MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014220	ATT	2	6	688411	688416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_014220	GAG	3	9	688441	688449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_014220	TGAAG	2	10	688454	688463	40 %	20 %	40 %	0 %	297616856
12504	NC_014220	T	6	6	688470	688475	0 %	100 %	0 %	0 %	297616856
12505	NC_014220	CAG	2	6	688513	688518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616856
12506	NC_014220	CGTTC	2	10	688550	688559	0 %	40 %	20 %	40 %	297616856
12507	NC_014220	TGC	2	6	688655	688660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616856
12508	NC_014220	GTG	2	6	688777	688782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616856
12509	NC_014220	TAC	2	6	688830	688835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616856
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12511	NC_014220	ATG	2	6	689034	689039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616856
12512	NC_014220	TAC	2	6	689060	689065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616856
12513	NC_014220	CGA	2	6	689075	689080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616856
12514	NC_014220	TAC	2	6	689226	689231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616856
12515	NC_014220	TAA	2	6	689259	689264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_014220	AG	3	6	689323	689328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_014220	AAG	2	6	689365	689370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_014220	TCT	2	6	689399	689404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_014220	CTTC	2	8	689420	689427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12520	NC_014220	AAC	2	6	689435	689440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_014220	GTA	2	6	689532	689537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_014220	CG	3	6	689555	689560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12523	NC_014220	AT	3	6	689563	689568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_014220	GAG	2	6	689642	689647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_014220	GA	3	6	689649	689654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_014220	GAA	2	6	689658	689663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616857
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12530	NC_014220	GGA	2	6	689725	689730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616857
12531	NC_014220	GGT	2	6	689775	689780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616857
12532	NC_014220	T	6	6	689790	689795	0 %	100 %	0 %	0 %	297616857
12533	NC_014220	A	6	6	689839	689844	100 %	0 %	0 %	0 %	297616857
12534	NC_014220	CGA	2	6	689862	689867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616857
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12551	NC_014220	TAC	2	6	690619	690624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616857
12552	NC_014220	CGG	2	6	690677	690682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616857
12553	NC_014220	TTA	2	6	690782	690787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616857
12554	NC_014220	GAA	2	6	690792	690797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616857
12555	NC_014220	GTTT	2	8	690804	690811	0 %	75 %	25 %	0 %	297616857
12556	NC_014220	CTGG	2	8	690912	690919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12557	NC_014220	GCA	2	6	691034	691039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616858
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12560	NC_014220	TTG	2	6	691175	691180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616858
12561	NC_014220	CGGAAA	2	12	691340	691351	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	297616858
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12563	NC_014220	TCA	2	6	691418	691423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616858
12564	NC_014220	GCG	3	9	691522	691530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616858
12565	NC_014220	GGC	3	9	691590	691598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616858
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12568	NC_014220	CTATA	2	10	691618	691627	40 %	40 %	0 %	20 %	297616858
12569	NC_014220	GCC	2	6	691675	691680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616858
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12586	NC_014220	GCAT	2	8	693063	693070	25 %	25 %	25 %	25 %	297616860
12587	NC_014220	GCT	2	6	693089	693094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616860
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12589	NC_014220	A	6	6	693177	693182	100 %	0 %	0 %	0 %	297616860
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12592	NC_014220	A	6	6	693430	693435	100 %	0 %	0 %	0 %	297616860
12593	NC_014220	AT	3	6	693523	693528	50 %	50 %	0 %	0 %	297616861
12594	NC_014220	GTT	2	6	693534	693539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616861
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12599	NC_014220	AG	5	10	693850	693859	50 %	0 %	50 %	0 %	297616861
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12603	NC_014220	AACGG	2	10	694054	694063	40 %	0 %	40 %	20 %	297616861
12604	NC_014220	GCT	2	6	694081	694086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616861
12605	NC_014220	TACCCT	2	12	694111	694122	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	297616861
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12610	NC_014220	AG	3	6	694438	694443	50 %	0 %	50 %	0 %	297616862
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12619	NC_014220	CTTT	2	8	694797	694804	0 %	75 %	0 %	25 %	297616862
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12622	NC_014220	TCA	2	6	695013	695018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616862
12623	NC_014220	TCC	2	6	695072	695077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616862
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12646	NC_014220	T	6	6	696299	696304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12986	NC_014220	AGA	2	6	715274	715279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616883
12987	NC_014220	AT	3	6	715301	715306	50 %	50 %	0 %	0 %	297616883
12988	NC_014220	TCA	2	6	715384	715389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616883
12989	NC_014220	GGT	2	6	715400	715405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616883
12990	NC_014220	GGGA	2	8	715497	715504	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12991	NC_014220	ATC	2	6	715590	715595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616884
12992	NC_014220	CTA	2	6	715615	715620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616884
12993	NC_014220	TGC	2	6	715687	715692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616884
12994	NC_014220	AGTA	2	8	715722	715729	50 %	25 %	25 %	0 %	297616884
12995	NC_014220	TTG	2	6	715761	715766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616884
12996	NC_014220	GGTTTT	2	12	715772	715783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616884
12997	NC_014220	CGG	2	6	715843	715848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616884
12998	NC_014220	TTA	2	6	715864	715869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616884
12999	NC_014220	T	6	6	715940	715945	0 %	100 %	0 %	0 %	297616884
13000	NC_014220	TCTTA	2	10	715967	715976	20 %	60 %	0 %	20 %	297616884

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