MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 63687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_015152	CCT	2	6	2442933	2442938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972064
46502	NC_015152	TGC	2	6	2443005	2443010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972064
46503	NC_015152	AGC	2	6	2443013	2443018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972064
46504	NC_015152	CGT	2	6	2443036	2443041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972064
46505	NC_015152	CCAA	2	8	2443113	2443120	50 %	0 %	0 %	50 %	325972064
46506	NC_015152	TGT	2	6	2443148	2443153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972064
46507	NC_015152	GGCA	2	8	2443214	2443221	25 %	0 %	50 %	25 %	325972064
46508	NC_015152	TTG	2	6	2443267	2443272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972064
46509	NC_015152	CTG	2	6	2443276	2443281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972064
46510	NC_015152	CAA	2	6	2443288	2443293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972064
46511	NC_015152	TGC	2	6	2443301	2443306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972064
46512	NC_015152	ATC	2	6	2443312	2443317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972064
46513	NC_015152	AAGC	2	8	2443318	2443325	50 %	0 %	25 %	25 %	325972064
46514	NC_015152	TGA	2	6	2443383	2443388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972064
46515	NC_015152	TGA	2	6	2443457	2443462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972064
46516	NC_015152	ACAA	2	8	2443463	2443470	75 %	0 %	0 %	25 %	325972064
46517	NC_015152	GCTT	2	8	2443568	2443575	0 %	50 %	25 %	25 %	325972064
46518	NC_015152	AGACA	2	10	2443582	2443591	60 %	0 %	20 %	20 %	325972064
46519	NC_015152	TACG	2	8	2443600	2443607	25 %	25 %	25 %	25 %	325972064
46520	NC_015152	GCC	2	6	2443616	2443621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972064
46521	NC_015152	AC	4	8	2443634	2443641	50 %	0 %	0 %	50 %	325972064
46522	NC_015152	TCA	2	6	2443649	2443654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972064
46523	NC_015152	TG	3	6	2443713	2443718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46524	NC_015152	TG	3	6	2443730	2443735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46525	NC_015152	A	6	6	2443751	2443756	100 %	0 %	0 %	0 %	325972065
46526	NC_015152	AAACC	2	10	2443791	2443800	60 %	0 %	0 %	40 %	325972065
46527	NC_015152	CTTT	2	8	2443826	2443833	0 %	75 %	0 %	25 %	325972065
46528	NC_015152	CT	3	6	2443835	2443840	0 %	50 %	0 %	50 %	325972065
46529	NC_015152	TGGCGA	2	12	2443920	2443931	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325972065
46530	NC_015152	TTGT	2	8	2444015	2444022	0 %	75 %	25 %	0 %	325972065
46531	NC_015152	TCT	2	6	2444032	2444037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972065
46532	NC_015152	GAA	2	6	2444180	2444185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972065
46533	NC_015152	TCA	2	6	2444214	2444219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972065
46534	NC_015152	CCTG	2	8	2444262	2444269	0 %	25 %	25 %	50 %	325972065
46535	NC_015152	TCA	2	6	2444273	2444278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972065
46536	NC_015152	GCA	2	6	2444288	2444293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972065
46537	NC_015152	CTA	2	6	2444350	2444355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972065
46538	NC_015152	TGC	2	6	2444428	2444433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972065
46539	NC_015152	CCT	2	6	2444472	2444477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972065
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46541	NC_015152	AT	3	6	2444525	2444530	50 %	50 %	0 %	0 %	325972065
46542	NC_015152	AAAG	2	8	2444588	2444595	75 %	0 %	25 %	0 %	325972065
46543	NC_015152	TATGG	2	10	2444614	2444623	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46544	NC_015152	TAC	2	6	2444624	2444629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46545	NC_015152	GCA	2	6	2444683	2444688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972066
46546	NC_015152	TC	3	6	2444693	2444698	0 %	50 %	0 %	50 %	325972066
46547	NC_015152	CAG	2	6	2444716	2444721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972066
46548	NC_015152	TC	3	6	2444754	2444759	0 %	50 %	0 %	50 %	325972066
46549	NC_015152	GAG	2	6	2444829	2444834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972066
46550	NC_015152	GCT	2	6	2444846	2444851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972066
46551	NC_015152	CAG	2	6	2444853	2444858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972066
46552	NC_015152	CT	3	6	2444906	2444911	0 %	50 %	0 %	50 %	325972066
