MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_014251	ATC	2	6	1958427	1958432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40002	NC_014251	GGC	2	6	1958445	1958450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40003	NC_014251	GTG	2	6	1958497	1958502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40004	NC_014251	GT	3	6	1958512	1958517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40005	NC_014251	GT	3	6	1958681	1958686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40006	NC_014251	ATG	2	6	1958706	1958711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40007	NC_014251	TCC	2	6	1958732	1958737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40008	NC_014251	TTA	2	6	1958741	1958746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40009	NC_014251	ATG	2	6	1958776	1958781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40010	NC_014251	CACGA	2	10	1958831	1958840	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
40011	NC_014251	GAC	2	6	1958844	1958849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40012	NC_014251	CAC	2	6	1958857	1958862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40013	NC_014251	TTC	2	6	1958932	1958937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40014	NC_014251	AG	3	6	1959171	1959176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40015	NC_014251	TCC	2	6	1959196	1959201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40016	NC_014251	AT	3	6	1959202	1959207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40017	NC_014251	CTA	2	6	1959279	1959284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40018	NC_014251	GCT	2	6	1959385	1959390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40019	NC_014251	TTC	2	6	1959459	1959464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40020	NC_014251	ACA	2	6	1959469	1959474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40021	NC_014251	CTT	2	6	1959495	1959500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40022	NC_014251	CTG	2	6	1959554	1959559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40023	NC_014251	TCG	2	6	1959629	1959634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40024	NC_014251	CCA	2	6	1959653	1959658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40025	NC_014251	CAGG	2	8	1959780	1959787	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40026	NC_014251	AAGC	2	8	1959828	1959835	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40027	NC_014251	TCC	2	6	1959836	1959841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40028	NC_014251	CGC	2	6	1959871	1959876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40029	NC_014251	T	6	6	1959957	1959962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40030	NC_014251	TAC	2	6	1959973	1959978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503633
40031	NC_014251	TGT	2	6	1959985	1959990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503633
40032	NC_014251	TC	3	6	1960047	1960052	0 %	50 %	0 %	50 %	298503633
40033	NC_014251	T	6	6	1960101	1960106	0 %	100 %	0 %	0 %	298503633
40034	NC_014251	T	7	7	1960120	1960126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40035	NC_014251	T	7	7	1960131	1960137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40036	NC_014251	CCG	2	6	1960195	1960200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40037	NC_014251	GTT	2	6	1960241	1960246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40038	NC_014251	TAT	2	6	1960262	1960267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40039	NC_014251	T	6	6	1960295	1960300	0 %	100 %	0 %	0 %	298503634
40040	NC_014251	T	7	7	1960305	1960311	0 %	100 %	0 %	0 %	298503634
40041	NC_014251	ACA	2	6	1960321	1960326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503634
40042	NC_014251	CGAC	2	8	1960358	1960365	25 %	0 %	25 %	50 %	298503634
40043	NC_014251	CTA	2	6	1960391	1960396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503634
40044	NC_014251	T	6	6	1960448	1960453	0 %	100 %	0 %	0 %	298503634
40045	NC_014251	TAAG	2	8	1960462	1960469	50 %	25 %	25 %	0 %	298503634
40046	NC_014251	TAA	2	6	1960479	1960484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503634
40047	NC_014251	ATC	2	6	1960488	1960493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503634
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40050	NC_014251	CCTT	2	8	1960540	1960547	0 %	50 %	0 %	50 %	298503634
40051	NC_014251	AAT	2	6	1960560	1960565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503634
40052	NC_014251	AAT	2	6	1960650	1960655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503634
40053	NC_014251	CTTT	2	8	1960679	1960686	0 %	75 %	0 %	25 %	298503634
40054	NC_014251	TCAA	2	8	1960726	1960733	50 %	25 %	0 %	25 %	298503634
40055	NC_014251	TCT	2	6	1960738	1960743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503634
40056	NC_014251	CTT	2	6	1960853	1960858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503634
40057	NC_014251	CT	3	6	1960864	1960869	0 %	50 %	0 %	50 %	298503634
40058	NC_014251	AT	3	6	1960899	1960904	50 %	50 %	0 %	0 %	298503634
40059	NC_014251	TGTATT	2	12	1960920	1960931	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298503634
40060	NC_014251	AAT	3	9	1961013	1961021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503634
40061	NC_014251	CG	3	6	1961043	1961048	0 %	0 %	50 %	50 %	298503634
40062	NC_014251	ATA	2	6	1961056	1961061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503634
40063	NC_014251	TC	3	6	1961082	1961087	0 %	50 %	0 %	50 %	298503634
40064	NC_014251	TAAG	2	8	1961110	1961117	50 %	25 %	25 %	0 %	298503634
40065	NC_014251	CTA	2	6	1961183	1961188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503634
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40067	NC_014251	TGA	2	6	1961350	1961355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503634
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40073	NC_014251	T	6	6	1961630	1961635	0 %	100 %	0 %	0 %	298503634
40074	NC_014251	GAAAA	2	10	1961710	1961719	80 %	0 %	20 %	0 %	298503635
40075	NC_014251	A	7	7	1961716	1961722	100 %	0 %	0 %	0 %	298503635
40076	NC_014251	GA	3	6	1961799	1961804	50 %	0 %	50 %	0 %	298503635
40077	NC_014251	GCAC	2	8	1961899	1961906	25 %	0 %	25 %	50 %	298503635
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40080	NC_014251	AGA	2	6	1961985	1961990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503635
40081	NC_014251	ATG	2	6	1962002	1962007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503635
40082	NC_014251	ATC	2	6	1962025	1962030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503635
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40087	NC_014251	AAGAT	2	10	1962215	1962224	60 %	20 %	20 %	0 %	298503635
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40102	NC_014251	TTG	2	6	1962999	1963004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503636
