MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 56417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_014925	CCT	2	6	2227607	2227612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319893425
48002	NC_014925	ACG	2	6	2227733	2227738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893425
48003	NC_014925	TC	3	6	2227739	2227744	0 %	50 %	0 %	50 %	319893425
48004	NC_014925	TCT	2	6	2227796	2227801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893425
48005	NC_014925	ATGA	2	8	2227951	2227958	50 %	25 %	25 %	0 %	319893425
48006	NC_014925	TCG	2	6	2228013	2228018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893425
48007	NC_014925	TCA	2	6	2228130	2228135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893425
48008	NC_014925	CAC	2	6	2228191	2228196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893425
48009	NC_014925	GTC	2	6	2228210	2228215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893425
48010	NC_014925	TGTGA	2	10	2228255	2228264	20 %	40 %	40 %	0 %	319893425
48011	NC_014925	TTA	2	6	2228270	2228275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893425
48012	NC_014925	AAC	2	6	2228284	2228289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893425
48013	NC_014925	ACC	2	6	2228296	2228301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893425
48014	NC_014925	GCC	2	6	2228306	2228311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319893425
48015	NC_014925	AC	3	6	2228372	2228377	50 %	0 %	0 %	50 %	319893425
48016	NC_014925	GTT	2	6	2228397	2228402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893425
48017	NC_014925	TCT	2	6	2228498	2228503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893425
48018	NC_014925	CGT	2	6	2228509	2228514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893425
48019	NC_014925	ATA	2	6	2228520	2228525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893425
48020	NC_014925	TTC	2	6	2228548	2228553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893425
48021	NC_014925	TCA	2	6	2228574	2228579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893425
48022	NC_014925	AC	3	6	2228605	2228610	50 %	0 %	0 %	50 %	319893426
48023	NC_014925	CTTT	2	8	2228611	2228618	0 %	75 %	0 %	25 %	319893426
48024	NC_014925	GAT	2	6	2228677	2228682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893426
48025	NC_014925	TTC	2	6	2228777	2228782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893426
48026	NC_014925	ATA	2	6	2228805	2228810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893426
48027	NC_014925	TA	3	6	2228833	2228838	50 %	50 %	0 %	0 %	319893426
48028	NC_014925	CATG	2	8	2228878	2228885	25 %	25 %	25 %	25 %	319893426
48029	NC_014925	CGA	3	9	2228896	2228904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893426
48030	NC_014925	ATA	2	6	2228915	2228920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893426
48031	NC_014925	CGT	2	6	2228999	2229004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893426
48032	NC_014925	ATC	2	6	2229005	2229010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893426
48033	NC_014925	CGT	2	6	2229067	2229072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893426
48034	NC_014925	CAC	2	6	2229086	2229091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893426
48035	NC_014925	CGA	2	6	2229118	2229123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893426
48036	NC_014925	TTCT	2	8	2229214	2229221	0 %	75 %	0 %	25 %	319893427
48037	NC_014925	GAATC	2	10	2229225	2229234	40 %	20 %	20 %	20 %	319893427
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48042	NC_014925	TCA	2	6	2229534	2229539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893427
48043	NC_014925	TCA	2	6	2229632	2229637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893427
48044	NC_014925	TTG	2	6	2229658	2229663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893427
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48047	NC_014925	TCA	2	6	2229714	2229719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893427
48048	NC_014925	TGACT	2	10	2229727	2229736	20 %	40 %	20 %	20 %	319893427
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48050	NC_014925	TAAAA	2	10	2229786	2229795	80 %	20 %	0 %	0 %	319893427
48051	NC_014925	ATG	2	6	2229871	2229876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893427
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48053	NC_014925	TTG	2	6	2229922	2229927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893427
48054	NC_014925	TCA	2	6	2229971	2229976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893427
48055	NC_014925	CGT	2	6	2230018	2230023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893427
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48062	NC_014925	TGAAA	2	10	2230270	2230279	60 %	20 %	20 %	0 %	319893427
48063	NC_014925	ACA	2	6	2230442	2230447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893427
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48065	NC_014925	TGT	2	6	2230471	2230476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893427
48066	NC_014925	CTC	2	6	2230571	2230576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48067	NC_014925	A	6	6	2230594	2230599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48068	NC_014925	TCC	2	6	2230611	2230616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48069	NC_014925	CG	3	6	2230630	2230635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48070	NC_014925	ACC	2	6	2230638	2230643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48071	NC_014925	GTTG	2	8	2230687	2230694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48072	NC_014925	ACT	2	6	2230775	2230780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48074	NC_014925	TGA	2	6	2230895	2230900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48076	NC_014925	TTGA	2	8	2230999	2231006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48077	NC_014925	GATG	2	8	2231018	2231025	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48078	NC_014925	T	6	6	2231146	2231151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48081	NC_014925	A	6	6	2231367	2231372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48082	NC_014925	CAC	2	6	2231373	2231378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48084	NC_014925	GTG	2	6	2231411	2231416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48085	NC_014925	CAATT	2	10	2231465	2231474	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48086	NC_014925	ACT	2	6	2231562	2231567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48087	NC_014925	ATTTCA	2	12	2231611	2231622	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48088	NC_014925	ACA	2	6	2231648	2231653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48089	NC_014925	ATT	2	6	2231655	2231660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893428
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48101	NC_014925	CTG	2	6	2232252	2232257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893428
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48106	NC_014925	CGT	2	6	2232525	2232530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893428
48107	NC_014925	AT	3	6	2232539	2232544	50 %	50 %	0 %	0 %	319893428
48108	NC_014925	TTC	2	6	2232553	2232558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893428
48109	NC_014925	AATTT	2	10	2232600	2232609	40 %	60 %	0 %	0 %	319893428
48110	NC_014925	TTGAT	2	10	2232650	2232659	20 %	60 %	20 %	0 %	319893428
48111	NC_014925	TTG	2	6	2232679	2232684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893428
