MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6192 chromosome

Total Repeats: 64538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_014484	GAG	2	6	259930	259935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717917
7003	NC_014484	AGA	2	6	259971	259976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717917
7004	NC_014484	CGT	2	6	259989	259994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717917
7005	NC_014484	AGG	2	6	260006	260011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717917
7006	NC_014484	AGG	2	6	260036	260041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717917
7007	NC_014484	GTT	2	6	260089	260094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307717917
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7010	NC_014484	AGG	2	6	260231	260236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717917
7011	NC_014484	AGA	2	6	260250	260255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717917
7012	NC_014484	GGGA	2	8	260342	260349	25 %	0 %	75 %	0 %	307717917
7013	NC_014484	CTG	2	6	260392	260397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717917
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7056	NC_014484	CAGA	2	8	261889	261896	50 %	0 %	25 %	25 %	307717919
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7122	NC_014484	TCG	2	6	264586	264591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717921
7123	NC_014484	GGA	2	6	264633	264638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717921
7124	NC_014484	CCT	2	6	264719	264724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717921
7125	NC_014484	TCTG	2	8	264797	264804	0 %	50 %	25 %	25 %	307717921
7126	NC_014484	GAC	2	6	264854	264859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717921
7127	NC_014484	GCC	2	6	264915	264920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717921
7128	NC_014484	GCC	2	6	264970	264975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717921
7129	NC_014484	CTC	2	6	264993	264998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717921
7130	NC_014484	GTA	2	6	265008	265013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717921
7131	NC_014484	GGA	2	6	265037	265042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717921
7132	NC_014484	TCT	2	6	265043	265048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717921
7133	NC_014484	TCC	2	6	265192	265197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717921
7134	NC_014484	GAG	2	6	265233	265238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717921
7135	NC_014484	GAG	2	6	265248	265253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717921
7136	NC_014484	CGATG	2	10	265269	265278	20 %	20 %	40 %	20 %	307717921
7137	NC_014484	CGT	2	6	265279	265284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717921
7138	NC_014484	GT	3	6	265283	265288	0 %	50 %	50 %	0 %	307717921
7139	NC_014484	CCT	2	6	265299	265304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717922
7140	NC_014484	CGC	2	6	265339	265344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717922
7141	NC_014484	CAC	3	9	265378	265386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717922
7142	NC_014484	AGGT	2	8	265406	265413	25 %	25 %	50 %	0 %	307717922
7143	NC_014484	AGT	2	6	265431	265436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717922
7144	NC_014484	GGC	2	6	265471	265476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717922
7145	NC_014484	CCCACC	2	12	265529	265540	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	307717922
7146	NC_014484	GAA	2	6	265576	265581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717922
7147	NC_014484	C	6	6	265598	265603	0 %	0 %	0 %	100 %	307717922
7148	NC_014484	CAT	2	6	265657	265662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717922
7149	NC_014484	GGT	2	6	265663	265668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717922
7150	NC_014484	TGA	3	9	265671	265679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717922
7151	NC_014484	TGC	2	6	265683	265688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717922
7152	NC_014484	AGG	3	9	265691	265699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717922
7153	NC_014484	GGCCT	2	10	265775	265784	0 %	20 %	40 %	40 %	307717922
7154	NC_014484	GAG	2	6	265810	265815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717922
7155	NC_014484	GCA	2	6	265830	265835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717922
7156	NC_014484	CTC	2	6	265855	265860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717922
7157	NC_014484	GAG	2	6	265861	265866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717922
7158	NC_014484	CAC	3	9	265867	265875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717922
7159	NC_014484	CTCG	2	8	265876	265883	0 %	25 %	25 %	50 %	307717922
7160	NC_014484	GAG	2	6	265921	265926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717922
7161	NC_014484	GAA	2	6	265951	265956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717922
7162	NC_014484	TGAGGG	2	12	266046	266057	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	307717922
7163	NC_014484	GAGG	2	8	266089	266096	25 %	0 %	75 %	0 %	307717922
7164	NC_014484	GAG	2	6	266101	266106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717922
7165	NC_014484	GAG	2	6	266143	266148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717922
7166	NC_014484	TCG	2	6	266153	266158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717922
7167	NC_014484	CTC	2	6	266224	266229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717922
7168	NC_014484	GCC	2	6	266267	266272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717922
7169	NC_014484	CCA	2	6	266301	266306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717922
7170	NC_014484	G	6	6	266337	266342	0 %	0 %	100 %	0 %	307717922
7171	NC_014484	CT	3	6	266365	266370	0 %	50 %	0 %	50 %	307717922
7172	NC_014484	GTC	2	6	266422	266427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717922
7173	NC_014484	GAG	2	6	266497	266502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717922
7174	NC_014484	CTC	3	9	266504	266512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717922
7175	NC_014484	TCA	2	6	266553	266558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717922
7176	NC_014484	TCC	2	6	266561	266566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7177	NC_014484	GTA	2	6	266573	266578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717923
7178	NC_014484	CTT	2	6	266597	266602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717923
7179	NC_014484	ACC	2	6	266631	266636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717923
