MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 38561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014205	TA	3	6	2	7	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014205	TC	3	6	10	15	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014205	CTT	2	6	58	63	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014205	ATA	2	6	100	105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526029
5	NC_014205	ATA	2	6	112	117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526029
6	NC_014205	GAA	3	9	129	137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526029
7	NC_014205	GA	3	6	256	261	50 %	0 %	50 %	0 %	297526029
8	NC_014205	AT	3	6	277	282	50 %	50 %	0 %	0 %	297526029
9	NC_014205	ATT	2	6	366	371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526029
10	NC_014205	ACA	2	6	403	408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526029
11	NC_014205	TTG	2	6	530	535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526029
12	NC_014205	ACT	2	6	551	556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526029
13	NC_014205	GAT	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526029
14	NC_014205	TAT	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526029
15	NC_014205	TAG	2	6	635	640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526029
16	NC_014205	AGT	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526029
17	NC_014205	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526029
18	NC_014205	ATG	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526029
19	NC_014205	AAC	2	6	737	742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526029
20	NC_014205	AT	3	6	749	754	50 %	50 %	0 %	0 %	297526029
21	NC_014205	AG	3	6	761	766	50 %	0 %	50 %	0 %	297526029
22	NC_014205	ATA	2	6	805	810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526029
23	NC_014205	GCA	2	6	820	825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526029
24	NC_014205	GA	3	6	834	839	50 %	0 %	50 %	0 %	297526029
25	NC_014205	AGA	2	6	853	858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526029
26	NC_014205	GAG	2	6	955	960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526029
27	NC_014205	TAG	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526029
28	NC_014205	TAC	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526029
29	NC_014205	TA	3	6	1067	1072	50 %	50 %	0 %	0 %	297526029
30	NC_014205	AGA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526029
31	NC_014205	ATA	2	6	1138	1143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526029
32	NC_014205	TAA	2	6	1166	1171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526029
33	NC_014205	AAAAC	2	10	1204	1213	80 %	0 %	0 %	20 %	297526029
34	NC_014205	ATA	2	6	1278	1283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526030
35	NC_014205	TGA	2	6	1289	1294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526030
36	NC_014205	T	6	6	1311	1316	0 %	100 %	0 %	0 %	297526030
37	NC_014205	AAT	2	6	1397	1402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526030
38	NC_014205	GA	3	6	1412	1417	50 %	0 %	50 %	0 %	297526030
39	NC_014205	AAC	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526030
40	NC_014205	ATGCA	2	10	1513	1522	40 %	20 %	20 %	20 %	297526030
41	NC_014205	GAA	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526030
42	NC_014205	TAA	2	6	1549	1554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526030
43	NC_014205	CAA	2	6	1560	1565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526030
44	NC_014205	AT	3	6	1650	1655	50 %	50 %	0 %	0 %	297526030
45	NC_014205	A	7	7	1721	1727	100 %	0 %	0 %	0 %	297526030
46	NC_014205	ACAA	2	8	1745	1752	75 %	0 %	0 %	25 %	297526030
47	NC_014205	ATT	2	6	1834	1839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526030
48	NC_014205	CCG	2	6	1850	1855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014205	CGC	2	6	1889	1894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_014205	CGGG	2	8	2037	2044	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014205	TTC	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014205	GAC	2	6	2120	2125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014205	TAT	2	6	2175	2180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014205	TAGT	2	8	2214	2221	25 %	50 %	25 %	0 %	297526031
55	NC_014205	TAT	2	6	2224	2229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526031
56	NC_014205	TA	3	6	2247	2252	50 %	50 %	0 %	0 %	297526031
57	NC_014205	AT	3	6	2285	2290	50 %	50 %	0 %	0 %	297526031
58	NC_014205	TTC	2	6	2291	2296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526031
59	NC_014205	TAA	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526031
60	NC_014205	TC	3	6	2357	2362	0 %	50 %	0 %	50 %	297526031
61	NC_014205	TA	3	6	2376	2381	50 %	50 %	0 %	0 %	297526031
62	NC_014205	CAT	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526031
63	NC_014205	TAA	2	6	2556	2561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526031
64	NC_014205	CT	3	6	2604	2609	0 %	50 %	0 %	50 %	297526031
65	NC_014205	TA	3	6	2634	2639	50 %	50 %	0 %	0 %	297526031
66	NC_014205	TACC	2	8	2649	2656	25 %	25 %	0 %	50 %	297526031
67	NC_014205	AGG	2	6	2711	2716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526031
68	NC_014205	TTG	2	6	2754	2759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526031
69	NC_014205	CA	3	6	2802	2807	50 %	0 %	0 %	50 %	297526031
70	NC_014205	GAT	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526031
71	NC_014205	TGTT	2	8	2920	2927	0 %	75 %	25 %	0 %	297526031
72	NC_014205	TCA	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526031
73	NC_014205	CTGG	2	8	3009	3016	0 %	25 %	50 %	25 %	297526031
74	NC_014205	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526031
