MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 63687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015152	CTCA	2	8	533890	533897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10502	NC_015152	AGG	2	6	533920	533925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_015152	ATTGC	2	10	534184	534193	20 %	40 %	20 %	20 %	325970332
10504	NC_015152	GTA	2	6	534195	534200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970332
10505	NC_015152	TGG	2	6	534265	534270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970332
10506	NC_015152	TGGA	2	8	534289	534296	25 %	25 %	50 %	0 %	325970332
10507	NC_015152	CCT	2	6	534301	534306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970332
10508	NC_015152	TGC	2	6	534353	534358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970332
10509	NC_015152	GTT	2	6	534366	534371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970332
10510	NC_015152	CCGATA	2	12	534376	534387	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325970332
10511	NC_015152	TG	3	6	534391	534396	0 %	50 %	50 %	0 %	325970332
10512	NC_015152	TGGAT	2	10	534460	534469	20 %	40 %	40 %	0 %	325970332
10513	NC_015152	TCT	2	6	534479	534484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970332
10514	NC_015152	CAC	2	6	534555	534560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970332
10515	NC_015152	CATG	2	8	534638	534645	25 %	25 %	25 %	25 %	325970332
10516	NC_015152	AGC	2	6	534822	534827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970332
10517	NC_015152	GAG	2	6	534837	534842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970332
10518	NC_015152	TTC	2	6	534864	534869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970332
10519	NC_015152	AGA	2	6	534887	534892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970332
10520	NC_015152	GAG	2	6	534944	534949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970332
10521	NC_015152	AGC	2	6	534997	535002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970332
10522	NC_015152	TCC	2	6	535004	535009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970332
10523	NC_015152	CTT	2	6	535032	535037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970332
10524	NC_015152	TTG	2	6	535081	535086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970332
10525	NC_015152	GAT	2	6	535115	535120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970332
10526	NC_015152	CTA	2	6	535148	535153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970332
10527	NC_015152	GTT	2	6	535163	535168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970332
10528	NC_015152	TCT	2	6	535232	535237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970333
10529	NC_015152	TCC	3	9	535352	535360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970333
10530	NC_015152	TTC	2	6	535390	535395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970333
10531	NC_015152	TGA	2	6	535417	535422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970333
10532	NC_015152	GGA	2	6	535444	535449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970333
10533	NC_015152	TGG	2	6	535478	535483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970333
10534	NC_015152	CTC	2	6	535612	535617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970333
10535	NC_015152	AAC	2	6	535619	535624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970333
10536	NC_015152	AGG	2	6	535748	535753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970333
10537	NC_015152	T	7	7	535765	535771	0 %	100 %	0 %	0 %	325970333
10538	NC_015152	TTG	2	6	535829	535834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970333
10539	NC_015152	TCAAT	2	10	535905	535914	40 %	40 %	0 %	20 %	325970333
10540	NC_015152	CCG	2	6	535930	535935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970333
10541	NC_015152	AG	3	6	535956	535961	50 %	0 %	50 %	0 %	325970333
10542	NC_015152	CAATC	2	10	535987	535996	40 %	20 %	0 %	40 %	325970333
10543	NC_015152	TAC	2	6	536024	536029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_015152	CAT	2	6	536040	536045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_015152	GTTCA	2	10	536066	536075	20 %	40 %	20 %	20 %	325970334
10546	NC_015152	TGCA	2	8	536094	536101	25 %	25 %	25 %	25 %	325970334
10547	NC_015152	CCA	2	6	536150	536155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970334
10548	NC_015152	CCTG	2	8	536251	536258	0 %	25 %	25 %	50 %	325970334
10549	NC_015152	AAC	2	6	536291	536296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970334
10550	NC_015152	GGAA	2	8	536323	536330	50 %	0 %	50 %	0 %	325970334
10551	NC_015152	TAT	2	6	536376	536381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970334
10552	NC_015152	GCA	2	6	536386	536391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970334
10553	NC_015152	CGGA	2	8	536400	536407	25 %	0 %	50 %	25 %	325970334
10554	NC_015152	TCC	2	6	536415	536420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970334
10555	NC_015152	AGG	2	6	536425	536430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970334
10556	NC_015152	CT	3	6	536549	536554	0 %	50 %	0 %	50 %	325970334
10557	NC_015152	CAA	2	6	536585	536590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970334
10558	NC_015152	CTT	2	6	536683	536688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970334
10559	NC_015152	TCA	2	6	536689	536694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970334
10560	NC_015152	CA	3	6	536722	536727	50 %	0 %	0 %	50 %	325970334
