MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015433	CAA	2	6	244691	244696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832087
5002	NC_015433	TGC	3	9	244762	244770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832087
5003	NC_015433	ATC	2	6	244841	244846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832087
5004	NC_015433	CTC	2	6	244911	244916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832087
5005	NC_015433	GCAG	2	8	244921	244928	25 %	0 %	50 %	25 %	330832087
5006	NC_015433	CTTAC	2	10	245065	245074	20 %	40 %	0 %	40 %	330832087
5007	NC_015433	GGT	2	6	245105	245110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832087
5008	NC_015433	CT	4	8	245193	245200	0 %	50 %	0 %	50 %	330832087
5009	NC_015433	ATC	2	6	245207	245212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832087
5010	NC_015433	AGA	2	6	245238	245243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832087
5011	NC_015433	ATGA	2	8	245313	245320	50 %	25 %	25 %	0 %	330832088
5012	NC_015433	TTA	2	6	245323	245328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832088
5013	NC_015433	CAG	2	6	245368	245373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832088
5014	NC_015433	TTG	2	6	245407	245412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832088
5015	NC_015433	AAG	2	6	245427	245432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832088
5016	NC_015433	CT	3	6	245468	245473	0 %	50 %	0 %	50 %	330832088
5017	NC_015433	GTC	2	6	245497	245502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832088
5018	NC_015433	AGA	2	6	245503	245508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832088
5019	NC_015433	GTC	2	6	245515	245520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832088
5020	NC_015433	TGG	2	6	245521	245526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832088
5021	NC_015433	CTACT	2	10	245544	245553	20 %	40 %	0 %	40 %	330832088
5022	NC_015433	TCT	2	6	245603	245608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832088
5023	NC_015433	TGGGC	2	10	245639	245648	0 %	20 %	60 %	20 %	330832088
5024	NC_015433	TC	3	6	245660	245665	0 %	50 %	0 %	50 %	330832088
5025	NC_015433	GTTAA	2	10	245724	245733	40 %	40 %	20 %	0 %	330832088
5026	NC_015433	AAC	2	6	245783	245788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832088
5027	NC_015433	GTG	2	6	245844	245849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832088
5028	NC_015433	AGA	2	6	245936	245941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832088
5029	NC_015433	GA	3	6	245951	245956	50 %	0 %	50 %	0 %	330832088
5030	NC_015433	ATC	2	6	246076	246081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832088
5031	NC_015433	TAT	2	6	246168	246173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832089
5032	NC_015433	CAAA	2	8	246175	246182	75 %	0 %	0 %	25 %	330832089
5033	NC_015433	TAT	2	6	246211	246216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832089
5034	NC_015433	AAG	2	6	246217	246222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832089
5035	NC_015433	CT	3	6	246242	246247	0 %	50 %	0 %	50 %	330832089
5036	NC_015433	GAC	2	6	246252	246257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832089
5037	NC_015433	TTTTAT	2	12	246300	246311	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	330832089
5038	NC_015433	CAA	2	6	246326	246331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832089
5039	NC_015433	TGA	2	6	246369	246374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832089
5040	NC_015433	GTAACA	2	12	246436	246447	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330832089
5041	NC_015433	CTA	2	6	246486	246491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832089
5042	NC_015433	TGT	2	6	246504	246509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832089
5043	NC_015433	TGA	2	6	246552	246557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832089
5044	NC_015433	ATG	2	6	246620	246625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832089
5045	NC_015433	GA	3	6	246653	246658	50 %	0 %	50 %	0 %	330832089
5046	NC_015433	AAAC	2	8	246695	246702	75 %	0 %	0 %	25 %	330832089
5047	NC_015433	CTT	2	6	246910	246915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_015433	TAT	2	6	246965	246970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_015433	CAG	2	6	247089	247094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832090
5050	NC_015433	ATG	2	6	247124	247129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832090
5051	NC_015433	CTT	2	6	247149	247154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832090
5052	NC_015433	ACC	2	6	247213	247218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832090
5053	NC_015433	CA	3	6	247312	247317	50 %	0 %	0 %	50 %	330832090
5054	NC_015433	GCA	2	6	247340	247345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832090
5055	NC_015433	CGT	2	6	247404	247409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832090
5056	NC_015433	GCG	2	6	247477	247482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330832090
5057	NC_015433	CCA	2	6	247497	247502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832090
5058	NC_015433	ATG	2	6	247532	247537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832090
5059	NC_015433	TGC	2	6	247663	247668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832090
5060	NC_015433	AAACC	2	10	247689	247698	60 %	0 %	0 %	40 %	330832090
5061	NC_015433	ACC	2	6	247729	247734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832090
5062	NC_015433	ACC	2	6	247819	247824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832090
5063	NC_015433	CAG	2	6	247839	247844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832090
5064	NC_015433	ACC	2	6	247948	247953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832090
5065	NC_015433	ACC	2	6	247957	247962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832090
5066	NC_015433	TGAAC	2	10	248085	248094	40 %	20 %	20 %	20 %	330832090
5067	NC_015433	TGA	2	6	248154	248159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832090
5068	NC_015433	TTC	2	6	248194	248199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832090
5069	NC_015433	AGA	2	6	248241	248246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832090
5070	NC_015433	GGA	2	6	248262	248267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832090