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48114	NC_014925	TCT	2	6	2232830	2232835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893428
48115	NC_014925	T	6	6	2232921	2232926	0 %	100 %	0 %	0 %	319893428
48116	NC_014925	TCA	2	6	2232932	2232937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893428
48117	NC_014925	ACT	2	6	2232986	2232991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893428
48118	NC_014925	GTC	2	6	2232992	2232997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893428
48119	NC_014925	GTT	2	6	2233085	2233090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893428
48120	NC_014925	GCA	2	6	2233130	2233135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893428
48121	NC_014925	ATTCA	2	10	2233144	2233153	40 %	40 %	0 %	20 %	319893428
48122	NC_014925	ATC	2	6	2233195	2233200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893428
48123	NC_014925	A	6	6	2233202	2233207	100 %	0 %	0 %	0 %	319893428
48124	NC_014925	T	6	6	2233291	2233296	0 %	100 %	0 %	0 %	319893428
48125	NC_014925	CAT	3	9	2233297	2233305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893428
48126	NC_014925	ATA	2	6	2233356	2233361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48127	NC_014925	ATT	2	6	2233370	2233375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48128	NC_014925	TAT	2	6	2233577	2233582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893429
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48130	NC_014925	GTAG	2	8	2233614	2233621	25 %	25 %	50 %	0 %	319893429
48131	NC_014925	AAT	2	6	2233656	2233661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893429
48132	NC_014925	A	6	6	2233710	2233715	100 %	0 %	0 %	0 %	319893429
48133	NC_014925	CAT	2	6	2233730	2233735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893429
48134	NC_014925	TCAA	2	8	2233760	2233767	50 %	25 %	0 %	25 %	319893429
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48146	NC_014925	AT	3	6	2234257	2234262	50 %	50 %	0 %	0 %	319893429
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48155	NC_014925	CTT	2	6	2234573	2234578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48156	NC_014925	ACA	2	6	2234597	2234602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48158	NC_014925	CA	3	6	2234658	2234663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48159	NC_014925	AGA	2	6	2234685	2234690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48160	NC_014925	ATTGTT	2	12	2234720	2234731	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48161	NC_014925	ATA	2	6	2234732	2234737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48164	NC_014925	TA	3	6	2234791	2234796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48165	NC_014925	TAT	2	6	2234846	2234851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48166	NC_014925	A	7	7	2234926	2234932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48167	NC_014925	CATT	2	8	2234968	2234975	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48168	NC_014925	TATGA	2	10	2234977	2234986	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48169	NC_014925	A	7	7	2235033	2235039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48170	NC_014925	T	6	6	2235050	2235055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48171	NC_014925	TGT	2	6	2235057	2235062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48173	NC_014925	ACA	2	6	2235115	2235120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48176	NC_014925	TTTA	2	8	2235264	2235271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48177	NC_014925	A	6	6	2235282	2235287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48178	NC_014925	ACA	2	6	2235311	2235316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893430
48179	NC_014925	A	7	7	2235335	2235341	100 %	0 %	0 %	0 %	319893430
48180	NC_014925	GGT	2	6	2235384	2235389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319893430
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48204	NC_014925	CATT	2	8	2236787	2236794	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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48212	NC_014925	A	6	6	2237178	2237183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48229	NC_014925	CG	3	6	2237935	2237940	0 %	0 %	50 %	50 %	319893433
48230	NC_014925	TC	3	6	2237941	2237946	0 %	50 %	0 %	50 %	319893433
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48234	NC_014925	T	6	6	2238071	2238076	0 %	100 %	0 %	0 %	319893433
48235	NC_014925	CTT	2	6	2238179	2238184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893433
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48237	NC_014925	GT	3	6	2238362	2238367	0 %	50 %	50 %	0 %	319893433
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48239	NC_014925	TGT	2	6	2238387	2238392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893433
48240	NC_014925	TTG	2	6	2238401	2238406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893433
48241	NC_014925	ATC	2	6	2238558	2238563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893433
48242	NC_014925	TTG	2	6	2238578	2238583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893433
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48244	NC_014925	ATG	2	6	2238623	2238628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893433
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48250	NC_014925	TAA	2	6	2238850	2238855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48255	NC_014925	ACTC	2	8	2239022	2239029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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48272	NC_014925	TA	3	6	2239996	2240001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48342	NC_014925	CGTAA	2	10	2243187	2243196	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48343	NC_014925	TTG	2	6	2243262	2243267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48349	NC_014925	A	7	7	2243562	2243568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48350	NC_014925	TCA	2	6	2243626	2243631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893438
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48354	NC_014925	ATC	2	6	2243909	2243914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893438
48355	NC_014925	CTT	2	6	2243952	2243957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893438
48356	NC_014925	T	6	6	2243962	2243967	0 %	100 %	0 %	0 %	319893438
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48472	NC_014925	GT	3	6	2248903	2248908	0 %	50 %	50 %	0 %	319893442
48473	NC_014925	TTTC	2	8	2248924	2248931	0 %	75 %	0 %	25 %	319893442
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48475	NC_014925	TAC	2	6	2249012	2249017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48476	NC_014925	T	7	7	2249098	2249104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48477	NC_014925	GCAT	2	8	2249165	2249172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48478	NC_014925	A	7	7	2249202	2249208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48479	NC_014925	GAC	2	6	2249303	2249308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893443
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48481	NC_014925	GCT	2	6	2249317	2249322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893443
48482	NC_014925	GAT	2	6	2249334	2249339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893443
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48500	NC_014925	A	6	6	2249974	2249979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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