MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 78663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_014168	GC	4	8	422962	422969	0 %	0 %	50 %	50 %	296392873
11003	NC_014168	CTT	2	6	422982	422987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392873
11004	NC_014168	CGG	2	6	423031	423036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392873
11005	NC_014168	CGC	2	6	423050	423055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392873
11006	NC_014168	GCAAG	2	10	423086	423095	40 %	0 %	40 %	20 %	296392873
11007	NC_014168	CGG	2	6	423107	423112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392873
11008	NC_014168	CGG	2	6	423187	423192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392873
11009	NC_014168	CGC	2	6	423199	423204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392873
11010	NC_014168	GC	3	6	423227	423232	0 %	0 %	50 %	50 %	296392873
11011	NC_014168	TGC	2	6	423241	423246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392873
11012	NC_014168	CGC	2	6	423273	423278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11013	NC_014168	TTG	2	6	423283	423288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392874
11014	NC_014168	GCC	2	6	423290	423295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392874
11015	NC_014168	CG	3	6	423376	423381	0 %	0 %	50 %	50 %	296392874
11016	NC_014168	CGA	2	6	423398	423403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392874
11017	NC_014168	CAG	2	6	423414	423419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392874
11018	NC_014168	CGA	2	6	423428	423433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392874
11019	NC_014168	GCT	2	6	423436	423441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392874
11020	NC_014168	GAA	2	6	423459	423464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392874
11021	NC_014168	GC	3	6	423508	423513	0 %	0 %	50 %	50 %	296392874
11022	NC_014168	CG	3	6	423533	423538	0 %	0 %	50 %	50 %	296392874
11023	NC_014168	CA	3	6	423550	423555	50 %	0 %	0 %	50 %	296392874
11024	NC_014168	CGC	2	6	423561	423566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392874
11025	NC_014168	TCA	2	6	423572	423577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392874
11026	NC_014168	CGG	2	6	423618	423623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392874
11027	NC_014168	CG	4	8	423661	423668	0 %	0 %	50 %	50 %	296392874
11028	NC_014168	CCG	2	6	423698	423703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392874
11029	NC_014168	GTT	2	6	423762	423767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392874
11030	NC_014168	CTG	2	6	423793	423798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392875
11031	NC_014168	CGTC	2	8	423807	423814	0 %	25 %	25 %	50 %	296392875
11032	NC_014168	TCC	2	6	423864	423869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392875
11033	NC_014168	AGCG	2	8	423873	423880	25 %	0 %	50 %	25 %	296392875
11034	NC_014168	GCCA	2	8	423909	423916	25 %	0 %	25 %	50 %	296392875
11035	NC_014168	GC	3	6	423957	423962	0 %	0 %	50 %	50 %	296392875
11036	NC_014168	GCG	2	6	423966	423971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392875
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11038	NC_014168	CG	3	6	424023	424028	0 %	0 %	50 %	50 %	296392875
11039	NC_014168	CG	4	8	424055	424062	0 %	0 %	50 %	50 %	296392875
11040	NC_014168	GGACA	2	10	424078	424087	40 %	0 %	40 %	20 %	296392875
11041	NC_014168	GGC	2	6	424088	424093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392875
11042	NC_014168	GGCA	2	8	424110	424117	25 %	0 %	50 %	25 %	296392875
11043	NC_014168	GCG	2	6	424143	424148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392875
11044	NC_014168	GC	3	6	424153	424158	0 %	0 %	50 %	50 %	296392875
11045	NC_014168	CGC	3	9	424160	424168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392875
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11052	NC_014168	CGAACG	2	12	424297	424308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392875
11053	NC_014168	GAG	2	6	424352	424357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392875
11054	NC_014168	CGT	2	6	424384	424389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392875
11055	NC_014168	GCCGC	2	10	424423	424432	0 %	0 %	40 %	60 %	296392875
11056	NC_014168	GGCTG	2	10	424482	424491	0 %	20 %	60 %	20 %	296392875
11057	NC_014168	CTC	2	6	424526	424531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392875
11058	NC_014168	GCA	2	6	424567	424572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392875
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11060	NC_014168	GCC	2	6	424668	424673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392875
11061	NC_014168	GTC	2	6	424736	424741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_014168	AGT	2	6	424746	424751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_014168	AAAT	2	8	424778	424785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_014168	GCG	3	9	424808	424816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392876
11065	NC_014168	ATC	2	6	424842	424847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392876
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11068	NC_014168	CCG	2	6	424902	424907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392876
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11070	NC_014168	CTCCGC	2	12	424984	424995	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	296392876
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11081	NC_014168	GAC	2	6	425721	425726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392877
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11089	NC_014168	CAC	2	6	425997	426002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392877
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11092	NC_014168	TCG	2	6	426109	426114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392877
