MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33004	NC_014251	GTT	2	6	1607285	1607290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503257
33005	NC_014251	TCA	2	6	1607346	1607351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503257
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33007	NC_014251	CCTG	2	8	1607370	1607377	0 %	25 %	25 %	50 %	298503257
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33009	NC_014251	CAAGGC	2	12	1607453	1607464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503257
33010	NC_014251	TGTT	2	8	1607577	1607584	0 %	75 %	25 %	0 %	298503258
33011	NC_014251	T	7	7	1607588	1607594	0 %	100 %	0 %	0 %	298503258
33012	NC_014251	CTT	2	6	1607610	1607615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503258
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33014	NC_014251	CTT	2	6	1607687	1607692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503258
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33017	NC_014251	T	6	6	1607919	1607924	0 %	100 %	0 %	0 %	298503258
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33020	NC_014251	GATCA	2	10	1608048	1608057	40 %	20 %	20 %	20 %	298503258
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33029	NC_014251	GA	3	6	1608637	1608642	50 %	0 %	50 %	0 %	298503259
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33035	NC_014251	CTT	3	9	1608937	1608945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503259
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33070	NC_014251	A	6	6	1611133	1611138	100 %	0 %	0 %	0 %	298503259
33071	NC_014251	ATC	2	6	1611143	1611148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503259
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33090	NC_014251	TTAA	2	8	1612202	1612209	50 %	50 %	0 %	0 %	298503260
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33092	NC_014251	TTAA	2	8	1612340	1612347	50 %	50 %	0 %	0 %	298503260
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33103	NC_014251	TTGG	2	8	1613208	1613215	0 %	50 %	50 %	0 %	298503261
33104	NC_014251	ACATCC	2	12	1613232	1613243	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	298503261
33105	NC_014251	CTT	2	6	1613266	1613271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503261
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33113	NC_014251	TA	3	6	1613737	1613742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33114	NC_014251	AGT	2	6	1613857	1613862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503262
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33116	NC_014251	AAG	2	6	1613902	1613907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503262
33117	NC_014251	TCT	2	6	1613963	1613968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503262
33118	NC_014251	TCA	2	6	1614037	1614042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503262
33119	NC_014251	C	6	6	1614102	1614107	0 %	0 %	0 %	100 %	298503262
33120	NC_014251	TCA	2	6	1614169	1614174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503262
33121	NC_014251	TCA	2	6	1614200	1614205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503262
33122	NC_014251	TCA	3	9	1614208	1614216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503262
33123	NC_014251	ATT	2	6	1614276	1614281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503262
33124	NC_014251	AT	3	6	1614330	1614335	50 %	50 %	0 %	0 %	298503262
33125	NC_014251	CAA	2	6	1614428	1614433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503262
33126	NC_014251	T	6	6	1614440	1614445	0 %	100 %	0 %	0 %	298503262
33127	NC_014251	TCA	2	6	1614493	1614498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503262
33128	NC_014251	TCC	2	6	1614549	1614554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503262
33129	NC_014251	GCAA	2	8	1614577	1614584	50 %	0 %	25 %	25 %	298503262
33130	NC_014251	CTA	2	6	1614613	1614618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503262
33131	NC_014251	AATA	2	8	1614620	1614627	75 %	25 %	0 %	0 %	298503262
33132	NC_014251	AT	4	8	1614707	1614714	50 %	50 %	0 %	0 %	298503262
33133	NC_014251	ATAA	2	8	1614769	1614776	75 %	25 %	0 %	0 %	298503262
33134	NC_014251	AAG	2	6	1614797	1614802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503262
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33136	NC_014251	TCC	2	6	1614949	1614954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503262
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33139	NC_014251	CAT	2	6	1615008	1615013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503262
33140	NC_014251	TGA	2	6	1615025	1615030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503262
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33142	NC_014251	AAG	2	6	1615198	1615203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503262
33143	NC_014251	T	6	6	1615236	1615241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33144	NC_014251	T	6	6	1615258	1615263	0 %	100 %	0 %	0 %	298503263
33145	NC_014251	AGA	2	6	1615295	1615300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503263
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33147	NC_014251	TAGAC	2	10	1615415	1615424	40 %	20 %	20 %	20 %	298503263
33148	NC_014251	TAA	2	6	1615469	1615474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503263
33149	NC_014251	TAA	2	6	1615549	1615554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33150	NC_014251	TA	3	6	1615591	1615596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33151	NC_014251	CTT	2	6	1615627	1615632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33152	NC_014251	TTC	2	6	1615679	1615684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503264
33153	NC_014251	T	6	6	1615691	1615696	0 %	100 %	0 %	0 %	298503264
33154	NC_014251	TTC	2	6	1615703	1615708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503264
33155	NC_014251	TTTC	2	8	1615711	1615718	0 %	75 %	0 %	25 %	298503264
33156	NC_014251	TGT	2	6	1615751	1615756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503264
33157	NC_014251	ATCTT	2	10	1615761	1615770	20 %	60 %	0 %	20 %	298503264
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33164	NC_014251	ACG	2	6	1616217	1616222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503264