7180	NC_014484	AGGA	2	8	266670	266677	50 %	0 %	50 %	0 %	307717923
7181	NC_014484	TC	3	6	266731	266736	0 %	50 %	0 %	50 %	307717923
7182	NC_014484	TGA	2	6	266737	266742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717923
7183	NC_014484	CCA	2	6	266767	266772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717923
7184	NC_014484	AGT	2	6	266776	266781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717923
7185	NC_014484	CGC	2	6	266834	266839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717923
7186	NC_014484	GAG	2	6	266843	266848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717923
7187	NC_014484	CAT	2	6	266891	266896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717923
7188	NC_014484	AGG	2	6	266970	266975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717923
7189	NC_014484	GCG	2	6	267096	267101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717923
7190	NC_014484	TCC	2	6	267108	267113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717923
7191	NC_014484	TCCC	2	8	267157	267164	0 %	25 %	0 %	75 %	307717923
7192	NC_014484	CGG	2	6	267181	267186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717923
7193	NC_014484	CCGGT	2	10	267207	267216	0 %	20 %	40 %	40 %	307717923
7194	NC_014484	CGGGTG	2	12	267285	267296	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	307717923
7195	NC_014484	CTC	2	6	267365	267370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717923
7196	NC_014484	CCA	2	6	267400	267405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717923
7197	NC_014484	CGG	2	6	267451	267456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717923
7198	NC_014484	GAGC	2	8	267470	267477	25 %	0 %	50 %	25 %	307717923
7199	NC_014484	G	6	6	267532	267537	0 %	0 %	100 %	0 %	307717923
7200	NC_014484	CGAGG	2	10	267554	267563	20 %	0 %	60 %	20 %	307717923
7201	NC_014484	ACC	2	6	267570	267575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717923
7202	NC_014484	CTC	2	6	267584	267589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717923
7203	NC_014484	TTG	2	6	267597	267602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307717923
7204	NC_014484	TCC	2	6	267621	267626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717923
7205	NC_014484	AGG	2	6	267672	267677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717923
7206	NC_014484	CT	3	6	267693	267698	0 %	50 %	0 %	50 %	307717923
7207	NC_014484	AGG	2	6	267732	267737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717923
7208	NC_014484	CACGGC	2	12	267743	267754	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	307717923
7209	NC_014484	TGA	2	6	267763	267768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717923
7210	NC_014484	TTC	2	6	267795	267800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717923
7211	NC_014484	AG	4	8	267801	267808	50 %	0 %	50 %	0 %	307717923
7212	NC_014484	CTCC	2	8	267835	267842	0 %	25 %	0 %	75 %	307717924
7213	NC_014484	CGT	2	6	267864	267869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717924
7214	NC_014484	GTGG	2	8	267913	267920	0 %	25 %	75 %	0 %	307717924
7215	NC_014484	AGA	2	6	267921	267926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717924
7216	NC_014484	GGT	2	6	267931	267936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717924
7217	NC_014484	TCG	2	6	268013	268018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717924
7218	NC_014484	TTC	2	6	268037	268042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717924
7219	NC_014484	ACC	2	6	268078	268083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717924
7220	NC_014484	TCC	2	6	268106	268111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717924
7221	NC_014484	GAG	2	6	268180	268185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717924
7222	NC_014484	GCTC	2	8	268280	268287	0 %	25 %	25 %	50 %	307717924
7223	NC_014484	GAT	2	6	268321	268326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717924
7224	NC_014484	CGA	2	6	268359	268364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717924
7225	NC_014484	GAG	2	6	268369	268374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717924
7226	NC_014484	GGT	2	6	268375	268380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717924
7227	NC_014484	C	6	6	268443	268448	0 %	0 %	0 %	100 %	307717924
7228	NC_014484	TC	3	6	268467	268472	0 %	50 %	0 %	50 %	307717924
7229	NC_014484	CTT	2	6	268486	268491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717924
7230	NC_014484	TGG	2	6	268546	268551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717925
7231	NC_014484	GTG	2	6	268641	268646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717925
7232	NC_014484	GAT	2	6	268666	268671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717925
7233	NC_014484	AGG	2	6	268683	268688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717925
7234	NC_014484	CGG	2	6	268693	268698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717925
7235	NC_014484	ATG	2	6	268728	268733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717925
7236	NC_014484	GGA	2	6	268819	268824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717925
7237	NC_014484	GCT	2	6	268840	268845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717925
7238	NC_014484	TCT	2	6	268849	268854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717925
7239	NC_014484	TGA	2	6	268945	268950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717925
7240	NC_014484	GAT	2	6	269012	269017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717925
7241	NC_014484	CAG	2	6	269048	269053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717925
7242	NC_014484	CTTC	2	8	269056	269063	0 %	50 %	0 %	50 %	307717925
7243	NC_014484	GTG	2	6	269072	269077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717925
7244	NC_014484	AGA	2	6	269152	269157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717925
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7487	NC_014484	AGGG	2	8	277646	277653	25 %	0 %	75 %	0 %	307717933
7488	NC_014484	AGG	2	6	277709	277714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717933
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7491	NC_014484	TAC	2	6	277765	277770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717933
7492	NC_014484	GTG	2	6	277807	277812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717933
7493	NC_014484	GGT	2	6	277830	277835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717933
7494	NC_014484	CGG	2	6	277842	277847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717933
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