MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014251	ATG	2	6	169598	169603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_014251	TCTG	2	8	169630	169637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_014251	CTGA	2	8	169638	169645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_014251	CAC	2	6	169658	169663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_014251	ATT	2	6	169669	169674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_014251	TGA	2	6	169851	169856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_014251	GAG	2	6	169922	169927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_014251	TAT	2	6	169966	169971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_014251	GACT	2	8	170039	170046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3510	NC_014251	A	6	6	170083	170088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014251	TGA	2	6	170194	170199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_014251	GAG	2	6	170265	170270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014251	TAT	2	6	170309	170314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501674
3514	NC_014251	AAG	2	6	170370	170375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501674
3515	NC_014251	GACT	2	8	170382	170389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_014251	A	6	6	170426	170431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_014251	ACTA	2	8	170485	170492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_014251	TATT	2	8	170529	170536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_014251	T	6	6	170535	170540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_014251	A	6	6	170592	170597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_014251	TCA	2	6	170628	170633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501675
3522	NC_014251	GTA	2	6	170682	170687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501675
3523	NC_014251	TTC	2	6	170706	170711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501675
3524	NC_014251	CTT	2	6	170720	170725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501675
3525	NC_014251	AGA	2	6	170741	170746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501675
3526	NC_014251	ACGC	2	8	170844	170851	25 %	0 %	25 %	50 %	298501675
3527	NC_014251	TAT	2	6	170942	170947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501675
3528	NC_014251	TCTG	2	8	170971	170978	0 %	50 %	25 %	25 %	298501675
3529	NC_014251	AAGGA	2	10	171075	171084	60 %	0 %	40 %	0 %	298501675
3530	NC_014251	CTT	2	6	171206	171211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501675
3531	NC_014251	TGT	2	6	171216	171221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501675
3532	NC_014251	CTT	2	6	171335	171340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501675
3533	NC_014251	GT	3	6	171347	171352	0 %	50 %	50 %	0 %	298501675
3534	NC_014251	TTC	2	6	171375	171380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501675
3535	NC_014251	ATTTT	2	10	171397	171406	20 %	80 %	0 %	0 %	298501675
3536	NC_014251	AGC	2	6	171438	171443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501675
3537	NC_014251	TTTTG	2	10	171544	171553	0 %	80 %	20 %	0 %	298501675
3538	NC_014251	TTC	2	6	171619	171624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501675
3539	NC_014251	T	6	6	171636	171641	0 %	100 %	0 %	0 %	298501675
3540	NC_014251	CTG	2	6	171653	171658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501675
3541	NC_014251	CTA	2	6	171680	171685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501675
3542	NC_014251	TGA	2	6	171736	171741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501675
3543	NC_014251	CTT	2	6	171743	171748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501675
3544	NC_014251	CATGGT	2	12	171752	171763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298501675
3545	NC_014251	CTT	2	6	171770	171775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501675
3546	NC_014251	T	6	6	171828	171833	0 %	100 %	0 %	0 %	298501675
3547	NC_014251	TTTTCA	2	12	171877	171888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298501675
3548	NC_014251	CTTG	2	8	172004	172011	0 %	50 %	25 %	25 %	298501675
3549	NC_014251	TAA	2	6	172116	172121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501675
3550	NC_014251	T	7	7	172127	172133	0 %	100 %	0 %	0 %	298501675
3551	NC_014251	AAT	2	6	172197	172202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501676
3552	NC_014251	ACTTGC	2	12	172209	172220	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298501676
3553	NC_014251	TAG	2	6	172234	172239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501676
3554	NC_014251	AGC	2	6	172288	172293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501676
3555	NC_014251	AGA	2	6	172363	172368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501676
3556	NC_014251	CTG	2	6	172373	172378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501676
3557	NC_014251	GAA	2	6	172499	172504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501676
3558	NC_014251	TCAAAA	2	12	172514	172525	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298501676
3559	NC_014251	CCG	2	6	172529	172534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501676
3560	NC_014251	TTC	2	6	172560	172565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501676
3561	NC_014251	CCG	2	6	172733	172738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501676
3562	NC_014251	TAG	2	6	172757	172762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501676
3563	NC_014251	TCA	2	6	172835	172840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501676
3564	NC_014251	GAC	2	6	172847	172852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501676
3565	NC_014251	ATA	2	6	172937	172942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501676
