MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 63687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_015152	AGA	2	6	2931941	2931946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972511
56002	NC_015152	GCGA	2	8	2931956	2931963	25 %	0 %	50 %	25 %	325972511
56003	NC_015152	AG	4	8	2931976	2931983	50 %	0 %	50 %	0 %	325972511
56004	NC_015152	GTT	2	6	2932009	2932014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972511
56005	NC_015152	AAT	2	6	2932072	2932077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972511
56006	NC_015152	CCA	2	6	2932095	2932100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972511
56007	NC_015152	TCG	2	6	2932163	2932168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972511
56008	NC_015152	CA	3	6	2932212	2932217	50 %	0 %	0 %	50 %	325972511
56009	NC_015152	GAT	2	6	2932258	2932263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972511
56010	NC_015152	GAT	2	6	2932294	2932299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972511
56011	NC_015152	AGG	2	6	2932342	2932347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972511
56012	NC_015152	AAG	2	6	2932349	2932354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972511
56013	NC_015152	TGG	2	6	2932356	2932361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972511
56014	NC_015152	ATTG	2	8	2932506	2932513	25 %	50 %	25 %	0 %	325972511
56015	NC_015152	CTT	2	6	2932565	2932570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972511
56016	NC_015152	GAC	2	6	2932597	2932602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972511
56017	NC_015152	CAA	2	6	2932656	2932661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972511
56018	NC_015152	ATG	2	6	2932711	2932716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56019	NC_015152	GAA	2	6	2932761	2932766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56020	NC_015152	T	6	6	2932811	2932816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56021	NC_015152	GAG	2	6	2932957	2932962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56022	NC_015152	GAA	2	6	2932971	2932976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972512
56023	NC_015152	AGCAGG	2	12	2933189	2933200	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325972512
56024	NC_015152	CGG	2	6	2933207	2933212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972512
56025	NC_015152	CCA	2	6	2933621	2933626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972512
56026	NC_015152	CCATCA	2	12	2933657	2933668	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325972512
56027	NC_015152	CAA	2	6	2933734	2933739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972512
56028	NC_015152	AGGCTG	2	12	2933801	2933812	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325972512
56029	NC_015152	TAG	2	6	2933816	2933821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972512
56030	NC_015152	TTC	2	6	2933824	2933829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972512
56031	NC_015152	GCT	2	6	2933953	2933958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972512
56032	NC_015152	CTGC	2	8	2933990	2933997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56033	NC_015152	TCT	2	6	2934006	2934011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56034	NC_015152	ACCA	2	8	2934028	2934035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56035	NC_015152	TTAT	2	8	2934052	2934059	25 %	75 %	0 %	0 %	325972513
56036	NC_015152	AG	3	6	2934061	2934066	50 %	0 %	50 %	0 %	325972513
56037	NC_015152	CCG	2	6	2934089	2934094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972513
56038	NC_015152	TCT	2	6	2934101	2934106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972513
56039	NC_015152	TTC	2	6	2934133	2934138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972513
56040	NC_015152	GGTC	2	8	2934200	2934207	0 %	25 %	50 %	25 %	325972513
56041	NC_015152	CTG	2	6	2934304	2934309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972513
56042	NC_015152	CTG	2	6	2934316	2934321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972513
56043	NC_015152	ATC	3	9	2934322	2934330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972513
56044	NC_015152	CCT	2	6	2934353	2934358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972513
56045	NC_015152	CTT	2	6	2934369	2934374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972513
56046	NC_015152	TCC	2	6	2934443	2934448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972513
56047	NC_015152	CAT	2	6	2934453	2934458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972513
56048	NC_015152	GGA	2	6	2934483	2934488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972513
56049	NC_015152	GCT	2	6	2934543	2934548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972513
56050	NC_015152	TCA	2	6	2934580	2934585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972514
56051	NC_015152	TGCT	2	8	2934640	2934647	0 %	50 %	25 %	25 %	325972514
56052	NC_015152	CTG	2	6	2934663	2934668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972514
56053	NC_015152	GTC	2	6	2934693	2934698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972514
56054	NC_015152	TCA	2	6	2934733	2934738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972514
56055	NC_015152	GAT	2	6	2934797	2934802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972514
56056	NC_015152	GAA	2	6	2934829	2934834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972514
56057	NC_015152	ATTGAA	2	12	2934930	2934941	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325972514
56058	NC_015152	C	6	6	2935019	2935024	0 %	0 %	0 %	100 %	325972514
56059	NC_015152	CTC	2	6	2935055	2935060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972514
56060	NC_015152	GGC	2	6	2935086	2935091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972514
56061	NC_015152	TGA	2	6	2935123	2935128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972514
56062	NC_015152	CTG	2	6	2935245	2935250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972514
56063	NC_015152	CCGA	2	8	2935278	2935285	25 %	0 %	25 %	50 %	325972514
56064	NC_015152	CAT	3	9	2935313	2935321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972514
56065	NC_015152	CAT	2	6	2935406	2935411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972514
56066	NC_015152	CCA	2	6	2935423	2935428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972514
