MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_014251	ATT	2	6	1408229	1408234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503028
29003	NC_014251	TGA	2	6	1408351	1408356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503028
29004	NC_014251	ACCA	2	8	1408404	1408411	50 %	0 %	0 %	50 %	298503028
29005	NC_014251	CAACTC	2	12	1408440	1408451	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	298503028
29006	NC_014251	ATC	2	6	1408455	1408460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503028
29007	NC_014251	TAGA	2	8	1408473	1408480	50 %	25 %	25 %	0 %	298503028
29008	NC_014251	GT	3	6	1408588	1408593	0 %	50 %	50 %	0 %	298503028
29009	NC_014251	TCA	2	6	1408658	1408663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503028
29010	NC_014251	GTT	2	6	1408664	1408669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503029
29011	NC_014251	AGCA	2	8	1408740	1408747	50 %	0 %	25 %	25 %	298503029
29012	NC_014251	GCC	2	6	1408822	1408827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298503029
29013	NC_014251	T	6	6	1408866	1408871	0 %	100 %	0 %	0 %	298503029
29014	NC_014251	GAC	2	6	1408874	1408879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503029
29015	NC_014251	TAG	2	6	1408894	1408899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503029
29016	NC_014251	ACG	2	6	1408986	1408991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503029
29017	NC_014251	TCC	2	6	1409036	1409041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29018	NC_014251	TTAC	2	8	1409061	1409068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29019	NC_014251	TAT	2	6	1409077	1409082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503030
29020	NC_014251	GAC	2	6	1409153	1409158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503030
29021	NC_014251	GTT	2	6	1409159	1409164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503030
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29024	NC_014251	T	6	6	1409264	1409269	0 %	100 %	0 %	0 %	298503030
29025	NC_014251	T	6	6	1409282	1409287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29026	NC_014251	TTTA	2	8	1409292	1409299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29027	NC_014251	ATT	2	6	1409311	1409316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503031
29028	NC_014251	T	6	6	1409315	1409320	0 %	100 %	0 %	0 %	298503031
29029	NC_014251	TCCA	2	8	1409357	1409364	25 %	25 %	0 %	50 %	298503031
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29034	NC_014251	T	6	6	1409594	1409599	0 %	100 %	0 %	0 %	298503031
29035	NC_014251	GTT	2	6	1409602	1409607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503031
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29038	NC_014251	TGA	2	6	1409809	1409814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503031
29039	NC_014251	TTGCT	2	10	1409822	1409831	0 %	60 %	20 %	20 %	298503031
29040	NC_014251	TTA	2	6	1409853	1409858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503031
29041	NC_014251	TTC	2	6	1409913	1409918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29042	NC_014251	T	6	6	1410039	1410044	0 %	100 %	0 %	0 %	298503032
29043	NC_014251	TGGTT	2	10	1410066	1410075	0 %	60 %	40 %	0 %	298503032
29044	NC_014251	AG	3	6	1410088	1410093	50 %	0 %	50 %	0 %	298503032
29045	NC_014251	TC	3	6	1410106	1410111	0 %	50 %	0 %	50 %	298503032
29046	NC_014251	AAACT	2	10	1410146	1410155	60 %	20 %	0 %	20 %	298503033
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29053	NC_014251	AGAAA	2	10	1410615	1410624	80 %	0 %	20 %	0 %	298503033
29054	NC_014251	ACTCCA	2	12	1410663	1410674	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	298503033
29055	NC_014251	AG	3	6	1410675	1410680	50 %	0 %	50 %	0 %	298503033
29056	NC_014251	GAT	2	6	1410730	1410735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503033
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29058	NC_014251	GAT	2	6	1410800	1410805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503033
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29068	NC_014251	TAAA	2	8	1411226	1411233	75 %	25 %	0 %	0 %	298503033
29069	NC_014251	T	6	6	1411298	1411303	0 %	100 %	0 %	0 %	298503033
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29078	NC_014251	T	6	6	1411662	1411667	0 %	100 %	0 %	0 %	298503034
29079	NC_014251	TCCA	2	8	1411700	1411707	25 %	25 %	0 %	50 %	298503034
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29090	NC_014251	ATT	2	6	1412265	1412270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29091	NC_014251	CAA	2	6	1412274	1412279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29092	NC_014251	ACA	2	6	1412304	1412309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29093	NC_014251	TGA	2	6	1412515	1412520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503036
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29095	NC_014251	TC	3	6	1412592	1412597	0 %	50 %	0 %	50 %	298503036
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29099	NC_014251	TAC	2	6	1412751	1412756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503036
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29106	NC_014251	GAAAG	2	10	1413342	1413351	60 %	0 %	40 %	0 %	298503036
29107	NC_014251	AAATA	2	10	1413355	1413364	80 %	20 %	0 %	0 %	298503036
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29109	NC_014251	GTCAA	2	10	1413383	1413392	40 %	20 %	20 %	20 %	298503036
