MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 56417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_014925	CAT	2	6	2037848	2037853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44002	NC_014925	CATT	2	8	2037864	2037871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44003	NC_014925	AAG	2	6	2037955	2037960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44004	NC_014925	GAA	2	6	2037981	2037986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44005	NC_014925	TC	3	6	2038010	2038015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44006	NC_014925	GATG	2	8	2038033	2038040	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44007	NC_014925	CT	3	6	2038058	2038063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44008	NC_014925	TGAT	2	8	2038109	2038116	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44009	NC_014925	AAC	2	6	2038160	2038165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44010	NC_014925	ACG	2	6	2038265	2038270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44011	NC_014925	TTG	2	6	2038277	2038282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44012	NC_014925	TCAA	2	8	2038341	2038348	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44013	NC_014925	TTGAG	2	10	2038355	2038364	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44014	NC_014925	AAC	2	6	2038412	2038417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44015	NC_014925	CAAAA	2	10	2038493	2038502	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44016	NC_014925	CCACT	2	10	2038522	2038531	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
44017	NC_014925	A	6	6	2038543	2038548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44018	NC_014925	CAA	2	6	2038570	2038575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893258
44019	NC_014925	AAGT	2	8	2038583	2038590	50 %	25 %	25 %	0 %	319893258
44020	NC_014925	TCATC	2	10	2038602	2038611	20 %	40 %	0 %	40 %	319893258
44021	NC_014925	AC	3	6	2038620	2038625	50 %	0 %	0 %	50 %	319893258
44022	NC_014925	CAA	2	6	2038702	2038707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893258
44023	NC_014925	TCA	2	6	2038718	2038723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893258
44024	NC_014925	TAA	2	6	2038738	2038743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893258
44025	NC_014925	AAC	2	6	2038745	2038750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893258
44026	NC_014925	ATGA	2	8	2038765	2038772	50 %	25 %	25 %	0 %	319893258
44027	NC_014925	ATTCA	2	10	2038792	2038801	40 %	40 %	0 %	20 %	319893258
44028	NC_014925	T	6	6	2038809	2038814	0 %	100 %	0 %	0 %	319893258
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44030	NC_014925	TGC	2	6	2038966	2038971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893258
44031	NC_014925	T	6	6	2038977	2038982	0 %	100 %	0 %	0 %	319893258
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44033	NC_014925	TCA	2	6	2039021	2039026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893259
44034	NC_014925	T	6	6	2039064	2039069	0 %	100 %	0 %	0 %	319893259
44035	NC_014925	GTTG	2	8	2039115	2039122	0 %	50 %	50 %	0 %	319893259
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44041	NC_014925	TCG	2	6	2039309	2039314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893259
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44044	NC_014925	ATT	2	6	2039478	2039483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893259
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44048	NC_014925	ACG	2	6	2039820	2039825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893259
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44053	NC_014925	TAC	2	6	2040161	2040166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893259
44054	NC_014925	TTA	2	6	2040190	2040195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893259
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44093	NC_014925	TTTAT	2	10	2041976	2041985	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44103	NC_014925	AC	3	6	2042406	2042411	50 %	0 %	0 %	50 %	319893260
44104	NC_014925	GGC	2	6	2042468	2042473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319893260
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44109	NC_014925	AGCA	2	8	2042596	2042603	50 %	0 %	25 %	25 %	319893260
44110	NC_014925	CCT	2	6	2042801	2042806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44111	NC_014925	TA	3	6	2042827	2042832	50 %	50 %	0 %	0 %	319893261
44112	NC_014925	TAA	2	6	2042914	2042919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893261
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44114	NC_014925	TGA	2	6	2043057	2043062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893261
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44120	NC_014925	CTTTCG	2	12	2043297	2043308	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	319893261
44121	NC_014925	CAA	2	6	2043327	2043332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893261
44122	NC_014925	AGA	2	6	2043346	2043351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319893261
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44125	NC_014925	ATAA	2	8	2043431	2043438	75 %	25 %	0 %	0 %	319893261
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44127	NC_014925	TCGTTA	2	12	2043516	2043527	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319893261
44128	NC_014925	A	6	6	2043527	2043532	100 %	0 %	0 %	0 %	319893261
44129	NC_014925	ATAA	2	8	2043587	2043594	75 %	25 %	0 %	0 %	319893261
44130	NC_014925	AC	3	6	2043657	2043662	50 %	0 %	0 %	50 %	319893261
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44145	NC_014925	GATT	2	8	2044174	2044181	25 %	50 %	25 %	0 %	319893262
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44155	NC_014925	TAA	2	6	2044575	2044580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44156	NC_014925	ACTCC	2	10	2044594	2044603	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
44157	NC_014925	GCT	2	6	2044635	2044640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44185	NC_014925	CCA	2	6	2045753	2045758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893264
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44209	NC_014925	AACC	2	8	2046670	2046677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44210	NC_014925	GAAAG	2	10	2046684	2046693	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44211	NC_014925	TAA	2	6	2046698	2046703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44212	NC_014925	TAG	2	6	2046807	2046812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44214	NC_014925	T	6	6	2046888	2046893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44215	NC_014925	TGT	2	6	2046899	2046904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44219	NC_014925	TGG	2	6	2047159	2047164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319893265
44220	NC_014925	AAAG	2	8	2047244	2047251	75 %	0 %	25 %	0 %	319893265
44221	NC_014925	AGC	2	6	2047279	2047284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893265
44222	NC_014925	ATC	2	6	2047290	2047295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893265
