MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015433	ATG	3	9	563848	563856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832392
11502	NC_015433	ATA	2	6	563911	563916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_015433	CAG	2	6	563951	563956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_015433	GAA	2	6	563974	563979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_015433	A	6	6	563986	563991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_015433	CTT	2	6	563996	564001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_015433	GAA	2	6	564032	564037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_015433	AGA	2	6	564102	564107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832393
11509	NC_015433	TGAA	2	8	564120	564127	50 %	25 %	25 %	0 %	330832393
11510	NC_015433	A	6	6	564130	564135	100 %	0 %	0 %	0 %	330832393
11511	NC_015433	ATG	2	6	564171	564176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832393
11512	NC_015433	AGA	2	6	564205	564210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832393
11513	NC_015433	GTTG	2	8	564229	564236	0 %	50 %	50 %	0 %	330832393
11514	NC_015433	ATCC	2	8	564329	564336	25 %	25 %	0 %	50 %	330832393
11515	NC_015433	GGT	2	6	564344	564349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832393
11516	NC_015433	TAG	2	6	564420	564425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832393
11517	NC_015433	TGA	2	6	564448	564453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832393
11518	NC_015433	GCTT	2	8	564504	564511	0 %	50 %	25 %	25 %	330832393
11519	NC_015433	CGT	2	6	564569	564574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832393
11520	NC_015433	GAT	2	6	564614	564619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832393
11521	NC_015433	ATTGAA	2	12	564623	564634	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	330832393
11522	NC_015433	GAT	2	6	564641	564646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832393
11523	NC_015433	AGG	2	6	564673	564678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832393
11524	NC_015433	TGG	2	6	564682	564687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832393
11525	NC_015433	GAA	2	6	564838	564843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832393
11526	NC_015433	AAGA	2	8	564875	564882	75 %	0 %	25 %	0 %	330832393
11527	NC_015433	ACC	2	6	564942	564947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832393
11528	NC_015433	AAGTG	2	10	565054	565063	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_015433	TCA	2	6	565090	565095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_015433	T	7	7	565102	565108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_015433	A	7	7	565131	565137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_015433	AAAG	2	8	565151	565158	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_015433	AAT	2	6	565187	565192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832394
11534	NC_015433	GGA	2	6	565337	565342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832394
11535	NC_015433	AG	3	6	565399	565404	50 %	0 %	50 %	0 %	330832394
11536	NC_015433	CGT	2	6	565419	565424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832394
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11538	NC_015433	GGT	2	6	565605	565610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832394
11539	NC_015433	AAT	2	6	565647	565652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832394
11540	NC_015433	ATTG	2	8	565661	565668	25 %	50 %	25 %	0 %	330832394
11541	NC_015433	TGA	2	6	565670	565675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832394
11542	NC_015433	AC	3	6	565767	565772	50 %	0 %	0 %	50 %	330832394
11543	NC_015433	GTA	2	6	565830	565835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832394
11544	NC_015433	TGA	2	6	565838	565843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832394
11545	NC_015433	T	6	6	565879	565884	0 %	100 %	0 %	0 %	330832395
11546	NC_015433	TTGG	2	8	565972	565979	0 %	50 %	50 %	0 %	330832395
11547	NC_015433	GCA	2	6	566320	566325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832395
11548	NC_015433	GCA	2	6	566425	566430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832395
11549	NC_015433	CTG	2	6	566450	566455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832395
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11551	NC_015433	TGGT	2	8	566525	566532	0 %	50 %	50 %	0 %	330832395
11552	NC_015433	GAT	2	6	566634	566639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832395
11553	NC_015433	TAT	3	9	566739	566747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832395
11554	NC_015433	AAT	2	6	566827	566832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_015433	TCCTTT	2	12	566924	566935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_015433	GAT	2	6	566972	566977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_015433	GTTG	2	8	567049	567056	0 %	50 %	50 %	0 %	330832396
11558	NC_015433	T	6	6	567058	567063	0 %	100 %	0 %	0 %	330832396
11559	NC_015433	GATA	2	8	567156	567163	50 %	25 %	25 %	0 %	330832396
11560	NC_015433	ACT	2	6	567169	567174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832396
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11562	NC_015433	AGGA	2	8	567293	567300	50 %	0 %	50 %	0 %	330832396
11563	NC_015433	TTG	2	6	567325	567330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832396
11564	NC_015433	GTT	2	6	567362	567367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832396
11565	NC_015433	GA	3	6	567481	567486	50 %	0 %	50 %	0 %	330832396
11566	NC_015433	CTG	2	6	567557	567562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832396
11567	NC_015433	ATG	2	6	567572	567577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832396
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11570	NC_015433	GAAA	2	8	567804	567811	75 %	0 %	25 %	0 %	330832396
11571	NC_015433	GTT	2	6	567863	567868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832396
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11577	NC_015433	AGGG	2	8	568294	568301	25 %	0 %	75 %	0 %	330832396
11578	NC_015433	TTGA	2	8	568408	568415	25 %	50 %	25 %	0 %	330832396
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11593	NC_015433	GTTG	2	8	569064	569071	0 %	50 %	50 %	0 %	330832396
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11606	NC_015433	T	7	7	569735	569741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_015433	GATAT	2	10	569745	569754	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_015433	CTG	2	6	569767	569772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_015433	A	6	6	569912	569917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_015433	TAT	2	6	569936	569941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832398
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11614	NC_015433	TGA	2	6	570278	570283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11616	NC_015433	AT	3	6	570406	570411	50 %	50 %	0 %	0 %	330832399
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11989	NC_015433	TGA	2	6	590652	590657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832418
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11991	NC_015433	TACT	2	8	590787	590794	25 %	50 %	0 %	25 %	330832418
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