40103	NC_014251	T	7	7	1963123	1963129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40104	NC_014251	GTA	2	6	1963131	1963136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40105	NC_014251	AAAT	2	8	1963139	1963146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40106	NC_014251	ACA	2	6	1963188	1963193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40107	NC_014251	AT	3	6	1963229	1963234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40108	NC_014251	T	6	6	1963257	1963262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40109	NC_014251	ACA	2	6	1963287	1963292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40110	NC_014251	A	6	6	1963312	1963317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40111	NC_014251	A	6	6	1963336	1963341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40112	NC_014251	T	7	7	1963368	1963374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40113	NC_014251	ATCA	2	8	1963390	1963397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40114	NC_014251	TAA	2	6	1963631	1963636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503637
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40118	NC_014251	T	6	6	1963747	1963752	0 %	100 %	0 %	0 %	298503637
40119	NC_014251	TAA	2	6	1963755	1963760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503637
40120	NC_014251	GAT	2	6	1963816	1963821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40121	NC_014251	AATA	2	8	1963872	1963879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40122	NC_014251	ATC	2	6	1963898	1963903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40123	NC_014251	CTA	2	6	1963905	1963910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40124	NC_014251	TATT	2	8	1963960	1963967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40125	NC_014251	TTG	2	6	1964001	1964006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503638
40126	NC_014251	T	6	6	1964011	1964016	0 %	100 %	0 %	0 %	298503638
40127	NC_014251	A	6	6	1964071	1964076	100 %	0 %	0 %	0 %	298503638
40128	NC_014251	TCA	2	6	1964077	1964082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503638
40129	NC_014251	ATA	2	6	1964147	1964152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503638
40130	NC_014251	A	6	6	1964157	1964162	100 %	0 %	0 %	0 %	298503638
40131	NC_014251	GCA	2	6	1964233	1964238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503638
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40133	NC_014251	ATT	2	6	1964370	1964375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503639
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40135	NC_014251	TCA	3	9	1964491	1964499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503639
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40142	NC_014251	ATG	2	6	1964718	1964723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503639
40143	NC_014251	TCA	2	6	1964953	1964958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503639
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40146	NC_014251	T	6	6	1965004	1965009	0 %	100 %	0 %	0 %	298503639
40147	NC_014251	CTT	2	6	1965015	1965020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503639
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40149	NC_014251	A	6	6	1965163	1965168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40150	NC_014251	ACA	2	6	1965194	1965199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40151	NC_014251	TTC	2	6	1965287	1965292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503640
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40153	NC_014251	T	7	7	1965360	1965366	0 %	100 %	0 %	0 %	298503640
40154	NC_014251	CAA	2	6	1965374	1965379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503640
40155	NC_014251	CTA	2	6	1965398	1965403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503640
40156	NC_014251	A	7	7	1965406	1965412	100 %	0 %	0 %	0 %	298503640
40157	NC_014251	TA	3	6	1965437	1965442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40158	NC_014251	ATAGT	2	10	1965455	1965464	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40159	NC_014251	CTA	2	6	1965539	1965544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503641
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40168	NC_014251	CTC	3	9	1965927	1965935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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40172	NC_014251	G	6	6	1966251	1966256	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40173	NC_014251	TCT	2	6	1966273	1966278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40178	NC_014251	GTT	2	6	1966408	1966413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40217	NC_014251	TTA	2	6	1968377	1968382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40226	NC_014251	A	7	7	1968937	1968943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40227	NC_014251	T	6	6	1968974	1968979	0 %	100 %	0 %	0 %	298503646
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40229	NC_014251	ACG	2	6	1969047	1969052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503646
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40233	NC_014251	TTGA	2	8	1969341	1969348	25 %	50 %	25 %	0 %	298503646
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40237	NC_014251	CGT	2	6	1969636	1969641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503646
40238	NC_014251	T	6	6	1969729	1969734	0 %	100 %	0 %	0 %	298503646
40239	NC_014251	TCT	2	6	1969821	1969826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503647
40240	NC_014251	CAT	2	6	1969889	1969894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503647
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40242	NC_014251	CAT	2	6	1969949	1969954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503647
40243	NC_014251	GGT	2	6	1970062	1970067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298503647
40244	NC_014251	CAA	3	9	1970104	1970112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503647
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40266	NC_014251	TGA	2	6	1971346	1971351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503651
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40272	NC_014251	TCAT	2	8	1971505	1971512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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40358	NC_014251	GTC	2	6	1975268	1975273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503657
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40481	NC_014251	TAC	2	6	1981575	1981580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40485	NC_014251	AAT	2	6	1981669	1981674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40489	NC_014251	ATT	2	6	1981763	1981768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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