170	648175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832467
13042	NC_015433	TCAA	2	8	648178	648185	50 %	25 %	0 %	25 %	330832467
13043	NC_015433	A	6	6	648204	648209	100 %	0 %	0 %	0 %	330832467
13044	NC_015433	TCG	2	6	648259	648264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832467
13045	NC_015433	CTT	2	6	648278	648283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832467
13046	NC_015433	AGG	2	6	648290	648295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832467
13047	NC_015433	CTT	2	6	648356	648361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832467
13048	NC_015433	TGGGC	2	10	648400	648409	0 %	20 %	60 %	20 %	330832467
13049	NC_015433	TTGA	2	8	648453	648460	25 %	50 %	25 %	0 %	330832467
13050	NC_015433	AGC	2	6	648554	648559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832467
13051	NC_015433	CTT	2	6	648593	648598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832467
13052	NC_015433	CCTC	2	8	648607	648614	0 %	25 %	0 %	75 %	330832467
13053	NC_015433	ACT	2	6	648676	648681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832467
13054	NC_015433	CTG	2	6	648729	648734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832467
13055	NC_015433	TAA	2	6	648743	648748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832467
13056	NC_015433	ACG	2	6	648766	648771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832467
13057	NC_015433	AGG	2	6	648784	648789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832467
13058	NC_015433	CTTC	2	8	648907	648914	0 %	50 %	0 %	50 %	330832468
13059	NC_015433	CT	3	6	649095	649100	0 %	50 %	0 %	50 %	330832468
13060	NC_015433	A	6	6	649101	649106	100 %	0 %	0 %	0 %	330832468
13061	NC_015433	A	6	6	649119	649124	100 %	0 %	0 %	0 %	330832468
13062	NC_015433	TTC	2	6	649155	649160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832468
13063	NC_015433	ATT	3	9	649227	649235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832468
13064	NC_015433	TG	3	6	649250	649255	0 %	50 %	50 %	0 %	330832468
13065	NC_015433	ATC	2	6	649260	649265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832468
13066	NC_015433	AGC	2	6	649310	649315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832468
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13068	NC_015433	TTC	2	6	649629	649634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832468
13069	NC_015433	TAA	2	6	649680	649685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832468
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13071	NC_015433	AAT	2	6	649754	649759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_015433	TAT	2	6	649764	649769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_015433	TAA	2	6	649819	649824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_015433	A	6	6	649846	649851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_015433	AGG	2	6	649867	649872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_015433	TGA	2	6	649880	649885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832469
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13080	NC_015433	AGCT	2	8	650037	650044	25 %	25 %	25 %	25 %	330832469
13081	NC_015433	C	6	6	650045	650050	0 %	0 %	0 %	100 %	330832469
13082	NC_015433	CAG	2	6	650057	650062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832469
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13097	NC_015433	ATGA	2	8	650842	650849	50 %	25 %	25 %	0 %	330832469
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13112	NC_015433	TAC	2	6	651463	651468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832469
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13120	NC_015433	CAG	2	6	651949	651954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832470
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13122	NC_015433	ACT	3	9	652021	652029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832470
13123	NC_015433	TGT	2	6	652031	652036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832470
13124	NC_015433	TCT	2	6	652117	652122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832470
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13141	NC_015433	ATT	2	6	652887	652892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13142	NC_015433	T	6	6	652927	652932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13143	NC_015433	TTC	2	6	652945	652950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13210	NC_015433	TTGAT	2	10	655827	655836	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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13212	NC_015433	ATTC	2	8	656002	656009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13223	NC_015433	A	6	6	656391	656396	100 %	0 %	0 %	0 %	330832473
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13226	NC_015433	A	6	6	656494	656499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13227	NC_015433	A	7	7	656504	656510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13228	NC_015433	AGG	2	6	656619	656624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13229	NC_015433	A	6	6	656641	656646	100 %	0 %	0 %	0 %	330832474
13230	NC_015433	CCA	2	6	656698	656703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832474
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13238	NC_015433	CAAA	2	8	656909	656916	75 %	0 %	0 %	25 %	330832474
13239	NC_015433	A	7	7	657107	657113	100 %	0 %	0 %	0 %	330832475
13240	NC_015433	TGC	2	6	657127	657132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832475
13241	NC_015433	A	6	6	657138	657143	100 %	0 %	0 %	0 %	330832475
13242	NC_015433	AGA	2	6	657169	657174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832475
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13244	NC_015433	ACGT	2	8	657252	657259	25 %	25 %	25 %	25 %	330832475
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