MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 63687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_015152	CTG	2	6	2775769	2775774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972370
53003	NC_015152	AAGG	2	8	2775897	2775904	50 %	0 %	50 %	0 %	325972370
53004	NC_015152	TCCG	2	8	2776069	2776076	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53005	NC_015152	CA	3	6	2776095	2776100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53006	NC_015152	AC	3	6	2776107	2776112	50 %	0 %	0 %	50 %	325972371
53007	NC_015152	TCG	2	6	2776161	2776166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972371
53008	NC_015152	GAC	2	6	2776228	2776233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972371
53009	NC_015152	GAAG	2	8	2776295	2776302	50 %	0 %	50 %	0 %	325972371
53010	NC_015152	TTG	3	9	2776320	2776328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972371
53011	NC_015152	AATC	2	8	2776341	2776348	50 %	25 %	0 %	25 %	325972371
53012	NC_015152	TGG	2	6	2776359	2776364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972371
53013	NC_015152	ATC	3	9	2776379	2776387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972371
53014	NC_015152	CCTTG	2	10	2776494	2776503	0 %	40 %	20 %	40 %	325972371
53015	NC_015152	AT	4	8	2776601	2776608	50 %	50 %	0 %	0 %	325972372
53016	NC_015152	TTCT	2	8	2776691	2776698	0 %	75 %	0 %	25 %	325972372
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53019	NC_015152	GAC	2	6	2776819	2776824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972372
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53043	NC_015152	CTTT	2	8	2777919	2777926	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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53067	NC_015152	CATA	2	8	2778786	2778793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53068	NC_015152	GA	3	6	2778827	2778832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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53070	NC_015152	GAG	2	6	2778846	2778851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53077	NC_015152	CGGCAT	2	12	2779090	2779101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325972374
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53112	NC_015152	TAC	2	6	2780867	2780872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972375
53113	NC_015152	TCC	2	6	2780874	2780879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53114	NC_015152	CGA	2	6	2780896	2780901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972376
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53116	NC_015152	GAA	2	6	2781033	2781038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972376
53117	NC_015152	CAG	2	6	2781068	2781073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972376
53118	NC_015152	CCA	2	6	2781104	2781109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972376
53119	NC_015152	ACC	2	6	2781157	2781162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972376
53120	NC_015152	TAC	2	6	2781171	2781176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972376
53121	NC_015152	TCC	2	6	2781232	2781237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972376
53122	NC_015152	AGC	2	6	2781321	2781326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972376
53123	NC_015152	CGG	2	6	2781334	2781339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972376
53124	NC_015152	CAGCAT	2	12	2781363	2781374	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325972376
53125	NC_015152	CAC	2	6	2781379	2781384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972376
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53127	NC_015152	GAA	2	6	2781451	2781456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972376
53128	NC_015152	CTT	2	6	2781507	2781512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972376
53129	NC_015152	GAC	2	6	2781546	2781551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972376
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53132	NC_015152	ATG	2	6	2781709	2781714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972376
53133	NC_015152	AG	3	6	2781757	2781762	50 %	0 %	50 %	0 %	325972376
53134	NC_015152	AAG	2	6	2781799	2781804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972376
53135	NC_015152	CA	3	6	2781811	2781816	50 %	0 %	0 %	50 %	325972376
53136	NC_015152	GAG	2	6	2781837	2781842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972376
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53139	NC_015152	GCG	2	6	2782014	2782019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972376
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53142	NC_015152	CAT	2	6	2782196	2782201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972376
53143	NC_015152	TCT	2	6	2782211	2782216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972376
53144	NC_015152	GCCA	2	8	2782313	2782320	25 %	0 %	25 %	50 %	325972376
53145	NC_015152	ATA	2	6	2782342	2782347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972376
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53151	NC_015152	CAACG	2	10	2782493	2782502	40 %	0 %	20 %	40 %	325972377
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53181	NC_015152	GTAC	2	8	2784398	2784405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53182	NC_015152	GGC	2	6	2784408	2784413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53183	NC_015152	CCTC	2	8	2784432	2784439	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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53187	NC_015152	CCA	2	6	2784616	2784621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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53210	NC_015152	TAGG	2	8	2785607	2785614	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53211	NC_015152	TTGTG	2	10	2785688	2785697	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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53213	NC_015152	CAAG	2	8	2785728	2785735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53214	NC_015152	GAT	2	6	2785777	2785782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53215	NC_015152	T	6	6	2785841	2785846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53216	NC_015152	TTG	2	6	2785854	2785859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53217	NC_015152	TTG	2	6	2785864	2785869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53218	NC_015152	TAT	2	6	2785870	2785875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53219	NC_015152	TACG	2	8	2785910	2785917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53220	NC_015152	AGG	2	6	2785986	2785991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53221	NC_015152	TGC	2	6	2786347	2786352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972379
53222	NC_015152	GAAG	2	8	2786425	2786432	50 %	0 %	50 %	0 %	325972379
53223	NC_015152	TTG	2	6	2786469	2786474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972379
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53226	NC_015152	CTTGGC	2	12	2786681	2786692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972379
