MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015433	AGA	2	6	321075	321080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832159
6502	NC_015433	AC	3	6	321119	321124	50 %	0 %	0 %	50 %	330832159
6503	NC_015433	GGT	2	6	321127	321132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832159
6504	NC_015433	CAT	2	6	321156	321161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832159
6505	NC_015433	TGCCA	2	10	321192	321201	20 %	20 %	20 %	40 %	330832159
6506	NC_015433	CATTT	2	10	321310	321319	20 %	60 %	0 %	20 %	330832159
6507	NC_015433	AG	3	6	321324	321329	50 %	0 %	50 %	0 %	330832159
6508	NC_015433	AAG	2	6	321347	321352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832159
6509	NC_015433	GAA	2	6	321412	321417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832159
6510	NC_015433	GCA	2	6	321424	321429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832159
6511	NC_015433	CAT	2	6	321508	321513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832160
6512	NC_015433	AT	3	6	321517	321522	50 %	50 %	0 %	0 %	330832160
6513	NC_015433	GCTG	2	8	321667	321674	0 %	25 %	50 %	25 %	330832160
6514	NC_015433	CAAGG	2	10	321722	321731	40 %	0 %	40 %	20 %	330832160
6515	NC_015433	GTCT	2	8	321813	321820	0 %	50 %	25 %	25 %	330832160
6516	NC_015433	GGT	2	6	321824	321829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832160
6517	NC_015433	TCGT	2	8	321846	321853	0 %	50 %	25 %	25 %	330832160
6518	NC_015433	GTG	2	6	321903	321908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832160
6519	NC_015433	TCT	2	6	321993	321998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832160
6520	NC_015433	ATG	2	6	322005	322010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832160
6521	NC_015433	TGC	2	6	322063	322068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832160
6522	NC_015433	AG	3	6	322136	322141	50 %	0 %	50 %	0 %	330832160
6523	NC_015433	GAT	2	6	322148	322153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832160
6524	NC_015433	CAAC	2	8	322169	322176	50 %	0 %	0 %	50 %	330832160
6525	NC_015433	CATG	2	8	322231	322238	25 %	25 %	25 %	25 %	330832160
6526	NC_015433	AGA	2	6	322239	322244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832160
6527	NC_015433	ATC	2	6	322262	322267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832160
6528	NC_015433	GGA	2	6	322339	322344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832160
6529	NC_015433	CTAG	2	8	322413	322420	25 %	25 %	25 %	25 %	330832161
6530	NC_015433	CTGT	2	8	322677	322684	0 %	50 %	25 %	25 %	330832161
6531	NC_015433	GAC	2	6	322703	322708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832161
6532	NC_015433	TGC	2	6	322714	322719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832161
6533	NC_015433	GTAG	2	8	322737	322744	25 %	25 %	50 %	0 %	330832161
6534	NC_015433	TCAT	2	8	322747	322754	25 %	50 %	0 %	25 %	330832161
6535	NC_015433	CTTC	2	8	322759	322766	0 %	50 %	0 %	50 %	330832161
6536	NC_015433	AGAGC	2	10	322808	322817	40 %	0 %	40 %	20 %	330832161
6537	NC_015433	AAT	2	6	322839	322844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832161
6538	NC_015433	TGGC	2	8	322863	322870	0 %	25 %	50 %	25 %	330832161
6539	NC_015433	ATG	2	6	322960	322965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832161
6540	NC_015433	TGA	2	6	323005	323010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832161
6541	NC_015433	TTA	2	6	323051	323056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832161
6542	NC_015433	A	6	6	323109	323114	100 %	0 %	0 %	0 %	330832161
6543	NC_015433	TGG	2	6	323396	323401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832162
6544	NC_015433	ATC	2	6	323450	323455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832162
6545	NC_015433	ATCA	2	8	323551	323558	50 %	25 %	0 %	25 %	330832162
6546	NC_015433	GA	3	6	323622	323627	50 %	0 %	50 %	0 %	330832162
6547	NC_015433	AAG	2	6	323648	323653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832162
6548	NC_015433	GCA	2	6	323671	323676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832162
6549	NC_015433	AAG	2	6	323690	323695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832162
6550	NC_015433	TGC	2	6	323721	323726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832162
6551	NC_015433	ATCA	2	8	323740	323747	50 %	25 %	0 %	25 %	330832162
6552	NC_015433	CAG	2	6	323759	323764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832162
6553	NC_015433	CGGA	2	8	323773	323780	25 %	0 %	50 %	25 %	330832162
6554	NC_015433	TGG	2	6	323787	323792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832162
6555	NC_015433	TGG	2	6	323819	323824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832162
6556	NC_015433	GAA	2	6	323902	323907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832162
6557	NC_015433	GGA	2	6	324120	324125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832162
6558	NC_015433	GT	3	6	324140	324145	0 %	50 %	50 %	0 %	330832162
6559	NC_015433	CGCCT	2	10	324230	324239	0 %	20 %	20 %	60 %	330832162
6560	NC_015433	ACA	2	6	324241	324246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832162
6561	NC_015433	GTTA	2	8	324289	324296	25 %	50 %	25 %	0 %	330832162
6562	NC_015433	GTCA	2	8	324343	324350	25 %	25 %	25 %	25 %	330832162
6563	NC_015433	TCT	2	6	324366	324371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832162
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6565	NC_015433	ATG	2	6	324425	324430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_015433	AATT	2	8	324449	324456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_015433	GAG	2	6	324517	324522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_015433	CGC	2	6	324537	324542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6569	NC_015433	ATT	2	6	324575	324580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_015433	AG	3	6	324591	324596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_015433	A	6	6	324611	324616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_015433	TGGTC	2	10	324659	324668	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6573	NC_015433	ATG	2	6	324712	324717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832163
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6576	NC_015433	ATC	2	6	324801	324806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832163
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6579	NC_015433	AGT	2	6	324860	324865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832163
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6581	NC_015433	CTG	2	6	324900	324905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832163
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6583	NC_015433	CCGA	2	8	325068	325075	25 %	0 %	25 %	50 %	330832163
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6585	NC_015433	A	6	6	325286	325291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6587	NC_015433	A	6	6	325330	325335	100 %	0 %	0 %	0 %	330832164
6588	NC_015433	A	6	6	325345	325350	100 %	0 %	0 %	0 %	330832164
6589	NC_015433	TAG	2	6	325361	325366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832164
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6594	NC_015433	AGA	2	6	325547	325552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832164
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6597	NC_015433	GGACT	2	10	325704	325713	20 %	20 %	40 %	20 %	330832164
6598	NC_015433	AGT	2	6	325797	325802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832164
6599	NC_015433	TGA	2	6	325826	325831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832164
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6605	NC_015433	AGT	2	6	326218	326223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832164
6606	NC_015433	A	7	7	326245	326251	100 %	0 %	0 %	0 %	330832164
6607	NC_015433	A	6	6	326318	326323	100 %	0 %	0 %	0 %	330832164
6608	NC_015433	CAC	2	6	326340	326345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832164
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6611	NC_015433	A	6	6	326473	326478	100 %	0 %	0 %	0 %	330832165
6612	NC_015433	A	7	7	326482	326488	100 %	0 %	0 %	0 %	330832165
6613	NC_015433	ATC	2	6	326552	326557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832165
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6616	NC_015433	GCCA	2	8	326824	326831	25 %	0 %	25 %	50 %	330832165
6617	NC_015433	GAA	2	6	326971	326976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832165
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6619	NC_015433	TCA	2	6	327013	327018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832165
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6622	NC_015433	CGA	2	6	327132	327137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832165
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