MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 63687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015152	TGA	2	6	820176	820181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970603
16002	NC_015152	CGA	2	6	820404	820409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970603
16003	NC_015152	ACA	2	6	820454	820459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970603
16004	NC_015152	CTTGC	2	10	820510	820519	0 %	40 %	20 %	40 %	325970603
16005	NC_015152	GAAGC	2	10	820533	820542	40 %	0 %	40 %	20 %	325970603
16006	NC_015152	TCC	2	6	820664	820669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970603
16007	NC_015152	GGA	2	6	820944	820949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970604
16008	NC_015152	GTT	2	6	821145	821150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970604
16009	NC_015152	TGG	2	6	821166	821171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970604
16010	NC_015152	TCC	2	6	821180	821185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970604
16011	NC_015152	TAC	2	6	821197	821202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970604
16012	NC_015152	GCCGT	2	10	821284	821293	0 %	20 %	40 %	40 %	325970604
16013	NC_015152	ATA	2	6	821310	821315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970604
16014	NC_015152	TTG	2	6	821362	821367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970604
16015	NC_015152	GTT	2	6	821396	821401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970604
16016	NC_015152	GAT	2	6	821402	821407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970604
16017	NC_015152	TCA	2	6	821418	821423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970604
16018	NC_015152	CAC	2	6	821492	821497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970604
16019	NC_015152	CGTTG	2	10	821515	821524	0 %	40 %	40 %	20 %	325970604
16020	NC_015152	TGC	2	6	821588	821593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970604
16021	NC_015152	GCTT	2	8	821630	821637	0 %	50 %	25 %	25 %	325970604
16022	NC_015152	ATG	2	6	821718	821723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970604
16023	NC_015152	GTT	2	6	821734	821739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970604
16024	NC_015152	CAT	2	6	821752	821757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970604
16025	NC_015152	CAA	2	6	821798	821803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16026	NC_015152	TAC	2	6	821830	821835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_015152	ATGG	2	8	821885	821892	25 %	25 %	50 %	0 %	325970605
16028	NC_015152	TGT	2	6	822072	822077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970605
16029	NC_015152	AAGGT	2	10	822114	822123	40 %	20 %	40 %	0 %	325970605
16030	NC_015152	GTCA	2	8	822128	822135	25 %	25 %	25 %	25 %	325970605
16031	NC_015152	CAAG	2	8	822145	822152	50 %	0 %	25 %	25 %	325970605
16032	NC_015152	CAT	2	6	822209	822214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970605
16033	NC_015152	GGAA	2	8	822229	822236	50 %	0 %	50 %	0 %	325970605
16034	NC_015152	GAT	2	6	822314	822319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970605
16035	NC_015152	AGGTG	2	10	822373	822382	20 %	20 %	60 %	0 %	325970605
16036	NC_015152	TCC	2	6	822384	822389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970605
16037	NC_015152	GAT	2	6	822395	822400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970605
16038	NC_015152	GAT	2	6	822428	822433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970605
16039	NC_015152	GAT	2	6	822491	822496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970605
16040	NC_015152	AGG	2	6	822499	822504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970605
16041	NC_015152	AAG	2	6	822560	822565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970605
16042	NC_015152	GCT	2	6	822572	822577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970605
16043	NC_015152	TGT	2	6	822667	822672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970605
16044	NC_015152	TGGA	2	8	822681	822688	25 %	25 %	50 %	0 %	325970605
16045	NC_015152	GCA	2	6	822743	822748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970605
16046	NC_015152	TC	3	6	822757	822762	0 %	50 %	0 %	50 %	325970605
16047	NC_015152	GGACAG	2	12	822771	822782	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325970605
16048	NC_015152	GAG	2	6	822801	822806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970605
16049	NC_015152	GAA	2	6	822848	822853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970605
16050	NC_015152	GAT	2	6	822943	822948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970605
16051	NC_015152	TGC	2	6	823032	823037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970605
16052	NC_015152	GAT	2	6	823114	823119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970605
16053	NC_015152	GAA	3	9	823188	823196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970606
16054	NC_015152	AGA	2	6	823200	823205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970606
16055	NC_015152	TTG	2	6	823253	823258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970606
16056	NC_015152	TGA	2	6	823319	823324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970606
16057	NC_015152	CAT	2	6	823341	823346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970606
16058	NC_015152	ATT	2	6	823456	823461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970606
16059	NC_015152	AAC	2	6	823495	823500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970606
16060	NC_015152	AAG	2	6	823507	823512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970606
16061	NC_015152	ATC	2	6	823561	823566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970606
16062	NC_015152	CGA	2	6	823617	823622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970606
16063	NC_015152	CTA	2	6	823632	823637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970606
16064	NC_015152	ACA	2	6	823808	823813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970606
