MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_014251	TCA	2	6	1482627	1482632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503113
30502	NC_014251	GCTTTG	2	12	1482647	1482658	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	298503113
30503	NC_014251	TGG	2	6	1482772	1482777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298503113
30504	NC_014251	ACA	2	6	1482858	1482863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503113
30505	NC_014251	ACC	2	6	1482898	1482903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503113
30506	NC_014251	AAGA	2	8	1482924	1482931	75 %	0 %	25 %	0 %	298503113
30507	NC_014251	GCT	2	6	1482935	1482940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503113
30508	NC_014251	CCTT	2	8	1483103	1483110	0 %	50 %	0 %	50 %	298503113
30509	NC_014251	AGA	2	6	1483138	1483143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503113
30510	NC_014251	GA	3	6	1483213	1483218	50 %	0 %	50 %	0 %	298503113
30511	NC_014251	CTG	2	6	1483227	1483232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503113
30512	NC_014251	CTG	2	6	1483275	1483280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503113
30513	NC_014251	TAGA	2	8	1483298	1483305	50 %	25 %	25 %	0 %	298503113
30514	NC_014251	ATT	2	6	1483321	1483326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503113
30515	NC_014251	TGA	2	6	1483338	1483343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503113
30516	NC_014251	GTT	2	6	1483600	1483605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503114
30517	NC_014251	AGA	2	6	1483735	1483740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503114
30518	NC_014251	CCA	2	6	1483879	1483884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503114
30519	NC_014251	AAG	2	6	1483890	1483895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503114
30520	NC_014251	TCT	2	6	1483904	1483909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503114
30521	NC_014251	GGAA	2	8	1484045	1484052	50 %	0 %	50 %	0 %	298503114
30522	NC_014251	ATG	2	6	1484128	1484133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503114
30523	NC_014251	CTG	2	6	1484261	1484266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503114
30524	NC_014251	ATG	2	6	1484287	1484292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503114
30525	NC_014251	CCA	2	6	1484356	1484361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503114
30526	NC_014251	AGA	2	6	1484369	1484374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503114
30527	NC_014251	GTC	2	6	1484533	1484538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503114
30528	NC_014251	T	7	7	1484638	1484644	0 %	100 %	0 %	0 %	298503115
30529	NC_014251	T	7	7	1484649	1484655	0 %	100 %	0 %	0 %	298503115
30530	NC_014251	TAA	2	6	1484670	1484675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503115
30531	NC_014251	GA	3	6	1484689	1484694	50 %	0 %	50 %	0 %	298503115
30532	NC_014251	ATGT	2	8	1484695	1484702	25 %	50 %	25 %	0 %	298503115
30533	NC_014251	A	6	6	1484744	1484749	100 %	0 %	0 %	0 %	298503115
30534	NC_014251	A	6	6	1484766	1484771	100 %	0 %	0 %	0 %	298503115
30535	NC_014251	TAC	2	6	1484776	1484781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503115
30536	NC_014251	GTA	2	6	1484787	1484792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503115
30537	NC_014251	ATA	3	9	1484838	1484846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503115
30538	NC_014251	A	6	6	1484855	1484860	100 %	0 %	0 %	0 %	298503115
30539	NC_014251	GAC	2	6	1484878	1484883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503115
30540	NC_014251	TAC	2	6	1484926	1484931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503115
30541	NC_014251	A	6	6	1484961	1484966	100 %	0 %	0 %	0 %	298503115
30542	NC_014251	CAA	2	6	1484969	1484974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503115
30543	NC_014251	GAA	2	6	1484975	1484980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503115
30544	NC_014251	A	6	6	1485008	1485013	100 %	0 %	0 %	0 %	298503115
30545	NC_014251	CTA	2	6	1485042	1485047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503115
30546	NC_014251	TGAAAA	2	12	1485073	1485084	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	298503115
30547	NC_014251	CTTC	2	8	1485140	1485147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30548	NC_014251	AAG	2	6	1485158	1485163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30549	NC_014251	T	6	6	1485167	1485172	0 %	100 %	0 %	0 %	298503116
30550	NC_014251	TGC	2	6	1485175	1485180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503116
30551	NC_014251	CTTGG	2	10	1485190	1485199	0 %	40 %	40 %	20 %	298503116
30552	NC_014251	ACG	2	6	1485279	1485284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503116
30553	NC_014251	CTT	2	6	1485335	1485340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503116
30554	NC_014251	CAC	2	6	1485353	1485358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503116
30555	NC_014251	TGA	2	6	1485446	1485451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503116
30556	NC_014251	GAT	2	6	1485509	1485514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503116
30557	NC_014251	TCA	2	6	1485517	1485522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503116
30558	NC_014251	AAG	2	6	1485552	1485557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503116
30559	NC_014251	TGA	2	6	1485603	1485608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503116
30560	NC_014251	GCA	2	6	1485706	1485711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503116
30561	NC_014251	GAT	2	6	1485732	1485737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503116
30562	NC_014251	CCA	2	6	1485761	1485766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503116
30563	NC_014251	AATG	2	8	1485801	1485808	50 %	25 %	25 %	0 %	298503116
30564	NC_014251	CAT	2	6	1486035	1486040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503116
30565	NC_014251	AAT	2	6	1486083	1486088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503116
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30567	NC_014251	CTT	2	6	1486592	1486597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503116
30568	NC_014251	GAT	2	6	1486677	1486682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503116
30569	NC_014251	CCAC	2	8	1486691	1486698	25 %	0 %	0 %	75 %	298503116
30570	NC_014251	TCT	2	6	1486702	1486707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503116
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30573	NC_014251	TCT	2	6	1486849	1486854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503116
30574	NC_014251	CCA	2	6	1486896	1486901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503116
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30576	NC_014251	AAGT	2	8	1486996	1487003	50 %	25 %	25 %	0 %	298503116
30577	NC_014251	TCCT	2	8	1487220	1487227	0 %	50 %	0 %	50 %	298503116
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30585	NC_014251	ACCAC	2	10	1487591	1487600	40 %	0 %	0 %	60 %	298503118
30586	NC_014251	TCC	2	6	1487671	1487676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503118
30587	NC_014251	CTG	2	6	1487727	1487732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503118
30588	NC_014251	ATG	3	9	1487816	1487824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503118
30589	NC_014251	TTC	2	6	1487845	1487850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503118
30590	NC_014251	AGA	2	6	1487873	1487878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503118
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30599	NC_014251	CAT	2	6	1488028	1488033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503118
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30601	NC_014251	AAG	2	6	1488052	1488057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503118
30602	NC_014251	CCT	2	6	1488068	1488073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503118
30603	NC_014251	TCAT	2	8	1488092	1488099	25 %	50 %	0 %	25 %	298503118
30604	NC_014251	AAG	2	6	1488166	1488171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503118
30605	NC_014251	GATT	2	8	1488184	1488191	25 %	50 %	25 %	0 %	298503118
30606	NC_014251	CCA	2	6	1488263	1488268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503118
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30610	NC_014251	TCAA	2	8	1488554	1488561	50 %	25 %	0 %	25 %	298503118
30611	NC_014251	ACC	3	9	1488583	1488591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503118
30612	NC_014251	TCA	2	6	1488624	1488629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503118
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30971	NC_014251	TAA	2	6	1506091	1506096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503134
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