MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6192 chromosome

Total Repeats: 64538

< Previous12...3334353637383940414243...129130Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_014484	ATTG	2	8	704498	704505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18502	NC_014484	GAA	2	6	704524	704529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_014484	AGG	2	6	704632	704637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18504	NC_014484	TCC	2	6	704675	704680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307718324
18505	NC_014484	GA	3	6	704684	704689	50 %	0 %	50 %	0 %	307718324
18506	NC_014484	CCT	3	9	704693	704701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307718324
18507	NC_014484	TCC	2	6	704704	704709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307718324
18508	NC_014484	CGA	2	6	704747	704752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307718324
18509	NC_014484	GGA	2	6	704759	704764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307718324
18510	NC_014484	CAT	2	6	704807	704812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307718324
18511	NC_014484	AG	3	6	704941	704946	50 %	0 %	50 %	0 %	307718324
18512	NC_014484	TGC	2	6	705000	705005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307718324
18513	NC_014484	ACG	2	6	705031	705036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307718324
18514	NC_014484	CACG	2	8	705118	705125	25 %	0 %	25 %	50 %	307718324
18515	NC_014484	GTG	2	6	705337	705342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307718325
18516	NC_014484	CGA	2	6	705351	705356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307718325
18517	NC_014484	CAT	2	6	705387	705392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307718325
18518	NC_014484	CCT	2	6	705408	705413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307718325
18519	NC_014484	TCA	2	6	705506	705511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307718325
18520	NC_014484	G	6	6	705597	705602	0 %	0 %	100 %	0 %	307718325
18521	NC_014484	TGG	2	6	705614	705619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307718325
18522	NC_014484	CTC	2	6	705634	705639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307718325
18523	NC_014484	ATG	2	6	705670	705675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307718325
18524	NC_014484	GAG	2	6	705694	705699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307718325
18525	NC_014484	CCACC	2	10	705711	705720	20 %	0 %	0 %	80 %	307718325
18526	NC_014484	CCT	2	6	705776	705781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307718325
18527	NC_014484	CTC	2	6	705895	705900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307718325
18528	NC_014484	GAGG	2	8	706018	706025	25 %	0 %	75 %	0 %	307718325
18529	NC_014484	CTCGG	2	10	706030	706039	0 %	20 %	40 %	40 %	307718325
18530	NC_014484	GTG	3	9	706045	706053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307718325
18531	NC_014484	ACC	2	6	706093	706098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307718325
18532	NC_014484	TCT	2	6	706103	706108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307718325
18533	NC_014484	GC	3	6	706171	706176	0 %	0 %	50 %	50 %	307718325
18534	NC_014484	ATG	2	6	706183	706188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307718325
18535	NC_014484	AGG	2	6	706199	706204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307718325
18536	NC_014484	CAC	2	6	706233	706238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307718325
18537	NC_014484	AGG	2	6	706355	706360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307718325
18538	NC_014484	GGA	2	6	706424	706429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307718326
18539	NC_014484	CTC	2	6	706437	706442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307718326
18540	NC_014484	CGC	2	6	706504	706509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307718326
18541	NC_014484	GGTGAA	2	12	706532	706543	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307718326
18542	NC_014484	GGT	2	6	706592	706597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307718326
18543	NC_014484	GAGAC	2	10	706620	706629	40 %	0 %	40 %	20 %	307718326
18544	NC_014484	CGA	2	6	706664	706669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307718326
18545	NC_014484	GAG	2	6	706733	706738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307718326
18546	NC_014484	CCA	2	6	706847	706852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307718326
18547	NC_014484	TCT	2	6	706873	706878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307718326
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18550	NC_014484	GC	3	6	706984	706989	0 %	0 %	50 %	50 %	307718326
18551	NC_014484	AGG	2	6	706999	707004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307718326
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18553	NC_014484	GAG	2	6	707091	707096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307718326
18554	NC_014484	CGC	2	6	707138	707143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307718326
18555	NC_014484	CAT	2	6	707201	707206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307718326
18556	NC_014484	TCC	2	6	707224	707229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307718326
18557	NC_014484	TCA	2	6	707260	707265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307718326
18558	NC_014484	CTA	2	6	707303	707308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307718326
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18561	NC_014484	CAT	2	6	707429	707434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307718326
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18569	NC_014484	GGC	2	6	707651	707656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307718326
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18572	NC_014484	CGG	2	6	707891	707896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307718326
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18578	NC_014484	GGA	2	6	708357	708362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307718327
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18580	NC_014484	AG	3	6	708434	708439	50 %	0 %	50 %	0 %	307718327
18581	NC_014484	TGG	3	9	708453	708461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307718327
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18588	NC_014484	GAG	2	6	708631	708636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307718327
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18591	NC_014484	T	7	7	708879	708885	0 %	100 %	0 %	0 %	307718328
18592	NC_014484	TCA	2	6	708908	708913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307718328
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18599	NC_014484	CTCCC	2	10	709146	709155	0 %	20 %	0 %	80 %	307718328
18600	NC_014484	GGT	2	6	709185	709190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307718328
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18603	NC_014484	CTC	2	6	709267	709272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307718328
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18605	NC_014484	TCT	2	6	709295	709300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307718328
18606	NC_014484	GAG	2	6	709411	709416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307718328
18607	NC_014484	ATCGA	2	10	709417	709426	40 %	20 %	20 %	20 %	307718328
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18610	NC_014484	TCC	2	6	709490	709495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307718328
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18618	NC_014484	CTC	2	6	709843	709848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307718328
18619	NC_014484	GCT	2	6	709914	709919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307718328
18620	NC_014484	CGG	2	6	709982	709987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307718328
18621	NC_014484	TCT	2	6	710018	710023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307718328
18622	NC_014484	CTC	2	6	710065	710070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307718328
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18624	NC_014484	GCGG	2	8	710193	710200	0 %	0 %	75 %	25 %	307718328
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18633	NC_014484	GCT	2	6	710541	710546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307718328
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18685	NC_014484	GTA	2	6	712554	712559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307718330
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18730	NC_014484	C	6	6	713937	713942	0 %	0 %	0 %	100 %	307718332
18731	NC_014484	GAG	2	6	713949	713954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307718332
18732	NC_014484	GAG	2	6	713964	713969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307718332
18733	NC_014484	AGC	2	6	713998	714003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307718332
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18735	NC_014484	TCGT	2	8	714030	714037	0 %	50 %	25 %	25 %	307718332
18736	NC_014484	ACC	2	6	714054	714059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18737	NC_014484	TTC	2	6	714078	714083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307718333
18738	NC_014484	CG	3	6	714095	714100	0 %	0 %	50 %	50 %	307718333
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18983	NC_014484	GAT	3	9	723091	723099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307718342
18984	NC_014484	GAGCC	2	10	723155	723164	20 %	0 %	40 %	40 %	307718342
18985	NC_014484	GAT	2	6	723193	723198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307718342
18986	NC_014484	ATG	2	6	723233	723238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307718342
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18991	NC_014484	GATCCA	2	12	723496	723507	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307718342
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18998	NC_014484	CCT	2	6	723771	723776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18999	NC_014484	TAT	2	6	723795	723800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19000	NC_014484	A	7	7	723824	723830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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