MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014220	CAG	2	6	89	94	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014220	ACT	2	6	118	123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616215
3	NC_014220	ACA	2	6	223	228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616215
4	NC_014220	GTA	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616215
5	NC_014220	TGC	2	6	446	451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616215
6	NC_014220	CGG	2	6	506	511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616215
7	NC_014220	CTT	2	6	574	579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616215
8	NC_014220	CAG	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616215
9	NC_014220	GAC	2	6	696	701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616215
10	NC_014220	AAG	2	6	733	738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616215
11	NC_014220	T	6	6	741	746	0 %	100 %	0 %	0 %	297616215
12	NC_014220	CA	3	6	747	752	50 %	0 %	0 %	50 %	297616215
13	NC_014220	AACA	2	8	774	781	75 %	0 %	0 %	25 %	297616215
14	NC_014220	TTA	2	6	862	867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616215
15	NC_014220	A	7	7	914	920	100 %	0 %	0 %	0 %	297616215
16	NC_014220	ATG	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616215
17	NC_014220	CATA	2	8	961	968	50 %	25 %	0 %	25 %	297616215
18	NC_014220	TA	3	6	975	980	50 %	50 %	0 %	0 %	297616215
19	NC_014220	TTG	2	6	1021	1026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616215
20	NC_014220	AT	3	6	1036	1041	50 %	50 %	0 %	0 %	297616215
21	NC_014220	CCAA	2	8	1042	1049	50 %	0 %	0 %	50 %	297616215
22	NC_014220	AGA	3	9	1166	1174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616215
23	NC_014220	CGG	2	6	1188	1193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616215
24	NC_014220	CAT	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616215
25	NC_014220	CAC	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616215
26	NC_014220	A	6	6	1321	1326	100 %	0 %	0 %	0 %	297616215
27	NC_014220	TCT	2	6	1329	1334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616215
28	NC_014220	TTA	2	6	1356	1361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616215
29	NC_014220	ACAG	2	8	1432	1439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014220	T	6	6	1458	1463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014220	CTA	3	9	1490	1498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014220	TAAG	2	8	1506	1513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014220	AAC	2	6	1514	1519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014220	AAG	2	6	1520	1525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014220	TGC	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616216
36	NC_014220	AG	3	6	1601	1606	50 %	0 %	50 %	0 %	297616216
37	NC_014220	TTCT	2	8	1634	1641	0 %	75 %	0 %	25 %	297616216
38	NC_014220	ACT	2	6	1666	1671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616216
39	NC_014220	AGA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616216
40	NC_014220	GAC	2	6	1825	1830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616216
41	NC_014220	GTC	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616216
42	NC_014220	A	6	6	1949	1954	100 %	0 %	0 %	0 %	297616216
43	NC_014220	CCT	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616216
44	NC_014220	GTT	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616216
45	NC_014220	GTA	2	6	2059	2064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616216
46	NC_014220	ATG	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616216
47	NC_014220	TCT	2	6	2107	2112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616216
48	NC_014220	AGA	2	6	2178	2183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616216
49	NC_014220	AAG	2	6	2489	2494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616216
50	NC_014220	TTTC	2	8	2537	2544	0 %	75 %	0 %	25 %	297616216
51	NC_014220	CCT	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616216
52	NC_014220	AGCG	2	8	2698	2705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014220	T	6	6	2743	2748	0 %	100 %	0 %	0 %	297616217
54	NC_014220	GT	3	6	2763	2768	0 %	50 %	50 %	0 %	297616217
55	NC_014220	AAAC	2	8	2822	2829	75 %	0 %	0 %	25 %	297616217
56	NC_014220	GCC	2	6	2906	2911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616217
57	NC_014220	TTAC	2	8	2933	2940	25 %	50 %	0 %	25 %	297616217
58	NC_014220	TGA	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616217
59	NC_014220	ATT	2	6	2959	2964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616217
60	NC_014220	AGC	2	6	2969	2974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616217
61	NC_014220	AG	3	6	2982	2987	50 %	0 %	50 %	0 %	297616217
62	NC_014220	AAC	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616217
63	NC_014220	GCT	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616217
64	NC_014220	CGT	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616217
65	NC_014220	AGA	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616217
66	NC_014220	CGG	2	6	3106	3111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616217
67	NC_014220	A	7	7	3175	3181	100 %	0 %	0 %	0 %	297616217
68	NC_014220	TAC	2	6	3242	3247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616217
