MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6192 chromosome

Total Repeats: 64538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64501	NC_014484	CAC	2	6	2471205	2471210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307719920
64502	NC_014484	GAA	2	6	2471267	2471272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307719920
64503	NC_014484	CCT	3	9	2471450	2471458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307719920
64504	NC_014484	TC	3	6	2471459	2471464	0 %	50 %	0 %	50 %	307719920
64505	NC_014484	GCC	2	6	2471467	2471472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307719920
64506	NC_014484	CGC	2	6	2471503	2471508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307719920
64507	NC_014484	GAG	2	6	2471550	2471555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307719920
64508	NC_014484	CTT	2	6	2471598	2471603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307719920
64509	NC_014484	CCA	3	9	2471657	2471665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307719920
64510	NC_014484	GCTC	3	12	2471718	2471729	0 %	25 %	25 %	50 %	307719920
64511	NC_014484	GAG	2	6	2471754	2471759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307719920
64512	NC_014484	TCC	2	6	2471773	2471778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307719920
64513	NC_014484	ACC	2	6	2471800	2471805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307719920
64514	NC_014484	CTC	2	6	2471812	2471817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307719920
64515	NC_014484	GCC	2	6	2471879	2471884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307719920
64516	NC_014484	CG	3	6	2471989	2471994	0 %	0 %	50 %	50 %	307719920
64517	NC_014484	TCCC	2	8	2471999	2472006	0 %	25 %	0 %	75 %	307719920
64518	NC_014484	AGG	2	6	2472016	2472021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307719920
64519	NC_014484	GCT	2	6	2472023	2472028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307719920
64520	NC_014484	CCT	2	6	2472071	2472076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307719920
64521	NC_014484	C	6	6	2472078	2472083	0 %	0 %	0 %	100 %	307719920
64522	NC_014484	CCT	2	6	2472110	2472115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307719920
64523	NC_014484	GTA	2	6	2472168	2472173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307719920
64524	NC_014484	CCT	2	6	2472221	2472226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307719920
64525	NC_014484	CT	3	6	2472225	2472230	0 %	50 %	0 %	50 %	307719920
64526	NC_014484	AGG	2	6	2472241	2472246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307719920
64527	NC_014484	CCT	2	6	2472278	2472283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307719920
64528	NC_014484	AG	3	6	2472318	2472323	50 %	0 %	50 %	0 %	307719920
64529	NC_014484	TCAG	2	8	2472337	2472344	25 %	25 %	25 %	25 %	307719920
64530	NC_014484	TCC	2	6	2472377	2472382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64531	NC_014484	TGG	2	6	2472402	2472407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64532	NC_014484	T	6	6	2472423	2472428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64533	NC_014484	ATG	2	6	2472491	2472496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64534	NC_014484	A	6	6	2472500	2472505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64535	NC_014484	A	6	6	2472511	2472516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64536	NC_014484	TTTA	2	8	2472587	2472594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64537	NC_014484	AATAA	2	10	2472611	2472620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64538	NC_014484	TCGT	2	8	2472637	2472644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.