MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_014251	GGAAGT	2	12	679005	679016	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	298502249
14003	NC_014251	TGG	3	9	679019	679027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502249
14004	NC_014251	GGC	2	6	679047	679052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298502249
14005	NC_014251	AG	3	6	679071	679076	50 %	0 %	50 %	0 %	298502250
14006	NC_014251	AGA	2	6	679114	679119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502250
14007	NC_014251	TGA	2	6	679176	679181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502250
14008	NC_014251	GAT	2	6	679188	679193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502250
14009	NC_014251	T	6	6	679229	679234	0 %	100 %	0 %	0 %	298502250
14010	NC_014251	T	6	6	679297	679302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_014251	T	7	7	679329	679335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_014251	GAT	2	6	679344	679349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_014251	AGCG	2	8	679415	679422	25 %	0 %	50 %	25 %	298502251
14014	NC_014251	TTC	2	6	679481	679486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502251
14015	NC_014251	CTGAC	2	10	679500	679509	20 %	20 %	20 %	40 %	298502251
14016	NC_014251	AGA	2	6	679518	679523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502251
14017	NC_014251	TCCAG	2	10	679525	679534	20 %	20 %	20 %	40 %	298502251
14018	NC_014251	CGT	2	6	679629	679634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502251
14019	NC_014251	TGA	2	6	679709	679714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502251
14020	NC_014251	GAT	2	6	679719	679724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502251
14021	NC_014251	TGT	2	6	679746	679751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502251
14022	NC_014251	GGTA	2	8	679880	679887	25 %	25 %	50 %	0 %	298502251
14023	NC_014251	GAT	2	6	679929	679934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_014251	T	6	6	679974	679979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_014251	AGAA	2	8	680061	680068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_014251	TAT	2	6	680138	680143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502252
14027	NC_014251	AGTG	2	8	680151	680158	25 %	25 %	50 %	0 %	298502252
14028	NC_014251	GGA	2	6	680399	680404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_014251	ATATA	2	10	680474	680483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_014251	AT	3	6	680491	680496	50 %	50 %	0 %	0 %	298502253
14031	NC_014251	ATCT	2	8	680518	680525	25 %	50 %	0 %	25 %	298502253
14032	NC_014251	TTG	2	6	680535	680540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502253
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14034	NC_014251	ATTT	2	8	680687	680694	25 %	75 %	0 %	0 %	298502253
14035	NC_014251	TGA	2	6	680809	680814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502253
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14040	NC_014251	TTC	2	6	681390	681395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502254
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14042	NC_014251	CTTT	2	8	681527	681534	0 %	75 %	0 %	25 %	298502255
14043	NC_014251	TTC	2	6	681544	681549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502255
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14045	NC_014251	TTG	2	6	681679	681684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502255
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14050	NC_014251	TTTG	2	8	681984	681991	0 %	75 %	25 %	0 %	298502255
14051	NC_014251	TTG	2	6	682073	682078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502255
14052	NC_014251	TCAA	2	8	682217	682224	50 %	25 %	0 %	25 %	298502255
14053	NC_014251	AAT	2	6	682426	682431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502255
14054	NC_014251	GCA	2	6	682475	682480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502255
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14056	NC_014251	GAT	2	6	682504	682509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502255
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14058	NC_014251	T	6	6	682704	682709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_014251	A	7	7	682713	682719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_014251	A	6	6	682721	682726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_014251	T	6	6	682735	682740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_014251	ATA	2	6	682748	682753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_014251	AAATA	2	10	682761	682770	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_014251	AGAAA	2	10	682782	682791	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_014251	TTG	2	6	682815	682820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_014251	A	6	6	682878	682883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_014251	GTT	2	6	682899	682904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502256
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14117	NC_014251	GAA	2	6	685269	685274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_014251	AAGCT	2	10	685275	685284	40 %	20 %	20 %	20 %	298502257
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14243	NC_014251	TGG	2	6	691425	691430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502261
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14250	NC_014251	AAG	2	6	691565	691570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14251	NC_014251	TTC	2	6	691600	691605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14254	NC_014251	ATAA	2	8	691715	691722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14255	NC_014251	ATCA	2	8	691737	691744	50 %	25 %	0 %	25 %	298502262
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14354	NC_014251	CGTA	2	8	695990	695997	25 %	25 %	25 %	25 %	298502264
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14367	NC_014251	GAG	2	6	696380	696385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298502265
14368	NC_014251	ATGT	2	8	696554	696561	25 %	50 %	25 %	0 %	298502265
14369	NC_014251	TTC	2	6	696579	696584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502265
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14373	NC_014251	TTA	2	6	696965	696970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502265
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14392	NC_014251	AAGCT	2	10	697986	697995	40 %	20 %	20 %	20 %	298502267
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14414	NC_014251	GTT	2	6	699313	699318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14416	NC_014251	ATA	2	6	699375	699380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14417	NC_014251	G	7	7	699387	699393	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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14427	NC_014251	TCG	2	6	700073	700078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14439	NC_014251	TA	3	6	700701	700706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14440	NC_014251	ATG	2	6	700725	700730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14442	NC_014251	GA	3	6	700911	700916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14443	NC_014251	AT	3	6	700955	700960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14444	NC_014251	GTAT	2	8	701030	701037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14445	NC_014251	ATG	2	6	701073	701078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14447	NC_014251	AGA	2	6	701107	701112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14448	NC_014251	GTC	2	6	701170	701175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14454	NC_014251	AATTTC	2	12	701362	701373	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298502273
14455	NC_014251	CAG	2	6	701481	701486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502273
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14476	NC_014251	TCC	2	6	702486	702491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14477	NC_014251	TTTAT	2	10	702497	702506	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14478	NC_014251	A	6	6	702519	702524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14479	NC_014251	ATT	3	9	702534	702542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14480	NC_014251	A	6	6	702553	702558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14481	NC_014251	TGT	2	6	702559	702564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14482	NC_014251	ACA	2	6	702569	702574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14483	NC_014251	A	6	6	702574	702579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14484	NC_014251	ATTTA	2	10	702610	702619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14485	NC_014251	A	6	6	702621	702626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14486	NC_014251	A	7	7	702628	702634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14487	NC_014251	TGA	2	6	702645	702650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502274
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14489	NC_014251	ATG	2	6	702743	702748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502274
14490	NC_014251	GGC	2	6	703049	703054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298502274
14491	NC_014251	TCT	2	6	703082	703087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502274
14492	NC_014251	ATTGG	2	10	703106	703115	20 %	40 %	40 %	0 %	298502274
14493	NC_014251	CAG	2	6	703119	703124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502274
14494	NC_014251	GTG	2	6	703173	703178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502274
14495	NC_014251	GTAA	2	8	703190	703197	50 %	25 %	25 %	0 %	298502274
14496	NC_014251	TAC	2	6	703225	703230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502274
14497	NC_014251	TTTTG	2	10	703231	703240	0 %	80 %	20 %	0 %	298502274
14498	NC_014251	AGG	2	6	703282	703287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298502274
14499	NC_014251	TTG	2	6	703311	703316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502274
14500	NC_014251	TAC	2	6	703453	703458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502274

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