69	NC_014220	TGC	2	6	3300	3305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616217
70	NC_014220	AGA	2	6	3357	3362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616217
71	NC_014220	GTAT	2	8	3375	3382	25 %	50 %	25 %	0 %	297616217
72	NC_014220	CG	3	6	3540	3545	0 %	0 %	50 %	50 %	297616217
73	NC_014220	GGA	2	6	3683	3688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616217
74	NC_014220	GCA	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616217
75	NC_014220	AGA	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616217
76	NC_014220	GTA	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616217
77	NC_014220	GAG	2	6	3808	3813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616217
78	NC_014220	A	6	6	3821	3826	100 %	0 %	0 %	0 %	297616217
79	NC_014220	ATA	2	6	3922	3927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616218
80	NC_014220	A	8	8	3944	3951	100 %	0 %	0 %	0 %	297616218
81	NC_014220	ATA	2	6	3991	3996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616218
82	NC_014220	TTC	2	6	4026	4031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616218
83	NC_014220	AGG	3	9	4065	4073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616218
84	NC_014220	TCT	2	6	4074	4079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616218
85	NC_014220	AAGA	2	8	4154	4161	75 %	0 %	25 %	0 %	297616219
86	NC_014220	TA	3	6	4173	4178	50 %	50 %	0 %	0 %	297616219
87	NC_014220	CG	3	6	4192	4197	0 %	0 %	50 %	50 %	297616219
88	NC_014220	CAC	2	6	4203	4208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616219
89	NC_014220	ACA	2	6	4228	4233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616219
90	NC_014220	TGA	2	6	4262	4267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616219
91	NC_014220	TTA	2	6	4276	4281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616219
92	NC_014220	TACCGT	2	12	4295	4306	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297616219
93	NC_014220	GAC	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616219
94	NC_014220	ACTCC	2	10	4385	4394	20 %	20 %	0 %	60 %	297616219
95	NC_014220	G	6	6	4407	4412	0 %	0 %	100 %	0 %	297616219
96	NC_014220	GTG	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616219
97	NC_014220	ATC	2	6	4516	4521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616219
98	NC_014220	AAC	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616219
99	NC_014220	CCCGGA	2	12	4604	4615	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	297616219
100	NC_014220	ATA	2	6	4647	4652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616219
101	NC_014220	GGA	2	6	4749	4754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616219
102	NC_014220	AT	3	6	4812	4817	50 %	50 %	0 %	0 %	297616219
103	NC_014220	AAG	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616219
104	NC_014220	TCCTA	2	10	4888	4897	20 %	40 %	0 %	40 %	297616219
105	NC_014220	CAA	2	6	4901	4906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616219
106	NC_014220	AGGA	2	8	4918	4925	50 %	0 %	50 %	0 %	297616219
107	NC_014220	GGT	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616219
108	NC_014220	CCAAA	2	10	5093	5102	60 %	0 %	0 %	40 %	297616219
109	NC_014220	T	7	7	5168	5174	0 %	100 %	0 %	0 %	297616219
110	NC_014220	A	7	7	5196	5202	100 %	0 %	0 %	0 %	297616219
111	NC_014220	GCG	2	6	5220	5225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616219
112	NC_014220	CGG	2	6	5226	5231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616219
113	NC_014220	AGC	2	6	5240	5245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616219
114	NC_014220	AACT	2	8	5260	5267	50 %	25 %	0 %	25 %	297616219
115	NC_014220	AGAA	2	8	5271	5278	75 %	0 %	25 %	0 %	297616219
116	NC_014220	CCG	2	6	5371	5376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616219
117	NC_014220	ATAA	2	8	5541	5548	75 %	25 %	0 %	0 %	297616219
118	NC_014220	ACC	2	6	5557	5562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616219
119	NC_014220	TTA	2	6	5566	5571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616219
120	NC_014220	TGAC	2	8	5575	5582	25 %	25 %	25 %	25 %	297616219
121	NC_014220	TTG	2	6	5613	5618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616219
122	NC_014220	TTC	2	6	5625	5630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616219
123	NC_014220	TACGTT	2	12	5664	5675	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	297616219
124	NC_014220	GCC	2	6	5681	5686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616219
125	NC_014220	AAG	2	6	5710	5715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616219
126	NC_014220	AAG	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616219
127	NC_014220	GA	3	6	5806	5811	50 %	0 %	50 %	0 %	297616219
128	NC_014220	GCT	2	6	5861	5866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616219
129	NC_014220	CG	3	6	5963	5968	0 %	0 %	50 %	50 %	297616219
130	NC_014220	CCAGG	2	10	6024	6033	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_014220	TTGC	2	8	6086	6093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014220	TGA	2	6	6132	6137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014220	AGGA	2	8	6153	6160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014220	GAA	2	6	6207	6212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014220	AGAA	2	8	6265	6272	75 %	0 %	25 %	0 %	297616220
