MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_014220	AAC	2	6	2282124	2282129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297618406
41502	NC_014220	CT	3	6	2282147	2282152	0 %	50 %	0 %	50 %	297618406
41503	NC_014220	CTTC	2	8	2282175	2282182	0 %	50 %	0 %	50 %	297618406
41504	NC_014220	A	6	6	2282249	2282254	100 %	0 %	0 %	0 %	297618406
41505	NC_014220	TCCC	2	8	2282265	2282272	0 %	25 %	0 %	75 %	297618406
41506	NC_014220	AAC	2	6	2282273	2282278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297618406
41507	NC_014220	CTTC	2	8	2282324	2282331	0 %	50 %	0 %	50 %	297618406
41508	NC_014220	ATC	2	6	2282410	2282415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618406
41509	NC_014220	TCA	2	6	2282489	2282494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618406
41510	NC_014220	CTT	2	6	2282505	2282510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618406
41511	NC_014220	CAC	2	6	2282518	2282523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297618406
41512	NC_014220	GTT	2	6	2282545	2282550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297618406
41513	NC_014220	CTT	2	6	2282574	2282579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618406
41514	NC_014220	GTGG	2	8	2282617	2282624	0 %	25 %	75 %	0 %	297618406
41515	NC_014220	TC	3	6	2282672	2282677	0 %	50 %	0 %	50 %	297618406
41516	NC_014220	AAG	2	6	2282684	2282689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297618406
41517	NC_014220	GA	3	6	2282695	2282700	50 %	0 %	50 %	0 %	297618406
41518	NC_014220	TCT	2	6	2282709	2282714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618406
41519	NC_014220	TGG	2	6	2282804	2282809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297618406
41520	NC_014220	CCG	2	6	2282831	2282836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297618406
41521	NC_014220	GTC	2	6	2282901	2282906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297618406
41522	NC_014220	CCT	2	6	2282949	2282954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297618406
41523	NC_014220	TCC	2	6	2283023	2283028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297618406
41524	NC_014220	AACG	2	8	2283029	2283036	50 %	0 %	25 %	25 %	297618406
41525	NC_014220	GCATCT	2	12	2283200	2283211	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297618406
41526	NC_014220	TCG	2	6	2283221	2283226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297618406
41527	NC_014220	CTT	3	9	2283261	2283269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618406
41528	NC_014220	CTT	2	6	2283350	2283355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618406
41529	NC_014220	AAC	2	6	2283367	2283372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297618406
41530	NC_014220	CTTTC	2	10	2283464	2283473	0 %	60 %	0 %	40 %	297618406
41531	NC_014220	TCCT	2	8	2283510	2283517	0 %	50 %	0 %	50 %	297618407
41532	NC_014220	TCT	2	6	2283553	2283558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618407
41533	NC_014220	GCC	2	6	2283567	2283572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297618407
41534	NC_014220	GTG	2	6	2283602	2283607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297618407
41535	NC_014220	GGA	2	6	2283696	2283701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297618407
41536	NC_014220	AAC	2	6	2283713	2283718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297618407
41537	NC_014220	GTT	2	6	2283794	2283799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297618407
41538	NC_014220	CTTTC	2	10	2283818	2283827	0 %	60 %	0 %	40 %	297618407
41539	NC_014220	CGT	2	6	2283887	2283892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297618407
41540	NC_014220	A	6	6	2283926	2283931	100 %	0 %	0 %	0 %	297618407
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41542	NC_014220	ACC	2	6	2284128	2284133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297618407
41543	NC_014220	AACC	2	8	2284158	2284165	50 %	0 %	0 %	50 %	297618407
41544	NC_014220	TAAA	2	8	2284191	2284198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41545	NC_014220	A	6	6	2284196	2284201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41546	NC_014220	CTC	2	6	2284261	2284266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41547	NC_014220	ACTT	2	8	2284296	2284303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41548	NC_014220	CT	3	6	2284396	2284401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41549	NC_014220	AGGC	2	8	2284405	2284412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41550	NC_014220	GTT	2	6	2284456	2284461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41551	NC_014220	GCTC	2	8	2284554	2284561	0 %	25 %	25 %	50 %	297618408
41552	NC_014220	CTT	2	6	2284569	2284574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618408
41553	NC_014220	GCC	2	6	2284641	2284646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297618408
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41555	NC_014220	CCT	2	6	2284732	2284737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297618408
41556	NC_014220	AAT	2	6	2284876	2284881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297618408
41557	NC_014220	TCA	2	6	2284914	2284919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618408
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41560	NC_014220	TTC	2	6	2285058	2285063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618408
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41564	NC_014220	TCT	2	6	2285230	2285235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618408
41565	NC_014220	AT	3	6	2285260	2285265	50 %	50 %	0 %	0 %	297618408
41566	NC_014220	CGG	2	6	2285276	2285281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297618408
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41569	NC_014220	ACG	2	6	2285385	2285390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297618408
41570	NC_014220	TAT	2	6	2285426	2285431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297618408
41571	NC_014220	TCG	2	6	2285568	2285573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297618408
41572	NC_014220	TCA	2	6	2285617	2285622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618408
41573	NC_014220	GCT	2	6	2285623	2285628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297618408
41574	NC_014220	TCC	2	6	2285637	2285642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297618408
41575	NC_014220	CTC	3	9	2285645	2285653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297618408
41576	NC_014220	CCAG	2	8	2285675	2285682	25 %	0 %	25 %	50 %	297618408
41577	NC_014220	CTC	2	6	2285990	2285995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41578	NC_014220	ATCCC	2	10	2286122	2286131	20 %	20 %	0 %	60 %	297618409
41579	NC_014220	GTG	2	6	2286136	2286141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297618409
