MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 63687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_015152	TTG	2	6	2905589	2905594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972490
55502	NC_015152	AAC	2	6	2905652	2905657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972490
55503	NC_015152	GGT	2	6	2905819	2905824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972490
55504	NC_015152	GGC	2	6	2905870	2905875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972490
55505	NC_015152	CCAT	2	8	2905883	2905890	25 %	25 %	0 %	50 %	325972490
55506	NC_015152	ATC	2	6	2905996	2906001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972490
55507	NC_015152	CAT	3	9	2906037	2906045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972490
55508	NC_015152	CGA	2	6	2906046	2906051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972490
55509	NC_015152	T	6	6	2906076	2906081	0 %	100 %	0 %	0 %	325972491
55510	NC_015152	TCT	2	6	2906110	2906115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972491
55511	NC_015152	CCG	2	6	2906153	2906158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972491
55512	NC_015152	AT	3	6	2906163	2906168	50 %	50 %	0 %	0 %	325972491
55513	NC_015152	TC	3	6	2906195	2906200	0 %	50 %	0 %	50 %	325972491
55514	NC_015152	CAT	2	6	2906225	2906230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972491
55515	NC_015152	CCT	3	9	2906431	2906439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972491
55516	NC_015152	GCT	2	6	2906473	2906478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972491
55517	NC_015152	CGC	2	6	2906539	2906544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972491
55518	NC_015152	CTC	2	6	2906639	2906644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972491
55519	NC_015152	GCT	2	6	2906656	2906661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972491
55520	NC_015152	AGC	2	6	2906679	2906684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972491
55521	NC_015152	CTC	2	6	2906690	2906695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972491
55522	NC_015152	TCC	2	6	2906697	2906702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972491
55523	NC_015152	AAT	2	6	2906811	2906816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972491
55524	NC_015152	CAA	2	6	2907011	2907016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972491
55525	NC_015152	AAAAC	2	10	2907019	2907028	80 %	0 %	0 %	20 %	325972491
55526	NC_015152	CAA	2	6	2907074	2907079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972491
55527	NC_015152	CGA	2	6	2907083	2907088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972491
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55529	NC_015152	TGC	2	6	2907175	2907180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972492
55530	NC_015152	AG	3	6	2907239	2907244	50 %	0 %	50 %	0 %	325972492
55531	NC_015152	GTA	2	6	2907281	2907286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972492
55532	NC_015152	GAA	2	6	2907325	2907330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972492
55533	NC_015152	TGG	2	6	2907400	2907405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972492
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55535	NC_015152	GC	3	6	2907521	2907526	0 %	0 %	50 %	50 %	325972492
55536	NC_015152	AG	3	6	2907554	2907559	50 %	0 %	50 %	0 %	325972492
55537	NC_015152	CAA	2	6	2907563	2907568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972492
55538	NC_015152	AAGC	2	8	2907571	2907578	50 %	0 %	25 %	25 %	325972492
55539	NC_015152	ACT	2	6	2907630	2907635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972492
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55541	NC_015152	CAG	2	6	2907776	2907781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972492
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55543	NC_015152	GA	3	6	2907787	2907792	50 %	0 %	50 %	0 %	325972492
55544	NC_015152	GCT	2	6	2907796	2907801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972492
55545	NC_015152	TGT	2	6	2907810	2907815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972492
55546	NC_015152	TCC	2	6	2907846	2907851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972493
55547	NC_015152	AGC	2	6	2907872	2907877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972493
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55551	NC_015152	AGC	2	6	2908112	2908117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972493
55552	NC_015152	CAA	2	6	2908126	2908131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972493
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55554	NC_015152	AGT	2	6	2908207	2908212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972493
55555	NC_015152	A	6	6	2908238	2908243	100 %	0 %	0 %	0 %	325972493
55556	NC_015152	AGT	2	6	2908470	2908475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972493
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55562	NC_015152	GCT	2	6	2908628	2908633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972494
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55565	NC_015152	CTTC	2	8	2908742	2908749	0 %	50 %	0 %	50 %	325972494
55566	NC_015152	CAG	2	6	2908764	2908769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972494
55567	NC_015152	ACCTCG	2	12	2908801	2908812	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325972494
55568	NC_015152	GAT	2	6	2908866	2908871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972494
55569	NC_015152	ATG	2	6	2908885	2908890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972494
55570	NC_015152	CGCCC	2	10	2908950	2908959	0 %	0 %	20 %	80 %	325972494