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11094	NC_014168	GC	3	6	426287	426292	0 %	0 %	50 %	50 %	296392877
11095	NC_014168	CCA	4	12	426371	426382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392877
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11100	NC_014168	CAC	2	6	426609	426614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392877
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11103	NC_014168	CGC	2	6	426720	426725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392877
11104	NC_014168	GC	3	6	426724	426729	0 %	0 %	50 %	50 %	296392877
11105	NC_014168	CGG	2	6	426734	426739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392877
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11109	NC_014168	GCA	2	6	426877	426882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11111	NC_014168	CCG	2	6	426923	426928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11112	NC_014168	CTT	2	6	426940	426945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392878
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11116	NC_014168	CG	3	6	427127	427132	0 %	0 %	50 %	50 %	296392878
11117	NC_014168	GGC	2	6	427170	427175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392878
11118	NC_014168	CTGGG	2	10	427177	427186	0 %	20 %	60 %	20 %	296392878
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11240	NC_014168	GTC	2	6	431855	431860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392883
11241	NC_014168	GCC	2	6	431896	431901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392883
11242	NC_014168	TCC	2	6	431911	431916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392883
11243	NC_014168	GC	3	6	431966	431971	0 %	0 %	50 %	50 %	296392883
11244	NC_014168	GGC	2	6	431973	431978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392883
11245	NC_014168	CCGA	2	8	431988	431995	25 %	0 %	25 %	50 %	296392883
11246	NC_014168	TCG	2	6	432049	432054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392883
11247	NC_014168	GC	3	6	432083	432088	0 %	0 %	50 %	50 %	296392883
11248	NC_014168	CGG	2	6	432131	432136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392883
11249	NC_014168	ACG	2	6	432142	432147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392883
11250	NC_014168	GCA	2	6	432215	432220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392883
11251	NC_014168	CCA	2	6	432293	432298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392883
11252	NC_014168	CGG	2	6	432299	432304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392883
11253	NC_014168	AGC	2	6	432337	432342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392883
11254	NC_014168	CGACCG	2	12	432374	432385	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296392883
11255	NC_014168	GTC	2	6	432396	432401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392883
11256	NC_014168	CTG	2	6	432420	432425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392883
11257	NC_014168	GCG	2	6	432440	432445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392883
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11260	NC_014168	GC	3	6	432641	432646	0 %	0 %	50 %	50 %	296392883
11261	NC_014168	GAC	3	9	432657	432665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392883
11262	NC_014168	CGC	2	6	432675	432680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392883
11263	NC_014168	GTC	2	6	432687	432692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392883
11264	NC_014168	ACG	2	6	432737	432742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392883
11265	NC_014168	GTCGA	2	10	432745	432754	20 %	20 %	40 %	20 %	296392883
11266	NC_014168	GCGG	2	8	432765	432772	0 %	0 %	75 %	25 %	296392883
11267	NC_014168	CGG	2	6	432785	432790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392883
11268	NC_014168	GCC	2	6	432832	432837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392883
11269	NC_014168	CG	3	6	432870	432875	0 %	0 %	50 %	50 %	296392883
11270	NC_014168	CGG	2	6	432884	432889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392883
11271	NC_014168	CGA	2	6	432917	432922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392883
11272	NC_014168	CGG	2	6	433049	433054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392883
11273	NC_014168	CCG	2	6	433093	433098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392883
11274	NC_014168	GCG	2	6	433141	433146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11275	NC_014168	CGC	2	6	433156	433161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11276	NC_014168	CGC	3	9	433178	433186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11277	NC_014168	GGACCA	2	12	433209	433220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11278	NC_014168	GAG	2	6	433240	433245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11279	NC_014168	AGGACG	2	12	433317	433328	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296392884
11280	NC_014168	ATC	2	6	433454	433459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392884
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11283	NC_014168	GGGC	2	8	433494	433501	0 %	0 %	75 %	25 %	296392884
11284	NC_014168	CGC	2	6	433594	433599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392884
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11289	NC_014168	GAG	2	6	433746	433751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11290	NC_014168	GTCC	2	8	433755	433762	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11291	NC_014168	CGT	2	6	433808	433813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392885
11292	NC_014168	GTC	2	6	433818	433823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392885
11293	NC_014168	CGG	2	6	433861	433866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392885
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11295	NC_014168	GCCGG	2	10	433981	433990	0 %	0 %	60 %	40 %	296392885
