MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 56417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_014925	ATT	2	6	1800503	1800508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893014
39003	NC_014925	TGA	2	6	1800593	1800598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893014
39004	NC_014925	AGA	2	6	1800611	1800616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319893014
39005	NC_014925	ATT	2	6	1800756	1800761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893014
39006	NC_014925	T	6	6	1800781	1800786	0 %	100 %	0 %	0 %	319893014
39007	NC_014925	CAA	2	6	1800885	1800890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893014
39008	NC_014925	ATC	2	6	1800891	1800896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893014
39009	NC_014925	TGA	2	6	1800929	1800934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893014
39010	NC_014925	GAAA	2	8	1800941	1800948	75 %	0 %	25 %	0 %	319893014
39011	NC_014925	GAT	2	6	1800966	1800971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893014
39012	NC_014925	ATT	2	6	1801141	1801146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893015
39013	NC_014925	AGA	2	6	1801250	1801255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319893015
39014	NC_014925	ACA	2	6	1801362	1801367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893015
39015	NC_014925	CAAAA	2	10	1801369	1801378	80 %	0 %	0 %	20 %	319893015
39016	NC_014925	TCAA	2	8	1801381	1801388	50 %	25 %	0 %	25 %	319893015
39017	NC_014925	GGT	2	6	1801401	1801406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319893015
39018	NC_014925	TGA	2	6	1801442	1801447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893015
39019	NC_014925	TAA	2	6	1801508	1801513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893015
39020	NC_014925	TACA	2	8	1801516	1801523	50 %	25 %	0 %	25 %	319893015
39021	NC_014925	TGG	3	9	1801610	1801618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319893015
39022	NC_014925	GTAT	2	8	1801705	1801712	25 %	50 %	25 %	0 %	319893015
39023	NC_014925	GTG	2	6	1801734	1801739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319893015
39024	NC_014925	GAT	2	6	1801827	1801832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893015
39025	NC_014925	TGTT	2	8	1801856	1801863	0 %	75 %	25 %	0 %	319893015
39026	NC_014925	GTC	2	6	1801971	1801976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893015
39027	NC_014925	GAAA	2	8	1802015	1802022	75 %	0 %	25 %	0 %	319893015
39028	NC_014925	ATT	2	6	1802036	1802041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893015
39029	NC_014925	GAA	2	6	1802046	1802051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319893015
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39031	NC_014925	GAT	2	6	1802133	1802138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893015
39032	NC_014925	GAA	2	6	1802159	1802164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319893015
39033	NC_014925	TCT	2	6	1802166	1802171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893015
39034	NC_014925	TCAA	2	8	1802245	1802252	50 %	25 %	0 %	25 %	319893015
39035	NC_014925	TTA	2	6	1802301	1802306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893015
39036	NC_014925	GAT	2	6	1802313	1802318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39037	NC_014925	ACC	2	6	1802342	1802347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39038	NC_014925	GAC	2	6	1802427	1802432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893016
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39043	NC_014925	TCAA	2	8	1802725	1802732	50 %	25 %	0 %	25 %	319893016
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39059	NC_014925	AT	3	6	1803283	1803288	50 %	50 %	0 %	0 %	319893016
39060	NC_014925	A	6	6	1803311	1803316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39061	NC_014925	TTG	2	6	1803367	1803372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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39063	NC_014925	TAAA	2	8	1803435	1803442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39064	NC_014925	AAT	2	6	1803640	1803645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39065	NC_014925	TAT	2	6	1803684	1803689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39066	NC_014925	ATTTT	2	10	1803690	1803699	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39067	NC_014925	GTTGAA	2	12	1803725	1803736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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39071	NC_014925	ATTG	2	8	1803838	1803845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39072	NC_014925	TG	3	6	1803869	1803874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39073	NC_014925	A	6	6	1803905	1803910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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39075	NC_014925	AGTA	2	8	1804101	1804108	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39076	NC_014925	TCGA	2	8	1804156	1804163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39077	NC_014925	TCA	2	6	1804218	1804223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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39080	NC_014925	CATA	2	8	1804309	1804316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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39085	NC_014925	ATGA	2	8	1804721	1804728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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39090	NC_014925	CCTA	2	8	1804915	1804922	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39091	NC_014925	TC	3	6	1805035	1805040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39092	NC_014925	GCC	2	6	1805131	1805136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39093	NC_014925	CTC	2	6	1805179	1805184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39094	NC_014925	TCGC	2	8	1805368	1805375	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39095	NC_014925	CTAG	2	8	1805435	1805442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39096	NC_014925	C	6	6	1805594	1805599	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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39101	NC_014925	AT	3	6	1806004	1806009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39102	NC_014925	TGG	2	6	1806024	1806029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39103	NC_014925	ATT	2	6	1806090	1806095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39104	NC_014925	AAT	2	6	1806165	1806170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39105	NC_014925	GA	3	6	1806203	1806208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39106	NC_014925	TCGGT	2	10	1806280	1806289	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39107	NC_014925	ACT	2	6	1806486	1806491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39108	NC_014925	AG	3	6	1806581	1806586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39109	NC_014925	TCC	2	6	1806607	1806612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39110	NC_014925	CGT	2	6	1806640	1806645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39111	NC_014925	AG	3	6	1806662	1806667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39112	NC_014925	ATT	2	6	1806688	1806693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39113	NC_014925	AAGC	2	8	1806775	1806782	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39114	NC_014925	TCGC	2	8	1806807	1806814	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39115	NC_014925	TCC	2	6	1806846	1806851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39116	NC_014925	CTT	2	6	1806885	1806890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39117	NC_014925	CTTA	2	8	1806969	1806976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39118	NC_014925	TCG	2	6	1806994	1806999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39119	NC_014925	TCG	2	6	1807013	1807018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39120	NC_014925	TAA	2	6	1807052	1807057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39121	NC_014925	TCA	2	6	1807099	1807104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39122	NC_014925	TTAC	2	8	1807121	1807128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39123	NC_014925	CAT	2	6	1807187	1807192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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39125	NC_014925	TTA	2	6	1807231	1807236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39126	NC_014925	GTC	2	6	1807246	1807251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39127	NC_014925	GAC	2	6	1807256	1807261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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39239	NC_014925	CAC	2	6	1812549	1812554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893019
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39274	NC_014925	T	7	7	1814604	1814610	0 %	100 %	0 %	0 %	319893022
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39358	NC_014925	A	6	6	1818497	1818502	100 %	0 %	0 %	0 %	319893028
39359	NC_014925	TTTCT	2	10	1818506	1818515	0 %	80 %	0 %	20 %	319893028
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39481	NC_014925	CAA	2	6	1825461	1825466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893033
39482	NC_014925	TAT	2	6	1825473	1825478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893033
39483	NC_014925	TTA	2	6	1825484	1825489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893033
39484	NC_014925	TTG	2	6	1825495	1825500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893033
39485	NC_014925	GT	3	6	1825616	1825621	0 %	50 %	50 %	0 %	319893033
39486	NC_014925	CATT	2	8	1825629	1825636	25 %	50 %	0 %	25 %	319893033
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39488	NC_014925	AAAG	2	8	1825696	1825703	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39489	NC_014925	ATT	2	6	1825741	1825746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893034
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39493	NC_014925	GCT	2	6	1825866	1825871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893034
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39497	NC_014925	TCA	2	6	1826007	1826012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893034
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39500	NC_014925	ATC	2	6	1826108	1826113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893034

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