MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_014220	GCCG	2	8	554607	554614	0 %	0 %	50 %	50 %	297616723
10003	NC_014220	TGATA	2	10	554636	554645	40 %	40 %	20 %	0 %	297616723
10004	NC_014220	AGC	2	6	554650	554655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616723
10005	NC_014220	CAT	2	6	554678	554683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616723
10006	NC_014220	CAA	2	6	554720	554725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616723
10007	NC_014220	AAGC	2	8	554796	554803	50 %	0 %	25 %	25 %	297616723
10008	NC_014220	GGCC	2	8	554907	554914	0 %	0 %	50 %	50 %	297616723
10009	NC_014220	GGT	2	6	555002	555007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616723
10010	NC_014220	GGGGA	2	10	555019	555028	20 %	0 %	80 %	0 %	297616723
10011	NC_014220	TC	4	8	555072	555079	0 %	50 %	0 %	50 %	297616723
10012	NC_014220	CTGG	2	8	555107	555114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10013	NC_014220	ATG	2	6	555152	555157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_014220	GAG	2	6	555204	555209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_014220	GA	3	6	555212	555217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_014220	ATGAG	2	10	555221	555230	40 %	20 %	40 %	0 %	297616724
10017	NC_014220	GGA	2	6	555261	555266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616724
10018	NC_014220	TGA	2	6	555360	555365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616724
10019	NC_014220	AGG	2	6	555401	555406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616724
10020	NC_014220	CTA	2	6	555528	555533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616724
10021	NC_014220	ACG	2	6	555628	555633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616724
10022	NC_014220	AGCGTT	2	12	555660	555671	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	297616724
10023	NC_014220	AGCC	2	8	555780	555787	25 %	0 %	25 %	50 %	297616724
10024	NC_014220	ACCG	2	8	555790	555797	25 %	0 %	25 %	50 %	297616724
10025	NC_014220	GA	4	8	555823	555830	50 %	0 %	50 %	0 %	297616724
10026	NC_014220	CAGC	2	8	555884	555891	25 %	0 %	25 %	50 %	297616724
10027	NC_014220	ACT	2	6	555905	555910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616724
10028	NC_014220	TGG	2	6	555986	555991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616724
10029	NC_014220	GTG	2	6	556006	556011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616724
10030	NC_014220	TGC	2	6	556018	556023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616724
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10032	NC_014220	G	6	6	556236	556241	0 %	0 %	100 %	0 %	297616724
10033	NC_014220	AGA	2	6	556319	556324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616724
10034	NC_014220	GCG	2	6	556336	556341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616724
10035	NC_014220	GTT	2	6	556344	556349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616724
10036	NC_014220	TTC	2	6	556367	556372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616724
10037	NC_014220	CGA	2	6	556410	556415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616724
10038	NC_014220	TGGC	2	8	556421	556428	0 %	25 %	50 %	25 %	297616724
10039	NC_014220	AGA	2	6	556431	556436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616724
10040	NC_014220	AGA	2	6	556524	556529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616724
10041	NC_014220	AG	3	6	556557	556562	50 %	0 %	50 %	0 %	297616724
10042	NC_014220	TAT	2	6	556603	556608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_014220	CGGAA	2	10	556743	556752	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10044	NC_014220	GGA	2	6	556816	556821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616725
10045	NC_014220	GAA	2	6	556876	556881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616725
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10047	NC_014220	CCTG	2	8	556967	556974	0 %	25 %	25 %	50 %	297616725
10048	NC_014220	AGG	2	6	556997	557002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616725
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10053	NC_014220	TA	3	6	557260	557265	50 %	50 %	0 %	0 %	297616725
10054	NC_014220	CGAA	2	8	557344	557351	50 %	0 %	25 %	25 %	297616725
10055	NC_014220	TTGGAG	2	12	557473	557484	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	297616725
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10057	NC_014220	TAT	2	6	557515	557520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616725
10058	NC_014220	GGA	2	6	557547	557552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616725
10059	NC_014220	GCCT	2	8	557751	557758	0 %	25 %	25 %	50 %	297616725
10060	NC_014220	GCT	2	6	557837	557842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616725
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10065	NC_014220	AAG	2	6	558103	558108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616725
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10068	NC_014220	GA	3	6	558238	558243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_014220	CAT	2	6	558253	558258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616726
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10089	NC_014220	GTTG	2	8	558880	558887	0 %	50 %	50 %	0 %	297616726
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10093	NC_014220	GGC	2	6	559081	559086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616726
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10105	NC_014220	GAAGGC	2	12	559757	559768	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	297616726
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10251	NC_014220	T	6	6	567778	567783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10354	NC_014220	G	8	8	573144	573151	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10355	NC_014220	CTGG	2	8	573171	573178	0 %	25 %	50 %	25 %	297616743
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10362	NC_014220	ATCT	2	8	573440	573447	25 %	50 %	0 %	25 %	297616743
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10366	NC_014220	GCT	2	6	573728	573733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616743
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