75	NC_014205	ATACT	2	10	3114	3123	40 %	40 %	0 %	20 %	297526031
76	NC_014205	AT	3	6	3155	3160	50 %	50 %	0 %	0 %	297526031
77	NC_014205	TTC	2	6	3176	3181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526031
78	NC_014205	AT	3	6	3217	3222	50 %	50 %	0 %	0 %	297526031
79	NC_014205	CGC	2	6	3231	3236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297526031
80	NC_014205	TCC	2	6	3278	3283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526031
81	NC_014205	CT	3	6	3376	3381	0 %	50 %	0 %	50 %	297526031
82	NC_014205	CTT	2	6	3430	3435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526031
83	NC_014205	TTG	2	6	3468	3473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526031
84	NC_014205	CAG	2	6	3489	3494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526031
85	NC_014205	AGA	2	6	3504	3509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526031
86	NC_014205	CAG	2	6	3518	3523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526031
87	NC_014205	GC	3	6	3561	3566	0 %	0 %	50 %	50 %	297526031
88	NC_014205	TGT	2	6	3569	3574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526031
89	NC_014205	CTC	2	6	3642	3647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526031
90	NC_014205	ATC	2	6	3668	3673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526031
91	NC_014205	TAG	2	6	3698	3703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526031
92	NC_014205	AT	3	6	3743	3748	50 %	50 %	0 %	0 %	297526031
93	NC_014205	TTC	2	6	3829	3834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526031
94	NC_014205	GTT	2	6	3884	3889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526031
95	NC_014205	ACC	2	6	3905	3910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_014205	TAGT	2	8	3950	3957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014205	T	6	6	3972	3977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014205	TAAA	2	8	4010	4017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014205	ATC	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526032
100	NC_014205	AAT	2	6	4145	4150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526032
101	NC_014205	TCT	2	6	4167	4172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526032
102	NC_014205	AAT	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526032
103	NC_014205	TTCAT	2	10	4293	4302	20 %	60 %	0 %	20 %	297526032
104	NC_014205	T	6	6	4391	4396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014205	CTC	2	6	4408	4413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014205	CCT	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014205	TGA	2	6	4486	4491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014205	AATAT	2	10	4587	4596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014205	GTT	2	6	4642	4647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014205	ATGT	2	8	4677	4684	25 %	50 %	25 %	0 %	297526033
111	NC_014205	GA	3	6	4734	4739	50 %	0 %	50 %	0 %	297526033
112	NC_014205	ATA	2	6	4802	4807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526033
113	NC_014205	GATC	2	8	4872	4879	25 %	25 %	25 %	25 %	297526033
114	NC_014205	ATG	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526033
115	NC_014205	ATG	2	6	5138	5143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526033
116	NC_014205	ATT	2	6	5268	5273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526033
117	NC_014205	TC	3	6	5288	5293	0 %	50 %	0 %	50 %	297526033
118	NC_014205	GTG	2	6	5345	5350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297526033
119	NC_014205	TAG	2	6	5363	5368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526033
120	NC_014205	AT	3	6	5416	5421	50 %	50 %	0 %	0 %	297526033
121	NC_014205	GAA	2	6	5464	5469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526033
122	NC_014205	TAGATA	2	12	5489	5500	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297526033
123	NC_014205	A	6	6	5550	5555	100 %	0 %	0 %	0 %	297526033
124	NC_014205	AAG	2	6	5593	5598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526033
125	NC_014205	CCT	2	6	5686	5691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526033
126	NC_014205	AGC	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526033
127	NC_014205	ATC	2	6	5762	5767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526033
128	NC_014205	TA	3	6	5827	5832	50 %	50 %	0 %	0 %	297526033
129	NC_014205	A	6	6	5925	5930	100 %	0 %	0 %	0 %	297526033
130	NC_014205	TTA	2	6	5954	5959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526034
131	NC_014205	TCA	2	6	5977	5982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526034
132	NC_014205	TCT	2	6	6024	6029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526034
133	NC_014205	TAT	2	6	6115	6120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526034
134	NC_014205	CTT	2	6	6124	6129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526034
135	NC_014205	AGA	2	6	6134	6139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526034
136	NC_014205	TAT	2	6	6142	6147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526034
137	NC_014205	TGA	2	6	6214	6219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526034
138	NC_014205	TCC	2	6	6244	6249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526034
139	NC_014205	CTA	2	6	6283	6288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526034
140	NC_014205	ATA	2	6	6374	6379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526034
141	NC_014205	TAT	2	6	6458	6463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526034
142	NC_014205	TCC	2	6	6560	6565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526034
143	NC_014205	CTCC	2	8	6619	6626	0 %	25 %	0 %	75 %	297526034