136	NC_014220	ACT	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616220
137	NC_014220	TCG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616220
138	NC_014220	TGG	2	6	6430	6435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616220
139	NC_014220	CGATG	2	10	6482	6491	20 %	20 %	40 %	20 %	297616220
140	NC_014220	ATG	2	6	6670	6675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616220
141	NC_014220	GTA	2	6	6693	6698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616220
142	NC_014220	CTA	2	6	6720	6725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616220
143	NC_014220	CA	3	6	6775	6780	50 %	0 %	0 %	50 %	297616220
144	NC_014220	TTG	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
145	NC_014220	AGA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616220
146	NC_014220	AAAG	2	8	6974	6981	75 %	0 %	25 %	0 %	297616220
147	NC_014220	TTG	2	6	6997	7002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
148	NC_014220	TGG	2	6	7039	7044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616220
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151	NC_014220	ACC	2	6	7288	7293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616220
152	NC_014220	TAA	2	6	7303	7308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616220
153	NC_014220	GGC	2	6	7309	7314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616220
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157	NC_014220	TTG	2	6	7492	7497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
158	NC_014220	TGCGCC	2	12	7501	7512	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297616220
159	NC_014220	GA	3	6	7527	7532	50 %	0 %	50 %	0 %	297616220
160	NC_014220	GGA	2	6	7541	7546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616220
161	NC_014220	GACG	2	8	7669	7676	25 %	0 %	50 %	25 %	297616220
162	NC_014220	GAA	2	6	7725	7730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616220
163	NC_014220	GAC	2	6	7868	7873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616220
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173	NC_014220	TGT	2	6	8350	8355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
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178	NC_014220	GAA	3	9	8649	8657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616220
179	NC_014220	A	7	7	8727	8733	100 %	0 %	0 %	0 %	297616221
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188	NC_014220	TGA	2	6	9245	9250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616221
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202	NC_014220	GAT	2	6	9826	9831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616222
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204	NC_014220	AG	3	6	9922	9927	50 %	0 %	50 %	0 %	297616222
205	NC_014220	GAG	2	6	9932	9937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616222
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208	NC_014220	TATAA	2	10	10175	10184	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
209	NC_014220	AGT	2	6	10223	10228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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211	NC_014220	GGT	2	6	10255	10260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
212	NC_014220	TTG	2	6	10345	10350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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214	NC_014220	GAG	2	6	10451	10456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
215	NC_014220	GAA	2	6	10477	10482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616223
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253	NC_014220	TGA	2	6	12408	12413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616224
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259	NC_014220	TAT	2	6	12649	12654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616224
260	NC_014220	T	6	6	12741	12746	0 %	100 %	0 %	0 %	297616224
261	NC_014220	GAA	2	6	12811	12816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616224
262	NC_014220	AGAA	2	8	12839	12846	75 %	0 %	25 %	0 %	297616224
263	NC_014220	AAG	2	6	12850	12855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616224
264	NC_014220	GAG	2	6	12935	12940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616224
265	NC_014220	TCG	2	6	12953	12958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616224
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267	NC_014220	GAC	2	6	13018	13023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616224
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269	NC_014220	ATG	2	6	13084	13089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616224
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272	NC_014220	GAT	2	6	13253	13258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_014220	GA	3	6	14903	14908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_014220	ACG	2	6	19986	19991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616230
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405	NC_014220	AGC	2	6	20334	20339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_014220	GAC	2	6	22726	22731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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