MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014251	GTG	2	6	480589	480594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502043
10002	NC_014251	AGA	2	6	480629	480634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502043
10003	NC_014251	AT	3	6	480635	480640	50 %	50 %	0 %	0 %	298502043
10004	NC_014251	CTT	2	6	480648	480653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502043
10005	NC_014251	CGT	2	6	480654	480659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502043
10006	NC_014251	TGT	2	6	480740	480745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502043
10007	NC_014251	TGG	2	6	480752	480757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502043
10008	NC_014251	ACAGA	2	10	480850	480859	60 %	0 %	20 %	20 %	298502043
10009	NC_014251	A	6	6	480967	480972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_014251	AGC	2	6	481061	481066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502044
10011	NC_014251	AT	3	6	481166	481171	50 %	50 %	0 %	0 %	298502044
10012	NC_014251	GAT	2	6	481236	481241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502044
10013	NC_014251	TAT	2	6	481343	481348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502044
10014	NC_014251	ATC	2	6	481398	481403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502044
10015	NC_014251	CCA	2	6	481443	481448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298502044
10016	NC_014251	AGA	3	9	481460	481468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502044
10017	NC_014251	TAC	2	6	481470	481475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502044
10018	NC_014251	GAT	2	6	481485	481490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502044
10019	NC_014251	CGT	2	6	481509	481514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502044
10020	NC_014251	ATG	2	6	481606	481611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502044
10021	NC_014251	TCT	2	6	481612	481617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502044
10022	NC_014251	TTG	2	6	481715	481720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_014251	ATCGA	2	10	481738	481747	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10024	NC_014251	TTGAAG	2	12	481788	481799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502045
10025	NC_014251	AGT	2	6	481804	481809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502045
10026	NC_014251	AAT	2	6	481983	481988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502045
10027	NC_014251	TCG	2	6	482062	482067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502046
10028	NC_014251	ACAA	2	8	482109	482116	75 %	0 %	0 %	25 %	298502046
10029	NC_014251	GTA	2	6	482188	482193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502047
10030	NC_014251	GCT	3	9	482248	482256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502047
10031	NC_014251	AGA	2	6	482265	482270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502047
10032	NC_014251	AAG	2	6	482300	482305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502047
10033	NC_014251	CGT	2	6	482314	482319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502047
10034	NC_014251	TCG	2	6	482352	482357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502047
10035	NC_014251	CGT	2	6	482419	482424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502047
10036	NC_014251	AAC	2	6	482455	482460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502047
10037	NC_014251	GTAAAG	2	12	482471	482482	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298502047
10038	NC_014251	A	6	6	482503	482508	100 %	0 %	0 %	0 %	298502047
10039	NC_014251	AGG	2	6	482515	482520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_014251	CGT	2	6	482550	482555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_014251	TAA	2	6	482603	482608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502048
10042	NC_014251	TCA	2	6	482655	482660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502048
10043	NC_014251	GCT	2	6	482706	482711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502048
10044	NC_014251	GCT	3	9	482727	482735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502048
10045	NC_014251	TGC	2	6	482822	482827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502048
10046	NC_014251	CA	3	6	482872	482877	50 %	0 %	0 %	50 %	298502048
10047	NC_014251	TCC	2	6	482888	482893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298502048
10048	NC_014251	ATC	2	6	482912	482917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502048
10049	NC_014251	TGA	2	6	482990	482995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502049
10050	NC_014251	CT	3	6	483062	483067	0 %	50 %	0 %	50 %	298502049
10051	NC_014251	TCG	2	6	483068	483073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502049
10052	NC_014251	AGC	2	6	483098	483103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502049
10053	NC_014251	GT	3	6	483127	483132	0 %	50 %	50 %	0 %	298502049
10054	NC_014251	A	6	6	483229	483234	100 %	0 %	0 %	0 %	298502049
10055	NC_014251	CTG	2	6	483259	483264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502049
10056	NC_014251	TTC	2	6	483347	483352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502049
10057	NC_014251	CTG	2	6	483397	483402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502049
10058	NC_014251	GTAG	2	8	483501	483508	25 %	25 %	50 %	0 %	298502049
10059	NC_014251	ATG	2	6	483511	483516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502049
10060	NC_014251	ATT	2	6	483558	483563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502049
10061	NC_014251	AGA	2	6	483566	483571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502049
