MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18008	NC_014251	AAGA	2	8	876527	876534	75 %	0 %	25 %	0 %	298502455
18009	NC_014251	GA	3	6	876565	876570	50 %	0 %	50 %	0 %	298502455
18010	NC_014251	CAAGC	2	10	876581	876590	40 %	0 %	20 %	40 %	298502455
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18121	NC_014251	AGGCGA	2	12	880963	880974	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	298502458
18122	NC_014251	AGA	2	6	880990	880995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
18123	NC_014251	AAG	2	6	880998	881003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
18124	NC_014251	A	6	6	881018	881023	100 %	0 %	0 %	0 %	298502458
18125	NC_014251	TGA	2	6	881055	881060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
18126	NC_014251	GAT	2	6	881066	881071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
18127	NC_014251	CTTA	2	8	881095	881102	25 %	50 %	0 %	25 %	298502458
18128	NC_014251	AACAA	2	10	881156	881165	80 %	0 %	0 %	20 %	298502458
18129	NC_014251	GAA	2	6	881189	881194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
18130	NC_014251	GTT	3	9	881195	881203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502458
18131	NC_014251	AGA	2	6	881260	881265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
18132	NC_014251	A	7	7	881364	881370	100 %	0 %	0 %	0 %	298502458
18133	NC_014251	ACTCCA	2	12	881417	881428	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	298502458
18134	NC_014251	GC	3	6	881507	881512	0 %	0 %	50 %	50 %	298502458
18135	NC_014251	ATT	2	6	881515	881520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502458
18136	NC_014251	TTG	2	6	881529	881534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502458
18137	NC_014251	GGT	2	6	881624	881629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502458
18138	NC_014251	GTG	2	6	881709	881714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502458
18139	NC_014251	TTG	2	6	881787	881792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502458
18140	NC_014251	GCT	2	6	881861	881866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502458
18141	NC_014251	ATA	2	6	881898	881903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
18142	NC_014251	TGG	2	6	881980	881985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502458
18143	NC_014251	TA	3	6	882014	882019	50 %	50 %	0 %	0 %	298502458
18144	NC_014251	ATG	2	6	882035	882040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
18145	NC_014251	TTG	2	6	882129	882134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502458
18146	NC_014251	ACA	2	6	882175	882180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502458
18147	NC_014251	CAG	2	6	882243	882248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502458
18148	NC_014251	TAAA	2	8	882276	882283	75 %	25 %	0 %	0 %	298502458
18149	NC_014251	AAC	2	6	882287	882292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502458
18150	NC_014251	CAAA	2	8	882295	882302	75 %	0 %	0 %	25 %	298502458
18151	NC_014251	ACTT	2	8	882349	882356	25 %	50 %	0 %	25 %	298502458
18152	NC_014251	TAA	2	6	882415	882420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
18153	NC_014251	ATT	2	6	882439	882444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502458
18154	NC_014251	TAT	2	6	882456	882461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502458
18155	NC_014251	GAA	2	6	882548	882553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
18156	NC_014251	CAA	2	6	882584	882589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502458
18157	NC_014251	TGA	2	6	882663	882668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
18158	NC_014251	AG	3	6	882735	882740	50 %	0 %	50 %	0 %	298502458
18159	NC_014251	AAGA	2	8	882746	882753	75 %	0 %	25 %	0 %	298502458
18160	NC_014251	GTC	2	6	882774	882779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502458
18161	NC_014251	GAA	2	6	882809	882814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
18162	NC_014251	ATC	2	6	882876	882881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502458
18163	NC_014251	GAA	2	6	882919	882924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
18164	NC_014251	ATA	2	6	882933	882938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
18165	NC_014251	ATG	2	6	882950	882955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
18166	NC_014251	ATG	2	6	883019	883024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
18167	NC_014251	GATT	2	8	883068	883075	25 %	50 %	25 %	0 %	298502458
18168	NC_014251	AAT	2	6	883094	883099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
18169	NC_014251	CTT	2	6	883174	883179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502458
18170	NC_014251	ATT	2	6	883195	883200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502458
18171	NC_014251	AAC	2	6	883266	883271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502458
18172	NC_014251	CAA	2	6	883294	883299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502458
18173	NC_014251	A	6	6	883298	883303	100 %	0 %	0 %	0 %	298502458
18174	NC_014251	TAA	2	6	883324	883329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
18175	NC_014251	CTT	2	6	883358	883363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502458
18176	NC_014251	ACA	2	6	883401	883406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502458
18177	NC_014251	CTT	2	6	883556	883561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502458
18178	NC_014251	ATA	2	6	883602	883607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
18179	NC_014251	TAG	2	6	883624	883629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
18180	NC_014251	ATATGG	2	12	883711	883722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
18181	NC_014251	GCATAT	2	12	883724	883735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298502458
18182	NC_014251	GCA	2	6	883742	883747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502458
18183	NC_014251	GATG	2	8	883756	883763	25 %	25 %	50 %	0 %	298502458
