MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 63687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015152	GACT	2	8	154055	154062	25 %	25 %	25 %	25 %	325969980
3002	NC_015152	GA	3	6	154068	154073	50 %	0 %	50 %	0 %	325969980
3003	NC_015152	CCCA	2	8	154077	154084	25 %	0 %	0 %	75 %	325969980
3004	NC_015152	ACT	2	6	154126	154131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969980
3005	NC_015152	CGG	2	6	154223	154228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969980
3006	NC_015152	AG	3	6	154286	154291	50 %	0 %	50 %	0 %	325969980
3007	NC_015152	TG	3	6	154318	154323	0 %	50 %	50 %	0 %	325969980
3008	NC_015152	TCC	2	6	154413	154418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969980
3009	NC_015152	TGC	2	6	154573	154578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969980
3010	NC_015152	GTG	2	6	154750	154755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969980
3011	NC_015152	AAG	2	6	154762	154767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969980
3012	NC_015152	CT	3	6	154792	154797	0 %	50 %	0 %	50 %	325969980
3013	NC_015152	CCT	2	6	154814	154819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969980
3014	NC_015152	TGCA	2	8	154921	154928	25 %	25 %	25 %	25 %	325969980
3015	NC_015152	ATG	2	6	154930	154935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969980
3016	NC_015152	GAA	2	6	154963	154968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969980
3017	NC_015152	GAA	2	6	155006	155011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969980
3018	NC_015152	CCG	2	6	155056	155061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325969980
3019	NC_015152	GTG	2	6	155091	155096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969980
3020	NC_015152	ATT	2	6	155127	155132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969980
3021	NC_015152	GAA	2	6	155243	155248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_015152	AG	4	8	155304	155311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015152	TCT	2	6	155320	155325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_015152	TTG	2	6	155546	155551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015152	GT	3	6	155593	155598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_015152	GT	3	6	155616	155621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_015152	GAA	2	6	155650	155655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969981
3028	NC_015152	GA	3	6	155663	155668	50 %	0 %	50 %	0 %	325969981
3029	NC_015152	TTC	2	6	155724	155729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969981
3030	NC_015152	TA	3	6	155849	155854	50 %	50 %	0 %	0 %	325969981
3031	NC_015152	GAA	2	6	155951	155956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969981
3032	NC_015152	A	6	6	155955	155960	100 %	0 %	0 %	0 %	325969981
3033	NC_015152	TCG	2	6	155967	155972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969981
3034	NC_015152	AGA	2	6	156197	156202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969981
3035	NC_015152	TGT	2	6	156262	156267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969981
3036	NC_015152	TCT	2	6	156310	156315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969981
3037	NC_015152	A	6	6	156386	156391	100 %	0 %	0 %	0 %	325969981
3038	NC_015152	AT	3	6	156490	156495	50 %	50 %	0 %	0 %	325969981
3039	NC_015152	TAT	2	6	156512	156517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969981
3040	NC_015152	AGC	2	6	156684	156689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969981
3041	NC_015152	TTG	2	6	156702	156707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969981
3042	NC_015152	ATG	2	6	156711	156716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969981
3043	NC_015152	TGA	2	6	156754	156759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969981
3044	NC_015152	AGA	2	6	156765	156770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969981
3045	NC_015152	AAG	2	6	156815	156820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969981
3046	NC_015152	GAT	2	6	156836	156841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969981
3047	NC_015152	GAA	2	6	156902	156907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969981
3048	NC_015152	ATG	2	6	156954	156959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_015152	TGT	2	6	156979	156984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_015152	TTC	2	6	157084	157089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969982
3051	NC_015152	GAT	3	9	157107	157115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969982
3052	NC_015152	GCC	2	6	157149	157154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325969982
3053	NC_015152	AAT	2	6	157170	157175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325969982
3054	NC_015152	TGA	2	6	157322	157327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969982
3055	NC_015152	TTG	2	6	157441	157446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969982
3056	NC_015152	GAAC	2	8	157460	157467	50 %	0 %	25 %	25 %	325969982
3057	NC_015152	ACC	2	6	157585	157590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969982
3058	NC_015152	AGC	2	6	157681	157686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969982
3059	NC_015152	AAG	2	6	157773	157778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969982
3060	NC_015152	CAC	2	6	157879	157884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_015152	GCG	2	6	157932	157937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969983
3062	NC_015152	ATT	2	6	157953	157958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969983
3063	NC_015152	GGA	2	6	157996	158001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969983
