MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_014220	GCT	2	6	661956	661961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12002	NC_014220	TAT	2	6	661998	662003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_014220	CTC	2	6	662083	662088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12004	NC_014220	AGC	2	6	662138	662143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12005	NC_014220	ATAA	2	8	662227	662234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_014220	CCG	2	6	662280	662285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12007	NC_014220	CCA	2	6	662337	662342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12008	NC_014220	ATT	2	6	662350	662355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_014220	CAG	2	6	662487	662492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12010	NC_014220	AT	3	6	662582	662587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12011	NC_014220	CCT	2	6	662633	662638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12012	NC_014220	CTT	2	6	662663	662668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616827
12013	NC_014220	CATT	2	8	662681	662688	25 %	50 %	0 %	25 %	297616827
12014	NC_014220	TCC	2	6	662689	662694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616827
12015	NC_014220	TCAAG	2	10	662724	662733	40 %	20 %	20 %	20 %	297616827
12016	NC_014220	AGC	2	6	662740	662745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616827
12017	NC_014220	AAC	2	6	662863	662868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616827
12018	NC_014220	ACA	3	9	662892	662900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616827
12019	NC_014220	CAAA	2	8	662983	662990	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12020	NC_014220	TGG	2	6	663023	663028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12021	NC_014220	A	7	7	663038	663044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12022	NC_014220	GAG	2	6	663115	663120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12023	NC_014220	CTC	2	6	663143	663148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12024	NC_014220	CGT	2	6	663156	663161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12025	NC_014220	GTG	2	6	663184	663189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_014220	CTT	2	6	663313	663318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616828
12027	NC_014220	ATG	2	6	663321	663326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616828
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12029	NC_014220	CAGA	2	8	663412	663419	50 %	0 %	25 %	25 %	297616828
12030	NC_014220	T	6	6	663466	663471	0 %	100 %	0 %	0 %	297616828
12031	NC_014220	CCGCC	2	10	663476	663485	0 %	0 %	20 %	80 %	297616828
12032	NC_014220	TTTC	2	8	663546	663553	0 %	75 %	0 %	25 %	297616828
12033	NC_014220	CCA	2	6	663556	663561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616828
12034	NC_014220	GCT	2	6	663630	663635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616828
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12038	NC_014220	CCT	2	6	663925	663930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12039	NC_014220	CTG	2	6	664061	664066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616829
12040	NC_014220	GGGC	2	8	664070	664077	0 %	0 %	75 %	25 %	297616829
12041	NC_014220	TCT	2	6	664142	664147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616829
12042	NC_014220	GAC	2	6	664158	664163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616829
12043	NC_014220	ACC	2	6	664285	664290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616829
12044	NC_014220	TCCA	2	8	664311	664318	25 %	25 %	0 %	50 %	297616829
12045	NC_014220	GGC	2	6	664320	664325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616829
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12049	NC_014220	AGTG	2	8	664523	664530	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12050	NC_014220	GCGA	2	8	664540	664547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12051	NC_014220	TTC	2	6	664588	664593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12052	NC_014220	CCGA	2	8	664626	664633	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12053	NC_014220	TAA	2	6	664676	664681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616830
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12056	NC_014220	GTGAT	2	10	664793	664802	20 %	40 %	40 %	0 %	297616830
12057	NC_014220	GCCA	2	8	664831	664838	25 %	0 %	25 %	50 %	297616830
12058	NC_014220	AGGGG	2	10	664839	664848	20 %	0 %	80 %	0 %	297616830
12059	NC_014220	CGG	2	6	664996	665001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616830
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12065	NC_014220	CTC	2	6	665264	665269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616830
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12071	NC_014220	ACCAGA	2	12	665513	665524	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	297616830
12072	NC_014220	CAAG	2	8	665535	665542	50 %	0 %	25 %	25 %	297616830
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12083	NC_014220	ATC	2	6	666051	666056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616831
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12091	NC_014220	GGT	2	6	666295	666300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616832
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12094	NC_014220	CTA	2	6	666427	666432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616832
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12103	NC_014220	TTCA	2	8	667151	667158	25 %	50 %	0 %	25 %	297616832
12104	NC_014220	AG	3	6	667246	667251	50 %	0 %	50 %	0 %	297616832
12105	NC_014220	GGC	2	6	667336	667341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616832
12106	NC_014220	GAA	2	6	667385	667390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12107	NC_014220	CAA	2	6	667467	667472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616833
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12110	NC_014220	TTC	2	6	667568	667573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616833
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12113	NC_014220	TTC	2	6	667616	667621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616833
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12117	NC_014220	CGC	2	6	667722	667727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616833
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12252	NC_014220	GA	3	6	674594	674599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12253	NC_014220	ACC	2	6	674770	674775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616839
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12346	NC_014220	GAAT	2	8	679965	679972	50 %	25 %	25 %	0 %	297616845
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12373	NC_014220	GGAAG	2	10	681744	681753	40 %	0 %	60 %	0 %	297616848
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12486	NC_014220	ATG	2	6	687603	687608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616854
12487	NC_014220	CGT	2	6	687616	687621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616854
12488	NC_014220	AAC	2	6	687766	687771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12489	NC_014220	AGG	2	6	687853	687858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12490	NC_014220	TTCA	2	8	687881	687888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12491	NC_014220	AGG	2	6	687896	687901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12496	NC_014220	TGCATC	2	12	688098	688109	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297616855
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12498	NC_014220	CTGT	2	8	688152	688159	0 %	50 %	25 %	25 %	297616855
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