46553	NC_015152	AAGC	2	8	2444937	2444944	50 %	0 %	25 %	25 %	325972066
46554	NC_015152	TAC	2	6	2444978	2444983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972066
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46564	NC_015152	TGA	2	6	2445485	2445490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972066
46565	NC_015152	CTG	2	6	2445516	2445521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972066
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46571	NC_015152	ACT	2	6	2446012	2446017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972066
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46577	NC_015152	AGGG	2	8	2446476	2446483	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46578	NC_015152	TC	3	6	2446511	2446516	0 %	50 %	0 %	50 %	325972067
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46582	NC_015152	GTA	2	6	2446679	2446684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972067
46583	NC_015152	AG	3	6	2446828	2446833	50 %	0 %	50 %	0 %	325972067
46584	NC_015152	CA	3	6	2446858	2446863	50 %	0 %	0 %	50 %	325972067
46585	NC_015152	CAC	2	6	2446867	2446872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972067
46586	NC_015152	ACC	2	6	2446875	2446880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972067
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46589	NC_015152	G	7	7	2446953	2446959	0 %	0 %	100 %	0 %	325972067
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46602	NC_015152	CACC	2	8	2447827	2447834	25 %	0 %	0 %	75 %	325972068
46603	NC_015152	GGTG	2	8	2447928	2447935	0 %	25 %	75 %	0 %	325972068
46604	NC_015152	CTG	2	6	2447975	2447980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972068
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46617	NC_015152	GTC	2	6	2448705	2448710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972069
46618	NC_015152	CGGT	2	8	2448739	2448746	0 %	25 %	50 %	25 %	325972069
46619	NC_015152	GTC	2	6	2448768	2448773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972069
46620	NC_015152	TGA	2	6	2448797	2448802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972069
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46622	NC_015152	GGTCTT	2	12	2448888	2448899	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325972069
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46624	NC_015152	GGT	2	6	2448960	2448965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972069
46625	NC_015152	CTT	2	6	2448975	2448980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972069
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46636	NC_015152	CA	3	6	2449688	2449693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46637	NC_015152	AT	3	6	2449696	2449701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46638	NC_015152	GCAA	2	8	2449728	2449735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46639	NC_015152	GT	3	6	2449795	2449800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46640	NC_015152	A	7	7	2449866	2449872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46643	NC_015152	TGT	2	6	2449963	2449968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46644	NC_015152	GA	4	8	2450013	2450020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46645	NC_015152	TAA	2	6	2450058	2450063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972070
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46652	NC_015152	A	7	7	2450254	2450260	100 %	0 %	0 %	0 %	325972070
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46684	NC_015152	GGA	2	6	2451630	2451635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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46701	NC_015152	A	7	7	2452405	2452411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46702	NC_015152	A	7	7	2452414	2452420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46703	NC_015152	CTC	2	6	2452426	2452431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46704	NC_015152	AT	3	6	2452441	2452446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46705	NC_015152	ATG	2	6	2452495	2452500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972074
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46725	NC_015152	GCCC	2	8	2453437	2453444	0 %	0 %	25 %	75 %	325972074
46726	NC_015152	GAA	2	6	2453453	2453458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972074
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46730	NC_015152	AG	3	6	2453842	2453847	50 %	0 %	50 %	0 %	325972075
46731	NC_015152	GAA	2	6	2453854	2453859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972075
46732	NC_015152	GCA	2	6	2453932	2453937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972075