3064	NC_015152	CTG	2	6	158003	158008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969983
3065	NC_015152	CCA	2	6	158052	158057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969983
3066	NC_015152	AGG	2	6	158127	158132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969983
3067	NC_015152	GCA	2	6	158170	158175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969983
3068	NC_015152	TGG	2	6	158313	158318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969983
3069	NC_015152	GCA	2	6	158366	158371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969983
3070	NC_015152	AGC	3	9	158376	158384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969983
3071	NC_015152	ACC	2	6	158396	158401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969983
3072	NC_015152	GAA	2	6	158489	158494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969983
3073	NC_015152	CT	3	6	158500	158505	0 %	50 %	0 %	50 %	325969983
3074	NC_015152	CTC	2	6	158524	158529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969983
3075	NC_015152	CTT	2	6	158530	158535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969983
3076	NC_015152	GTT	2	6	158609	158614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969983
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3079	NC_015152	CCA	2	6	158837	158842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969983
3080	NC_015152	TGA	2	6	159036	159041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969983
3081	NC_015152	AGA	2	6	159044	159049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969983
3082	NC_015152	AAC	2	6	159068	159073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_015152	GAA	2	6	159084	159089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_015152	ATC	2	6	159150	159155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_015152	ATG	2	6	159204	159209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015152	TTA	2	6	159236	159241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_015152	TAA	2	6	159257	159262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_015152	A	6	6	159261	159266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_015152	GGA	2	6	159300	159305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_015152	GAAA	2	8	159345	159352	75 %	0 %	25 %	0 %	325969984
3091	NC_015152	ACTC	2	8	159362	159369	25 %	25 %	0 %	50 %	325969984
3092	NC_015152	GAT	2	6	159430	159435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969984
3093	NC_015152	AGAT	2	8	159458	159465	50 %	25 %	25 %	0 %	325969984
3094	NC_015152	GA	3	6	159474	159479	50 %	0 %	50 %	0 %	325969984
3095	NC_015152	ATC	2	6	159490	159495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969984
3096	NC_015152	GTCC	2	8	159529	159536	0 %	25 %	25 %	50 %	325969984
3097	NC_015152	TCA	2	6	159566	159571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969984
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3099	NC_015152	AAC	2	6	159657	159662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969984
3100	NC_015152	TGA	2	6	159728	159733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969984
3101	NC_015152	CTT	2	6	159819	159824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969984
3102	NC_015152	ACAAT	2	10	159858	159867	60 %	20 %	0 %	20 %	325969984
3103	NC_015152	TCC	2	6	159940	159945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969984
3104	NC_015152	TTG	2	6	159982	159987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969984
3105	NC_015152	GA	3	6	160063	160068	50 %	0 %	50 %	0 %	325969984
3106	NC_015152	ATG	2	6	160160	160165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969984
3107	NC_015152	AGA	2	6	160215	160220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969984
3108	NC_015152	TTC	2	6	160222	160227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969984
3109	NC_015152	TTC	2	6	160251	160256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969984
3110	NC_015152	CA	3	6	160294	160299	50 %	0 %	0 %	50 %	325969984
3111	NC_015152	TAA	2	6	160319	160324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325969984
3112	NC_015152	ATTC	2	8	160358	160365	25 %	50 %	0 %	25 %	325969984
3113	NC_015152	TGT	2	6	160371	160376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969984
3114	NC_015152	GTC	2	6	160489	160494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969984
3115	NC_015152	ATT	2	6	160576	160581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969984
3116	NC_015152	CTC	2	6	160603	160608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969984
3117	NC_015152	GAAG	2	8	160615	160622	50 %	0 %	50 %	0 %	325969984
3118	NC_015152	AAG	2	6	160624	160629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969984
3119	NC_015152	AATAA	2	10	160650	160659	80 %	20 %	0 %	0 %	325969984
3120	NC_015152	GTAT	2	8	160670	160677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_015152	CA	3	6	160734	160739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_015152	AGTA	2	8	160802	160809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_015152	CAGG	2	8	160814	160821	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3124	NC_015152	GAA	3	9	160843	160851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_015152	CTG	2	6	160859	160864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_015152	TG	3	6	160875	160880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015152	GCATA	2	10	160896	160905	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3128	NC_015152	TGA	2	6	160917	160922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_015152	TAT	2	6	160929	160934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015152	TTG	2	6	160968	160973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_015152	TAC	2	6	161043	161048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_015152	AGC	2	6	161108	161113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_015152	ATGCA	2	10	161152	161161	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3134	NC_015152	AGA	2	6	161251	161256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969985
