MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015433	TAC	2	6	345443	345448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_015433	CCT	2	6	345531	345536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7003	NC_015433	GGT	2	6	345667	345672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_015433	TCG	2	6	345782	345787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_015433	CGT	2	6	345862	345867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_015433	GA	3	6	346086	346091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_015433	TGGAAG	2	12	346109	346120	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_015433	T	6	6	346249	346254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_015433	CAG	2	6	346406	346411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_015433	AGT	2	6	346432	346437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_015433	ATG	2	6	346520	346525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_015433	CGG	2	6	346612	346617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_015433	GCT	2	6	346656	346661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_015433	T	8	8	346670	346677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_015433	T	6	6	346679	346684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_015433	T	6	6	346711	346716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_015433	TTGT	2	8	346742	346749	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_015433	ATA	2	6	346754	346759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_015433	TGA	2	6	346779	346784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832178
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7021	NC_015433	TAT	2	6	346978	346983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832178
7022	NC_015433	T	6	6	347047	347052	0 %	100 %	0 %	0 %	330832178
7023	NC_015433	TAAGGC	2	12	347118	347129	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330832178
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7029	NC_015433	ATG	2	6	347477	347482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832178
7030	NC_015433	AGT	2	6	347628	347633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832178
7031	NC_015433	TGC	2	6	347652	347657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832178
7032	NC_015433	CGT	2	6	347791	347796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832178
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7039	NC_015433	TTTAT	2	10	348155	348164	20 %	80 %	0 %	0 %	330832178
7040	NC_015433	GAA	2	6	348178	348183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832178
7041	NC_015433	GAA	2	6	348282	348287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832178
7042	NC_015433	CAT	2	6	348303	348308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832178
7043	NC_015433	TTA	2	6	348398	348403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832178
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7047	NC_015433	A	6	6	348790	348795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7049	NC_015433	CTA	2	6	348937	348942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832179
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7053	NC_015433	AG	3	6	349037	349042	50 %	0 %	50 %	0 %	330832179
7054	NC_015433	CT	3	6	349056	349061	0 %	50 %	0 %	50 %	330832179
7055	NC_015433	CCT	2	6	349261	349266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832180
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7058	NC_015433	CAG	2	6	349523	349528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832180
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7063	NC_015433	AGC	2	6	349692	349697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832180
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7067	NC_015433	TCA	2	6	349901	349906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832180
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7071	NC_015433	TGA	2	6	350029	350034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832180
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7074	NC_015433	GTTG	2	8	350152	350159	0 %	50 %	50 %	0 %	330832181
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7089	NC_015433	ATGG	2	8	351058	351065	25 %	25 %	50 %	0 %	330832182
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7109	NC_015433	AGA	2	6	352007	352012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7111	NC_015433	TAT	2	6	352052	352057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_015433	GA	3	6	352067	352072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_015433	T	6	6	352094	352099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_015433	GAC	2	6	352139	352144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7122	NC_015433	AGTT	2	8	352549	352556	25 %	50 %	25 %	0 %	330832184
7123	NC_015433	TGG	2	6	352561	352566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832184
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7238	NC_015433	T	6	6	358475	358480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7239	NC_015433	AGG	2	6	358535	358540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7240	NC_015433	AGAT	2	8	358604	358611	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7241	NC_015433	AGG	2	6	358619	358624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7242	NC_015433	CTGAAG	2	12	358644	358655	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330832190
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7245	NC_015433	TGA	2	6	358959	358964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832191
7246	NC_015433	CCT	2	6	358974	358979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832191
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7370	NC_015433	TTG	2	6	365656	365661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832196
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7383	NC_015433	GAGT	2	8	366550	366557	25 %	25 %	50 %	0 %	330832197
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