MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_014220	GAT	2	6	716027	716032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616884
13003	NC_014220	TAG	2	6	716092	716097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616884
13004	NC_014220	TTC	2	6	716110	716115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616884
13005	NC_014220	TGC	2	6	716158	716163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616884
13006	NC_014220	TGG	2	6	716239	716244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616884
13007	NC_014220	TTC	2	6	716262	716267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616884
13008	NC_014220	T	6	6	716306	716311	0 %	100 %	0 %	0 %	297616884
13009	NC_014220	GGA	2	6	716351	716356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616884
13010	NC_014220	CGT	2	6	716374	716379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616884
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13012	NC_014220	TTC	2	6	716432	716437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616884
13013	NC_014220	ATG	2	6	716526	716531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616884
13014	NC_014220	CCA	2	6	716697	716702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13015	NC_014220	GT	3	6	716725	716730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_014220	CTTT	2	8	716761	716768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13017	NC_014220	ACT	2	6	717158	717163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616885
13018	NC_014220	T	6	6	717177	717182	0 %	100 %	0 %	0 %	297616885
13019	NC_014220	GA	3	6	717257	717262	50 %	0 %	50 %	0 %	297616885
13020	NC_014220	CGG	2	6	717279	717284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616885
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13040	NC_014220	A	7	7	718717	718723	100 %	0 %	0 %	0 %	297616885
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13053	NC_014220	CCG	2	6	719409	719414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13054	NC_014220	TGA	2	6	719469	719474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_014220	CTG	2	6	719477	719482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_014220	GTT	3	9	719488	719496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13059	NC_014220	TTA	2	6	719619	719624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13102	NC_014220	AGA	2	6	721640	721645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616888
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13106	NC_014220	GA	4	8	721882	721889	50 %	0 %	50 %	0 %	297616888
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13122	NC_014220	AAG	2	6	723072	723077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616888
13123	NC_014220	GGCG	2	8	723169	723176	0 %	0 %	75 %	25 %	297616889
13124	NC_014220	CGC	2	6	723208	723213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616889
13125	NC_014220	AG	3	6	723291	723296	50 %	0 %	50 %	0 %	297616889
13126	NC_014220	TGAGG	2	10	723350	723359	20 %	20 %	60 %	0 %	297616889
13127	NC_014220	GAA	2	6	723450	723455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616889
13128	NC_014220	GGA	2	6	723473	723478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616889
13129	NC_014220	GAG	2	6	723528	723533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616889
13130	NC_014220	GTC	2	6	723608	723613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616889
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13132	NC_014220	GGA	2	6	723659	723664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616889
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13137	NC_014220	A	6	6	724022	724027	100 %	0 %	0 %	0 %	297616890
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13139	NC_014220	GGCA	2	8	724109	724116	25 %	0 %	50 %	25 %	297616890
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13147	NC_014220	GCA	2	6	724706	724711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616890
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13153	NC_014220	TCTTA	2	10	725227	725236	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13154	NC_014220	TAT	2	6	725445	725450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616891
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13237	NC_014220	GCCCA	2	10	730202	730211	20 %	0 %	20 %	60 %	297616897
13238	NC_014220	GAA	2	6	730212	730217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616897
13239	NC_014220	AG	3	6	730263	730268	50 %	0 %	50 %	0 %	297616897
13240	NC_014220	TCA	2	6	730338	730343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616897
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13242	NC_014220	TCC	2	6	730475	730480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616897
13243	NC_014220	TGC	2	6	730494	730499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616897
13244	NC_014220	GGGCA	2	10	730516	730525	20 %	0 %	60 %	20 %	297616897
13245	NC_014220	CTT	2	6	730626	730631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616897
13246	NC_014220	CCT	2	6	730647	730652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616897
13247	NC_014220	TGC	2	6	730704	730709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616897
13248	NC_014220	CCT	2	6	730721	730726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616897
13249	NC_014220	CCTG	2	8	730790	730797	0 %	25 %	25 %	50 %	297616897
13250	NC_014220	CTT	2	6	730860	730865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616897
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13254	NC_014220	TGG	2	6	731085	731090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616897
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13262	NC_014220	TCCA	2	8	731275	731282	25 %	25 %	0 %	50 %	297616897
13263	NC_014220	CGT	2	6	731315	731320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616898
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13266	NC_014220	AGGG	2	8	731510	731517	25 %	0 %	75 %	0 %	297616898
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13270	NC_014220	GTG	2	6	731805	731810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616899
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13343	NC_014220	TAA	2	6	735548	735553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13356	NC_014220	GAGG	2	8	736183	736190	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13357	NC_014220	GTT	2	6	736270	736275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616904
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13486	NC_014220	CGC	2	6	743200	743205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13487	NC_014220	CGA	2	6	743211	743216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13488	NC_014220	TTA	2	6	743241	743246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13489	NC_014220	GT	3	6	743271	743276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13490	NC_014220	CAG	2	6	743321	743326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13491	NC_014220	AGG	2	6	743511	743516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13492	NC_014220	GGC	2	6	743532	743537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13493	NC_014220	AGG	2	6	743636	743641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13494	NC_014220	GAA	2	6	743776	743781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13495	NC_014220	TGG	2	6	743811	743816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13496	NC_014220	GGT	2	6	743860	743865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13497	NC_014220	GTC	2	6	743874	743879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13498	NC_014220	TCGTG	2	10	743883	743892	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13499	NC_014220	GGA	2	6	743988	743993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_014220	ATC	2	6	744012	744017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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