46733	NC_015152	TCA	2	6	2453946	2453951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972075
46734	NC_015152	GAC	2	6	2453966	2453971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972075
46735	NC_015152	TTCCA	2	10	2453975	2453984	20 %	40 %	0 %	40 %	325972075
46736	NC_015152	TGGGAT	2	12	2453995	2454006	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	325972075
46737	NC_015152	CAT	2	6	2454022	2454027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972075
46738	NC_015152	CCT	2	6	2454061	2454066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972075
46739	NC_015152	GAA	2	6	2454079	2454084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972075
46740	NC_015152	ATC	2	6	2454098	2454103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972075
46741	NC_015152	CAAT	2	8	2454277	2454284	50 %	25 %	0 %	25 %	325972075
46742	NC_015152	TGAAA	2	10	2454292	2454301	60 %	20 %	20 %	0 %	325972076
46743	NC_015152	GA	3	6	2454319	2454324	50 %	0 %	50 %	0 %	325972076
46744	NC_015152	CCCT	2	8	2454354	2454361	0 %	25 %	0 %	75 %	325972076
46745	NC_015152	TGC	2	6	2454373	2454378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972076
46746	NC_015152	GCA	2	6	2454382	2454387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972076
46747	NC_015152	GCA	2	6	2454452	2454457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972076
46748	NC_015152	GCA	2	6	2454460	2454465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972076
46749	NC_015152	TCG	2	6	2454504	2454509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972076
46750	NC_015152	TCGA	2	8	2454596	2454603	25 %	25 %	25 %	25 %	325972076
46751	NC_015152	ACTC	2	8	2454738	2454745	25 %	25 %	0 %	50 %	325972076
46752	NC_015152	TAT	2	6	2454764	2454769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972076
46753	NC_015152	CGA	2	6	2454810	2454815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972076
46754	NC_015152	CA	3	6	2454903	2454908	50 %	0 %	0 %	50 %	325972076
46755	NC_015152	ATG	2	6	2454924	2454929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972076
46756	NC_015152	GAACA	2	10	2454956	2454965	60 %	0 %	20 %	20 %	325972076
46757	NC_015152	TCG	2	6	2454969	2454974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972076
46758	NC_015152	ATC	2	6	2455106	2455111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972076
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46762	NC_015152	ACC	2	6	2455271	2455276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972076
46763	NC_015152	AC	3	6	2455327	2455332	50 %	0 %	0 %	50 %	325972076
46764	NC_015152	GAA	2	6	2455366	2455371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972076
46765	NC_015152	GGAA	2	8	2455396	2455403	50 %	0 %	50 %	0 %	325972076
46766	NC_015152	GTC	2	6	2455412	2455417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972076
46767	NC_015152	CGAC	2	8	2455512	2455519	25 %	0 %	25 %	50 %	325972076
46768	NC_015152	GAA	2	6	2455697	2455702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972076
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46771	NC_015152	TAC	2	6	2455936	2455941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972077
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46778	NC_015152	CGG	2	6	2456290	2456295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972077
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46815	NC_015152	ACC	2	6	2457932	2457937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972080
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46822	NC_015152	ATG	2	6	2458226	2458231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972080
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46826	NC_015152	CT	3	6	2458434	2458439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46827	NC_015152	GTTC	2	8	2458451	2458458	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46828	NC_015152	AG	3	6	2458462	2458467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46829	NC_015152	AAG	2	6	2458582	2458587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972081
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46834	NC_015152	ATG	2	6	2458766	2458771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972081
46835	NC_015152	AGC	2	6	2458781	2458786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972081
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46838	NC_015152	GAT	2	6	2458846	2458851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972081
46839	NC_015152	GCC	2	6	2458939	2458944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972081
