MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_014251	TTC	2	6	1533270	1533275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503167
31502	NC_014251	CAT	2	6	1533298	1533303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503167
31503	NC_014251	TCA	2	6	1533368	1533373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31504	NC_014251	TCTT	2	8	1533375	1533382	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31505	NC_014251	ATTTT	2	10	1533394	1533403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31506	NC_014251	CAAA	2	8	1533407	1533414	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31507	NC_014251	ATTTG	2	10	1533439	1533448	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31508	NC_014251	AAAC	2	8	1533470	1533477	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31509	NC_014251	GAAG	2	8	1533542	1533549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31510	NC_014251	CT	3	6	1533593	1533598	0 %	50 %	0 %	50 %	298503168
31511	NC_014251	AAT	2	6	1533607	1533612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503168
31512	NC_014251	ATT	2	6	1533617	1533622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503168
31513	NC_014251	CTG	2	6	1533635	1533640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503168
31514	NC_014251	TGAA	2	8	1533694	1533701	50 %	25 %	25 %	0 %	298503168
31515	NC_014251	ATC	2	6	1533767	1533772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503168
31516	NC_014251	CCAG	2	8	1533773	1533780	25 %	0 %	25 %	50 %	298503168
31517	NC_014251	ACC	2	6	1533814	1533819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503168
31518	NC_014251	TAA	2	6	1533833	1533838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503168
31519	NC_014251	CCA	2	6	1533882	1533887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503168
31520	NC_014251	GAAG	2	8	1533904	1533911	50 %	0 %	50 %	0 %	298503168
31521	NC_014251	GAG	2	6	1533987	1533992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298503168
31522	NC_014251	GCT	2	6	1534298	1534303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503168
31523	NC_014251	AGC	2	6	1534306	1534311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503168
31524	NC_014251	ATG	3	9	1534313	1534321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503168
31525	NC_014251	ACC	2	6	1534342	1534347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503168
31526	NC_014251	AGC	3	9	1534349	1534357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503168
31527	NC_014251	GAC	2	6	1534359	1534364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503168
31528	NC_014251	AAT	2	6	1534399	1534404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503168
31529	NC_014251	TAA	2	6	1534414	1534419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503168
31530	NC_014251	T	6	6	1534443	1534448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31531	NC_014251	TAT	2	6	1534460	1534465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31532	NC_014251	CCT	2	6	1534487	1534492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31533	NC_014251	TGC	2	6	1534606	1534611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503169
31534	NC_014251	TAGC	2	8	1534679	1534686	25 %	25 %	25 %	25 %	298503169
31535	NC_014251	TCA	2	6	1534736	1534741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503169
31536	NC_014251	CAG	2	6	1534788	1534793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503169
31537	NC_014251	ACC	2	6	1534820	1534825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503169
31538	NC_014251	AGC	2	6	1534840	1534845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503169
31539	NC_014251	AAG	2	6	1534906	1534911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503169
31540	NC_014251	TCA	2	6	1535123	1535128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503169
31541	NC_014251	ACT	2	6	1535240	1535245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503169
31542	NC_014251	TTG	2	6	1535282	1535287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503169
31543	NC_014251	TGGC	2	8	1535300	1535307	0 %	25 %	50 %	25 %	298503169
31544	NC_014251	CCAA	2	8	1535318	1535325	50 %	0 %	0 %	50 %	298503169
31545	NC_014251	TTC	2	6	1535356	1535361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503169
31546	NC_014251	AAT	2	6	1535425	1535430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503169
31547	NC_014251	TCTTT	2	10	1535448	1535457	0 %	80 %	0 %	20 %	298503169
31548	NC_014251	CTT	2	6	1535502	1535507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503169
31549	NC_014251	TCTTG	2	10	1535568	1535577	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31550	NC_014251	GTT	2	6	1535625	1535630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503170
31551	NC_014251	CAA	2	6	1535670	1535675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503170
31552	NC_014251	CG	3	6	1535870	1535875	0 %	0 %	50 %	50 %	298503170
31553	NC_014251	GTT	2	6	1535886	1535891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503170
31554	NC_014251	CT	3	6	1535967	1535972	0 %	50 %	0 %	50 %	298503170
31555	NC_014251	TTG	2	6	1536061	1536066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503170
31556	NC_014251	TCT	2	6	1536081	1536086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503170
31557	NC_014251	TTC	2	6	1536107	1536112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503170
