MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015433	CTT	2	6	218814	218819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832063
4502	NC_015433	TAAG	2	8	218857	218864	50 %	25 %	25 %	0 %	330832063
4503	NC_015433	CTGT	2	8	218972	218979	0 %	50 %	25 %	25 %	330832063
4504	NC_015433	ACA	2	6	218990	218995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832063
4505	NC_015433	GTT	2	6	219017	219022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832063
4506	NC_015433	ATG	2	6	219029	219034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832063
4507	NC_015433	A	7	7	219115	219121	100 %	0 %	0 %	0 %	330832063
4508	NC_015433	AAG	2	6	219158	219163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832063
4509	NC_015433	GTG	2	6	219171	219176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832063
4510	NC_015433	GTTTT	2	10	219180	219189	0 %	80 %	20 %	0 %	330832063
4511	NC_015433	T	6	6	219186	219191	0 %	100 %	0 %	0 %	330832063
4512	NC_015433	T	6	6	219206	219211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_015433	AAT	2	6	219221	219226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832064
4514	NC_015433	CCATA	2	10	219282	219291	40 %	20 %	0 %	40 %	330832064
4515	NC_015433	TGCT	2	8	219303	219310	0 %	50 %	25 %	25 %	330832064
4516	NC_015433	AAT	2	6	219406	219411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832064
4517	NC_015433	AGA	2	6	219412	219417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832064
4518	NC_015433	TTC	2	6	219451	219456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832064
4519	NC_015433	TTGG	2	8	219478	219485	0 %	50 %	50 %	0 %	330832064
4520	NC_015433	CTTC	2	8	219486	219493	0 %	50 %	0 %	50 %	330832064
4521	NC_015433	TCT	2	6	219543	219548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832064
4522	NC_015433	GACA	2	8	219607	219614	50 %	0 %	25 %	25 %	330832064
4523	NC_015433	T	6	6	219649	219654	0 %	100 %	0 %	0 %	330832064
4524	NC_015433	TGG	2	6	219674	219679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832064
4525	NC_015433	AG	3	6	219696	219701	50 %	0 %	50 %	0 %	330832064
4526	NC_015433	T	6	6	219717	219722	0 %	100 %	0 %	0 %	330832064
4527	NC_015433	ATC	2	6	219742	219747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832064
4528	NC_015433	TCT	2	6	219776	219781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832064
4529	NC_015433	GTC	2	6	219878	219883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832064
4530	NC_015433	CAT	2	6	220054	220059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832064
4531	NC_015433	AGA	2	6	220169	220174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_015433	ATT	2	6	220433	220438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832065
4533	NC_015433	AGA	2	6	220500	220505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832065
4534	NC_015433	AGA	2	6	220530	220535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832065
4535	NC_015433	GTT	2	6	220603	220608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832065
4536	NC_015433	GAT	2	6	220635	220640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832065
4537	NC_015433	ATGAC	2	10	220670	220679	40 %	20 %	20 %	20 %	330832065
4538	NC_015433	ATG	2	6	220847	220852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832065
4539	NC_015433	GAA	2	6	221161	221166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832065
4540	NC_015433	GAGT	2	8	221202	221209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_015433	TAG	2	6	221210	221215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_015433	TTG	2	6	221220	221225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_015433	T	6	6	221245	221250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_015433	GTT	2	6	221276	221281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_015433	TTGAT	2	10	221285	221294	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_015433	ATCTGC	2	12	221308	221319	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_015433	TAT	2	6	221351	221356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_015433	TAA	2	6	221358	221363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_015433	ATTG	2	8	221387	221394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_015433	TG	3	6	221393	221398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_015433	TTTA	2	8	221433	221440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_015433	ATTTA	2	10	221469	221478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_015433	AAG	2	6	221505	221510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_015433	CAT	2	6	221577	221582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832066
4555	NC_015433	GAT	2	6	221643	221648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832066
4556	NC_015433	AAG	3	9	221717	221725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832066
4557	NC_015433	AAAT	2	8	221810	221817	75 %	25 %	0 %	0 %	330832066
4558	NC_015433	GAC	3	9	221859	221867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832066
4559	NC_015433	TTG	2	6	221948	221953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832066
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4561	NC_015433	GTT	2	6	221989	221994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832066
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4563	NC_015433	GTA	2	6	222097	222102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832066
4564	NC_015433	GTA	2	6	222190	222195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832066
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4572	NC_015433	AGCTC	2	10	222496	222505	20 %	20 %	20 %	40 %	330832066
4573	NC_015433	GGC	2	6	222519	222524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330832066
4574	NC_015433	GTA	2	6	222749	222754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_015433	GAAT	2	8	222763	222770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_015433	A	7	7	222919	222925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_015433	AAC	2	6	222928	222933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_015433	C	6	6	222939	222944	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4579	NC_015433	AT	3	6	222978	222983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_015433	AAAATT	2	12	223062	223073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_015433	TTTA	2	8	223108	223115	25 %	75 %	0 %	0 %	330832067
4582	NC_015433	TGT	2	6	223168	223173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832067
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4590	NC_015433	CAA	2	6	223753	223758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832067
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4600	NC_015433	CAT	2	6	224107	224112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832067
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4603	NC_015433	GTA	2	6	224282	224287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832067
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4605	NC_015433	CAGT	2	8	224340	224347	25 %	25 %	25 %	25 %	330832067
4606	NC_015433	TTC	2	6	224492	224497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832067
4607	NC_015433	AAT	2	6	224639	224644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832067
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4609	NC_015433	CT	4	8	224739	224746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_015433	CTT	2	6	224760	224765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_015433	AGG	2	6	224780	224785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_015433	CCT	2	6	224803	224808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4613	NC_015433	TGGT	2	8	224900	224907	0 %	50 %	50 %	0 %	330832068
4614	NC_015433	CGA	2	6	224928	224933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832068
4615	NC_015433	CAG	2	6	224937	224942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832068
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4617	NC_015433	TCCAA	2	10	225032	225041	40 %	20 %	0 %	40 %	330832068
4618	NC_015433	AACTC	2	10	225068	225077	40 %	20 %	0 %	40 %	330832068
4619	NC_015433	AGA	2	6	225152	225157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832068
4620	NC_015433	AGC	2	6	225271	225276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832068
4621	NC_015433	CAA	2	6	225285	225290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832068
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4623	NC_015433	TCT	2	6	225326	225331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832068
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4625	NC_015433	ACA	2	6	225383	225388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832068
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4998	NC_015433	TGG	2	6	244504	244509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832087
4999	NC_015433	A	6	6	244515	244520	100 %	0 %	0 %	0 %	330832087
5000	NC_015433	CAG	2	6	244653	244658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832087

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