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55574	NC_015152	GAT	2	6	2909355	2909360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972494
55575	NC_015152	GTC	2	6	2909374	2909379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972494
55576	NC_015152	AAC	2	6	2909438	2909443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972494
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55578	NC_015152	ACTT	2	8	2909572	2909579	25 %	50 %	0 %	25 %	325972495
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55583	NC_015152	CT	3	6	2909954	2909959	0 %	50 %	0 %	50 %	325972495
55584	NC_015152	TTTGT	2	10	2909960	2909969	0 %	80 %	20 %	0 %	325972495
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55586	NC_015152	TTTCC	2	10	2910042	2910051	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
55587	NC_015152	CCAAA	2	10	2910091	2910100	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
55588	NC_015152	A	6	6	2910176	2910181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55589	NC_015152	TGT	2	6	2910225	2910230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55590	NC_015152	GCT	2	6	2910271	2910276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55591	NC_015152	AAC	2	6	2910339	2910344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55592	NC_015152	GGT	2	6	2910357	2910362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55593	NC_015152	CCCA	2	8	2910383	2910390	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
55594	NC_015152	A	6	6	2910414	2910419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55595	NC_015152	GT	3	6	2910516	2910521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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55597	NC_015152	CTT	2	6	2910538	2910543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55598	NC_015152	G	7	7	2910579	2910585	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55599	NC_015152	AGT	2	6	2910587	2910592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55600	NC_015152	CAG	2	6	2910637	2910642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55601	NC_015152	GTT	2	6	2910647	2910652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55602	NC_015152	ACA	2	6	2910660	2910665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55603	NC_015152	CTCC	2	8	2910681	2910688	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55604	NC_015152	ACA	2	6	2910846	2910851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55605	NC_015152	GAT	2	6	2910854	2910859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55606	NC_015152	GGT	2	6	2910998	2911003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55607	NC_015152	CTAC	2	8	2911017	2911024	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55608	NC_015152	CTC	2	6	2911078	2911083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55609	NC_015152	GCC	2	6	2911088	2911093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55610	NC_015152	ACC	2	6	2911116	2911121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55611	NC_015152	TAT	2	6	2911127	2911132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55612	NC_015152	CCT	2	6	2911307	2911312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55613	NC_015152	GCAGA	2	10	2911339	2911348	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55614	NC_015152	CCA	2	6	2911362	2911367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55615	NC_015152	ACC	2	6	2911370	2911375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55616	NC_015152	GGT	2	6	2911452	2911457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55617	NC_015152	TAC	2	6	2911487	2911492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55619	NC_015152	CTG	2	6	2911547	2911552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55740	NC_015152	ACGG	2	8	2917781	2917788	25 %	0 %	50 %	25 %	325972497
55741	NC_015152	CTA	2	6	2917809	2917814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972497
55742	NC_015152	GCT	2	6	2917827	2917832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972497
55743	NC_015152	GTT	3	9	2917857	2917865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972497
55744	NC_015152	CCTTG	2	10	2917911	2917920	0 %	40 %	20 %	40 %	325972497
55745	NC_015152	ATC	2	6	2918035	2918040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972497
55746	NC_015152	G	6	6	2918120	2918125	0 %	0 %	100 %	0 %	325972497
55747	NC_015152	AAACGA	2	12	2918162	2918173	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	325972497
55748	NC_015152	TAA	2	6	2918176	2918181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972497
55749	NC_015152	CGG	2	6	2918188	2918193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972498
55750	NC_015152	GAACC	2	10	2918237	2918246	40 %	0 %	20 %	40 %	325972498
55751	NC_015152	TAC	2	6	2918296	2918301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972498
55752	NC_015152	TGC	2	6	2918483	2918488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972498
55753	NC_015152	CCA	2	6	2918551	2918556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972498
55754	NC_015152	CTG	2	6	2918570	2918575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972498
55755	NC_015152	GTACC	2	10	2918604	2918613	20 %	20 %	20 %	40 %	325972498
55756	NC_015152	CAC	2	6	2918646	2918651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972498
55757	NC_015152	CTG	2	6	2918657	2918662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972498
55758	NC_015152	GTC	2	6	2918690	2918695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972498
55759	NC_015152	AGT	2	6	2918725	2918730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972498
55760	NC_015152	TACC	2	8	2918890	2918897	25 %	25 %	0 %	50 %	325972498
