MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015433	AGGAT	2	10	618405	618414	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_015433	ACT	2	6	618419	618424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_015433	GGT	2	6	618452	618457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_015433	ACG	2	6	618525	618530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_015433	CGT	2	6	618545	618550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_015433	T	6	6	618557	618562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_015433	AG	3	6	618640	618645	50 %	0 %	50 %	0 %	330832438
12508	NC_015433	GAG	2	6	618682	618687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832438
12509	NC_015433	CAA	2	6	618719	618724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_015433	TTG	2	6	618739	618744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832439
12511	NC_015433	ATG	2	6	618800	618805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832439
12512	NC_015433	TGG	2	6	618847	618852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832439
12513	NC_015433	TTGA	2	8	618853	618860	25 %	50 %	25 %	0 %	330832439
12514	NC_015433	GATATT	2	12	618877	618888	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	330832439
12515	NC_015433	AGAA	2	8	618917	618924	75 %	0 %	25 %	0 %	330832439
12516	NC_015433	A	6	6	618940	618945	100 %	0 %	0 %	0 %	330832439
12517	NC_015433	TAAA	2	8	618946	618953	75 %	25 %	0 %	0 %	330832439
12518	NC_015433	ATTG	2	8	619094	619101	25 %	50 %	25 %	0 %	330832440
12519	NC_015433	CAG	2	6	619186	619191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832440
12520	NC_015433	TCG	2	6	619214	619219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832440
12521	NC_015433	CTA	2	6	619271	619276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832440
12522	NC_015433	GAA	2	6	619332	619337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832440
12523	NC_015433	ATG	2	6	619338	619343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832440
12524	NC_015433	CGT	2	6	619374	619379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832440
12525	NC_015433	GAA	2	6	619392	619397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832440
12526	NC_015433	TGA	2	6	619454	619459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832440
12527	NC_015433	ATG	2	6	619602	619607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832440
12528	NC_015433	AAGA	2	8	619638	619645	75 %	0 %	25 %	0 %	330832440
12529	NC_015433	ACC	2	6	619690	619695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832440
12530	NC_015433	AAG	2	6	619735	619740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832440
12531	NC_015433	CGT	2	6	619785	619790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832440
12532	NC_015433	CCA	2	6	619851	619856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832440
12533	NC_015433	ATT	2	6	619900	619905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832440
12534	NC_015433	AGA	2	6	619907	619912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832440
12535	NC_015433	TTC	2	6	619954	619959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832440
12536	NC_015433	CAC	2	6	619977	619982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832440
12537	NC_015433	ATG	2	6	620049	620054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832440
12538	NC_015433	ACG	2	6	620116	620121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832440
12539	NC_015433	AAG	2	6	620152	620157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832440
12540	NC_015433	A	6	6	620163	620168	100 %	0 %	0 %	0 %	330832440
12541	NC_015433	ATC	2	6	620181	620186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832440
12542	NC_015433	ACT	2	6	620335	620340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832440
12543	NC_015433	GAA	2	6	620412	620417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832440
12544	NC_015433	GAG	2	6	620490	620495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832440
12545	NC_015433	GTG	2	6	620518	620523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832440
12546	NC_015433	TTGA	2	8	620556	620563	25 %	50 %	25 %	0 %	330832440
12547	NC_015433	TTGG	2	8	620588	620595	0 %	50 %	50 %	0 %	330832440
12548	NC_015433	TCG	2	6	620770	620775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832440
12549	NC_015433	CGTC	2	8	620807	620814	0 %	25 %	25 %	50 %	330832440
12550	NC_015433	AGCTGA	2	12	620900	620911	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330832440
12551	NC_015433	ATAA	2	8	620912	620919	75 %	25 %	0 %	0 %	330832440
12552	NC_015433	AAG	2	6	620923	620928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_015433	CTT	2	6	620939	620944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_015433	T	6	6	620943	620948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_015433	CAAC	2	8	620964	620971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12556	NC_015433	TGA	2	6	621187	621192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832441
12557	NC_015433	GAT	2	6	621209	621214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832441
12558	NC_015433	GCA	2	6	621220	621225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832441
12559	NC_015433	ATG	2	6	621246	621251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832441
12560	NC_015433	ACC	2	6	621329	621334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832441
12561	NC_015433	CAG	2	6	621388	621393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832441
12562	NC_015433	AAG	2	6	621417	621422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832441