53227	NC_015152	CGG	2	6	2786725	2786730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972379
53228	NC_015152	CAC	2	6	2786782	2786787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972379
53229	NC_015152	GTACCC	2	12	2786844	2786855	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325972379
53230	NC_015152	CATGC	2	10	2786858	2786867	20 %	20 %	20 %	40 %	325972379
53231	NC_015152	CGC	2	6	2786908	2786913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972379
53232	NC_015152	TCAA	2	8	2786918	2786925	50 %	25 %	0 %	25 %	325972379
53233	NC_015152	GAT	2	6	2786998	2787003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972379
53234	NC_015152	CGA	2	6	2787121	2787126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972379
53235	NC_015152	ATG	2	6	2787176	2787181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972379
53236	NC_015152	ACC	2	6	2787206	2787211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972379
53237	NC_015152	GGA	2	6	2787235	2787240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972379
53238	NC_015152	ATT	2	6	2787270	2787275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972379
53239	NC_015152	CCA	2	6	2787298	2787303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972379
53240	NC_015152	TGCAGA	2	12	2787420	2787431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325972379
53241	NC_015152	ATG	2	6	2787476	2787481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972379
53242	NC_015152	AGCA	2	8	2787527	2787534	50 %	0 %	25 %	25 %	325972379
53243	NC_015152	A	7	7	2787632	2787638	100 %	0 %	0 %	0 %	325972379
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53246	NC_015152	CCAC	2	8	2787783	2787790	25 %	0 %	0 %	75 %	325972379
53247	NC_015152	TGC	2	6	2787793	2787798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972379
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53250	NC_015152	CAT	2	6	2787898	2787903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972379
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53252	NC_015152	TGA	2	6	2788062	2788067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972379
53253	NC_015152	CGA	2	6	2788158	2788163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972379
53254	NC_015152	GTAT	2	8	2788295	2788302	25 %	50 %	25 %	0 %	325972380
53255	NC_015152	CAA	2	6	2788308	2788313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972380
53256	NC_015152	AACC	2	8	2788322	2788329	50 %	0 %	0 %	50 %	325972380
53257	NC_015152	GAA	2	6	2788336	2788341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972380
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53262	NC_015152	AG	3	6	2788777	2788782	50 %	0 %	50 %	0 %	325972380
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53280	NC_015152	A	7	7	2789795	2789801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53281	NC_015152	CTT	2	6	2789823	2789828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972382
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53288	NC_015152	TC	3	6	2790081	2790086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53289	NC_015152	GTA	2	6	2790089	2790094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53290	NC_015152	CTTC	2	8	2790116	2790123	0 %	50 %	0 %	50 %	325972383
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53344	NC_015152	GAA	2	6	2793267	2793272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972385
53345	NC_015152	TGC	2	6	2793296	2793301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972385
53346	NC_015152	AAGG	2	8	2793358	2793365	50 %	0 %	50 %	0 %	325972385
53347	NC_015152	GTA	2	6	2793403	2793408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972385
53348	NC_015152	AGA	2	6	2793432	2793437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972385
53349	NC_015152	TTC	2	6	2793466	2793471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972385
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53351	NC_015152	TGC	2	6	2793610	2793615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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53468	NC_015152	CTC	2	6	2799647	2799652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972393
53469	NC_015152	GTT	2	6	2799675	2799680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972393
53470	NC_015152	TCA	2	6	2799751	2799756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972393
53471	NC_015152	CCAGG	2	10	2799877	2799886	20 %	0 %	40 %	40 %	325972393
53472	NC_015152	CAT	2	6	2799887	2799892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972393
53473	NC_015152	GAATG	2	10	2799916	2799925	40 %	20 %	40 %	0 %	325972393
53474	NC_015152	GTT	2	6	2799936	2799941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972393
53475	NC_015152	CCTA	2	8	2800051	2800058	25 %	25 %	0 %	50 %	325972393
53476	NC_015152	GCC	2	6	2800080	2800085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972393
53477	NC_015152	TTCG	2	8	2800184	2800191	0 %	50 %	25 %	25 %	325972393
53478	NC_015152	CCA	2	6	2800258	2800263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972393
53479	NC_015152	GCA	2	6	2800314	2800319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972393
53480	NC_015152	GATG	2	8	2800463	2800470	25 %	25 %	50 %	0 %	325972393
53481	NC_015152	AT	3	6	2800505	2800510	50 %	50 %	0 %	0 %	325972394
53482	NC_015152	ATT	2	6	2800601	2800606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972394
53483	NC_015152	CT	5	10	2800727	2800736	0 %	50 %	0 %	50 %	325972394
53484	NC_015152	TTA	2	6	2800801	2800806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972394
53485	NC_015152	CAT	2	6	2800811	2800816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972394
53486	NC_015152	GAA	2	6	2800898	2800903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972394
53487	NC_015152	CAC	2	6	2800988	2800993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972394
53488	NC_015152	CGG	2	6	2801015	2801020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972394
53489	NC_015152	GCC	2	6	2801037	2801042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972394
53490	NC_015152	T	7	7	2801080	2801086	0 %	100 %	0 %	0 %	325972394
53491	NC_015152	AGC	2	6	2801163	2801168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972394
53492	NC_015152	ATC	2	6	2801199	2801204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972394
53493	NC_015152	GTA	2	6	2801265	2801270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972394
53494	NC_015152	TCC	2	6	2801271	2801276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972394
53495	NC_015152	TCA	2	6	2801329	2801334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972394
53496	NC_015152	TG	3	6	2801374	2801379	0 %	50 %	50 %	0 %	325972394
53497	NC_015152	TAT	2	6	2801433	2801438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972394
53498	NC_015152	AAG	2	6	2801502	2801507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972394
53499	NC_015152	CCCA	2	8	2801538	2801545	25 %	0 %	0 %	75 %	325972394
53500	NC_015152	TCT	2	6	2801592	2801597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972395

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