3135	NC_015152	TGC	2	6	161301	161306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969985
3136	NC_015152	CCTTTC	2	12	161344	161355	0 %	50 %	0 %	50 %	325969985
3137	NC_015152	CAG	2	6	161388	161393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969985
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3143	NC_015152	AGATG	2	10	161516	161525	40 %	20 %	40 %	0 %	325969986
3144	NC_015152	TTG	2	6	161527	161532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969986
3145	NC_015152	CTG	2	6	161566	161571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969986
3146	NC_015152	TTTTG	2	10	161597	161606	0 %	80 %	20 %	0 %	325969986
3147	NC_015152	CTG	2	6	161662	161667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969986
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3150	NC_015152	TCG	2	6	161797	161802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3151	NC_015152	TAC	2	6	161928	161933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969987
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3154	NC_015152	GCT	2	6	162153	162158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969987
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3156	NC_015152	GCA	2	6	162312	162317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969987
3157	NC_015152	GAT	2	6	162360	162365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969987
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3163	NC_015152	AAG	2	6	162628	162633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969987
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3182	NC_015152	TGA	2	6	163743	163748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3184	NC_015152	AAG	2	6	163813	163818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3185	NC_015152	AG	3	6	163847	163852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3186	NC_015152	CCAT	2	8	163906	163913	25 %	25 %	0 %	50 %	325969989
3187	NC_015152	CTG	2	6	163935	163940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969989
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3196	NC_015152	GTA	2	6	164456	164461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3198	NC_015152	GAG	2	6	164486	164491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3219	NC_015152	A	6	6	165709	165714	100 %	0 %	0 %	0 %	325969991
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3229	NC_015152	AGGA	2	8	166434	166441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3230	NC_015152	A	7	7	166489	166495	100 %	0 %	0 %	0 %	325969992
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3232	NC_015152	TGA	2	6	166521	166526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969992
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3237	NC_015152	TACG	2	8	166970	166977	25 %	25 %	25 %	25 %	325969992
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3242	NC_015152	GA	3	6	167314	167319	50 %	0 %	50 %	0 %	325969992
3243	NC_015152	GT	3	6	167367	167372	0 %	50 %	50 %	0 %	325969992
3244	NC_015152	TC	3	6	167473	167478	0 %	50 %	0 %	50 %	325969992
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3247	NC_015152	TGA	2	6	167658	167663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969992
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3249	NC_015152	TTC	2	6	167775	167780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969992
3250	NC_015152	GAA	2	6	167906	167911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969992
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3354	NC_015152	T	7	7	173198	173204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3355	NC_015152	A	6	6	173259	173264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3356	NC_015152	GA	3	6	173290	173295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3357	NC_015152	TAA	2	6	173341	173346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325969999
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3375	NC_015152	ATTG	2	8	174283	174290	25 %	50 %	25 %	0 %	325969999
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3378	NC_015152	TGA	2	6	174340	174345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969999
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3386	NC_015152	TTG	2	6	174624	174629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3387	NC_015152	TAT	2	6	174653	174658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3388	NC_015152	AGT	2	6	174686	174691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3390	NC_015152	CAG	2	6	174800	174805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970000
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3494	NC_015152	GTTT	2	8	180083	180090	0 %	75 %	25 %	0 %	325970007
3495	NC_015152	TCCA	2	8	180173	180180	25 %	25 %	0 %	50 %	325970007
3496	NC_015152	CCAT	2	8	180246	180253	25 %	25 %	0 %	50 %	325970007
3497	NC_015152	CTT	2	6	180268	180273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970007
3498	NC_015152	TGC	2	6	180286	180291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970007
3499	NC_015152	TCA	2	6	180324	180329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970007
3500	NC_015152	TGC	2	6	180339	180344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970007

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