MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_014251	GCT	2	6	1558558	1558563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503197
32003	NC_014251	ATG	2	6	1558641	1558646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503197
32004	NC_014251	GCT	2	6	1558681	1558686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503197
32005	NC_014251	TG	3	6	1558709	1558714	0 %	50 %	50 %	0 %	298503197
32006	NC_014251	CAT	2	6	1558751	1558756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503197
32007	NC_014251	ATC	3	9	1558765	1558773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503197
32008	NC_014251	CAGC	2	8	1558778	1558785	25 %	0 %	25 %	50 %	298503197
32009	NC_014251	TCA	2	6	1558906	1558911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503197
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32012	NC_014251	ACG	2	6	1559040	1559045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503197
32013	NC_014251	AAG	2	6	1559187	1559192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503197
32014	NC_014251	CAC	2	6	1559268	1559273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503197
32015	NC_014251	GAA	2	6	1559307	1559312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503197
32016	NC_014251	CAT	2	6	1559336	1559341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503197
32017	NC_014251	CCAA	2	8	1559381	1559388	50 %	0 %	0 %	50 %	298503197
32018	NC_014251	CAAGAG	2	12	1559654	1559665	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	298503197
32019	NC_014251	CA	3	6	1559721	1559726	50 %	0 %	0 %	50 %	298503197
32020	NC_014251	CAT	2	6	1559736	1559741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503197
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32025	NC_014251	TTTTAG	2	12	1560095	1560106	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298503197
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32031	NC_014251	CG	3	6	1560320	1560325	0 %	0 %	50 %	50 %	298503197
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32037	NC_014251	TAA	2	6	1560674	1560679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503197
32038	NC_014251	GCT	3	9	1560725	1560733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32039	NC_014251	CTT	2	6	1560734	1560739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32040	NC_014251	CAAA	2	8	1560740	1560747	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32041	NC_014251	TTA	2	6	1560749	1560754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32042	NC_014251	A	6	6	1560773	1560778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32043	NC_014251	CTTC	2	8	1560806	1560813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32044	NC_014251	TTC	2	6	1560845	1560850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503198
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32051	NC_014251	GATT	2	8	1561219	1561226	25 %	50 %	25 %	0 %	298503198
32052	NC_014251	TATT	2	8	1561233	1561240	25 %	75 %	0 %	0 %	298503198
32053	NC_014251	T	6	6	1561278	1561283	0 %	100 %	0 %	0 %	298503199
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32068	NC_014251	CAA	2	6	1562007	1562012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503199
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32071	NC_014251	T	6	6	1562072	1562077	0 %	100 %	0 %	0 %	298503199
32072	NC_014251	TCA	2	6	1562102	1562107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503199
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32085	NC_014251	A	7	7	1562664	1562670	100 %	0 %	0 %	0 %	298503201
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32089	NC_014251	GCTAG	2	10	1562904	1562913	20 %	20 %	40 %	20 %	298503201
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32101	NC_014251	CTA	2	6	1563610	1563615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32102	NC_014251	ATT	2	6	1563626	1563631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503203
32103	NC_014251	GCA	2	6	1563636	1563641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503203
32104	NC_014251	TTCTT	2	10	1563659	1563668	0 %	80 %	0 %	20 %	298503203
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32110	NC_014251	TGC	2	6	1563937	1563942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503203
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32114	NC_014251	CAT	3	9	1564073	1564081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503203
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32118	NC_014251	TTC	2	6	1564367	1564372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503203
32119	NC_014251	ACGACC	2	12	1564376	1564387	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	298503203
32120	NC_014251	CTT	2	6	1564453	1564458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503203
32121	NC_014251	TCA	2	6	1564480	1564485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503203
32122	NC_014251	TCA	2	6	1564540	1564545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503203
32123	NC_014251	TTC	2	6	1564571	1564576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32124	NC_014251	A	6	6	1564590	1564595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32125	NC_014251	TCT	2	6	1564638	1564643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503204
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32156	NC_014251	A	7	7	1566275	1566281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32157	NC_014251	CAT	2	6	1566372	1566377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503207
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32237	NC_014251	TCA	2	6	1570393	1570398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503209
32238	NC_014251	CTT	2	6	1570415	1570420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503210
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32241	NC_014251	TGT	2	6	1570534	1570539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503210
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32263	NC_014251	T	6	6	1571596	1571601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32264	NC_014251	TAT	2	6	1571614	1571619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32267	NC_014251	T	6	6	1571752	1571757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32268	NC_014251	T	6	6	1571762	1571767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32269	NC_014251	AATCA	2	10	1571787	1571796	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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32272	NC_014251	CTA	2	6	1571833	1571838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32302	NC_014251	A	6	6	1573411	1573416	100 %	0 %	0 %	0 %	298503212
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32340	NC_014251	CTT	2	6	1575201	1575206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503217
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32353	NC_014251	TTTTC	2	10	1575657	1575666	0 %	80 %	0 %	20 %	298503217
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32383	NC_014251	ATT	2	6	1577238	1577243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32467	NC_014251	TGA	2	6	1580631	1580636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503222
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32470	NC_014251	TAGA	2	8	1580792	1580799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32471	NC_014251	ATT	2	6	1580881	1580886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32472	NC_014251	TAAT	2	8	1580904	1580911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32473	NC_014251	ATCC	2	8	1580956	1580963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32474	NC_014251	TA	3	6	1580998	1581003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32475	NC_014251	CTA	2	6	1581099	1581104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503223
32476	NC_014251	AAC	2	6	1581128	1581133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503223
32477	NC_014251	CTT	2	6	1581144	1581149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503223
32478	NC_014251	CAG	2	6	1581213	1581218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32479	NC_014251	GAA	2	6	1581233	1581238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32480	NC_014251	C	6	6	1581242	1581247	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32481	NC_014251	TTG	2	6	1581291	1581296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32482	NC_014251	G	6	6	1581336	1581341	0 %	0 %	100 %	0 %	298503224
32483	NC_014251	ATA	2	6	1581400	1581405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503224
32484	NC_014251	TA	3	6	1581404	1581409	50 %	50 %	0 %	0 %	298503224
32485	NC_014251	TAT	2	6	1581482	1581487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32486	NC_014251	CTA	2	6	1581500	1581505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32487	NC_014251	CTG	2	6	1581549	1581554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32488	NC_014251	GAG	2	6	1581557	1581562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32489	NC_014251	TTTC	2	8	1581574	1581581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32490	NC_014251	A	6	6	1581590	1581595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32491	NC_014251	AG	3	6	1581602	1581607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32492	NC_014251	CT	3	6	1581621	1581626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32493	NC_014251	CTCA	2	8	1581642	1581649	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32494	NC_014251	TGC	3	9	1581709	1581717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503225
32495	NC_014251	CTA	2	6	1581726	1581731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503225
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32497	NC_014251	GGAA	2	8	1581791	1581798	50 %	0 %	50 %	0 %	298503225
32498	NC_014251	TCC	2	6	1581856	1581861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503225
32499	NC_014251	GT	3	6	1581929	1581934	0 %	50 %	50 %	0 %	298503225
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