MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_014251	T	6	6	1337209	1337214	0 %	100 %	0 %	0 %	298502949
27503	NC_014251	CAT	2	6	1337305	1337310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502949
27504	NC_014251	T	6	6	1337345	1337350	0 %	100 %	0 %	0 %	298502949
27505	NC_014251	TTC	2	6	1337420	1337425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502949
27506	NC_014251	AGA	2	6	1337441	1337446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502949
27507	NC_014251	A	6	6	1337489	1337494	100 %	0 %	0 %	0 %	298502949
27508	NC_014251	ATA	2	6	1337544	1337549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27509	NC_014251	TAA	2	6	1337582	1337587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27510	NC_014251	T	6	6	1337593	1337598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27511	NC_014251	A	6	6	1337600	1337605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27512	NC_014251	TTTTTA	2	12	1337614	1337625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27513	NC_014251	TCA	2	6	1337655	1337660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27514	NC_014251	TTTG	2	8	1337668	1337675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27515	NC_014251	TCTT	2	8	1337684	1337691	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27516	NC_014251	ATT	2	6	1337709	1337714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27517	NC_014251	CAT	2	6	1337719	1337724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27518	NC_014251	ACCA	2	8	1337743	1337750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27519	NC_014251	TAAT	2	8	1337780	1337787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27520	NC_014251	AGT	2	6	1337792	1337797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27521	NC_014251	TTGA	2	8	1337813	1337820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27522	NC_014251	TTC	2	6	1337825	1337830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27523	NC_014251	TCT	2	6	1337876	1337881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27524	NC_014251	TAA	2	6	1337931	1337936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502950
27525	NC_014251	TTCT	2	8	1337970	1337977	0 %	75 %	0 %	25 %	298502950
27526	NC_014251	TGT	2	6	1338028	1338033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502950
27527	NC_014251	T	7	7	1338073	1338079	0 %	100 %	0 %	0 %	298502950
27528	NC_014251	ATA	2	6	1338116	1338121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502950
27529	NC_014251	T	7	7	1338128	1338134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27530	NC_014251	ATTT	2	8	1338144	1338151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27531	NC_014251	TTCA	2	8	1338173	1338180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27532	NC_014251	TGT	2	6	1338217	1338222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27533	NC_014251	CCT	2	6	1338287	1338292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27534	NC_014251	A	6	6	1338305	1338310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27535	NC_014251	TCA	2	6	1338360	1338365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27538	NC_014251	TATT	2	8	1338458	1338465	25 %	75 %	0 %	0 %	298502951
27539	NC_014251	T	6	6	1338464	1338469	0 %	100 %	0 %	0 %	298502951
27540	NC_014251	TAT	2	6	1338534	1338539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502951
27541	NC_014251	CAA	2	6	1338550	1338555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502951
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27543	NC_014251	T	6	6	1338678	1338683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27544	NC_014251	ATCA	2	8	1338693	1338700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27545	NC_014251	AAT	2	6	1338784	1338789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27546	NC_014251	TAA	2	6	1338816	1338821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27547	NC_014251	ATG	2	6	1338886	1338891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502952
27548	NC_014251	CTT	3	9	1338893	1338901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502952
27549	NC_014251	AAT	2	6	1338921	1338926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502952
27550	NC_014251	TTG	2	6	1338946	1338951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502952
27551	NC_014251	T	6	6	1338982	1338987	0 %	100 %	0 %	0 %	298502952
27552	NC_014251	AT	3	6	1338997	1339002	50 %	50 %	0 %	0 %	298502952
27553	NC_014251	TTTGA	2	10	1339044	1339053	20 %	60 %	20 %	0 %	298502952
27554	NC_014251	TTGCT	2	10	1339061	1339070	0 %	60 %	20 %	20 %	298502952
27555	NC_014251	TCATC	2	10	1339088	1339097	20 %	40 %	0 %	40 %	298502952
27556	NC_014251	TTC	2	6	1339201	1339206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502952
27557	NC_014251	GCGAT	2	10	1339276	1339285	20 %	20 %	40 %	20 %	298502952
27558	NC_014251	GCTT	2	8	1339302	1339309	0 %	50 %	25 %	25 %	298502952
27559	NC_014251	GGA	2	6	1339339	1339344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298502952
27560	NC_014251	GGTT	2	8	1339359	1339366	0 %	50 %	50 %	0 %	298502952
27561	NC_014251	TTC	2	6	1339387	1339392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502952
27562	NC_014251	T	8	8	1339453	1339460	0 %	100 %	0 %	0 %	298502952
27563	NC_014251	CTT	2	6	1339502	1339507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502952
27564	NC_014251	T	7	7	1339575	1339581	0 %	100 %	0 %	0 %	298502952
27565	NC_014251	GACA	2	8	1339770	1339777	50 %	0 %	25 %	25 %	298502952
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27570	NC_014251	ACG	2	6	1339950	1339955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502952
27571	NC_014251	CTA	2	6	1339973	1339978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502952
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27577	NC_014251	GTCAA	2	10	1340440	1340449	40 %	20 %	20 %	20 %	298502952
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27579	NC_014251	CCAT	2	8	1340536	1340543	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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27593	NC_014251	CTG	2	6	1341147	1341152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502953
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27596	NC_014251	T	7	7	1341377	1341383	0 %	100 %	0 %	0 %	298502953
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27601	NC_014251	TCC	2	6	1341543	1341548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27602	NC_014251	CTT	2	6	1341553	1341558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27603	NC_014251	AT	3	6	1341566	1341571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27604	NC_014251	AG	3	6	1341625	1341630	50 %	0 %	50 %	0 %	298502954
27605	NC_014251	TGA	2	6	1341640	1341645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502954
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27608	NC_014251	AAATGG	2	12	1341718	1341729	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298502954
27609	NC_014251	CAAG	2	8	1341766	1341773	50 %	0 %	25 %	25 %	298502954
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