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11300	NC_014168	GGCG	2	8	434234	434241	0 %	0 %	75 %	25 %	296392885
11301	NC_014168	GCA	3	9	434249	434257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392885
11302	NC_014168	ATC	2	6	434268	434273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392885
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11310	NC_014168	CGA	2	6	434730	434735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392886
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11313	NC_014168	TAC	2	6	434776	434781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392886
11314	NC_014168	GAC	2	6	434792	434797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392886
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11319	NC_014168	ACC	2	6	434956	434961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392886
11320	NC_014168	TCG	2	6	435050	435055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392886
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11323	NC_014168	CCGCGT	2	12	435236	435247	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296392887
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11326	NC_014168	CGG	2	6	435341	435346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392887
11327	NC_014168	CGT	2	6	435359	435364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392887
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11329	NC_014168	GAC	2	6	435451	435456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392887
11330	NC_014168	CGA	2	6	435461	435466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392887
11331	NC_014168	TGA	2	6	435542	435547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392887
11332	NC_014168	CCGC	2	8	435556	435563	0 %	0 %	25 %	75 %	296392887
11333	NC_014168	GTC	2	6	435573	435578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392887
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11340	NC_014168	GC	3	6	435811	435816	0 %	0 %	50 %	50 %	296392887
11341	NC_014168	CCG	2	6	435842	435847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392887
11342	NC_014168	GCG	2	6	435865	435870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392887
11343	NC_014168	GGC	2	6	435888	435893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392887
11344	NC_014168	CCT	2	6	435934	435939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11345	NC_014168	GCGCG	2	10	435947	435956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11346	NC_014168	GCG	2	6	435959	435964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11347	NC_014168	ACGGG	2	10	435969	435978	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11348	NC_014168	CGG	2	6	435982	435987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11349	NC_014168	ATCC	2	8	436013	436020	25 %	25 %	0 %	50 %	296392888
11350	NC_014168	GGC	2	6	436031	436036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392888
11351	NC_014168	CCGG	2	8	436058	436065	0 %	0 %	50 %	50 %	296392888
11352	NC_014168	CAC	2	6	436073	436078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392888
11353	NC_014168	CCG	2	6	436092	436097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392888
11354	NC_014168	AGG	2	6	436113	436118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392888
11355	NC_014168	ATG	2	6	436155	436160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392888
11356	NC_014168	TTTC	2	8	436237	436244	0 %	75 %	0 %	25 %	296392888
11357	NC_014168	TGC	2	6	436254	436259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392888
11358	NC_014168	GTCCTG	2	12	436319	436330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392888
11359	NC_014168	CCG	2	6	436374	436379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392888
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11362	NC_014168	CGC	2	6	436492	436497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392888
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11480	NC_014168	CTG	2	6	441161	441166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11481	NC_014168	GGT	2	6	441201	441206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11482	NC_014168	GAA	2	6	441215	441220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392894
11483	NC_014168	CGTCCT	2	12	441236	441247	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296392894
11484	NC_014168	C	6	6	441303	441308	0 %	0 %	0 %	100 %	296392894
11485	NC_014168	CCCG	2	8	441311	441318	0 %	0 %	25 %	75 %	296392894
11486	NC_014168	CGGG	2	8	441319	441326	0 %	0 %	75 %	25 %	296392894
11487	NC_014168	CGG	2	6	441335	441340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392894
11488	NC_014168	CGA	2	6	441350	441355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392894
11489	NC_014168	GAC	2	6	441378	441383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392894
11490	NC_014168	GAT	2	6	441384	441389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392894
11491	NC_014168	GAC	2	6	441390	441395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392894
11492	NC_014168	GAC	3	9	441402	441410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392894
11493	NC_014168	CGAGC	2	10	441422	441431	20 %	0 %	40 %	40 %	296392894
11494	NC_014168	GC	3	6	441430	441435	0 %	0 %	50 %	50 %	296392894
11495	NC_014168	CT	3	6	441485	441490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11496	NC_014168	GGC	2	6	441592	441597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392895
11497	NC_014168	CGG	2	6	441616	441621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392895
11498	NC_014168	CCG	2	6	441627	441632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392895
11499	NC_014168	GCC	2	6	441635	441640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392895
11500	NC_014168	G	6	6	441643	441648	0 %	0 %	100 %	0 %	296392895

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