MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_014251	TCA	2	6	1237456	1237461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502844
25502	NC_014251	CTG	2	6	1237465	1237470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502844
25503	NC_014251	TTG	2	6	1237539	1237544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502844
25504	NC_014251	ATA	2	6	1237598	1237603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502844
25505	NC_014251	T	6	6	1237628	1237633	0 %	100 %	0 %	0 %	298502844
25506	NC_014251	TTG	2	6	1237639	1237644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502844
25507	NC_014251	GATT	2	8	1237675	1237682	25 %	50 %	25 %	0 %	298502844
25508	NC_014251	T	6	6	1237688	1237693	0 %	100 %	0 %	0 %	298502844
25509	NC_014251	TTC	2	6	1237730	1237735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25510	NC_014251	GAC	2	6	1237751	1237756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502844
25511	NC_014251	TGC	2	6	1237798	1237803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502844
25512	NC_014251	TGCC	2	8	1237939	1237946	0 %	25 %	25 %	50 %	298502844
25513	NC_014251	TTG	2	6	1237977	1237982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502844
25514	NC_014251	CTA	2	6	1238026	1238031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502844
25515	NC_014251	CCAC	2	8	1238043	1238050	25 %	0 %	0 %	75 %	298502844
25516	NC_014251	TCTGA	2	10	1238053	1238062	20 %	40 %	20 %	20 %	298502844
25517	NC_014251	AGTA	2	8	1238105	1238112	50 %	25 %	25 %	0 %	298502844
25518	NC_014251	GACC	2	8	1238134	1238141	25 %	0 %	25 %	50 %	298502844
25519	NC_014251	ACC	2	6	1238144	1238149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298502844
25520	NC_014251	GCA	2	6	1238160	1238165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502844
25521	NC_014251	TTC	2	6	1238188	1238193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25522	NC_014251	CT	3	6	1238205	1238210	0 %	50 %	0 %	50 %	298502844
25523	NC_014251	ACC	2	6	1238243	1238248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298502844
25524	NC_014251	CCAG	2	8	1238262	1238269	25 %	0 %	25 %	50 %	298502844
25525	NC_014251	TAT	2	6	1238302	1238307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502844
25526	NC_014251	ATC	2	6	1238336	1238341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502844
25527	NC_014251	T	6	6	1238361	1238366	0 %	100 %	0 %	0 %	298502844
25528	NC_014251	CAC	2	6	1238389	1238394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298502844
25529	NC_014251	T	6	6	1238414	1238419	0 %	100 %	0 %	0 %	298502844
25530	NC_014251	TCA	2	6	1238499	1238504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502844
25531	NC_014251	CTT	2	6	1238627	1238632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25532	NC_014251	ATTT	2	8	1238662	1238669	25 %	75 %	0 %	0 %	298502844
25533	NC_014251	ACTG	2	8	1238715	1238722	25 %	25 %	25 %	25 %	298502844
25534	NC_014251	TTTCT	2	10	1238727	1238736	0 %	80 %	0 %	20 %	298502844
25535	NC_014251	TA	3	6	1238759	1238764	50 %	50 %	0 %	0 %	298502844
25536	NC_014251	AGTA	2	8	1238800	1238807	50 %	25 %	25 %	0 %	298502844
25537	NC_014251	TCCA	2	8	1238825	1238832	25 %	25 %	0 %	50 %	298502844
25538	NC_014251	TGT	2	6	1238841	1238846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502844
25539	NC_014251	T	6	6	1238906	1238911	0 %	100 %	0 %	0 %	298502844
25540	NC_014251	TTC	2	6	1238918	1238923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25541	NC_014251	TTC	2	6	1238963	1238968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25542	NC_014251	TGGTTC	2	12	1239032	1239043	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	298502844
25543	NC_014251	TGT	2	6	1239062	1239067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502844
25544	NC_014251	TTG	2	6	1239088	1239093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502844
25545	NC_014251	T	7	7	1239102	1239108	0 %	100 %	0 %	0 %	298502844
25546	NC_014251	TTGAT	2	10	1239113	1239122	20 %	60 %	20 %	0 %	298502844
25547	NC_014251	TGG	2	6	1239131	1239136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502844
25548	NC_014251	GTTT	2	8	1239197	1239204	0 %	75 %	25 %	0 %	298502844
25549	NC_014251	TCT	2	6	1239210	1239215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25550	NC_014251	CTT	2	6	1239289	1239294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25551	NC_014251	T	6	6	1239301	1239306	0 %	100 %	0 %	0 %	298502844
25552	NC_014251	GTT	2	6	1239441	1239446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502844
25553	NC_014251	TTC	2	6	1239449	1239454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25554	NC_014251	CTT	2	6	1239478	1239483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25555	NC_014251	GTA	2	6	1239501	1239506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502844
25556	NC_014251	TCT	2	6	1239531	1239536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25557	NC_014251	CTT	2	6	1239553	1239558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25558	NC_014251	T	6	6	1239562	1239567	0 %	100 %	0 %	0 %	298502844
25559	NC_014251	TCT	2	6	1239586	1239591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25560	NC_014251	TAC	2	6	1239779	1239784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502844
25561	NC_014251	CAA	2	6	1239817	1239822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502844
25562	NC_014251	GTT	2	6	1239865	1239870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502844
25563	NC_014251	T	7	7	1239886	1239892	0 %	100 %	0 %	0 %	298502844
25564	NC_014251	GTTGAA	2	12	1239930	1239941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502844