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41581	NC_014220	CTA	2	6	2286239	2286244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618409
41582	NC_014220	A	7	7	2286310	2286316	100 %	0 %	0 %	0 %	297618409
41583	NC_014220	TC	3	6	2286336	2286341	0 %	50 %	0 %	50 %	297618409
41584	NC_014220	CAA	2	6	2286390	2286395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297618409
41585	NC_014220	TCCC	2	8	2286470	2286477	0 %	25 %	0 %	75 %	297618409
41586	NC_014220	CAT	2	6	2286512	2286517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618409
41587	NC_014220	TCA	2	6	2286533	2286538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618409
41588	NC_014220	CTGT	2	8	2286539	2286546	0 %	50 %	25 %	25 %	297618409
41589	NC_014220	TC	3	6	2286548	2286553	0 %	50 %	0 %	50 %	297618410
41590	NC_014220	TGA	2	6	2286580	2286585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297618410
41591	NC_014220	GTC	2	6	2286605	2286610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297618410
41592	NC_014220	TTA	2	6	2286646	2286651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297618410
41593	NC_014220	CCCG	2	8	2286658	2286665	0 %	0 %	25 %	75 %	297618410
41594	NC_014220	GAG	2	6	2286763	2286768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297618410
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41596	NC_014220	C	7	7	2287013	2287019	0 %	0 %	0 %	100 %	297618410
41597	NC_014220	ACC	3	9	2287089	2287097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297618410
41598	NC_014220	CTT	2	6	2287105	2287110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618410
41599	NC_014220	CGG	2	6	2287210	2287215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297618410
41600	NC_014220	CGA	2	6	2287231	2287236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297618410
41601	NC_014220	A	6	6	2287245	2287250	100 %	0 %	0 %	0 %	297618410
41602	NC_014220	ATC	2	6	2287324	2287329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618411
41603	NC_014220	ACC	2	6	2287408	2287413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297618411
41604	NC_014220	TC	3	6	2287487	2287492	0 %	50 %	0 %	50 %	297618411
41605	NC_014220	TTG	2	6	2287570	2287575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297618411
41606	NC_014220	CTT	2	6	2287643	2287648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618411
41607	NC_014220	TCA	2	6	2287651	2287656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618411
41608	NC_014220	ATTT	2	8	2287683	2287690	25 %	75 %	0 %	0 %	297618411
41609	NC_014220	TCC	2	6	2287742	2287747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297618411
41610	NC_014220	GAA	2	6	2287759	2287764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297618411
41611	NC_014220	CAC	2	6	2287803	2287808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297618411
41612	NC_014220	TCCA	2	8	2287815	2287822	25 %	25 %	0 %	50 %	297618411
41613	NC_014220	AAAC	2	8	2287834	2287841	75 %	0 %	0 %	25 %	297618411
41614	NC_014220	CGTC	2	8	2287852	2287859	0 %	25 %	25 %	50 %	297618411
41615	NC_014220	ATG	2	6	2287861	2287866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297618411
41616	NC_014220	ATC	2	6	2287957	2287962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618411
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41618	NC_014220	CGA	2	6	2288052	2288057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297618411
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41620	NC_014220	ATC	2	6	2288329	2288334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618411
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41855	NC_014220	ATC	2	6	2300200	2300205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618421
41856	NC_014220	T	6	6	2300238	2300243	0 %	100 %	0 %	0 %	297618421
41857	NC_014220	GTT	2	6	2300271	2300276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297618421
41858	NC_014220	CAA	2	6	2300304	2300309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297618421
41859	NC_014220	TA	3	6	2300327	2300332	50 %	50 %	0 %	0 %	297618421
41860	NC_014220	TTA	2	6	2300385	2300390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41861	NC_014220	AATCC	2	10	2300401	2300410	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41862	NC_014220	T	6	6	2300457	2300462	0 %	100 %	0 %	0 %	297618422
41863	NC_014220	CA	3	6	2300514	2300519	50 %	0 %	0 %	50 %	297618422
41864	NC_014220	AAG	2	6	2300568	2300573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297618422
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41868	NC_014220	TTC	2	6	2300844	2300849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618422
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41874	NC_014220	CTG	2	6	2301095	2301100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297618422
41875	NC_014220	CCGC	2	8	2301119	2301126	0 %	0 %	25 %	75 %	297618422
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41879	NC_014220	CGT	2	6	2301236	2301241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297618422
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41885	NC_014220	T	6	6	2301529	2301534	0 %	100 %	0 %	0 %	297618423
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41973	NC_014220	AGTCG	2	10	2306331	2306340	20 %	20 %	40 %	20 %	297618429
41974	NC_014220	GTC	2	6	2306419	2306424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297618429
41975	NC_014220	GTCA	2	8	2306436	2306443	25 %	25 %	25 %	25 %	297618429
41976	NC_014220	GTC	2	6	2306445	2306450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297618429
41977	NC_014220	GCA	2	6	2306516	2306521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297618429
41978	NC_014220	ACCG	2	8	2306553	2306560	25 %	0 %	25 %	50 %	297618429
41979	NC_014220	AT	3	6	2306618	2306623	50 %	50 %	0 %	0 %	297618429
41980	NC_014220	GGC	2	6	2306716	2306721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297618429
41981	NC_014220	CCG	2	6	2306905	2306910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297618429
41982	NC_014220	CGG	2	6	2307012	2307017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297618429
41983	NC_014220	CTA	2	6	2307080	2307085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618429
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41987	NC_014220	CTA	2	6	2307434	2307439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618430
41988	NC_014220	TGC	2	6	2307462	2307467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297618430
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41991	NC_014220	TCCT	2	8	2307693	2307700	0 %	50 %	0 %	50 %	297618430
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42000	NC_014220	GCC	2	6	2308204	2308209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297618430

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