MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40502	NC_014220	CTT	2	6	2226894	2226899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618330
40503	NC_014220	GAA	2	6	2226958	2226963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297618330
40504	NC_014220	ATAA	2	8	2227028	2227035	75 %	25 %	0 %	0 %	297618330
40505	NC_014220	AGG	2	6	2227040	2227045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297618330
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40509	NC_014220	CGGCC	2	10	2227118	2227127	0 %	0 %	40 %	60 %	297618330
40510	NC_014220	GCA	2	6	2227171	2227176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297618330
40511	NC_014220	GGCG	2	8	2227218	2227225	0 %	0 %	75 %	25 %	297618330
40512	NC_014220	CGG	2	6	2227251	2227256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297618330
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40515	NC_014220	CCCCG	2	10	2227323	2227332	0 %	0 %	20 %	80 %	297618330
40516	NC_014220	ATA	3	9	2227378	2227386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297618331
40517	NC_014220	CCTG	2	8	2227388	2227395	0 %	25 %	25 %	50 %	297618331
40518	NC_014220	GCC	2	6	2227509	2227514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297618331
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40521	NC_014220	CGGG	2	8	2227645	2227652	0 %	0 %	75 %	25 %	297618331
40522	NC_014220	GA	3	6	2227681	2227686	50 %	0 %	50 %	0 %	297618331
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40558	NC_014220	C	6	6	2229854	2229859	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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40612	NC_014220	TGG	2	6	2232675	2232680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297618337
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40614	NC_014220	AAGGT	2	10	2232770	2232779	40 %	20 %	40 %	0 %	297618337
40615	NC_014220	ACCG	2	8	2232805	2232812	25 %	0 %	25 %	50 %	297618337
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40617	NC_014220	CCT	2	6	2232950	2232955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297618338
40618	NC_014220	ATC	2	6	2233001	2233006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618338
40619	NC_014220	TC	3	6	2233028	2233033	0 %	50 %	0 %	50 %	297618338
40620	NC_014220	CTTC	2	8	2233104	2233111	0 %	50 %	0 %	50 %	297618338
40621	NC_014220	TCA	2	6	2233136	2233141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618338
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40649	NC_014220	TAT	2	6	2234811	2234816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40652	NC_014220	GGCT	2	8	2234883	2234890	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40653	NC_014220	T	7	7	2235034	2235040	0 %	100 %	0 %	0 %	297618341
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40733	NC_014220	GCA	3	9	2239713	2239721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40974	NC_014220	TCT	2	6	2253478	2253483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618369
40975	NC_014220	CTG	2	6	2253517	2253522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297618369
40976	NC_014220	AAG	2	6	2253721	2253726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297618369
40977	NC_014220	CCGG	2	8	2253818	2253825	0 %	0 %	50 %	50 %	297618369
40978	NC_014220	ACTGTA	2	12	2253881	2253892	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297618369
40979	NC_014220	T	6	6	2253916	2253921	0 %	100 %	0 %	0 %	297618369
40980	NC_014220	GACTAC	2	12	2253954	2253965	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297618370
40981	NC_014220	CTT	2	6	2254010	2254015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618370
40982	NC_014220	TCA	2	6	2254021	2254026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618370
40983	NC_014220	GCCC	2	8	2254060	2254067	0 %	0 %	25 %	75 %	297618370
40984	NC_014220	TTG	2	6	2254152	2254157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297618370
40985	NC_014220	AAAT	2	8	2254170	2254177	75 %	25 %	0 %	0 %	297618370
40986	NC_014220	GAT	2	6	2254181	2254186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297618370
40987	NC_014220	CTT	3	9	2254231	2254239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618370
40988	NC_014220	CCT	2	6	2254369	2254374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40989	NC_014220	TGG	2	6	2254519	2254524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297618371
40990	NC_014220	CTT	2	6	2254562	2254567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618371
40991	NC_014220	CCT	2	6	2254582	2254587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297618372
40992	NC_014220	AGC	2	6	2254621	2254626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297618372
40993	NC_014220	TC	3	6	2254627	2254632	0 %	50 %	0 %	50 %	297618372
40994	NC_014220	CTT	2	6	2254634	2254639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297618372
40995	NC_014220	CTC	2	6	2254781	2254786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297618372
40996	NC_014220	TAA	2	6	2254817	2254822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297618372
40997	NC_014220	TGCCT	2	10	2254883	2254892	0 %	40 %	20 %	40 %	297618372
40998	NC_014220	T	6	6	2254914	2254919	0 %	100 %	0 %	0 %	297618372
40999	NC_014220	CAT	2	6	2255079	2255084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618372
41000	NC_014220	AT	3	6	2255128	2255133	50 %	50 %	0 %	0 %	297618372

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