MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 43896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_014494	GCT	2	6	1116080	1116085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307067802
23003	NC_014494	TCT	2	6	1116101	1116106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067802
23004	NC_014494	TTC	2	6	1116118	1116123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067802
23005	NC_014494	TGT	2	6	1116127	1116132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307067802
23006	NC_014494	CCT	2	6	1116135	1116140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307067802
23007	NC_014494	AGAT	2	8	1116169	1116176	50 %	25 %	25 %	0 %	307067802
23008	NC_014494	AG	3	6	1116199	1116204	50 %	0 %	50 %	0 %	307067802
23009	NC_014494	CTT	2	6	1116237	1116242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067802
23010	NC_014494	AAT	2	6	1116254	1116259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307067802
23011	NC_014494	ATT	2	6	1116272	1116277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307067802
23012	NC_014494	TTC	2	6	1116285	1116290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067803
23013	NC_014494	GGT	2	6	1116389	1116394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307067803
23014	NC_014494	TTC	2	6	1116553	1116558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067803
23015	NC_014494	TTC	2	6	1116570	1116575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067803
23016	NC_014494	TTGG	2	8	1116595	1116602	0 %	50 %	50 %	0 %	307067803
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23019	NC_014494	CTT	2	6	1116863	1116868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067803
23020	NC_014494	CCA	2	6	1116985	1116990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307067803
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23022	NC_014494	GAT	2	6	1117011	1117016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307067803
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23024	NC_014494	TTC	2	6	1117074	1117079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067803
23025	NC_014494	CTTG	2	8	1117106	1117113	0 %	50 %	25 %	25 %	307067803
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23029	NC_014494	CTT	3	9	1117232	1117240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067803
23030	NC_014494	TTC	2	6	1117305	1117310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067803
23031	NC_014494	TCT	2	6	1117318	1117323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067803
23032	NC_014494	T	6	6	1117352	1117357	0 %	100 %	0 %	0 %	307067803
23033	NC_014494	CTA	2	6	1117391	1117396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067804
23034	NC_014494	CTG	2	6	1117505	1117510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307067804
23035	NC_014494	ATCA	2	8	1117581	1117588	50 %	25 %	0 %	25 %	307067804
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23043	NC_014494	ACC	2	6	1117915	1117920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307067805
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23052	NC_014494	GGA	2	6	1118540	1118545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23053	NC_014494	TAT	2	6	1118549	1118554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307067806
23054	NC_014494	ATTT	2	8	1118572	1118579	25 %	75 %	0 %	0 %	307067806
23055	NC_014494	ACGC	2	8	1118585	1118592	25 %	0 %	25 %	50 %	307067806
23056	NC_014494	AAAG	2	8	1118600	1118607	75 %	0 %	25 %	0 %	307067806
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23058	NC_014494	TCA	3	9	1118674	1118682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067806
23059	NC_014494	ACTT	2	8	1118700	1118707	25 %	50 %	0 %	25 %	307067806
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23062	NC_014494	GAA	2	6	1118789	1118794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23063	NC_014494	ATTA	2	8	1118853	1118860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23064	NC_014494	GCT	2	6	1118899	1118904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307067807
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23068	NC_014494	AGCT	2	8	1119176	1119183	25 %	25 %	25 %	25 %	307067807
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23078	NC_014494	ACTG	2	8	1119816	1119823	25 %	25 %	25 %	25 %	307067807
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23107	NC_014494	TCAA	2	8	1121124	1121131	50 %	25 %	0 %	25 %	307067808
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23109	NC_014494	CT	3	6	1121236	1121241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23110	NC_014494	AAG	2	6	1121248	1121253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23113	NC_014494	CAA	2	6	1121447	1121452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307067809
23114	NC_014494	TGA	2	6	1121497	1121502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307067809
23115	NC_014494	CAT	2	6	1121507	1121512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067809
23116	NC_014494	GCT	2	6	1121545	1121550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307067809
23117	NC_014494	CTT	2	6	1121555	1121560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067809
23118	NC_014494	CTT	2	6	1121573	1121578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067809
23119	NC_014494	CA	3	6	1121628	1121633	50 %	0 %	0 %	50 %	307067809
23120	NC_014494	ATC	2	6	1121655	1121660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067809
23121	NC_014494	TCATCT	2	12	1121687	1121698	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307067809
23122	NC_014494	CAC	2	6	1121777	1121782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307067809
23123	NC_014494	CAT	2	6	1121825	1121830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067809
23124	NC_014494	CCA	2	6	1121954	1121959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307067809
23125	NC_014494	TTG	2	6	1121969	1121974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307067809
23126	NC_014494	GGCA	2	8	1121984	1121991	25 %	0 %	50 %	25 %	307067809
23127	NC_014494	AAC	2	6	1122036	1122041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307067809
23128	NC_014494	TAT	2	6	1122077	1122082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307067809
23129	NC_014494	CTA	3	9	1122083	1122091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067809
23130	NC_014494	ACC	2	6	1122138	1122143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307067809
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23133	NC_014494	CTG	2	6	1122236	1122241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307067809