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33166	NC_014251	CTT	2	6	1616269	1616274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503264
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33191	NC_014251	TAT	2	6	1617651	1617656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33192	NC_014251	GTTT	2	8	1617667	1617674	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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33197	NC_014251	TTTA	2	8	1617801	1617808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33202	NC_014251	ATG	2	6	1618127	1618132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503265
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33205	NC_014251	TTGCGG	2	12	1618241	1618252	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	298503265
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33210	NC_014251	TTA	2	6	1618556	1618561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503265
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33219	NC_014251	CTTG	2	8	1619211	1619218	0 %	50 %	25 %	25 %	298503265
33220	NC_014251	CAA	2	6	1619251	1619256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503265
33221	NC_014251	CTG	2	6	1619416	1619421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503265
33222	NC_014251	AAAG	2	8	1619580	1619587	75 %	0 %	25 %	0 %	298503266
33223	NC_014251	ATT	2	6	1619605	1619610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503266
33224	NC_014251	ACTACA	2	12	1619627	1619638	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	298503266
33225	NC_014251	GTT	2	6	1619644	1619649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503266
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33227	NC_014251	T	8	8	1619696	1619703	0 %	100 %	0 %	0 %	298503266
33228	NC_014251	TGC	2	6	1619712	1619717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503266
33229	NC_014251	A	6	6	1619722	1619727	100 %	0 %	0 %	0 %	298503266
33230	NC_014251	CTT	2	6	1619734	1619739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503266
33231	NC_014251	TCA	2	6	1619804	1619809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503266
33232	NC_014251	AAAG	2	8	1619823	1619830	75 %	0 %	25 %	0 %	298503266
33233	NC_014251	ACA	2	6	1619914	1619919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503266
33234	NC_014251	ACA	2	6	1619936	1619941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503266
33235	NC_014251	CTTT	2	8	1620005	1620012	0 %	75 %	0 %	25 %	298503266
33236	NC_014251	ATG	2	6	1620055	1620060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503266
33237	NC_014251	GAA	2	6	1620080	1620085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503266
33238	NC_014251	TCTT	2	8	1620161	1620168	0 %	75 %	0 %	25 %	298503266
33239	NC_014251	TCA	2	6	1620263	1620268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503266
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33241	NC_014251	CTTG	2	8	1620466	1620473	0 %	50 %	25 %	25 %	298503266
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33243	NC_014251	CTCA	2	8	1620550	1620557	25 %	25 %	0 %	50 %	298503266
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33245	NC_014251	TCA	2	6	1620617	1620622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503266
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33344	NC_014251	AGGT	2	8	1625250	1625257	25 %	25 %	50 %	0 %	298503274
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33352	NC_014251	GCAAGT	2	12	1625924	1625935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298503274
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33472	NC_014251	ATT	2	6	1631744	1631749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503283
33473	NC_014251	CT	3	6	1631759	1631764	0 %	50 %	0 %	50 %	298503283
33474	NC_014251	GCT	3	9	1631803	1631811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503283
33475	NC_014251	TC	3	6	1631849	1631854	0 %	50 %	0 %	50 %	298503283
33476	NC_014251	A	6	6	1631886	1631891	100 %	0 %	0 %	0 %	298503283
33477	NC_014251	CTTG	2	8	1631892	1631899	0 %	50 %	25 %	25 %	298503283
33478	NC_014251	ATC	2	6	1631973	1631978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503283
33479	NC_014251	CTG	2	6	1632065	1632070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503283
33480	NC_014251	GAA	2	6	1632115	1632120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503283
33481	NC_014251	A	6	6	1632176	1632181	100 %	0 %	0 %	0 %	298503283
33482	NC_014251	TCAA	2	8	1632242	1632249	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33483	NC_014251	A	7	7	1632276	1632282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33484	NC_014251	CAT	2	6	1632322	1632327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33485	NC_014251	ATC	2	6	1632374	1632379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33486	NC_014251	TCT	2	6	1632418	1632423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503284
33487	NC_014251	TTC	2	6	1632425	1632430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503284
33488	NC_014251	TAC	2	6	1632591	1632596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503284
33489	NC_014251	GTT	2	6	1632599	1632604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503284
33490	NC_014251	GTTG	2	8	1632640	1632647	0 %	50 %	50 %	0 %	298503284
33491	NC_014251	GTTG	2	8	1632679	1632686	0 %	50 %	50 %	0 %	298503284
33492	NC_014251	TAA	2	6	1632845	1632850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503284
33493	NC_014251	TGA	2	6	1632878	1632883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503284
33494	NC_014251	AAC	2	6	1632999	1633004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503284
33495	NC_014251	TTA	2	6	1633018	1633023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503284
33496	NC_014251	ACAGTT	2	12	1633030	1633041	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298503284
33497	NC_014251	TAA	2	6	1633076	1633081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503284
33498	NC_014251	GT	3	6	1633225	1633230	0 %	50 %	50 %	0 %	298503284
33499	NC_014251	GTT	2	6	1633239	1633244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503284
33500	NC_014251	GTT	2	6	1633288	1633293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503284

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