55761	NC_015152	CATT	2	8	2918952	2918959	25 %	50 %	0 %	25 %	325972499
55762	NC_015152	T	6	6	2918984	2918989	0 %	100 %	0 %	0 %	325972499
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55764	NC_015152	CTGT	2	8	2919114	2919121	0 %	50 %	25 %	25 %	325972499
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55769	NC_015152	CTTT	2	8	2919580	2919587	0 %	75 %	0 %	25 %	325972499
55770	NC_015152	GCG	2	6	2919693	2919698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972499
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55773	NC_015152	T	6	6	2919772	2919777	0 %	100 %	0 %	0 %	325972499
55774	NC_015152	AGT	2	6	2919953	2919958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972500
55775	NC_015152	ATAATG	2	12	2920075	2920086	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325972500
55776	NC_015152	CAA	2	6	2920209	2920214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972500
55777	NC_015152	TGC	2	6	2920287	2920292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972500
55778	NC_015152	AGA	2	6	2920348	2920353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972500
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55787	NC_015152	TGC	2	6	2920674	2920679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972501
55788	NC_015152	AGG	2	6	2920699	2920704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972501
55789	NC_015152	TCC	2	6	2920715	2920720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972501
55790	NC_015152	CAGA	2	8	2920924	2920931	50 %	0 %	25 %	25 %	325972501
55791	NC_015152	CAGG	2	8	2920965	2920972	25 %	0 %	50 %	25 %	325972501
55792	NC_015152	A	6	6	2921001	2921006	100 %	0 %	0 %	0 %	325972501
55793	NC_015152	GAT	2	6	2921012	2921017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972501
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55797	NC_015152	CAAT	2	8	2921267	2921274	50 %	25 %	0 %	25 %	325972502
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55801	NC_015152	TCG	2	6	2921554	2921559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972502
55802	NC_015152	ATC	2	6	2921700	2921705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972502
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55807	NC_015152	GCC	2	6	2922034	2922039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972502
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55811	NC_015152	CAT	2	6	2922311	2922316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972502
55812	NC_015152	TAG	2	6	2922451	2922456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972502
55813	NC_015152	GTA	2	6	2922477	2922482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972502
55814	NC_015152	TTTC	2	8	2922492	2922499	0 %	75 %	0 %	25 %	325972502
55815	NC_015152	CCG	2	6	2922598	2922603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972502
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55817	NC_015152	AAT	2	6	2922752	2922757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55818	NC_015152	CATC	2	8	2922761	2922768	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55819	NC_015152	AAG	2	6	2922775	2922780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55820	NC_015152	GGAT	2	8	2923115	2923122	25 %	25 %	50 %	0 %	325972503
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55823	NC_015152	TGC	2	6	2923281	2923286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972503
55824	NC_015152	AGT	2	6	2923293	2923298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972503
55825	NC_015152	GGT	2	6	2923302	2923307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972503
55826	NC_015152	CCTT	2	8	2923387	2923394	0 %	50 %	0 %	50 %	325972504
55827	NC_015152	TCT	2	6	2923466	2923471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972504
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55838	NC_015152	CAA	2	6	2924253	2924258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972504
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55842	NC_015152	CAG	2	6	2924367	2924372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972504
55843	NC_015152	TTG	2	6	2924384	2924389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972504
55844	NC_015152	CTG	3	9	2924497	2924505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972504
55845	NC_015152	GCAG	2	8	2924513	2924520	25 %	0 %	50 %	25 %	325972504
55846	NC_015152	AGA	2	6	2924645	2924650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972504
55847	NC_015152	CT	3	6	2924665	2924670	0 %	50 %	0 %	50 %	325972504
55848	NC_015152	AAG	2	6	2924687	2924692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972505
55849	NC_015152	CTT	2	6	2924704	2924709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972505
55850	NC_015152	CTA	2	6	2924735	2924740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972505
55851	NC_015152	CGTT	2	8	2924773	2924780	0 %	50 %	25 %	25 %	325972505
55852	NC_015152	GTG	3	9	2924810	2924818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972505
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55854	NC_015152	TGC	2	6	2924892	2924897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972505
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55857	NC_015152	GTACT	2	10	2925030	2925039	20 %	40 %	20 %	20 %	325972505
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55967	NC_015152	AC	3	6	2930811	2930816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55968	NC_015152	TGC	2	6	2930859	2930864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972511
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55974	NC_015152	TTCC	2	8	2931084	2931091	0 %	50 %	0 %	50 %	325972511
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