18184	NC_014251	ACT	2	6	883826	883831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502458
18185	NC_014251	TGG	2	6	883858	883863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502458
18186	NC_014251	ATG	2	6	883989	883994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
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18189	NC_014251	A	6	6	884153	884158	100 %	0 %	0 %	0 %	298502458
18190	NC_014251	GAA	2	6	884188	884193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
18191	NC_014251	GAT	2	6	884255	884260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
18192	NC_014251	ATA	2	6	884268	884273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
18193	NC_014251	TAC	2	6	884438	884443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502458
18194	NC_014251	TGA	2	6	884524	884529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
18195	NC_014251	TCA	2	6	884532	884537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502458
18196	NC_014251	ATA	2	6	884553	884558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
18197	NC_014251	GAA	2	6	884581	884586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
18198	NC_014251	AAG	2	6	884598	884603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
18199	NC_014251	TAAAGC	2	12	884611	884622	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298502458
18200	NC_014251	TAC	2	6	884650	884655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502458
18201	NC_014251	TAG	2	6	884659	884664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
18202	NC_014251	GAA	2	6	884677	884682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
18203	NC_014251	TGC	2	6	884689	884694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502458
18204	NC_014251	A	6	6	884777	884782	100 %	0 %	0 %	0 %	298502458
18205	NC_014251	CTT	2	6	884783	884788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502458
18206	NC_014251	CAA	2	6	884789	884794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502458
18207	NC_014251	TC	3	6	884834	884839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18208	NC_014251	TGAT	2	8	884904	884911	25 %	50 %	25 %	0 %	298502459
18209	NC_014251	GA	3	6	884927	884932	50 %	0 %	50 %	0 %	298502459
18210	NC_014251	AGA	2	6	884977	884982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502459
18211	NC_014251	TTA	2	6	885028	885033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502459
18212	NC_014251	TGG	2	6	885036	885041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502459
18213	NC_014251	GAG	2	6	885074	885079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298502459
18214	NC_014251	CTTTA	2	10	885122	885131	20 %	60 %	0 %	20 %	298502459
18215	NC_014251	GCA	2	6	885218	885223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502459
18216	NC_014251	TGG	2	6	885348	885353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502459
18217	NC_014251	AGG	2	6	885360	885365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298502459
18218	NC_014251	T	6	6	885428	885433	0 %	100 %	0 %	0 %	298502459
18219	NC_014251	ACA	2	6	885455	885460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502459
18220	NC_014251	GAC	2	6	885475	885480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502459
18221	NC_014251	AAG	2	6	885501	885506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502459
18222	NC_014251	GTTG	2	8	885522	885529	0 %	50 %	50 %	0 %	298502459
18223	NC_014251	ATG	2	6	885560	885565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502459
18224	NC_014251	GAGC	2	8	885613	885620	25 %	0 %	50 %	25 %	298502459
18225	NC_014251	TTG	2	6	885711	885716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502459
18226	NC_014251	GAC	2	6	885852	885857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502459
18227	NC_014251	TCA	2	6	885970	885975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502459
18228	NC_014251	GCA	2	6	885980	885985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502459
18229	NC_014251	AGA	2	6	886041	886046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502459
18230	NC_014251	CTG	2	6	886049	886054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502459
18231	NC_014251	CCTTT	2	10	886104	886113	0 %	60 %	0 %	40 %	298502459
18232	NC_014251	AGA	2	6	886120	886125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502459
18233	NC_014251	GA	3	6	886209	886214	50 %	0 %	50 %	0 %	298502459
18234	NC_014251	GTCT	2	8	886271	886278	0 %	50 %	25 %	25 %	298502459
18235	NC_014251	GCT	2	6	886286	886291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502459
18236	NC_014251	AATC	2	8	886295	886302	50 %	25 %	0 %	25 %	298502459
18237	NC_014251	ACCG	2	8	886326	886333	25 %	0 %	25 %	50 %	298502459
18238	NC_014251	AGA	2	6	886356	886361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502459
18239	NC_014251	AC	3	6	886437	886442	50 %	0 %	0 %	50 %	298502459
18240	NC_014251	ACAGG	2	10	886496	886505	40 %	0 %	40 %	20 %	298502459
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18485	NC_014251	AGT	2	6	898429	898434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502475
18486	NC_014251	GAC	2	6	898475	898480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502475
18487	NC_014251	CTT	2	6	898524	898529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502475
18488	NC_014251	GAT	2	6	898538	898543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502475
18489	NC_014251	AAG	2	6	898554	898559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502475
18490	NC_014251	GTATCG	2	12	898677	898688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298502475
18491	NC_014251	TTTGG	2	10	898790	898799	0 %	60 %	40 %	0 %	298502475
18492	NC_014251	CGT	2	6	898802	898807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502475
18493	NC_014251	AAG	2	6	898815	898820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502475
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