29110	NC_014251	CCCCT	2	10	1413514	1413523	0 %	20 %	0 %	80 %	298503036
29111	NC_014251	TGGTCA	2	12	1413531	1413542	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298503036
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29117	NC_014251	T	7	7	1414038	1414044	0 %	100 %	0 %	0 %	298503036
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29119	NC_014251	CTT	2	6	1414182	1414187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503036
29120	NC_014251	TCC	2	6	1414190	1414195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503036
29121	NC_014251	AAAC	2	8	1414356	1414363	75 %	0 %	0 %	25 %	298503036
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29133	NC_014251	CTT	2	6	1414733	1414738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503037
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29148	NC_014251	ATT	2	6	1415212	1415217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29149	NC_014251	GAA	2	6	1415226	1415231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29150	NC_014251	A	6	6	1415230	1415235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29151	NC_014251	TTAT	2	8	1415262	1415269	25 %	75 %	0 %	0 %	298503038
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29160	NC_014251	A	6	6	1415875	1415880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29161	NC_014251	AGGT	2	8	1415993	1416000	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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29184	NC_014251	AGATG	2	10	1416757	1416766	40 %	20 %	40 %	0 %	298503040
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29187	NC_014251	GAAAA	2	10	1417125	1417134	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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29190	NC_014251	CTT	2	6	1417352	1417357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29191	NC_014251	TA	4	8	1417360	1417367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29192	NC_014251	CTT	2	6	1417403	1417408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29222	NC_014251	CT	3	6	1418893	1418898	0 %	50 %	0 %	50 %	298503044
29223	NC_014251	CAT	2	6	1419023	1419028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503044
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29227	NC_014251	TCT	2	6	1419259	1419264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503044
29228	NC_014251	CAC	2	6	1419300	1419305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503044
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29230	NC_014251	CT	3	6	1419420	1419425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29231	NC_014251	TAT	2	6	1419444	1419449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29232	NC_014251	CTC	2	6	1419562	1419567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503045
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29234	NC_014251	ATC	2	6	1419592	1419597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503045
29235	NC_014251	TG	3	6	1419598	1419603	0 %	50 %	50 %	0 %	298503045
29236	NC_014251	CTTG	2	8	1419746	1419753	0 %	50 %	25 %	25 %	298503046
29237	NC_014251	ACC	2	6	1419774	1419779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503046
29238	NC_014251	GTC	2	6	1419828	1419833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503046
29239	NC_014251	ATC	2	6	1419892	1419897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503046
29240	NC_014251	CG	3	6	1419980	1419985	0 %	0 %	50 %	50 %	298503046
29241	NC_014251	CGCT	2	8	1420021	1420028	0 %	25 %	25 %	50 %	298503046
29242	NC_014251	ATT	2	6	1420050	1420055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503046
29243	NC_014251	GGTA	2	8	1420060	1420067	25 %	25 %	50 %	0 %	298503046
29244	NC_014251	TGGC	2	8	1420103	1420110	0 %	25 %	50 %	25 %	298503046
29245	NC_014251	TGT	3	9	1420127	1420135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503046
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29249	NC_014251	CTT	2	6	1420236	1420241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503046
29250	NC_014251	CCAA	2	8	1420356	1420363	50 %	0 %	0 %	50 %	298503046
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29252	NC_014251	CTT	2	6	1420580	1420585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503046
29253	NC_014251	CAGC	2	8	1420598	1420605	25 %	0 %	25 %	50 %	298503046
29254	NC_014251	TTCT	2	8	1420649	1420656	0 %	75 %	0 %	25 %	298503047
29255	NC_014251	GTC	2	6	1420673	1420678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503047
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29257	NC_014251	CTT	2	6	1420843	1420848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503047
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29280	NC_014251	CCTA	2	8	1421958	1421965	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29281	NC_014251	A	7	7	1422014	1422020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29282	NC_014251	T	6	6	1422068	1422073	0 %	100 %	0 %	0 %	298503049
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29315	NC_014251	GAA	2	6	1423521	1423526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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29348	NC_014251	TTTC	2	8	1424785	1424792	0 %	75 %	0 %	25 %	298503052
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29352	NC_014251	T	6	6	1424996	1425001	0 %	100 %	0 %	0 %	298503052
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