56067	NC_015152	TCA	2	6	2935429	2935434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972514
56068	NC_015152	TCG	2	6	2935441	2935446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972514
56069	NC_015152	GCC	2	6	2935461	2935466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972514
56070	NC_015152	CAG	2	6	2935496	2935501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972514
56071	NC_015152	ATCCTG	2	12	2935536	2935547	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325972514
56072	NC_015152	CCA	2	6	2935567	2935572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972514
56073	NC_015152	CAT	2	6	2935592	2935597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972514
56074	NC_015152	ATG	2	6	2935662	2935667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972514
56075	NC_015152	CCG	2	6	2935683	2935688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972514
56076	NC_015152	TGC	2	6	2935696	2935701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972514
56077	NC_015152	TCA	2	6	2935705	2935710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972514
56078	NC_015152	GCA	2	6	2935836	2935841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972514
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56080	NC_015152	ACA	2	6	2935921	2935926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972515
56081	NC_015152	TTCT	2	8	2936019	2936026	0 %	75 %	0 %	25 %	325972515
56082	NC_015152	CAA	2	6	2936031	2936036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972515
56083	NC_015152	CGT	2	6	2936060	2936065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972515
56084	NC_015152	AC	3	6	2936105	2936110	50 %	0 %	0 %	50 %	325972515
56085	NC_015152	CGA	2	6	2936114	2936119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972515
56086	NC_015152	GTG	2	6	2936175	2936180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972515
56087	NC_015152	CAACGC	2	12	2936228	2936239	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325972515
56088	NC_015152	CGA	2	6	2936318	2936323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972515
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56090	NC_015152	GGGC	2	8	2936836	2936843	0 %	0 %	75 %	25 %	325972516
56091	NC_015152	GCTACG	2	12	2936886	2936897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325972516
56092	NC_015152	CTG	2	6	2936948	2936953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972516
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56100	NC_015152	ATC	2	6	2937296	2937301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972516
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56103	NC_015152	GAA	2	6	2937394	2937399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972516
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56105	NC_015152	CAA	2	6	2937509	2937514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972516
56106	NC_015152	ATG	2	6	2937575	2937580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56107	NC_015152	AGG	2	6	2937590	2937595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56108	NC_015152	CAGC	2	8	2937639	2937646	25 %	0 %	25 %	50 %	325972517
56109	NC_015152	GAA	2	6	2937664	2937669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972517
56110	NC_015152	TC	3	6	2937675	2937680	0 %	50 %	0 %	50 %	325972517
56111	NC_015152	GAA	2	6	2937807	2937812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972517
56112	NC_015152	CAT	2	6	2937873	2937878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972517
56113	NC_015152	CGA	2	6	2937900	2937905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972517
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56115	NC_015152	ATCGCC	2	12	2938066	2938077	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325972517
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56232	NC_015152	A	7	7	2943397	2943403	100 %	0 %	0 %	0 %	325972522
56233	NC_015152	TGC	2	6	2943470	2943475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972522
56234	NC_015152	AAG	2	6	2943515	2943520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972522
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56246	NC_015152	CCAA	2	8	2943973	2943980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56247	NC_015152	GTT	2	6	2944000	2944005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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56346	NC_015152	TA	3	6	2948454	2948459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56347	NC_015152	AGTA	2	8	2948460	2948467	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56348	NC_015152	T	6	6	2948474	2948479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56349	NC_015152	TAT	3	9	2948495	2948503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56350	NC_015152	ATAA	2	8	2948573	2948580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56351	NC_015152	CATC	2	8	2948599	2948606	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56352	NC_015152	CGC	2	6	2948713	2948718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972528
56353	NC_015152	GGAG	2	8	2948729	2948736	25 %	0 %	75 %	0 %	325972528
56354	NC_015152	A	6	6	2948744	2948749	100 %	0 %	0 %	0 %	325972528
56355	NC_015152	ATC	3	9	2948804	2948812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972528
56356	NC_015152	AACCC	2	10	2948823	2948832	40 %	0 %	0 %	60 %	325972528
56357	NC_015152	GGC	2	6	2948906	2948911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972528
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56359	NC_015152	ATC	2	6	2948978	2948983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972528
56360	NC_015152	GCCC	2	8	2948998	2949005	0 %	0 %	25 %	75 %	325972528
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56364	NC_015152	GCC	2	6	2949338	2949343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972528
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56368	NC_015152	TCT	2	6	2949824	2949829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56369	NC_015152	CTA	2	6	2949837	2949842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56370	NC_015152	GCAAG	2	10	2949870	2949879	40 %	0 %	40 %	20 %	325972529
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56373	NC_015152	GCT	2	6	2949994	2949999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972529
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56382	NC_015152	AGC	2	6	2950471	2950476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972529