12563	NC_015433	ATAG	2	8	621470	621477	50 %	25 %	25 %	0 %	330832441
12564	NC_015433	T	6	6	621501	621506	0 %	100 %	0 %	0 %	330832441
12565	NC_015433	ATG	2	6	621516	621521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832441
12566	NC_015433	CCT	2	6	621654	621659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12567	NC_015433	TTCTT	2	10	621683	621692	0 %	80 %	0 %	20 %	330832442
12568	NC_015433	ATG	2	6	621728	621733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832442
12569	NC_015433	AGC	2	6	621745	621750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832442
12570	NC_015433	ATA	2	6	621809	621814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832442
12571	NC_015433	TTAA	2	8	621851	621858	50 %	50 %	0 %	0 %	330832442
12572	NC_015433	TAC	2	6	621862	621867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832442
12573	NC_015433	TTGG	2	8	621868	621875	0 %	50 %	50 %	0 %	330832442
12574	NC_015433	GAA	2	6	621885	621890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832442
12575	NC_015433	GAT	3	9	621913	621921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832442
12576	NC_015433	ATA	2	6	622105	622110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832442
12577	NC_015433	TGAAC	2	10	622119	622128	40 %	20 %	20 %	20 %	330832442
12578	NC_015433	GCG	2	6	622134	622139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330832442
12579	NC_015433	CG	3	6	622166	622171	0 %	0 %	50 %	50 %	330832442
12580	NC_015433	AG	3	6	622201	622206	50 %	0 %	50 %	0 %	330832442
12581	NC_015433	GTT	2	6	622343	622348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832442
12582	NC_015433	CAT	2	6	622412	622417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832443
12583	NC_015433	AGT	2	6	622469	622474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832443
12584	NC_015433	AG	3	6	622626	622631	50 %	0 %	50 %	0 %	330832443
12585	NC_015433	TCCA	2	8	622740	622747	25 %	25 %	0 %	50 %	330832443
12586	NC_015433	AAG	2	6	622786	622791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832443
12587	NC_015433	GTA	2	6	622806	622811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832443
12588	NC_015433	GAT	2	6	623070	623075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832443
12589	NC_015433	GTT	2	6	623132	623137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832443
12590	NC_015433	CGAAAA	2	12	623141	623152	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	330832443
12591	NC_015433	AAT	2	6	623170	623175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832443
12592	NC_015433	T	7	7	623198	623204	0 %	100 %	0 %	0 %	330832443
12593	NC_015433	TCC	2	6	623219	623224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832444
12594	NC_015433	TTG	2	6	623272	623277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832444
12595	NC_015433	AAG	2	6	623303	623308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832444
12596	NC_015433	TGT	2	6	623320	623325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832444
12597	NC_015433	GAT	2	6	623356	623361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832444
12598	NC_015433	GT	3	6	623395	623400	0 %	50 %	50 %	0 %	330832444
12599	NC_015433	GTT	2	6	623547	623552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832444
12600	NC_015433	ATAGC	2	10	623565	623574	40 %	20 %	20 %	20 %	330832444
12601	NC_015433	T	6	6	623631	623636	0 %	100 %	0 %	0 %	330832444
12602	NC_015433	TG	3	6	623703	623708	0 %	50 %	50 %	0 %	330832444
12603	NC_015433	CTT	2	6	623742	623747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832444
12604	NC_015433	TCA	2	6	623816	623821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832444
12605	NC_015433	TTG	2	6	623954	623959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832444
12606	NC_015433	CTA	2	6	623973	623978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832444
12607	NC_015433	T	6	6	624006	624011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_015433	TA	3	6	624036	624041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_015433	TGTAT	2	10	624070	624079	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_015433	TAA	2	6	624081	624086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_015433	T	6	6	624126	624131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_015433	ATA	2	6	624145	624150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_015433	GAA	2	6	624151	624156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_015433	A	7	7	624182	624188	100 %	0 %	0 %	0 %	330832445
12615	NC_015433	GAT	2	6	624200	624205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832445
12616	NC_015433	ATT	2	6	624224	624229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832445
12617	NC_015433	GGAC	2	8	624352	624359	25 %	0 %	50 %	25 %	330832445
12618	NC_015433	GAT	2	6	624464	624469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832445
12619	NC_015433	CTT	2	6	624521	624526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832445
12620	NC_015433	CGT	2	6	624527	624532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832445
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12622	NC_015433	CCA	2	6	624679	624684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832445
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12743	NC_015433	AGGA	2	8	632533	632540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12990	NC_015433	TTG	2	6	645909	645914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832464
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12993	NC_015433	ATG	2	6	645981	645986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832464
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