MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_015433	CAAG	2	8	518425	518432	50 %	0 %	25 %	25 %	330832351
10503	NC_015433	TTGA	2	8	518437	518444	25 %	50 %	25 %	0 %	330832351
10504	NC_015433	CCTT	2	8	518471	518478	0 %	50 %	0 %	50 %	330832351
10505	NC_015433	TCCA	2	8	518501	518508	25 %	25 %	0 %	50 %	330832351
10506	NC_015433	ATTT	2	8	518582	518589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_015433	ACA	2	6	518781	518786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_015433	AGAA	2	8	518814	518821	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_015433	TAT	2	6	518825	518830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832352
10510	NC_015433	CTG	2	6	518866	518871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832352
10511	NC_015433	GGC	2	6	518928	518933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330832352
10512	NC_015433	ATGCCC	2	12	519001	519012	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330832352
10513	NC_015433	GTG	2	6	519013	519018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832352
10514	NC_015433	TCAC	2	8	519046	519053	25 %	25 %	0 %	50 %	330832352
10515	NC_015433	GAA	2	6	519063	519068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832352
10516	NC_015433	TCA	2	6	519198	519203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832352
10517	NC_015433	GGAA	2	8	519229	519236	50 %	0 %	50 %	0 %	330832352
10518	NC_015433	GTC	2	6	519252	519257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832352
10519	NC_015433	GAA	2	6	519279	519284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832352
10520	NC_015433	TC	3	6	519371	519376	0 %	50 %	0 %	50 %	330832352
10521	NC_015433	GCT	2	6	519412	519417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832352
10522	NC_015433	GAA	2	6	519465	519470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832352
10523	NC_015433	CAAG	2	8	519686	519693	50 %	0 %	25 %	25 %	330832352
10524	NC_015433	TGAT	2	8	519697	519704	25 %	50 %	25 %	0 %	330832352
10525	NC_015433	CTA	2	6	519746	519751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832352
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10529	NC_015433	AGT	2	6	519824	519829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832352
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10531	NC_015433	TCA	2	6	520066	520071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832352
10532	NC_015433	AAG	2	6	520081	520086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832352
10533	NC_015433	CATAAA	2	12	520111	520122	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	330832352
10534	NC_015433	A	6	6	520170	520175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_015433	GAA	2	6	520178	520183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_015433	A	6	6	520268	520273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_015433	GAA	2	6	520278	520283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_015433	TTC	2	6	520304	520309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_015433	TGTT	2	8	520338	520345	0 %	75 %	25 %	0 %	330832353
10540	NC_015433	T	6	6	520383	520388	0 %	100 %	0 %	0 %	330832353
10541	NC_015433	T	6	6	520521	520526	0 %	100 %	0 %	0 %	330832353
10542	NC_015433	ATTAT	2	10	520679	520688	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_015433	GAG	2	6	520731	520736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_015433	GAA	2	6	520768	520773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832354
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10547	NC_015433	GAAG	2	8	520962	520969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_015433	GAA	2	6	520977	520982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_015433	AAT	2	6	520985	520990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_015433	AAT	3	9	521002	521010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_015433	GATTA	2	10	521026	521035	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_015433	ATG	2	6	521043	521048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_015433	T	6	6	521049	521054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_015433	T	7	7	521089	521095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_015433	A	6	6	521125	521130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_015433	ACTTA	3	15	521160	521174	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10557	NC_015433	TAAGT	2	10	521181	521190	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_015433	GGT	2	6	521212	521217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_015433	A	6	6	521224	521229	100 %	0 %	0 %	0 %	330832355
10560	NC_015433	T	6	6	521238	521243	0 %	100 %	0 %	0 %	330832355
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10572	NC_015433	AGA	2	6	521694	521699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832355
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10577	NC_015433	ATAA	2	8	521956	521963	75 %	25 %	0 %	0 %	330832355
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10580	NC_015433	T	6	6	522055	522060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10582	NC_015433	A	6	6	522070	522075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10583	NC_015433	TTG	2	6	522077	522082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_015433	TCC	2	6	522133	522138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10589	NC_015433	CAC	2	6	522249	522254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10590	NC_015433	ATG	2	6	522282	522287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10592	NC_015433	AATA	2	8	522348	522355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_015433	TGG	2	6	522363	522368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_015433	GAG	2	6	522383	522388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_015433	AGTA	2	8	522402	522409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10599	NC_015433	TGT	2	6	522554	522559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832356
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10604	NC_015433	CTTTT	2	10	522683	522692	0 %	80 %	0 %	20 %	330832356
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10606	NC_015433	CAT	2	6	522695	522700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832356
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10609	NC_015433	T	7	7	522756	522762	0 %	100 %	0 %	0 %	330832356
10610	NC_015433	ATTT	2	8	522780	522787	25 %	75 %	0 %	0 %	330832356
10611	NC_015433	A	6	6	522789	522794	100 %	0 %	0 %	0 %	330832356
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10620	NC_015433	T	6	6	523148	523153	0 %	100 %	0 %	0 %	330832356
10621	NC_015433	TTG	2	6	523165	523170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832356
10622	NC_015433	TA	3	6	523250	523255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_015433	A	11	11	523255	523265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_015433	AAT	2	6	523283	523288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10993	NC_015433	AGA	2	6	540346	540351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10994	NC_015433	GA	3	6	540350	540355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10995	NC_015433	A	6	6	540355	540360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10996	NC_015433	ATAGG	2	10	540377	540386	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10997	NC_015433	A	6	6	540387	540392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10998	NC_015433	CAG	2	6	540393	540398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10999	NC_015433	ACC	2	6	540501	540506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832370
11000	NC_015433	TGG	2	6	540525	540530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832370

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