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44224	NC_014925	AAC	2	6	2047314	2047319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893265
44225	NC_014925	AC	3	6	2047323	2047328	50 %	0 %	0 %	50 %	319893265
44226	NC_014925	AT	3	6	2047421	2047426	50 %	50 %	0 %	0 %	319893265
44227	NC_014925	AAC	2	6	2047479	2047484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893265
44228	NC_014925	GGC	2	6	2047556	2047561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319893265
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44230	NC_014925	T	6	6	2047723	2047728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44231	NC_014925	ACGA	2	8	2047763	2047770	50 %	0 %	25 %	25 %	319893266
44232	NC_014925	ATT	2	6	2047777	2047782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893266
44233	NC_014925	AC	3	6	2047803	2047808	50 %	0 %	0 %	50 %	319893266
44234	NC_014925	AT	3	6	2047829	2047834	50 %	50 %	0 %	0 %	319893266
44235	NC_014925	ACA	2	6	2047917	2047922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893266
44236	NC_014925	GAA	2	6	2047990	2047995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319893266
44237	NC_014925	TTC	2	6	2047999	2048004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893266
44238	NC_014925	ATC	2	6	2048027	2048032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893266
44239	NC_014925	ATTG	2	8	2048038	2048045	25 %	50 %	25 %	0 %	319893266
44240	NC_014925	CGT	2	6	2048095	2048100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893266
44241	NC_014925	TGT	2	6	2048129	2048134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893266
44242	NC_014925	CGA	2	6	2048313	2048318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893266
44243	NC_014925	CGC	2	6	2048341	2048346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319893266
44244	NC_014925	TCAC	2	8	2048348	2048355	25 %	25 %	0 %	50 %	319893266
44245	NC_014925	AACG	2	8	2048398	2048405	50 %	0 %	25 %	25 %	319893266
44246	NC_014925	TAA	3	9	2048428	2048436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893266
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44248	NC_014925	TA	4	8	2048515	2048522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44249	NC_014925	T	6	6	2048538	2048543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44250	NC_014925	ACA	2	6	2048554	2048559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44251	NC_014925	TA	3	6	2048589	2048594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44252	NC_014925	TGA	2	6	2048617	2048622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893267
44253	NC_014925	TGAA	2	8	2048665	2048672	50 %	25 %	25 %	0 %	319893267
44254	NC_014925	TCCCTA	2	12	2048813	2048824	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	319893267
44255	NC_014925	TTG	2	6	2048837	2048842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893267
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44258	NC_014925	TCT	2	6	2049181	2049186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893268
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44271	NC_014925	T	7	7	2049868	2049874	0 %	100 %	0 %	0 %	319893268
44272	NC_014925	CTG	2	6	2049893	2049898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893268
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44288	NC_014925	CATT	2	8	2050674	2050681	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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44342	NC_014925	AAAAT	2	10	2052759	2052768	80 %	20 %	0 %	0 %	319893272
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44349	NC_014925	AGTA	2	8	2053251	2053258	50 %	25 %	25 %	0 %	319893273
44350	NC_014925	TGT	2	6	2053369	2053374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893273
44351	NC_014925	ATCAAA	2	12	2053395	2053406	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319893273
44352	NC_014925	TGCT	2	8	2053424	2053431	0 %	50 %	25 %	25 %	319893273
44353	NC_014925	TCC	2	6	2053432	2053437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44354	NC_014925	TTCA	2	8	2053459	2053466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44355	NC_014925	CATA	2	8	2053499	2053506	50 %	25 %	0 %	25 %	319893274
44356	NC_014925	ATTTT	2	10	2053507	2053516	20 %	80 %	0 %	0 %	319893274
44357	NC_014925	TCA	2	6	2053612	2053617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893274
44358	NC_014925	GAT	2	6	2053686	2053691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893274
44359	NC_014925	AAT	2	6	2053703	2053708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893274
44360	NC_014925	ATC	2	6	2053716	2053721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893274
44361	NC_014925	GACT	2	8	2053731	2053738	25 %	25 %	25 %	25 %	319893274
44362	NC_014925	GT	3	6	2053772	2053777	0 %	50 %	50 %	0 %	319893274
44363	NC_014925	GTCCTA	2	12	2053829	2053840	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319893274
44364	NC_014925	CCAT	2	8	2053884	2053891	25 %	25 %	0 %	50 %	319893274
44365	NC_014925	CAT	2	6	2053917	2053922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893274
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44368	NC_014925	TGC	2	6	2054034	2054039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893274
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44370	NC_014925	A	6	6	2054115	2054120	100 %	0 %	0 %	0 %	319893274
44371	NC_014925	TTG	2	6	2054145	2054150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893274
44372	NC_014925	A	6	6	2054159	2054164	100 %	0 %	0 %	0 %	319893274
44373	NC_014925	CCATG	2	10	2054171	2054180	20 %	20 %	20 %	40 %	319893274
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44378	NC_014925	T	6	6	2054348	2054353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44379	NC_014925	ACA	2	6	2054411	2054416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893275
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44386	NC_014925	TCA	3	9	2054649	2054657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893275
44387	NC_014925	ATT	2	6	2054687	2054692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44388	NC_014925	TA	3	6	2054694	2054699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44389	NC_014925	ATT	2	6	2054707	2054712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44390	NC_014925	TAA	2	6	2054724	2054729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44391	NC_014925	A	6	6	2054728	2054733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44392	NC_014925	GAAAA	2	10	2054769	2054778	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44393	NC_014925	CTATC	2	10	2054789	2054798	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44394	NC_014925	TTCT	2	8	2054823	2054830	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44395	NC_014925	A	6	6	2054831	2054836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44418	NC_014925	AATG	2	8	2055912	2055919	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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44475	NC_014925	ACT	2	6	2058476	2058481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893279
44476	NC_014925	A	6	6	2058506	2058511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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