MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 78663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_014168	CGGCG	2	10	460143	460152	0 %	0 %	60 %	40 %	296392912
12003	NC_014168	CGA	2	6	460155	460160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392912
12004	NC_014168	CGC	2	6	460166	460171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392912
12005	NC_014168	CGC	2	6	460191	460196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392912
12006	NC_014168	TCG	2	6	460277	460282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392912
12007	NC_014168	GGCG	2	8	460302	460309	0 %	0 %	75 %	25 %	296392912
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12009	NC_014168	GGT	2	6	460389	460394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392912
12010	NC_014168	CGC	2	6	460410	460415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392912
12011	NC_014168	GGCG	2	8	460488	460495	0 %	0 %	75 %	25 %	296392912
12012	NC_014168	CG	3	6	460503	460508	0 %	0 %	50 %	50 %	296392912
12013	NC_014168	ACG	2	6	460523	460528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392912
12014	NC_014168	CCGC	2	8	460529	460536	0 %	0 %	25 %	75 %	296392912
12015	NC_014168	CG	3	6	460575	460580	0 %	0 %	50 %	50 %	296392912
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12031	NC_014168	CTG	2	6	461323	461328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12033	NC_014168	GAG	2	6	461415	461420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12119	NC_014168	TCG	2	6	464310	464315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392916
12120	NC_014168	GTC	2	6	464351	464356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392916
12121	NC_014168	AAC	2	6	464357	464362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392916
12122	NC_014168	GTC	2	6	464420	464425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392916
12123	NC_014168	TCA	2	6	464520	464525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392916
12124	NC_014168	GCC	2	6	464582	464587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392916
12125	NC_014168	GCG	2	6	464600	464605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392916
12126	NC_014168	CGC	2	6	464617	464622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392916
12127	NC_014168	GAGC	2	8	464623	464630	25 %	0 %	50 %	25 %	296392916
12128	NC_014168	GC	3	6	464672	464677	0 %	0 %	50 %	50 %	296392916
12129	NC_014168	TCG	2	6	464778	464783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392916
12130	NC_014168	CGG	2	6	464796	464801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392916
12131	NC_014168	CGG	3	9	464833	464841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392916
12132	NC_014168	CGG	2	6	464857	464862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392916
12133	NC_014168	AGC	2	6	464922	464927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392916
12134	NC_014168	GCG	2	6	464939	464944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12135	NC_014168	CCT	2	6	464968	464973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392917
12136	NC_014168	G	6	6	464979	464984	0 %	0 %	100 %	0 %	296392917
12137	NC_014168	CGC	2	6	465094	465099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392917
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12139	NC_014168	GCC	2	6	465152	465157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392917
12140	NC_014168	GCG	2	6	465192	465197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392917
12141	NC_014168	TCGGG	2	10	465210	465219	0 %	20 %	60 %	20 %	296392917
12142	NC_014168	CAA	2	6	465247	465252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392917
12143	NC_014168	GTCGT	2	10	465281	465290	0 %	40 %	40 %	20 %	296392917
12144	NC_014168	GCTG	2	8	465357	465364	0 %	25 %	50 %	25 %	296392917
12145	NC_014168	CGC	2	6	465391	465396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392917
12146	NC_014168	CGG	2	6	465436	465441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392917
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12148	NC_014168	CGA	2	6	465550	465555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392917
12149	NC_014168	GCC	2	6	465570	465575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392917
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12151	NC_014168	AGA	2	6	465645	465650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392917
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12153	NC_014168	TCC	2	6	465740	465745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392917
12154	NC_014168	TCG	2	6	465777	465782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392917
12155	NC_014168	CGC	2	6	465799	465804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392917
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12157	NC_014168	CAT	2	6	465817	465822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392917
12158	NC_014168	CG	3	6	465980	465985	0 %	0 %	50 %	50 %	296392917
12159	NC_014168	AGC	2	6	465990	465995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392917
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12161	NC_014168	CGG	2	6	466078	466083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392917
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12163	NC_014168	GCA	2	6	466155	466160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392917
12164	NC_014168	GC	4	8	466221	466228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12165	NC_014168	GC	3	6	466248	466253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12166	NC_014168	TG	3	6	466272	466277	0 %	50 %	50 %	0 %	296392918
12167	NC_014168	GAG	2	6	466332	466337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392918
12168	NC_014168	CGA	3	9	466340	466348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392918
12169	NC_014168	CGG	2	6	466367	466372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392918
12170	NC_014168	TTC	2	6	466410	466415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392918
12171	NC_014168	TCG	2	6	466462	466467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392918
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12174	NC_014168	GTC	2	6	466530	466535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392918