31558	NC_014251	TCC	2	6	1536161	1536166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503170
31559	NC_014251	GAT	2	6	1536217	1536222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503170
31560	NC_014251	ATT	2	6	1536326	1536331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503170
31561	NC_014251	AGT	2	6	1536401	1536406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503171
31562	NC_014251	TGC	2	6	1536411	1536416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503171
31563	NC_014251	GTG	2	6	1536425	1536430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298503171
31564	NC_014251	GTT	2	6	1536445	1536450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503171
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31566	NC_014251	CGCAT	2	10	1536589	1536598	20 %	20 %	20 %	40 %	298503171
31567	NC_014251	GCC	2	6	1536625	1536630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298503171
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31569	NC_014251	CAT	2	6	1536813	1536818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503171
31570	NC_014251	CCAA	2	8	1536854	1536861	50 %	0 %	0 %	50 %	298503171
31571	NC_014251	ACA	2	6	1536901	1536906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503171
31572	NC_014251	A	6	6	1536994	1536999	100 %	0 %	0 %	0 %	298503171
31573	NC_014251	T	6	6	1537075	1537080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31574	NC_014251	ATTT	2	8	1537086	1537093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31575	NC_014251	T	6	6	1537133	1537138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31576	NC_014251	CCT	2	6	1537152	1537157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31577	NC_014251	ATC	2	6	1537221	1537226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503172
31578	NC_014251	GTT	3	9	1537290	1537298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503172
31579	NC_014251	ACG	2	6	1537318	1537323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503172
31580	NC_014251	AGA	2	6	1537358	1537363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503172
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31582	NC_014251	T	7	7	1537495	1537501	0 %	100 %	0 %	0 %	298503173
31583	NC_014251	AAC	2	6	1537532	1537537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31584	NC_014251	AAAG	2	8	1537636	1537643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31585	NC_014251	CAA	2	6	1537690	1537695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503174
31586	NC_014251	AAAACA	2	12	1537721	1537732	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	298503174
31587	NC_014251	TTC	2	6	1537842	1537847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503174
31588	NC_014251	CCCAA	2	10	1537895	1537904	40 %	0 %	0 %	60 %	298503174
31589	NC_014251	CGG	2	6	1537928	1537933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298503174
31590	NC_014251	CTG	2	6	1537992	1537997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503174
31591	NC_014251	GAA	2	6	1537998	1538003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503174
31592	NC_014251	CGT	2	6	1538031	1538036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503174
31593	NC_014251	CGA	2	6	1538063	1538068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503174
31594	NC_014251	AAT	2	6	1538112	1538117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503174
31595	NC_014251	GAA	2	6	1538280	1538285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503174
31596	NC_014251	GAA	2	6	1538304	1538309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503174
31597	NC_014251	CAT	2	6	1538327	1538332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503174
31598	NC_014251	TTG	2	6	1538359	1538364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503174
31599	NC_014251	AGCC	2	8	1538413	1538420	25 %	0 %	25 %	50 %	298503174
31600	NC_014251	CTA	2	6	1538452	1538457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503174
31601	NC_014251	TGC	2	6	1538489	1538494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503174
31602	NC_014251	CGT	2	6	1538502	1538507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503174
31603	NC_014251	ACC	2	6	1538590	1538595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503174
31604	NC_014251	TGC	2	6	1538612	1538617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503174
31605	NC_014251	AGC	2	6	1538624	1538629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503174
31606	NC_014251	CTT	2	6	1538663	1538668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503174
31607	NC_014251	CCT	2	6	1538687	1538692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503174
31608	NC_014251	TTGA	2	8	1538760	1538767	25 %	50 %	25 %	0 %	298503174
31609	NC_014251	GAA	2	6	1538799	1538804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503174
31610	NC_014251	GGC	2	6	1538816	1538821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298503174
31611	NC_014251	AAAAGA	2	12	1538860	1538871	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298503174
31612	NC_014251	ATC	2	6	1538892	1538897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503174
31613	NC_014251	GAAAGA	2	12	1538957	1538968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503174
31614	NC_014251	CATC	2	8	1538981	1538988	25 %	25 %	0 %	50 %	298503174
31615	NC_014251	GAT	2	6	1539024	1539029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503174
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