10561	NC_015152	GTT	2	6	536775	536780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970334
10562	NC_015152	CTT	2	6	536805	536810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970334
10563	NC_015152	GGACA	2	10	536907	536916	40 %	0 %	40 %	20 %	325970334
10564	NC_015152	GGA	2	6	536921	536926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970334
10565	NC_015152	CTGC	2	8	537005	537012	0 %	25 %	25 %	50 %	325970334
10566	NC_015152	ACC	2	6	537019	537024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970334
10567	NC_015152	GGA	2	6	537071	537076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970334
10568	NC_015152	TGA	2	6	537149	537154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970334
10569	NC_015152	TGC	2	6	537163	537168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970334
10570	NC_015152	TTC	2	6	537256	537261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970334
10571	NC_015152	GGTC	2	8	537292	537299	0 %	25 %	50 %	25 %	325970334
10572	NC_015152	TGA	2	6	537320	537325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970334
10573	NC_015152	TCT	2	6	537342	537347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970334
10574	NC_015152	CCT	2	6	537352	537357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970334
10575	NC_015152	GCTT	2	8	537444	537451	0 %	50 %	25 %	25 %	325970334
10576	NC_015152	TAC	2	6	537474	537479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970334
10577	NC_015152	GGTGCA	2	12	537564	537575	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325970334
10578	NC_015152	AGC	2	6	537640	537645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970334
10579	NC_015152	TGC	2	6	537655	537660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970334
10580	NC_015152	CCG	2	6	537776	537781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970334
10581	NC_015152	AAG	2	6	537786	537791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970334
10582	NC_015152	AAGG	2	8	537838	537845	50 %	0 %	50 %	0 %	325970334
10583	NC_015152	AAT	2	6	537871	537876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970335
10584	NC_015152	GCT	2	6	537919	537924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970335
10585	NC_015152	TG	3	6	537951	537956	0 %	50 %	50 %	0 %	325970335
10586	NC_015152	A	6	6	537969	537974	100 %	0 %	0 %	0 %	325970335
10587	NC_015152	GGA	2	6	538021	538026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970335
10588	NC_015152	ATC	2	6	538029	538034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970335
10589	NC_015152	GAT	2	6	538049	538054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970335
10590	NC_015152	TGCC	2	8	538073	538080	0 %	25 %	25 %	50 %	325970335
10591	NC_015152	TCCT	2	8	538081	538088	0 %	50 %	0 %	50 %	325970335
10592	NC_015152	TCT	2	6	538114	538119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970335
10593	NC_015152	GGCA	2	8	538120	538127	25 %	0 %	50 %	25 %	325970335
10594	NC_015152	CTCC	2	8	538155	538162	0 %	25 %	0 %	75 %	325970335
10595	NC_015152	TGA	2	6	538179	538184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970335
10596	NC_015152	A	6	6	538197	538202	100 %	0 %	0 %	0 %	325970335
10597	NC_015152	GAG	2	6	538274	538279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970335
10598	NC_015152	TTG	2	6	538298	538303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970335
10599	NC_015152	TGG	2	6	538322	538327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970335
10600	NC_015152	TGG	2	6	538352	538357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970335
10601	NC_015152	TGT	2	6	538425	538430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970335
10602	NC_015152	GCT	2	6	538432	538437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970335
10603	NC_015152	TCCCTT	2	12	538508	538519	0 %	50 %	0 %	50 %	325970335
10604	NC_015152	ATG	2	6	538569	538574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970335
10605	NC_015152	TTC	2	6	538586	538591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970335
10606	NC_015152	CAAA	2	8	538642	538649	75 %	0 %	0 %	25 %	325970335
10607	NC_015152	TCA	2	6	538830	538835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970335
10608	NC_015152	GAT	2	6	538892	538897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970335
10609	NC_015152	AAG	2	6	538946	538951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970335
10610	NC_015152	GGA	2	6	538972	538977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970335
10611	NC_015152	CTTT	2	8	539066	539073	0 %	75 %	0 %	25 %	325970336
10612	NC_015152	ACT	2	6	539098	539103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970336
10613	NC_015152	CTC	2	6	539133	539138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970336
10614	NC_015152	CTT	2	6	539139	539144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970336
10615	NC_015152	TC	3	6	539162	539167	0 %	50 %	0 %	50 %	325970336
10616	NC_015152	CCA	2	6	539196	539201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970336
10617	NC_015152	GCA	2	6	539371	539376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970336
10618	NC_015152	TGGTG	2	10	539432	539441	0 %	40 %	60 %	0 %	325970336
10619	NC_015152	GCAG	2	8	539554	539561	25 %	0 %	50 %	25 %	325970336
10620	NC_015152	CTT	2	6	539582	539587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970336
10621	NC_015152	CT	3	6	539722	539727	0 %	50 %	0 %	50 %	325970336