12175	NC_014168	CGG	2	6	466537	466542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392918
12176	NC_014168	CGC	2	6	466616	466621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392918
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12180	NC_014168	GC	3	6	466679	466684	0 %	0 %	50 %	50 %	296392918
12181	NC_014168	CGG	2	6	466712	466717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392918
12182	NC_014168	TGC	2	6	466750	466755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392918
12183	NC_014168	TGC	2	6	466768	466773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392918
12184	NC_014168	TCG	2	6	466774	466779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392918
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12191	NC_014168	GGTGCT	2	12	466946	466957	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296392918
12192	NC_014168	TCG	3	9	467005	467013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392918
12193	NC_014168	GGA	3	9	467030	467038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392918
12194	NC_014168	TGG	2	6	467101	467106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392918
12195	NC_014168	CGG	2	6	467113	467118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392918
12196	NC_014168	CTG	2	6	467143	467148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392918
12197	NC_014168	ATGAGG	2	12	467149	467160	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296392918
12198	NC_014168	GAT	2	6	467187	467192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12199	NC_014168	TGC	2	6	467351	467356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392919
12200	NC_014168	GC	3	6	467388	467393	0 %	0 %	50 %	50 %	296392919
12201	NC_014168	CG	3	6	467545	467550	0 %	0 %	50 %	50 %	296392919
12202	NC_014168	CGC	2	6	467553	467558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392919
12203	NC_014168	ATT	2	6	467653	467658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296392919
12204	NC_014168	ACGC	2	8	467701	467708	25 %	0 %	25 %	50 %	296392919
12205	NC_014168	CGA	2	6	467796	467801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392919
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12208	NC_014168	GACGCG	2	12	467833	467844	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296392919
12209	NC_014168	GAT	2	6	467856	467861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392919
12210	NC_014168	CG	3	6	467933	467938	0 %	0 %	50 %	50 %	296392919
12211	NC_014168	GAT	2	6	467949	467954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392919
12212	NC_014168	CCA	2	6	467957	467962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392919
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12214	NC_014168	TCGGGG	2	12	468026	468037	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296392919
12215	NC_014168	TCA	2	6	468050	468055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392919
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12218	NC_014168	CTG	2	6	468340	468345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392919
12219	NC_014168	CGCC	2	8	468377	468384	0 %	0 %	25 %	75 %	296392919
12220	NC_014168	GTG	2	6	468385	468390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392919
12221	NC_014168	TGC	2	6	468398	468403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392919
12222	NC_014168	GCG	2	6	468410	468415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392919
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12224	NC_014168	GGTCC	2	10	468459	468468	0 %	20 %	40 %	40 %	296392919
12225	NC_014168	CAT	2	6	468525	468530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392919
12226	NC_014168	CGCGG	2	10	468545	468554	0 %	0 %	60 %	40 %	296392919
12227	NC_014168	ATC	2	6	468625	468630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392919
12228	NC_014168	CGA	2	6	468642	468647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392919
12229	NC_014168	CGG	2	6	468798	468803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392919
12230	NC_014168	ACC	2	6	468811	468816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392919
12231	NC_014168	CAG	2	6	468841	468846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392919
12232	NC_014168	ATC	2	6	468883	468888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392919
12233	NC_014168	CG	3	6	468904	468909	0 %	0 %	50 %	50 %	296392919
12234	NC_014168	GGC	2	6	468940	468945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392919
12235	NC_014168	CGCAAG	2	12	468955	468966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392919
12236	NC_014168	AGG	2	6	469031	469036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392919
12237	NC_014168	CGC	2	6	469044	469049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392919
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12486	NC_014168	ACA	2	6	479378	479383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392930
12487	NC_014168	GCC	2	6	479415	479420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392930
12488	NC_014168	TCGA	2	8	479490	479497	25 %	25 %	25 %	25 %	296392930
12489	NC_014168	AGGC	2	8	479594	479601	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12490	NC_014168	CGA	2	6	479616	479621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392931
12491	NC_014168	GCC	2	6	479655	479660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392931
12492	NC_014168	CCG	2	6	479708	479713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392931
12493	NC_014168	TGT	2	6	479720	479725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392931
12494	NC_014168	TCC	2	6	479732	479737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392931
12495	NC_014168	TCA	2	6	479813	479818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392931
12496	NC_014168	TC	3	6	479837	479842	0 %	50 %	0 %	50 %	296392931
12497	NC_014168	GCT	2	6	479968	479973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392931
12498	NC_014168	AAT	2	6	480011	480016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296392931
12499	NC_014168	GTC	2	6	480023	480028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392932
12500	NC_014168	TCG	2	6	480073	480078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392932

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