10062	NC_014251	TGA	2	6	483655	483660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502049
10063	NC_014251	AAG	2	6	483661	483666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502049
10064	NC_014251	GAC	2	6	483681	483686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502049
10065	NC_014251	GAT	2	6	483800	483805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502049
10066	NC_014251	GAA	2	6	483837	483842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502049
10067	NC_014251	AAACTC	2	12	483846	483857	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	298502049
10068	NC_014251	ATAA	2	8	483883	483890	75 %	25 %	0 %	0 %	298502049
10069	NC_014251	AGG	2	6	483891	483896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_014251	AATC	2	8	483984	483991	50 %	25 %	0 %	25 %	298502050
10071	NC_014251	A	6	6	484035	484040	100 %	0 %	0 %	0 %	298502050
10072	NC_014251	GTG	2	6	484059	484064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502050
10073	NC_014251	TGCA	2	8	484068	484075	25 %	25 %	25 %	25 %	298502050
10074	NC_014251	CGT	2	6	484076	484081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502050
10075	NC_014251	AGC	2	6	484084	484089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502050
10076	NC_014251	CGTA	2	8	484096	484103	25 %	25 %	25 %	25 %	298502050
10077	NC_014251	ATG	2	6	484125	484130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502050
10078	NC_014251	CTA	2	6	484152	484157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502050
10079	NC_014251	CGT	2	6	484244	484249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502050
10080	NC_014251	ATC	2	6	484271	484276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502050
10081	NC_014251	ATC	2	6	484290	484295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_014251	TTG	2	6	484300	484305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_014251	ATG	3	9	484312	484320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_014251	TCA	2	6	484383	484388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_014251	TAG	2	6	484399	484404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_014251	T	7	7	484424	484430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_014251	AAC	2	6	484437	484442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_014251	AAG	2	6	484532	484537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502051
10089	NC_014251	TGT	2	6	484570	484575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502051
10090	NC_014251	TTG	2	6	484596	484601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502051
10091	NC_014251	TC	3	6	484650	484655	0 %	50 %	0 %	50 %	298502051
10092	NC_014251	GAT	2	6	484681	484686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502051
10093	NC_014251	TGT	2	6	484690	484695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502051
10094	NC_014251	TGA	2	6	484702	484707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502051
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10099	NC_014251	A	6	6	484965	484970	100 %	0 %	0 %	0 %	298502052
10100	NC_014251	GGC	2	6	484981	484986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298502052
10101	NC_014251	TAG	2	6	484992	484997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502052
10102	NC_014251	TGA	2	6	485005	485010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502052
10103	NC_014251	TAA	2	6	485041	485046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502052
10104	NC_014251	TGG	2	6	485161	485166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502052
10105	NC_014251	GAGAT	2	10	485202	485211	40 %	20 %	40 %	0 %	298502052
10106	NC_014251	TCA	2	6	485214	485219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502052
10107	NC_014251	ATTCC	2	10	485220	485229	20 %	40 %	0 %	40 %	298502052
10108	NC_014251	GTCA	2	8	485263	485270	25 %	25 %	25 %	25 %	298502052
10109	NC_014251	GTTG	2	8	485371	485378	0 %	50 %	50 %	0 %	298502052
10110	NC_014251	ATC	2	6	485450	485455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502052
10111	NC_014251	TGGTG	2	10	485476	485485	0 %	40 %	60 %	0 %	298502052
10112	NC_014251	GTA	2	6	485525	485530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502052
10113	NC_014251	TTGG	2	8	485579	485586	0 %	50 %	50 %	0 %	298502052
10114	NC_014251	GA	3	6	485600	485605	50 %	0 %	50 %	0 %	298502052
10115	NC_014251	ACG	2	6	485720	485725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502052
10116	NC_014251	GGT	2	6	485789	485794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502052
10117	NC_014251	TGC	2	6	485839	485844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502052
10118	NC_014251	CT	3	6	485857	485862	0 %	50 %	0 %	50 %	298502052
10119	NC_014251	TCTGT	2	10	485895	485904	0 %	60 %	20 %	20 %	298502052
10120	NC_014251	TGGAT	2	10	485905	485914	20 %	40 %	40 %	0 %	298502052
10121	NC_014251	AGA	2	6	485929	485934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502052
10122	NC_014251	CTG	2	6	485940	485945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502052
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10127	NC_014251	TAAA	2	8	486223	486230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_014251	CCT	2	6	486233	486238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10130	NC_014251	TTTA	2	8	486297	486304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_014251	ATA	2	6	486325	486330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_014251	TTTTA	2	10	486362	486371	20 %	80 %	0 %	0 %	298502053
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10224	NC_014251	AGA	2	6	491242	491247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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