16065	NC_015152	GAA	2	6	823876	823881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970606
16066	NC_015152	GAG	2	6	823915	823920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970606
16067	NC_015152	TGC	2	6	823944	823949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970606
16068	NC_015152	CAG	2	6	823972	823977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970606
16069	NC_015152	AG	3	6	823995	824000	50 %	0 %	50 %	0 %	325970606
16070	NC_015152	TGC	2	6	824010	824015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970606
16071	NC_015152	TGA	2	6	824112	824117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970606
16072	NC_015152	GCT	2	6	824127	824132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970606
16073	NC_015152	CTT	2	6	824136	824141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970606
16074	NC_015152	TCA	2	6	824213	824218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970606
16075	NC_015152	T	6	6	824227	824232	0 %	100 %	0 %	0 %	325970606
16076	NC_015152	AAC	2	6	824234	824239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970606
16077	NC_015152	TGGA	2	8	824270	824277	25 %	25 %	50 %	0 %	325970606
16078	NC_015152	ATA	2	6	824351	824356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970606
16079	NC_015152	GAT	2	6	824368	824373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970606
16080	NC_015152	CCCT	2	8	824400	824407	0 %	25 %	0 %	75 %	325970606
16081	NC_015152	CCTC	2	8	824459	824466	0 %	25 %	0 %	75 %	325970606
16082	NC_015152	ACA	2	6	824513	824518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970606
16083	NC_015152	GGAAG	2	10	824529	824538	40 %	0 %	60 %	0 %	325970606
16084	NC_015152	ATC	2	6	824626	824631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970606
16085	NC_015152	CAT	2	6	824700	824705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970606
16086	NC_015152	CCA	2	6	824828	824833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970606
16087	NC_015152	CGCA	2	8	824847	824854	25 %	0 %	25 %	50 %	325970606
16088	NC_015152	CCT	2	6	824864	824869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970606
16089	NC_015152	GAA	2	6	824901	824906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970606
16090	NC_015152	AGC	2	6	824915	824920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970606
16091	NC_015152	TGA	2	6	824921	824926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970606
16092	NC_015152	TTGC	2	8	824950	824957	0 %	50 %	25 %	25 %	325970606
16093	NC_015152	AGC	2	6	825023	825028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970606
16094	NC_015152	AGC	2	6	825097	825102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970607
16095	NC_015152	TGCT	2	8	825131	825138	0 %	50 %	25 %	25 %	325970607
16096	NC_015152	TGA	2	6	825173	825178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970607
16097	NC_015152	GGT	2	6	825225	825230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970607
16098	NC_015152	CTC	2	6	825318	825323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970607
16099	NC_015152	AAGC	2	8	825354	825361	50 %	0 %	25 %	25 %	325970607
16100	NC_015152	GA	4	8	825412	825419	50 %	0 %	50 %	0 %	325970607
16101	NC_015152	TCC	2	6	825475	825480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970607
16102	NC_015152	GGC	2	6	825482	825487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970607
16103	NC_015152	GAC	2	6	825527	825532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970607
16104	NC_015152	CAA	2	6	825615	825620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970607
16105	NC_015152	AATCC	2	10	825672	825681	40 %	20 %	0 %	40 %	325970607
16106	NC_015152	AGG	2	6	825697	825702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970607
16107	NC_015152	T	6	6	825746	825751	0 %	100 %	0 %	0 %	325970607
16108	NC_015152	GA	3	6	825772	825777	50 %	0 %	50 %	0 %	325970607
16109	NC_015152	GAA	2	6	825838	825843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970607
16110	NC_015152	GTT	3	9	825897	825905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970607
16111	NC_015152	GTTCTT	2	12	826010	826021	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325970607
16112	NC_015152	GAG	2	6	826041	826046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970607
16113	NC_015152	CGTA	2	8	826069	826076	25 %	25 %	25 %	25 %	325970608
16114	NC_015152	CAA	2	6	826082	826087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970608
16115	NC_015152	TGA	2	6	826120	826125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970608
16116	NC_015152	GGCC	2	8	826145	826152	0 %	0 %	50 %	50 %	325970608
16117	NC_015152	TAG	2	6	826179	826184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970608
16118	NC_015152	GCA	2	6	826224	826229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970608
16119	NC_015152	CTT	2	6	826259	826264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970608
16120	NC_015152	CGC	2	6	826312	826317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970608
16121	NC_015152	TCA	2	6	826402	826407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970608
16122	NC_015152	ATC	2	6	826449	826454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970608
16123	NC_015152	TCC	2	6	826455	826460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970608
16124	NC_015152	TCGA	2	8	826488	826495	25 %	25 %	25 %	25 %	325970608
16125	NC_015152	GGT	2	6	826511	826516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970608
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16129	NC_015152	TGA	2	6	826627	826632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970608
16130	NC_015152	TGA	2	6	826639	826644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970608
16131	NC_015152	CTC	2	6	826691	826696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970609
16132	NC_015152	TGA	2	6	826779	826784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970609
