MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 56417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_014925	T	6	6	2507304	2507309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54004	NC_014925	ATA	2	6	2507377	2507382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893651
54005	NC_014925	TTA	2	6	2507428	2507433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893651
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54009	NC_014925	TA	3	6	2507507	2507512	50 %	50 %	0 %	0 %	319893651
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54016	NC_014925	A	6	6	2507652	2507657	100 %	0 %	0 %	0 %	319893651
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54052	NC_014925	A	7	7	2508990	2508996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54053	NC_014925	TA	3	6	2509123	2509128	50 %	50 %	0 %	0 %	319893653
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54059	NC_014925	AAGAA	2	10	2509330	2509339	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54060	NC_014925	ATAA	2	8	2509350	2509357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54080	NC_014925	GTCATT	2	12	2510630	2510641	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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54087	NC_014925	CCA	2	6	2510998	2511003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54088	NC_014925	TAC	2	6	2511048	2511053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54091	NC_014925	AT	3	6	2511149	2511154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54092	NC_014925	GAA	2	6	2511274	2511279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54093	NC_014925	CAA	2	6	2511285	2511290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54094	NC_014925	AAGCG	2	10	2511351	2511360	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54095	NC_014925	TC	3	6	2511370	2511375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54096	NC_014925	TAA	2	6	2511446	2511451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54111	NC_014925	CTT	2	6	2512198	2512203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893656
54112	NC_014925	TAA	2	6	2512249	2512254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893656
54113	NC_014925	AAAG	2	8	2512283	2512290	75 %	0 %	25 %	0 %	319893656
54114	NC_014925	ATC	2	6	2512293	2512298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893656
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54119	NC_014925	TAT	2	6	2512546	2512551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893656
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54121	NC_014925	GT	3	6	2512647	2512652	0 %	50 %	50 %	0 %	319893656
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54233	NC_014925	AGC	2	6	2517691	2517696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893662
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54237	NC_014925	GAAA	2	8	2517790	2517797	75 %	0 %	25 %	0 %	319893662
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54239	NC_014925	A	7	7	2517851	2517857	100 %	0 %	0 %	0 %	319893662
54240	NC_014925	GACCT	2	10	2517963	2517972	20 %	20 %	20 %	40 %	319893662
54241	NC_014925	TAA	2	6	2518063	2518068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893662
54242	NC_014925	ATA	2	6	2518095	2518100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893662
54243	NC_014925	AAG	2	6	2518185	2518190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319893662
54244	NC_014925	TAA	2	6	2518213	2518218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893662
54245	NC_014925	CTG	2	6	2518221	2518226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893662
54246	NC_014925	AAT	2	6	2518295	2518300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893662
54247	NC_014925	ATG	2	6	2518329	2518334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893662
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54250	NC_014925	CAA	2	6	2518508	2518513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893662
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54253	NC_014925	TGGT	2	8	2518591	2518598	0 %	50 %	50 %	0 %	319893662
54254	NC_014925	AGTC	2	8	2518613	2518620	25 %	25 %	25 %	25 %	319893662
54255	NC_014925	TGT	2	6	2518644	2518649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893662
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54259	NC_014925	CAA	2	6	2518892	2518897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893662
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54266	NC_014925	ATC	2	6	2519218	2519223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893663
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54270	NC_014925	ATT	3	9	2519370	2519378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893663
54271	NC_014925	T	6	6	2519500	2519505	0 %	100 %	0 %	0 %	319893663
54272	NC_014925	TCA	2	6	2519510	2519515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893663
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54291	NC_014925	TGA	2	6	2520727	2520732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893664
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54293	NC_014925	TTA	2	6	2520918	2520923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893664
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54296	NC_014925	A	6	6	2521066	2521071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54297	NC_014925	T	6	6	2521098	2521103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54298	NC_014925	AAT	2	6	2521199	2521204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893665
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54300	NC_014925	CTTT	2	8	2521461	2521468	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54301	NC_014925	CAT	2	6	2521478	2521483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54302	NC_014925	ACG	2	6	2521502	2521507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54303	NC_014925	TCA	2	6	2521521	2521526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54304	NC_014925	TGTTA	2	10	2521618	2521627	20 %	60 %	20 %	0 %	319893666
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54329	NC_014925	CTTC	2	8	2523247	2523254	0 %	50 %	0 %	50 %	319893666
54330	NC_014925	CCT	2	6	2523291	2523296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54331	NC_014925	CAC	2	6	2523325	2523330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893667
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54333	NC_014925	TTG	2	6	2523540	2523545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893667
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54336	NC_014925	AT	3	6	2523712	2523717	50 %	50 %	0 %	0 %	319893667
54337	NC_014925	TCA	2	6	2523931	2523936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893667
54338	NC_014925	CGC	2	6	2523984	2523989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319893667
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54340	NC_014925	TGCTTC	2	12	2524029	2524040	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	319893667
54341	NC_014925	GTT	2	6	2524056	2524061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893667
54342	NC_014925	TGA	2	6	2524096	2524101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893667
54343	NC_014925	ATTT	2	8	2524163	2524170	25 %	75 %	0 %	0 %	319893667
54344	NC_014925	CTG	2	6	2524211	2524216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893667
54345	NC_014925	CAT	2	6	2524223	2524228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893667
54346	NC_014925	ATA	2	6	2524259	2524264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893667
54347	NC_014925	AC	3	6	2524292	2524297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54348	NC_014925	ATCA	2	8	2524353	2524360	50 %	25 %	0 %	25 %	319893668
54349	NC_014925	AAT	2	6	2524531	2524536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893668
54350	NC_014925	TGA	2	6	2524582	2524587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893668
54351	NC_014925	TGC	2	6	2524708	2524713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893668
54352	NC_014925	GAC	2	6	2524718	2524723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893668
54353	NC_014925	TGTA	2	8	2524733	2524740	25 %	50 %	25 %	0 %	319893668
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54355	NC_014925	AAC	2	6	2524820	2524825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893668
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54466	NC_014925	A	6	6	2530048	2530053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54467	NC_014925	TCTT	2	8	2530096	2530103	0 %	75 %	0 %	25 %	319893673
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54472	NC_014925	ATT	2	6	2530312	2530317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893673
54473	NC_014925	TCA	2	6	2530354	2530359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893673
54474	NC_014925	TGT	2	6	2530380	2530385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893673
54475	NC_014925	TGA	2	6	2530399	2530404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893673
54476	NC_014925	ATC	2	6	2530434	2530439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893673
54477	NC_014925	GTT	2	6	2530523	2530528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893673
54478	NC_014925	CAC	2	6	2530529	2530534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893673
54479	NC_014925	CTG	2	6	2530535	2530540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893673
54480	NC_014925	GTT	2	6	2530637	2530642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893673
54481	NC_014925	TCA	2	6	2530750	2530755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893673
54482	NC_014925	GTT	2	6	2530772	2530777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893673
54483	NC_014925	CTG	2	6	2530784	2530789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893673
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54486	NC_014925	CTT	2	6	2530979	2530984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893673
54487	NC_014925	TATC	2	8	2531069	2531076	25 %	50 %	0 %	25 %	319893673
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54490	NC_014925	TGT	2	6	2531241	2531246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893673
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54494	NC_014925	TTGT	2	8	2531416	2531423	0 %	75 %	25 %	0 %	319893673
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54497	NC_014925	TGT	2	6	2531757	2531762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893673
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54499	NC_014925	GTT	2	6	2531804	2531809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893673
54500	NC_014925	TTGAA	2	10	2531835	2531844	40 %	40 %	20 %	0 %	319893673

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