144	NC_014205	TCTCA	2	10	6785	6794	20 %	40 %	0 %	40 %	297526034
145	NC_014205	TC	3	6	6833	6838	0 %	50 %	0 %	50 %	297526034
146	NC_014205	TAC	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526034
147	NC_014205	AT	3	6	6855	6860	50 %	50 %	0 %	0 %	297526034
148	NC_014205	TAC	2	6	6908	6913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526034
149	NC_014205	TCC	3	9	6917	6925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526034
150	NC_014205	ACCAAT	2	12	6926	6937	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	297526034
151	NC_014205	TAA	2	6	7017	7022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014205	GTG	2	6	7023	7028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014205	ACA	2	6	7082	7087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526035
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166	NC_014205	AT	3	6	7531	7536	50 %	50 %	0 %	0 %	297526035
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170	NC_014205	GTA	2	6	7687	7692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526036
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229	NC_014205	TTA	2	6	9771	9776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_014205	GTTT	2	8	11442	11449	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
267	NC_014205	ATT	2	6	11453	11458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_014205	AT	3	6	11463	11468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_014205	AAG	2	6	11517	11522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_014205	AGT	2	6	11524	11529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_014205	TAAA	2	8	11564	11571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_014205	GAA	2	6	11588	11593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_014205	GAA	2	6	11681	11686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_014205	AAT	2	6	11729	11734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_014205	AT	3	6	11733	11738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_014205	TCA	2	6	11749	11754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_014205	TA	4	8	11876	11883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_014205	ATA	2	6	11901	11906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_014205	AT	3	6	12105	12110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_014205	T	6	6	12139	12144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014205	TA	3	6	12207	12212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014205	TTTG	2	8	12223	12230	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014205	TA	4	8	12233	12240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_014205	AAT	2	6	16693	16698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526044
404	NC_014205	AGC	2	6	16709	16714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526044
405	NC_014205	ACT	2	6	16836	16841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526044
406	NC_014205	CTT	2	6	16852	16857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526044
407	NC_014205	CAA	2	6	16869	16874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526045
408	NC_014205	TAA	2	6	16911	16916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526045
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423	NC_014205	TAT	2	6	17448	17453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526046
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440	NC_014205	AC	3	6	18017	18022	50 %	0 %	0 %	50 %	297526046
441	NC_014205	ATAA	2	8	18044	18051	75 %	25 %	0 %	0 %	297526046
442	NC_014205	CAA	2	6	18084	18089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526046
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447	NC_014205	AGA	2	6	18287	18292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526047
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450	NC_014205	CCCTT	2	10	18331	18340	0 %	40 %	0 %	60 %	297526047
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458	NC_014205	AAT	2	6	18600	18605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526047
459	NC_014205	CTT	2	6	18617	18622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526047
460	NC_014205	ATC	2	6	18651	18656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526047
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463	NC_014205	GCAT	2	8	18919	18926	25 %	25 %	25 %	25 %	297526047
464	NC_014205	T	6	6	18996	19001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_014205	AGAT	2	8	19266	19273	50 %	25 %	25 %	0 %	297526048
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467	NC_014205	T	6	6	19338	19343	0 %	100 %	0 %	0 %	297526048
468	NC_014205	AAG	2	6	19344	19349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526048
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471	NC_014205	AT	3	6	19446	19451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_014205	AAT	2	6	19453	19458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_014205	TAA	2	6	19496	19501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526049
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479	NC_014205	CATA	2	8	19804	19811	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
480	NC_014205	ATA	2	6	19841	19846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_014205	TCC	2	6	19873	19878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
482	NC_014205	CAA	2	6	19897	19902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526050
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499	NC_014205	TTC	2	6	20548	20553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526050
500	NC_014205	TAT	2	6	20624	20629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526050

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