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56387	NC_015152	CTG	2	6	2950635	2950640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972529
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56396	NC_015152	CA	3	6	2951159	2951164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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56399	NC_015152	CATG	2	8	2951267	2951274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56400	NC_015152	CAT	2	6	2951314	2951319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972530
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56404	NC_015152	TCTCT	2	10	2951502	2951511	0 %	60 %	0 %	40 %	325972530
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56414	NC_015152	TGA	2	6	2951837	2951842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972532
56415	NC_015152	GA	3	6	2951841	2951846	50 %	0 %	50 %	0 %	325972532
56416	NC_015152	CCTGC	2	10	2951890	2951899	0 %	20 %	20 %	60 %	325972532
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56421	NC_015152	TGC	2	6	2952135	2952140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972532
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56424	NC_015152	T	6	6	2952355	2952360	0 %	100 %	0 %	0 %	325972532
56425	NC_015152	ATTGGA	2	12	2952467	2952478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972532
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56428	NC_015152	ACC	2	6	2952629	2952634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972532
56429	NC_015152	TGA	2	6	2952655	2952660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972532
56430	NC_015152	ATG	2	6	2952684	2952689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972532
56431	NC_015152	GTA	2	6	2952728	2952733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56432	NC_015152	TACT	2	8	2952753	2952760	25 %	50 %	0 %	25 %	325972533
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56434	NC_015152	CGAT	2	8	2952934	2952941	25 %	25 %	25 %	25 %	325972533
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56452	NC_015152	CTG	2	6	2954321	2954326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972533
56453	NC_015152	GTTCT	2	10	2954353	2954362	0 %	60 %	20 %	20 %	325972533
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56455	NC_015152	CCG	2	6	2954443	2954448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972533
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56457	NC_015152	TTC	2	6	2954617	2954622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56458	NC_015152	T	8	8	2954656	2954663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56459	NC_015152	AAT	2	6	2954789	2954794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972534
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56461	NC_015152	TGG	2	6	2954881	2954886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972534
56462	NC_015152	GTC	2	6	2954947	2954952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972534
56463	NC_015152	TTG	2	6	2954988	2954993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972534
56464	NC_015152	TC	3	6	2955068	2955073	0 %	50 %	0 %	50 %	325972534
56465	NC_015152	GAG	2	6	2955119	2955124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972534
56466	NC_015152	CTT	2	6	2955157	2955162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972534
56467	NC_015152	GAA	2	6	2955175	2955180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972534
56468	NC_015152	CAT	2	6	2955242	2955247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972534
56469	NC_015152	CCT	2	6	2955267	2955272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56470	NC_015152	GCAA	2	8	2955357	2955364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56471	NC_015152	CCTC	2	8	2955392	2955399	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56472	NC_015152	CAAC	2	8	2955564	2955571	50 %	0 %	0 %	50 %	325972535
56473	NC_015152	CAGG	2	8	2955598	2955605	25 %	0 %	50 %	25 %	325972535
56474	NC_015152	TGA	2	6	2955655	2955660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972535
56475	NC_015152	TCG	2	6	2955744	2955749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972535
56476	NC_015152	TTCCC	2	10	2955767	2955776	0 %	40 %	0 %	60 %	325972535
56477	NC_015152	GCA	2	6	2955789	2955794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972535
56478	NC_015152	GAG	2	6	2955884	2955889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972535
56479	NC_015152	AGC	2	6	2955987	2955992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972535
56480	NC_015152	GCG	2	6	2956014	2956019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972535
56481	NC_015152	GGT	2	6	2956113	2956118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972535
56482	NC_015152	GAAG	2	8	2956196	2956203	50 %	0 %	50 %	0 %	325972535
56483	NC_015152	CGC	2	6	2956231	2956236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972535
56484	NC_015152	TTA	2	6	2956240	2956245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972535
56485	NC_015152	GAA	2	6	2956277	2956282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972535
56486	NC_015152	TCT	2	6	2956305	2956310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972535
56487	NC_015152	CAGA	2	8	2956315	2956322	50 %	0 %	25 %	25 %	325972535
56488	NC_015152	CAG	2	6	2956323	2956328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972535
56489	NC_015152	GAA	2	6	2956347	2956352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972535
56490	NC_015152	AAGGC	2	10	2956452	2956461	40 %	0 %	40 %	20 %	325972535
56491	NC_015152	ATC	2	6	2956565	2956570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972535
56492	NC_015152	ACCT	2	8	2956626	2956633	25 %	25 %	0 %	50 %	325972535
56493	NC_015152	TCC	2	6	2956634	2956639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972535
56494	NC_015152	GCC	2	6	2956680	2956685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972535
56495	NC_015152	A	6	6	2956729	2956734	100 %	0 %	0 %	0 %	325972535
56496	NC_015152	CT	3	6	2956776	2956781	0 %	50 %	0 %	50 %	325972535
56497	NC_015152	TCAG	2	8	2956869	2956876	25 %	25 %	25 %	25 %	325972535
56498	NC_015152	GAT	2	6	2956940	2956945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972535
56499	NC_015152	CT	3	6	2956958	2956963	0 %	50 %	0 %	50 %	325972535
56500	NC_015152	TTC	2	6	2957021	2957026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972535

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