MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae 670-6B chromosome

Total Repeats: 45893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014498	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014498	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014498	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014498	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014498	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014498	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014498	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	307126152
8	NC_014498	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	307126152
9	NC_014498	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126152
10	NC_014498	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307126152
11	NC_014498	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307126152
12	NC_014498	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126152
13	NC_014498	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126152
14	NC_014498	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126152
15	NC_014498	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	307126152
16	NC_014498	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126152
17	NC_014498	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126152
18	NC_014498	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	307126152
19	NC_014498	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	307126152
20	NC_014498	AT	3	6	742	747	50 %	50 %	0 %	0 %	307126152
21	NC_014498	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126152
22	NC_014498	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126152
23	NC_014498	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	307126152
24	NC_014498	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126152
25	NC_014498	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126152
26	NC_014498	A	8	8	1195	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	307126152
27	NC_014498	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126152
28	NC_014498	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126152
29	NC_014498	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	307126152
30	NC_014498	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	307126152
31	NC_014498	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	307126152
32	NC_014498	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	307126152
33	NC_014498	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	307126152
34	NC_014498	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126152
35	NC_014498	T	6	6	1577	1582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014498	T	6	6	1586	1591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014498	T	6	6	1599	1604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014498	A	6	6	1614	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014498	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014498	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014498	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014498	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126153
43	NC_014498	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	307126153
44	NC_014498	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126153
45	NC_014498	AG	3	6	1772	1777	50 %	0 %	50 %	0 %	307126153
46	NC_014498	A	7	7	1895	1901	100 %	0 %	0 %	0 %	307126153
47	NC_014498	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126153
48	NC_014498	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126153
49	NC_014498	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126153
50	NC_014498	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126153
51	NC_014498	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	307126153
52	NC_014498	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126153
53	NC_014498	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126153
54	NC_014498	AG	3	6	2184	2189	50 %	0 %	50 %	0 %	307126153
55	NC_014498	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	307126153
56	NC_014498	A	7	7	2294	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	307126153
57	NC_014498	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126153
58	NC_014498	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126153
59	NC_014498	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126153
60	NC_014498	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126153
61	NC_014498	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	307126153
62	NC_014498	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126153
63	NC_014498	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	307126153
64	NC_014498	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	307126153
65	NC_014498	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126153
66	NC_014498	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014498	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126154
68	NC_014498	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	307126154
69	NC_014498	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	307126154
70	NC_014498	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126154
71	NC_014498	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126154
72	NC_014498	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126154
73	NC_014498	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014498	A	7	7	3281	3287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014498	CAG	2	6	3318	3323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014498	T	7	7	3351	3357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014498	TAT	2	6	3379	3384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014498	GTCCA	2	10	3477	3486	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014498	GTA	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126155
80	NC_014498	TAAATC	2	12	3568	3579	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307126155
81	NC_014498	ATCT	2	8	3640	3647	25 %	50 %	0 %	25 %	307126155
82	NC_014498	ATCA	2	8	3676	3683	50 %	25 %	0 %	25 %	307126155
83	NC_014498	A	6	6	3683	3688	100 %	0 %	0 %	0 %	307126155
84	NC_014498	C	6	6	3705	3710	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_014498	CAA	2	6	3733	3738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014498	TGG	2	6	3781	3786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126156
87	NC_014498	GGT	2	6	3824	3829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126156
88	NC_014498	TAG	2	6	3842	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126156
89	NC_014498	TTTC	2	8	3876	3883	0 %	75 %	0 %	25 %	307126156
90	NC_014498	AAT	2	6	3893	3898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126156