5071	NC_015433	AAG	2	6	248307	248312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832090
5072	NC_015433	T	6	6	248357	248362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_015433	TTA	2	6	248365	248370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_015433	AATTT	2	10	248382	248391	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_015433	ATT	2	6	248400	248405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_015433	AGA	2	6	248431	248436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_015433	A	7	7	248452	248458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_015433	TAA	2	6	248460	248465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_015433	TAG	2	6	248490	248495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_015433	GTTT	2	8	248512	248519	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_015433	AAGA	2	8	248534	248541	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_015433	GGA	2	6	248553	248558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_015433	TGA	2	6	248612	248617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832091
5084	NC_015433	GAA	2	6	248647	248652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832091
5085	NC_015433	CG	3	6	248716	248721	0 %	0 %	50 %	50 %	330832091
5086	NC_015433	GGCTT	2	10	248791	248800	0 %	40 %	40 %	20 %	330832091
5087	NC_015433	CTA	2	6	248815	248820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832091
5088	NC_015433	TGA	2	6	248880	248885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832091
5089	NC_015433	TCTT	2	8	248946	248953	0 %	75 %	0 %	25 %	330832091
5090	NC_015433	AGG	2	6	249017	249022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832091
5091	NC_015433	ACTT	2	8	249028	249035	25 %	50 %	0 %	25 %	330832091
5092	NC_015433	ACC	2	6	249060	249065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832091
5093	NC_015433	AGC	3	9	249093	249101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832091
5094	NC_015433	TCA	2	6	249185	249190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832091
5095	NC_015433	TGG	2	6	249207	249212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832091
5096	NC_015433	TTG	2	6	249293	249298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832091
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5098	NC_015433	AAC	2	6	249372	249377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832091
5099	NC_015433	AAGG	2	8	249385	249392	50 %	0 %	50 %	0 %	330832091
5100	NC_015433	CAT	2	6	249432	249437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832091
5101	NC_015433	ATC	2	6	249503	249508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_015433	AAG	2	6	249524	249529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_015433	GGAAT	2	10	249633	249642	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_015433	AT	3	6	249657	249662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_015433	T	6	6	249693	249698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_015433	GAA	2	6	249757	249762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_015433	T	6	6	249767	249772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_015433	CTG	2	6	249779	249784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_015433	GA	3	6	249837	249842	50 %	0 %	50 %	0 %	330832092
5110	NC_015433	T	6	6	249900	249905	0 %	100 %	0 %	0 %	330832092
5111	NC_015433	TAT	2	6	249923	249928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832092
5112	NC_015433	ATT	3	9	249936	249944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832092
5113	NC_015433	CAT	2	6	250013	250018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832092
5114	NC_015433	TTC	2	6	250051	250056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832092
5115	NC_015433	GAG	2	6	250057	250062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832092
5116	NC_015433	CAA	2	6	250223	250228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832092
5117	NC_015433	ATG	2	6	250234	250239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832092
5118	NC_015433	TGG	2	6	250252	250257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832092
5119	NC_015433	CAC	2	6	250378	250383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832092
5120	NC_015433	AGG	2	6	250468	250473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832092
5121	NC_015433	ATG	2	6	250477	250482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832092
5122	NC_015433	AAAGA	2	10	250503	250512	80 %	0 %	20 %	0 %	330832092
5123	NC_015433	GGA	2	6	250601	250606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832092
5124	NC_015433	TGAT	2	8	250630	250637	25 %	50 %	25 %	0 %	330832092
5125	NC_015433	TGG	2	6	250658	250663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832092
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5132	NC_015433	TAC	2	6	251229	251234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832093
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5142	NC_015433	A	6	6	251914	251919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_015433	T	7	7	251950	251956	0 %	100 %	0 %	0 %	330832094
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5235	NC_015433	GCAG	2	8	257017	257024	25 %	0 %	50 %	25 %	330832101
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5239	NC_015433	GGA	2	6	257153	257158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832101
5240	NC_015433	CTCTA	2	10	257173	257182	20 %	40 %	0 %	40 %	330832101
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5244	NC_015433	TTGG	2	8	257318	257325	0 %	50 %	50 %	0 %	330832101
5245	NC_015433	AGC	2	6	257692	257697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832101
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5373	NC_015433	TTG	2	6	263667	263672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832108
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5380	NC_015433	TCTGC	2	10	263933	263942	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5381	NC_015433	ATC	2	6	264076	264081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832109
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5491	NC_015433	AAC	2	6	268725	268730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832111
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