3566	NC_014251	CCT	2	6	172959	172964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501677
3567	NC_014251	AAC	2	6	172986	172991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501677
3568	NC_014251	CTT	2	6	173049	173054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501677
3569	NC_014251	ATC	2	6	173069	173074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501677
3570	NC_014251	ATG	3	9	173089	173097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501677
3571	NC_014251	CATC	2	8	173142	173149	25 %	25 %	0 %	50 %	298501677
3572	NC_014251	CGCT	2	8	173212	173219	0 %	25 %	25 %	50 %	298501677
3573	NC_014251	CTC	2	6	173302	173307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501677
3574	NC_014251	ACG	2	6	173323	173328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501677
3575	NC_014251	TTG	2	6	173410	173415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501677
3576	NC_014251	TGA	2	6	173511	173516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501677
3577	NC_014251	CGT	2	6	173518	173523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501677
3578	NC_014251	ATA	2	6	173611	173616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501677
3579	NC_014251	AT	3	6	173639	173644	50 %	50 %	0 %	0 %	298501677
3580	NC_014251	ATT	2	6	173648	173653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501677
3581	NC_014251	CTA	2	6	173663	173668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501678
3582	NC_014251	ATGGTG	2	12	173754	173765	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298501678
3583	NC_014251	CTC	2	6	173769	173774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501678
3584	NC_014251	AGTC	2	8	173792	173799	25 %	25 %	25 %	25 %	298501678
3585	NC_014251	A	6	6	173807	173812	100 %	0 %	0 %	0 %	298501678
3586	NC_014251	CCTT	2	8	173854	173861	0 %	50 %	0 %	50 %	298501678
3587	NC_014251	GCC	2	6	173890	173895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501678
3588	NC_014251	TGAC	2	8	173896	173903	25 %	25 %	25 %	25 %	298501678
3589	NC_014251	GAC	2	6	173909	173914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501678
3590	NC_014251	A	6	6	174055	174060	100 %	0 %	0 %	0 %	298501678
3591	NC_014251	TCCTT	2	10	174097	174106	0 %	60 %	0 %	40 %	298501678
3592	NC_014251	T	6	6	174118	174123	0 %	100 %	0 %	0 %	298501678
3593	NC_014251	A	7	7	174179	174185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_014251	A	6	6	174194	174199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_014251	TATAT	2	10	174231	174240	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_014251	CAT	2	6	174267	174272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3598	NC_014251	CCAA	2	8	174378	174385	50 %	0 %	0 %	50 %	298501679
3599	NC_014251	AAAG	2	8	174405	174412	75 %	0 %	25 %	0 %	298501679
3600	NC_014251	CCG	2	6	174418	174423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501679
3601	NC_014251	TCT	2	6	174479	174484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501679
3602	NC_014251	TTG	2	6	174492	174497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501679
3603	NC_014251	TCCA	2	8	174526	174533	25 %	25 %	0 %	50 %	298501679
3604	NC_014251	T	6	6	174534	174539	0 %	100 %	0 %	0 %	298501679
3605	NC_014251	TTC	2	6	174664	174669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501679
3606	NC_014251	CTT	2	6	174675	174680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501679
3607	NC_014251	AAT	2	6	174698	174703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501679
3608	NC_014251	ATT	2	6	174720	174725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501679
3609	NC_014251	T	7	7	174733	174739	0 %	100 %	0 %	0 %	298501679
3610	NC_014251	ACA	2	6	174754	174759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501679
3611	NC_014251	TCT	2	6	174760	174765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501679
3612	NC_014251	A	6	6	174858	174863	100 %	0 %	0 %	0 %	298501679
3613	NC_014251	AAT	2	6	174892	174897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501679
3614	NC_014251	TCATT	2	10	174902	174911	20 %	60 %	0 %	20 %	298501679
3615	NC_014251	CTG	2	6	174914	174919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501679
3616	NC_014251	CTG	2	6	175071	175076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501679
3617	NC_014251	GCT	2	6	175081	175086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501679
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3619	NC_014251	AAG	2	6	175300	175305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501679
3620	NC_014251	TAG	3	9	175373	175381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501679
3621	NC_014251	CTG	2	6	175385	175390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501679
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3623	NC_014251	CAA	2	6	175455	175460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501679
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3625	NC_014251	TTA	2	6	175538	175543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501680
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3749	NC_014251	ATC	2	6	181252	181257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501686
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3753	NC_014251	ATCT	2	8	181473	181480	25 %	50 %	0 %	25 %	298501686
3754	NC_014251	ATG	2	6	181562	181567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501686
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3777	NC_014251	TTGT	2	8	183035	183042	0 %	75 %	25 %	0 %	298501689
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3889	NC_014251	A	6	6	188491	188496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4000	NC_014251	CAA	2	6	193536	193541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501699

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