16133	NC_015152	TGA	2	6	826798	826803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970609
16134	NC_015152	ATG	2	6	826809	826814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970609
16135	NC_015152	ATTT	2	8	826867	826874	25 %	75 %	0 %	0 %	325970609
16136	NC_015152	TGCC	2	8	826912	826919	0 %	25 %	25 %	50 %	325970609
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16141	NC_015152	TTC	2	6	827192	827197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970610
16142	NC_015152	TGA	2	6	827283	827288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970610
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16145	NC_015152	ATC	2	6	827383	827388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970610
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16150	NC_015152	TCT	2	6	827603	827608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970610
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16161	NC_015152	TTG	2	6	827983	827988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16166	NC_015152	AGG	2	6	828179	828184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16167	NC_015152	TGA	2	6	828227	828232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970611
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16172	NC_015152	TGA	2	6	828553	828558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970612
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16203	NC_015152	TTC	2	6	830005	830010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970613
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16207	NC_015152	C	7	7	830250	830256	0 %	0 %	0 %	100 %	325970613
16208	NC_015152	TCG	2	6	830353	830358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970613
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16215	NC_015152	TTGCC	2	10	830788	830797	0 %	40 %	20 %	40 %	325970614
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16218	NC_015152	TCGA	2	8	831141	831148	25 %	25 %	25 %	25 %	325970614
16219	NC_015152	CCG	3	9	831168	831176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970614
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16223	NC_015152	GTTT	2	8	831384	831391	0 %	75 %	25 %	0 %	325970615
16224	NC_015152	TGC	2	6	831553	831558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970615
16225	NC_015152	TCT	2	6	831686	831691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970615
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16228	NC_015152	CAATCT	2	12	831867	831878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970616
16229	NC_015152	CT	3	6	831882	831887	0 %	50 %	0 %	50 %	325970616
16230	NC_015152	CTTC	2	8	831999	832006	0 %	50 %	0 %	50 %	325970616
16231	NC_015152	GTA	2	6	832031	832036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970616
16232	NC_015152	TGA	2	6	832072	832077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970616
16233	NC_015152	GATT	2	8	832118	832125	25 %	50 %	25 %	0 %	325970616
16234	NC_015152	ACAG	2	8	832137	832144	50 %	0 %	25 %	25 %	325970616
16235	NC_015152	TCC	2	6	832295	832300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970617
16236	NC_015152	CCA	2	6	832362	832367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970617
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16361	NC_015152	GCT	2	6	839322	839327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970624
16362	NC_015152	GAC	2	6	839377	839382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970624
16363	NC_015152	CGT	2	6	839391	839396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970624
16364	NC_015152	TTC	2	6	839400	839405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970624
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16366	NC_015152	ATG	2	6	839474	839479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970624
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16382	NC_015152	CT	3	6	840161	840166	0 %	50 %	0 %	50 %	325970624
16383	NC_015152	CTT	2	6	840228	840233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970624
16384	NC_015152	GTCC	2	8	840242	840249	0 %	25 %	25 %	50 %	325970624
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16387	NC_015152	T	7	7	840465	840471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16388	NC_015152	CA	3	6	840472	840477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16389	NC_015152	CTT	2	6	840492	840497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16390	NC_015152	TTC	2	6	840534	840539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16391	NC_015152	GTAT	2	8	840556	840563	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16392	NC_015152	GCAT	2	8	840637	840644	25 %	25 %	25 %	25 %	325970625
16393	NC_015152	AGG	3	9	840692	840700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970625
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16409	NC_015152	GGTTT	2	10	841457	841466	0 %	60 %	40 %	0 %	325970626
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16481	NC_015152	TTGC	2	8	845685	845692	0 %	50 %	25 %	25 %	325970629
16482	NC_015152	CAC	2	6	845703	845708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970629
16483	NC_015152	ACTT	2	8	845713	845720	25 %	50 %	0 %	25 %	325970629
16484	NC_015152	CTG	2	6	845776	845781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970629
16485	NC_015152	CAT	2	6	845821	845826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970629
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16488	NC_015152	TACG	2	8	846097	846104	25 %	25 %	25 %	25 %	325970629
16489	NC_015152	TGAT	2	8	846140	846147	25 %	50 %	25 %	0 %	325970629
16490	NC_015152	TTG	2	6	846153	846158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970629
16491	NC_015152	CAGG	2	8	846219	846226	25 %	0 %	50 %	25 %	325970629
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16493	NC_015152	ATTA	2	8	846333	846340	50 %	50 %	0 %	0 %	325970630
16494	NC_015152	TCA	2	6	846445	846450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970630
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