91	NC_014498	ATA	2	6	3901	3906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126156
92	NC_014498	CT	3	6	4104	4109	0 %	50 %	0 %	50 %	307126156
93	NC_014498	TCA	2	6	4115	4120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126156
94	NC_014498	ATA	2	6	4165	4170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014498	T	7	7	4211	4217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014498	A	6	6	4262	4267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014498	GGGA	2	8	4304	4311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014498	TC	3	6	4364	4369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014498	GCAA	2	8	4388	4395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014498	AAG	2	6	4552	4557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014498	GTC	2	6	4565	4570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014498	AGG	2	6	4659	4664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014498	AC	3	6	4739	4744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014498	CT	3	6	4821	4826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014498	GGAG	2	8	4851	4858	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014498	TAAA	2	8	4954	4961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014498	AAC	2	6	4966	4971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014498	CTA	2	6	4997	5002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014498	ATAG	2	8	5044	5051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014498	ATG	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014498	TGAA	2	8	5123	5130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014498	GTA	2	6	5170	5175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014498	TG	4	8	5200	5207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014498	TACT	2	8	5222	5229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014498	AT	3	6	5240	5245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014498	T	6	6	5251	5256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014498	GTA	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014498	TTTG	2	8	5284	5291	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014498	ACT	2	6	5307	5312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014498	CTT	2	6	5380	5385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126157
121	NC_014498	AT	3	6	5447	5452	50 %	50 %	0 %	0 %	307126157
122	NC_014498	CCA	2	6	5453	5458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126157
123	NC_014498	CTT	2	6	5493	5498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126157
124	NC_014498	AAATAC	2	12	5585	5596	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307126157
125	NC_014498	AAAG	2	8	5637	5644	75 %	0 %	25 %	0 %	307126157
126	NC_014498	ACC	2	6	5656	5661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126157
127	NC_014498	CCA	2	6	5699	5704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126157
128	NC_014498	AATC	2	8	5706	5713	50 %	25 %	0 %	25 %	307126157
129	NC_014498	AATC	2	8	5727	5734	50 %	25 %	0 %	25 %	307126157
130	NC_014498	ATT	2	6	5825	5830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126157
131	NC_014498	AAT	2	6	5906	5911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126158
132	NC_014498	AAGC	2	8	6033	6040	50 %	0 %	25 %	25 %	307126158
133	NC_014498	TTC	2	6	6147	6152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126158
134	NC_014498	TAGTT	2	10	6220	6229	20 %	60 %	20 %	0 %	307126158
135	NC_014498	TCC	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307126158
136	NC_014498	CTA	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126158
137	NC_014498	AT	3	6	6313	6318	50 %	50 %	0 %	0 %	307126158
138	NC_014498	CCA	2	6	6338	6343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126158
139	NC_014498	TGT	2	6	6398	6403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126158
140	NC_014498	TAG	2	6	6433	6438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014498	TCTT	2	8	6526	6533	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014498	CTT	2	6	6606	6611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014498	TTG	2	6	6619	6624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014498	CTT	2	6	6692	6697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014498	TA	4	8	6714	6721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014498	AT	3	6	6724	6729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014498	AAG	2	6	6758	6763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014498	CTT	2	6	6823	6828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014498	CAA	2	6	6840	6845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014498	CAA	2	6	6852	6857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_014498	TC	3	6	6958	6963	0 %	50 %	0 %	50 %	307126159
152	NC_014498	TTA	2	6	7028	7033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126159
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168	NC_014498	CTTG	2	8	7909	7916	0 %	50 %	25 %	25 %	307126159
169	NC_014498	CT	3	6	8059	8064	0 %	50 %	0 %	50 %	307126159
170	NC_014498	TTC	2	6	8314	8319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126159
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173	NC_014498	TTC	2	6	8416	8421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_014498	CT	3	6	8440	8445	0 %	50 %	0 %	50 %	307126160
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182	NC_014498	CTATG	2	10	8953	8962	20 %	40 %	20 %	20 %	307126160
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242	NC_014498	T	6	6	11287	11292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_014498	CCT	2	6	12537	12542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
264	NC_014498	TAT	2	6	12558	12563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_014498	GTCA	2	8	12573	12580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
266	NC_014498	A	7	7	12600	12606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_014498	TTATT	2	10	12629	12638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_014498	TAT	2	6	12664	12669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_014498	TAA	2	6	12706	12711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_014498	T	6	6	12793	12798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_014498	CTT	2	6	12813	12818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126172
272	NC_014498	T	7	7	12826	12832	0 %	100 %	0 %	0 %	307126172
273	NC_014498	CAT	2	6	12881	12886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126172
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275	NC_014498	TTC	2	6	12968	12973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126172
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433	NC_014498	A	7	7	20094	20100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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