MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_014220	ACG	2	6	634544	634549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616798
11503	NC_014220	TGT	2	6	634556	634561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616798
11504	NC_014220	GA	3	6	634644	634649	50 %	0 %	50 %	0 %	297616799
11505	NC_014220	GACC	2	8	634656	634663	25 %	0 %	25 %	50 %	297616799
11506	NC_014220	TAG	2	6	634679	634684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616799
11507	NC_014220	A	6	6	634689	634694	100 %	0 %	0 %	0 %	297616799
11508	NC_014220	GCT	2	6	634713	634718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616799
11509	NC_014220	TAC	2	6	634867	634872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616799
11510	NC_014220	AAT	2	6	634992	634997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616800
11511	NC_014220	GCA	2	6	635008	635013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616800
11512	NC_014220	CCT	2	6	635024	635029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616800
11513	NC_014220	AGG	2	6	635039	635044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616800
11514	NC_014220	T	7	7	635114	635120	0 %	100 %	0 %	0 %	297616800
11515	NC_014220	TCT	2	6	635228	635233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616800
11516	NC_014220	AGG	2	6	635319	635324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616800
11517	NC_014220	CTTG	2	8	635372	635379	0 %	50 %	25 %	25 %	297616800
11518	NC_014220	AAC	2	6	635407	635412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616800
11519	NC_014220	GCTC	2	8	635448	635455	0 %	25 %	25 %	50 %	297616800
11520	NC_014220	GAG	2	6	635650	635655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616800
11521	NC_014220	GGT	2	6	635703	635708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616800
11522	NC_014220	GGT	2	6	635751	635756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616800
11523	NC_014220	TTG	2	6	635791	635796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616800
11524	NC_014220	TAATG	2	10	635814	635823	40 %	40 %	20 %	0 %	297616800
11525	NC_014220	AG	3	6	635871	635876	50 %	0 %	50 %	0 %	297616800
11526	NC_014220	TTG	2	6	635919	635924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616800
11527	NC_014220	TGG	2	6	635927	635932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616800
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11529	NC_014220	TGTC	2	8	635994	636001	0 %	50 %	25 %	25 %	297616800
11530	NC_014220	GAT	2	6	636076	636081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616800
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11532	NC_014220	GATT	2	8	636146	636153	25 %	50 %	25 %	0 %	297616801
11533	NC_014220	GCTG	2	8	636171	636178	0 %	25 %	50 %	25 %	297616801
11534	NC_014220	AGG	2	6	636206	636211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616801
11535	NC_014220	TCT	2	6	636222	636227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616801
11536	NC_014220	TA	3	6	636256	636261	50 %	50 %	0 %	0 %	297616801
11537	NC_014220	GTC	2	6	636266	636271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616801
11538	NC_014220	ATA	2	6	636334	636339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616801
11539	NC_014220	CCG	2	6	636453	636458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616801
11540	NC_014220	CTA	2	6	636464	636469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616801
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11542	NC_014220	GCA	2	6	636501	636506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616801
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11550	NC_014220	GCGG	2	8	637016	637023	0 %	0 %	75 %	25 %	297616802
11551	NC_014220	GCAG	2	8	637051	637058	25 %	0 %	50 %	25 %	297616802
11552	NC_014220	TGGA	2	8	637071	637078	25 %	25 %	50 %	0 %	297616802
11553	NC_014220	GAT	2	6	637106	637111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616802
11554	NC_014220	AG	3	6	637215	637220	50 %	0 %	50 %	0 %	297616802
11555	NC_014220	CCG	2	6	637236	637241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616802
11556	NC_014220	CGGG	2	8	637250	637257	0 %	0 %	75 %	25 %	297616802
11557	NC_014220	TGG	2	6	637273	637278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616802
11558	NC_014220	AT	3	6	637398	637403	50 %	50 %	0 %	0 %	297616802
11559	NC_014220	TCGATA	2	12	637438	637449	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297616802
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11562	NC_014220	TGG	2	6	637585	637590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616802
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11565	NC_014220	ATA	2	6	637644	637649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616802
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11569	NC_014220	CG	3	6	637880	637885	0 %	0 %	50 %	50 %	297616802
11570	NC_014220	GAA	2	6	637919	637924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616802
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11572	NC_014220	GAGT	2	8	638052	638059	25 %	25 %	50 %	0 %	297616802
11573	NC_014220	ACC	2	6	638093	638098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616803
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11575	NC_014220	TGA	2	6	638248	638253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616803
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11587	NC_014220	GGT	2	6	638788	638793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616804
11588	NC_014220	TGC	2	6	638811	638816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616804
11589	NC_014220	TGC	2	6	638839	638844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616804
11590	NC_014220	ATGA	2	8	638867	638874	50 %	25 %	25 %	0 %	297616804
11591	NC_014220	GGCA	2	8	638896	638903	25 %	0 %	50 %	25 %	297616804
11592	NC_014220	T	6	6	638908	638913	0 %	100 %	0 %	0 %	297616804
11593	NC_014220	GAA	2	6	638954	638959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616804
11594	NC_014220	CGGG	2	8	638992	638999	0 %	0 %	75 %	25 %	297616804
11595	NC_014220	TTATTT	2	12	639100	639111	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	297616804
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11603	NC_014220	CGAG	2	8	639374	639381	25 %	0 %	50 %	25 %	297616805
11604	NC_014220	GTG	2	6	639433	639438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616805
11605	NC_014220	GCG	2	6	639527	639532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616805
11606	NC_014220	GGC	2	6	639576	639581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616805
11607	NC_014220	AG	3	6	639609	639614	50 %	0 %	50 %	0 %	297616805
11608	NC_014220	TTG	2	6	639634	639639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616805
11609	NC_014220	ATGGT	2	10	639686	639695	20 %	40 %	40 %	0 %	297616805
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11611	NC_014220	CAT	2	6	639867	639872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616805
11612	NC_014220	G	6	6	639879	639884	0 %	0 %	100 %	0 %	297616805
11613	NC_014220	GGA	2	6	639924	639929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616805
11614	NC_014220	ATG	2	6	639968	639973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616805
11615	NC_014220	GAG	2	6	640009	640014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616805
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11617	NC_014220	GAA	2	6	640061	640066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_014220	AAT	2	6	640100	640105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616806
11619	NC_014220	CTTG	2	8	640108	640115	0 %	50 %	25 %	25 %	297616806
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11986	NC_014220	GAT	2	6	661044	661049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616826
11987	NC_014220	T	6	6	661064	661069	0 %	100 %	0 %	0 %	297616826
11988	NC_014220	CATC	2	8	661133	661140	25 %	25 %	0 %	50 %	297616826
11989	NC_014220	GCT	2	6	661187	661192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616826
11990	NC_014220	CCG	2	6	661198	661203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616826
11991	NC_014220	AAT	2	6	661261	661266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616826
11992	NC_014220	GCCCTG	2	12	661273	661284	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297616826
11993	NC_014220	AAC	2	6	661306	661311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616826
11994	NC_014220	TCT	2	6	661333	661338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616826
11995	NC_014220	CTG	2	6	661365	661370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616826
11996	NC_014220	GTT	2	6	661489	661494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616826
11997	NC_014220	AAC	2	6	661521	661526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616826
11998	NC_014220	CCT	2	6	661626	661631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11999	NC_014220	AGTT	2	8	661644	661651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12000	NC_014220	CA	3	6	661691	661696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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