23134	NC_014494	TTC	2	6	1122288	1122293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067809
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23137	NC_014494	TAT	2	6	1122404	1122409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23138	NC_014494	ACT	2	6	1122410	1122415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23139	NC_014494	TCA	2	6	1122440	1122445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23140	NC_014494	T	6	6	1122446	1122451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23141	NC_014494	TGA	2	6	1122504	1122509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23142	NC_014494	CA	3	6	1122517	1122522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23143	NC_014494	TCA	2	6	1122525	1122530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23144	NC_014494	CCT	2	6	1122552	1122557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23145	NC_014494	TAG	2	6	1122567	1122572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23146	NC_014494	CTA	2	6	1122602	1122607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23147	NC_014494	CTA	2	6	1122610	1122615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23148	NC_014494	GTAT	2	8	1122696	1122703	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23149	NC_014494	TCTA	2	8	1122768	1122775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23150	NC_014494	TTTA	2	8	1122851	1122858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23151	NC_014494	AT	3	6	1122875	1122880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23152	NC_014494	CTTA	2	8	1123017	1123024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23153	NC_014494	TCT	3	9	1123110	1123118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067810
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23165	NC_014494	AGC	2	6	1123576	1123581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307067810
23166	NC_014494	T	6	6	1123618	1123623	0 %	100 %	0 %	0 %	307067810
23167	NC_014494	AAG	2	6	1123670	1123675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23171	NC_014494	T	6	6	1123800	1123805	0 %	100 %	0 %	0 %	307067811
23172	NC_014494	TC	3	6	1123832	1123837	0 %	50 %	0 %	50 %	307067811
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23181	NC_014494	A	6	6	1124267	1124272	100 %	0 %	0 %	0 %	307067812
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23186	NC_014494	TAT	2	6	1124516	1124521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307067812
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23189	NC_014494	A	6	6	1124566	1124571	100 %	0 %	0 %	0 %	307067812
23190	NC_014494	A	8	8	1124578	1124585	100 %	0 %	0 %	0 %	307067812
23191	NC_014494	A	6	6	1124631	1124636	100 %	0 %	0 %	0 %	307067812
23192	NC_014494	T	6	6	1124673	1124678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23193	NC_014494	T	7	7	1124716	1124722	0 %	100 %	0 %	0 %	307067813
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23196	NC_014494	T	6	6	1124771	1124776	0 %	100 %	0 %	0 %	307067813
23197	NC_014494	TCGTC	2	10	1124824	1124833	0 %	40 %	20 %	40 %	307067813
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23202	NC_014494	CAT	2	6	1125007	1125012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067813
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23206	NC_014494	TA	3	6	1125227	1125232	50 %	50 %	0 %	0 %	307067813
23207	NC_014494	CTT	3	9	1125307	1125315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067813
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23217	NC_014494	TCA	2	6	1125751	1125756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067813
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23219	NC_014494	ATC	2	6	1125779	1125784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23220	NC_014494	ATT	2	6	1125793	1125798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23221	NC_014494	GAAA	2	8	1125819	1125826	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23222	NC_014494	A	7	7	1125824	1125830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23223	NC_014494	CTA	2	6	1125850	1125855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067814
23224	NC_014494	T	7	7	1125873	1125879	0 %	100 %	0 %	0 %	307067814
23225	NC_014494	GAT	2	6	1125898	1125903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307067814
23226	NC_014494	AAG	2	6	1125910	1125915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307067814
23227	NC_014494	ATA	2	6	1125926	1125931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307067814
23228	NC_014494	GTC	2	6	1126065	1126070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23229	NC_014494	GTA	2	6	1126239	1126244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307067815
23230	NC_014494	GAA	2	6	1126269	1126274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307067815
23231	NC_014494	GAT	2	6	1126338	1126343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307067815
23232	NC_014494	CTA	2	6	1126595	1126600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067815
23233	NC_014494	CT	3	6	1126601	1126606	0 %	50 %	0 %	50 %	307067815
23234	NC_014494	AGA	2	6	1126634	1126639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307067815
23235	NC_014494	T	6	6	1126670	1126675	0 %	100 %	0 %	0 %	307067815
23236	NC_014494	TCA	2	6	1126682	1126687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067815
23237	NC_014494	AGG	2	6	1126722	1126727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23387	NC_014494	ATAAA	2	10	1132355	1132364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23393	NC_014494	T	7	7	1132508	1132514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23474	NC_014494	TAA	3	9	1136005	1136013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23478	NC_014494	CTG	2	6	1136248	1136253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307067825
23479	NC_014494	CTG	2	6	1136380	1136385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307067825
23480	NC_014494	GTTG	2	8	1136397	1136404	0 %	50 %	50 %	0 %	307067825
23481	NC_014494	CTT	2	6	1136632	1136637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307067825
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23484	NC_014494	TCA	2	6	1136724	1136729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067825
23485	NC_014494	GATT	2	8	1136835	1136842	25 %	50 %	25 %	0 %	307067825
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23491	NC_014494	T	6	6	1137317	1137322	0 %	100 %	0 %	0 %	307067825
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