10622	NC_015152	ACG	2	6	539733	539738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970336
10623	NC_015152	TCC	2	6	539783	539788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10624	NC_015152	CAG	2	6	539824	539829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10661	NC_015152	AG	3	6	541739	541744	50 %	0 %	50 %	0 %	325970339
10662	NC_015152	TA	3	6	541754	541759	50 %	50 %	0 %	0 %	325970339
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10728	NC_015152	ATG	2	6	545135	545140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10730	NC_015152	TTTCT	2	10	545194	545203	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10731	NC_015152	CTT	2	6	545220	545225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970343
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10733	NC_015152	ATCT	2	8	545290	545297	25 %	50 %	0 %	25 %	325970343
10734	NC_015152	GAT	2	6	545391	545396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970343
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10736	NC_015152	CATTGG	2	12	545484	545495	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325970343
10737	NC_015152	GAT	2	6	545499	545504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970343
10738	NC_015152	TGC	3	9	545550	545558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970343
10739	NC_015152	TGC	2	6	545619	545624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970343
10740	NC_015152	TAT	2	6	545634	545639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970343
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10861	NC_015152	GCA	2	6	552868	552873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970351
10862	NC_015152	GGC	2	6	552880	552885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970351
10863	NC_015152	GAA	2	6	552898	552903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970351
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10870	NC_015152	CTG	2	6	553270	553275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970352
10871	NC_015152	TTGT	2	8	553292	553299	0 %	75 %	25 %	0 %	325970352
10872	NC_015152	ATG	2	6	553301	553306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970352
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10880	NC_015152	CTG	2	6	553663	553668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970352
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10926	NC_015152	AG	3	6	555376	555381	50 %	0 %	50 %	0 %	325970354
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10937	NC_015152	TTA	2	6	555990	555995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10938	NC_015152	TAA	2	6	556002	556007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10939	NC_015152	ATT	2	6	556033	556038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10942	NC_015152	TGCAA	2	10	556156	556165	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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10962	NC_015152	GAAG	2	8	557186	557193	50 %	0 %	50 %	0 %	325970355
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10968	NC_015152	TC	3	6	557505	557510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10969	NC_015152	TCA	2	6	557544	557549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10974	NC_015152	A	6	6	557788	557793	100 %	0 %	0 %	0 %	325970356
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10978	NC_015152	CTT	2	6	557956	557961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970356
10979	NC_015152	CAT	2	6	558019	558024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970356
10980	NC_015152	CTG	2	6	558076	558081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970356
10981	NC_015152	ATC	2	6	558104	558109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970356
10982	NC_015152	CAT	2	6	558283	558288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970356
10983	NC_015152	GTG	2	6	558306	558311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970356
10984	NC_015152	TCA	2	6	558399	558404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970356
10985	NC_015152	GAGG	2	8	558448	558455	25 %	0 %	75 %	0 %	325970356
10986	NC_015152	A	6	6	558468	558473	100 %	0 %	0 %	0 %	325970357
10987	NC_015152	TATC	2	8	558506	558513	25 %	50 %	0 %	25 %	325970357
10988	NC_015152	ATG	2	6	558597	558602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970357
10989	NC_015152	GAA	2	6	558620	558625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970357
10990	NC_015152	TCA	2	6	558679	558684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970357
10991	NC_015152	GTG	2	6	558706	558711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970357
10992	NC_015152	CT	3	6	558734	558739	0 %	50 %	0 %	50 %	325970357
10993	NC_015152	TTCT	2	8	558789	558796	0 %	75 %	0 %	25 %	325970357
10994	NC_015152	GTT	2	6	558798	558803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970357
10995	NC_015152	ATG	2	6	558810	558815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970357
10996	NC_015152	ACC	2	6	558828	558833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970357
10997	NC_015152	TTC	2	6	558948	558953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970357
10998	NC_015152	TGA	2	6	558974	558979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970357
10999	NC_015152	TGG	2	6	558995	559000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970357
11000	NC_015152	CT	3	6	559036	559041	0 %	50 %	0 %	50 %	325970357

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