MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_014251	ATA	2	6	1661784	1661789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503307
34003	NC_014251	GAT	2	6	1661813	1661818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503307
34004	NC_014251	GTT	2	6	1661893	1661898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503307
34005	NC_014251	TTC	2	6	1661906	1661911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503307
34006	NC_014251	CAC	2	6	1661926	1661931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503307
34007	NC_014251	T	6	6	1661949	1661954	0 %	100 %	0 %	0 %	298503307
34008	NC_014251	ATC	2	6	1661967	1661972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503307
34009	NC_014251	TTG	2	6	1661975	1661980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503307
34010	NC_014251	GGC	2	6	1662003	1662008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298503307
34011	NC_014251	TTG	2	6	1662047	1662052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503307
34012	NC_014251	CTT	2	6	1662098	1662103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503307
34013	NC_014251	ATC	2	6	1662321	1662326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503307
34014	NC_014251	TCT	2	6	1662354	1662359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503307
34015	NC_014251	CTC	2	6	1662527	1662532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503307
34016	NC_014251	CA	3	6	1662557	1662562	50 %	0 %	0 %	50 %	298503307
34017	NC_014251	GTT	2	6	1662581	1662586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503307
34018	NC_014251	ATT	2	6	1662594	1662599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503307
34019	NC_014251	T	6	6	1662598	1662603	0 %	100 %	0 %	0 %	298503307
34020	NC_014251	CTT	3	9	1662607	1662615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503307
34021	NC_014251	CAT	2	6	1662644	1662649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503307
34022	NC_014251	ATT	2	6	1662653	1662658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503307
34023	NC_014251	TTCTA	2	10	1662686	1662695	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34024	NC_014251	TCTA	2	8	1662705	1662712	25 %	50 %	0 %	25 %	298503308
34025	NC_014251	A	6	6	1662855	1662860	100 %	0 %	0 %	0 %	298503308
34026	NC_014251	TAC	2	6	1662868	1662873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503308
34027	NC_014251	CCA	2	6	1663082	1663087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503309
34028	NC_014251	TCTTG	2	10	1663101	1663110	0 %	60 %	20 %	20 %	298503309
34029	NC_014251	AGAC	2	8	1663128	1663135	50 %	0 %	25 %	25 %	298503309
34030	NC_014251	CAT	2	6	1663140	1663145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503309
34031	NC_014251	AGT	2	6	1663150	1663155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503309
34032	NC_014251	ATCT	2	8	1663162	1663169	25 %	50 %	0 %	25 %	298503309
34033	NC_014251	TCT	2	6	1663172	1663177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503309
34034	NC_014251	CCCAT	2	10	1663226	1663235	20 %	20 %	0 %	60 %	298503309
34035	NC_014251	GTT	2	6	1663274	1663279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503309
34036	NC_014251	CTG	2	6	1663299	1663304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503309
34037	NC_014251	A	6	6	1663422	1663427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34038	NC_014251	A	7	7	1663431	1663437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34039	NC_014251	A	7	7	1663466	1663472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34040	NC_014251	CTT	2	6	1663484	1663489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34041	NC_014251	TA	4	8	1663497	1663504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34042	NC_014251	TAT	2	6	1663509	1663514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34043	NC_014251	CAA	2	6	1663589	1663594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503310
34044	NC_014251	CAT	2	6	1663610	1663615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503310
34045	NC_014251	CTT	2	6	1663619	1663624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503310
34046	NC_014251	GTCA	2	8	1663626	1663633	25 %	25 %	25 %	25 %	298503310
34047	NC_014251	TGA	2	6	1663658	1663663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503310
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34050	NC_014251	TACA	2	8	1663920	1663927	50 %	25 %	0 %	25 %	298503310
34051	NC_014251	GCT	2	6	1663981	1663986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503310
34052	NC_014251	ATG	2	6	1663994	1663999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503310
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34054	NC_014251	T	6	6	1664019	1664024	0 %	100 %	0 %	0 %	298503310
34055	NC_014251	TCAT	2	8	1664047	1664054	25 %	50 %	0 %	25 %	298503310
34056	NC_014251	T	6	6	1664057	1664062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34057	NC_014251	CTT	2	6	1664070	1664075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34058	NC_014251	TAC	2	6	1664082	1664087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34059	NC_014251	TAC	2	6	1664095	1664100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34060	NC_014251	AGA	2	6	1664175	1664180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34061	NC_014251	A	6	6	1664182	1664187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34062	NC_014251	GAA	2	6	1664305	1664310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34063	NC_014251	CTA	2	6	1664421	1664426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34064	NC_014251	TA	3	6	1664425	1664430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34065	NC_014251	CTA	2	6	1664502	1664507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34066	NC_014251	AGA	2	6	1664584	1664589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503311
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34071	NC_014251	CAT	2	6	1664850	1664855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503311
34072	NC_014251	ATAG	2	8	1664857	1664864	50 %	25 %	25 %	0 %	298503311
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34078	NC_014251	CCAT	2	8	1665266	1665273	25 %	25 %	0 %	50 %	298503311
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34091	NC_014251	GTA	2	6	1665679	1665684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503311
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34100	NC_014251	TACT	2	8	1666066	1666073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34101	NC_014251	ATT	2	6	1666075	1666080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503312
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34114	NC_014251	GAT	2	6	1666457	1666462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503312
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34118	NC_014251	AGT	2	6	1666528	1666533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503312
34119	NC_014251	AAC	2	6	1666556	1666561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503312
34120	NC_014251	TTTC	2	8	1666576	1666583	0 %	75 %	0 %	25 %	298503312
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34126	NC_014251	T	6	6	1666847	1666852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34127	NC_014251	ATTT	2	8	1666855	1666862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34193	NC_014251	TATT	2	8	1670595	1670602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34226	NC_014251	AGCT	2	8	1671990	1671997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34227	NC_014251	TAGC	2	8	1671999	1672006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34228	NC_014251	GA	3	6	1672021	1672026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34229	NC_014251	TTACT	2	10	1672108	1672117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34230	NC_014251	T	7	7	1672150	1672156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34231	NC_014251	T	6	6	1672161	1672166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34232	NC_014251	ACCA	2	8	1672174	1672181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34233	NC_014251	CTA	2	6	1672213	1672218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503320
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34236	NC_014251	CT	3	6	1672400	1672405	0 %	50 %	0 %	50 %	298503320
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