25565	NC_014251	CTT	2	6	1239958	1239963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25566	NC_014251	CTT	2	6	1240015	1240020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25567	NC_014251	TCT	2	6	1240068	1240073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25568	NC_014251	TCT	2	6	1240198	1240203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25569	NC_014251	TTC	2	6	1240209	1240214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25570	NC_014251	TCT	2	6	1240269	1240274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25571	NC_014251	GATT	2	8	1240282	1240289	25 %	50 %	25 %	0 %	298502844
25572	NC_014251	TAG	2	6	1240294	1240299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502844
25573	NC_014251	ACT	2	6	1240314	1240319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502844
25574	NC_014251	GAA	2	6	1240341	1240346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502844
25575	NC_014251	GATG	2	8	1240380	1240387	25 %	25 %	50 %	0 %	298502844
25576	NC_014251	TGT	2	6	1240425	1240430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502844
25577	NC_014251	GCT	2	6	1240443	1240448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502844
25578	NC_014251	TTAC	2	8	1240461	1240468	25 %	50 %	0 %	25 %	298502844
25579	NC_014251	AT	3	6	1240500	1240505	50 %	50 %	0 %	0 %	298502844
25580	NC_014251	GAT	2	6	1240594	1240599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502844
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25582	NC_014251	CCA	2	6	1240783	1240788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298502844
25583	NC_014251	ATA	2	6	1240820	1240825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502844
25584	NC_014251	TCA	3	9	1240830	1240838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502844
25585	NC_014251	GCT	2	6	1240870	1240875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502844
25586	NC_014251	TCT	2	6	1240881	1240886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502844
25587	NC_014251	GAT	2	6	1240887	1240892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502844
25588	NC_014251	A	6	6	1240973	1240978	100 %	0 %	0 %	0 %	298502844
25589	NC_014251	ATT	2	6	1241064	1241069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502844
25590	NC_014251	CCT	2	6	1241070	1241075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25591	NC_014251	TA	3	6	1241088	1241093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25592	NC_014251	TAT	2	6	1241109	1241114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25593	NC_014251	TAT	2	6	1241122	1241127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25594	NC_014251	TAT	2	6	1241129	1241134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25595	NC_014251	A	6	6	1241177	1241182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25596	NC_014251	TAT	2	6	1241220	1241225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25597	NC_014251	GAG	2	6	1241313	1241318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298502845
25598	NC_014251	TGA	2	6	1241346	1241351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502845
25599	NC_014251	T	8	8	1241372	1241379	0 %	100 %	0 %	0 %	298502845
25600	NC_014251	TTCAAA	2	12	1241409	1241420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298502845
25601	NC_014251	GATGA	2	10	1241445	1241454	40 %	20 %	40 %	0 %	298502845
25602	NC_014251	CAC	2	6	1241486	1241491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298502845
25603	NC_014251	TAA	2	6	1241505	1241510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502845
25604	NC_014251	TTC	2	6	1241532	1241537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502845
25605	NC_014251	GAG	2	6	1241562	1241567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298502845
25606	NC_014251	TTTC	2	8	1241584	1241591	0 %	75 %	0 %	25 %	298502845
25607	NC_014251	T	6	6	1241690	1241695	0 %	100 %	0 %	0 %	298502845
25608	NC_014251	TTC	2	6	1241706	1241711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502845
25609	NC_014251	CTT	2	6	1241817	1241822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502845
25610	NC_014251	TTCT	2	8	1241826	1241833	0 %	75 %	0 %	25 %	298502845
25611	NC_014251	CTT	2	6	1241948	1241953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502845
25612	NC_014251	TCC	2	6	1241994	1241999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298502845
25613	NC_014251	TC	4	8	1242028	1242035	0 %	50 %	0 %	50 %	298502845
25614	NC_014251	ATTG	2	8	1242044	1242051	25 %	50 %	25 %	0 %	298502845
25615	NC_014251	T	6	6	1242131	1242136	0 %	100 %	0 %	0 %	298502845
25616	NC_014251	TCTTCC	2	12	1242187	1242198	0 %	50 %	0 %	50 %	298502845
25617	NC_014251	CATTC	2	10	1242362	1242371	20 %	40 %	0 %	40 %	298502845
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25619	NC_014251	AT	3	6	1242611	1242616	50 %	50 %	0 %	0 %	298502846
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25976	NC_014251	TAT	2	6	1262309	1262314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25977	NC_014251	T	6	6	1262333	1262338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25978	NC_014251	ATT	4	12	1262344	1262355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25979	NC_014251	A	6	6	1262363	1262368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25980	NC_014251	CTCCAG	2	12	1262471	1262482	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	298502862
25981	NC_014251	TAT	2	6	1262531	1262536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502862
25982	NC_014251	T	6	6	1262583	1262588	0 %	100 %	0 %	0 %	298502862
25983	NC_014251	TGA	2	6	1262607	1262612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502862
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25999	NC_014251	TGC	2	6	1263438	1263443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502862
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