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46841	NC_015152	TGTA	2	8	2459084	2459091	25 %	50 %	25 %	0 %	325972081
46842	NC_015152	ACCGG	2	10	2459095	2459104	20 %	0 %	40 %	40 %	325972081
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46845	NC_015152	GGA	2	6	2459280	2459285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972081
46846	NC_015152	CTT	2	6	2459301	2459306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972081
46847	NC_015152	GTCG	2	8	2459346	2459353	0 %	25 %	50 %	25 %	325972081
46848	NC_015152	CAT	2	6	2459523	2459528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972081
46849	NC_015152	CCTT	2	8	2459570	2459577	0 %	50 %	0 %	50 %	325972081
46850	NC_015152	CT	3	6	2459611	2459616	0 %	50 %	0 %	50 %	325972082
46851	NC_015152	AGA	2	6	2459624	2459629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972082
46852	NC_015152	AGC	2	6	2459641	2459646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972082
46853	NC_015152	CAT	2	6	2459708	2459713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972082
46854	NC_015152	TGC	2	6	2459738	2459743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972082
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46856	NC_015152	GAA	2	6	2459805	2459810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972082
46857	NC_015152	CTG	2	6	2459859	2459864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972082
46858	NC_015152	CTGC	2	8	2460020	2460027	0 %	25 %	25 %	50 %	325972082
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46873	NC_015152	CTG	2	6	2460864	2460869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972082
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46943	NC_015152	ACT	2	6	2464739	2464744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972086
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46965	NC_015152	ACT	2	6	2466028	2466033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972086
46966	NC_015152	TAAG	2	8	2466119	2466126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46967	NC_015152	T	6	6	2466166	2466171	0 %	100 %	0 %	0 %	325972087
46968	NC_015152	GCA	2	6	2466187	2466192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972087
46969	NC_015152	ACA	2	6	2466283	2466288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972087
46970	NC_015152	GCAA	2	8	2466360	2466367	50 %	0 %	25 %	25 %	325972087
46971	NC_015152	AGTA	2	8	2466371	2466378	50 %	25 %	25 %	0 %	325972087
46972	NC_015152	CT	3	6	2466453	2466458	0 %	50 %	0 %	50 %	325972087
46973	NC_015152	CTG	2	6	2466537	2466542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972087
46974	NC_015152	TCA	3	9	2466624	2466632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972087
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46979	NC_015152	GCTT	2	8	2466956	2466963	0 %	50 %	25 %	25 %	325972087
46980	NC_015152	TCT	2	6	2467103	2467108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972087
46981	NC_015152	CTT	2	6	2467126	2467131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972087
46982	NC_015152	GAG	2	6	2467176	2467181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972087
46983	NC_015152	TCT	2	6	2467216	2467221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972087
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46986	NC_015152	CCCT	2	8	2467338	2467345	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46987	NC_015152	A	7	7	2467373	2467379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46988	NC_015152	CAAG	2	8	2467399	2467406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46989	NC_015152	AT	3	6	2467417	2467422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46990	NC_015152	AG	3	6	2467445	2467450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46991	NC_015152	GCA	2	6	2467479	2467484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972088
46992	NC_015152	TGGA	2	8	2467632	2467639	25 %	25 %	50 %	0 %	325972088
46993	NC_015152	CCT	2	6	2467650	2467655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972088
46994	NC_015152	GGCCC	2	10	2467678	2467687	0 %	0 %	40 %	60 %	325972088
46995	NC_015152	AACC	2	8	2467755	2467762	50 %	0 %	0 %	50 %	325972088
46996	NC_015152	A	6	6	2467873	2467878	100 %	0 %	0 %	0 %	325972088
46997	NC_015152	AAT	2	6	2467993	2467998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972088
46998	NC_015152	CGA	2	6	2468022	2468027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972088
46999	NC_015152	ATT	2	6	2468164	2468169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972088
47000	NC_015152	CCT	2	6	2468195	2468200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972088

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