MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 78663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
70001	NC_014168	CGG	2	6	2808598	2808603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395103
70002	NC_014168	CG	3	6	2808624	2808629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70003	NC_014168	CGA	2	6	2808678	2808683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395104
70004	NC_014168	CTC	2	6	2808687	2808692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296395104
70005	NC_014168	ACG	2	6	2808695	2808700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395104
70006	NC_014168	CAG	2	6	2808740	2808745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395104
70007	NC_014168	CGC	2	6	2808759	2808764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395104
70008	NC_014168	CGCC	2	8	2808768	2808775	0 %	0 %	25 %	75 %	296395104
70009	NC_014168	GTC	2	6	2808805	2808810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395104
70010	NC_014168	AAC	2	6	2808899	2808904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296395104
70011	NC_014168	GCTG	2	8	2808986	2808993	0 %	25 %	50 %	25 %	296395104
70012	NC_014168	CGG	2	6	2809110	2809115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395104
70013	NC_014168	CTC	2	6	2809116	2809121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296395104
70014	NC_014168	CGG	2	6	2809122	2809127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395104
70015	NC_014168	CGG	2	6	2809136	2809141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395104
70016	NC_014168	CGG	2	6	2809145	2809150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395104
70017	NC_014168	GCGA	2	8	2809171	2809178	25 %	0 %	50 %	25 %	296395104
70018	NC_014168	CGG	3	9	2809179	2809187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395104
70019	NC_014168	CCT	2	6	2809245	2809250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296395104
70020	NC_014168	CGC	2	6	2809344	2809349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395104
70021	NC_014168	CGC	2	6	2809353	2809358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395104
70022	NC_014168	TC	3	6	2809377	2809382	0 %	50 %	0 %	50 %	296395104
70023	NC_014168	CTG	2	6	2809402	2809407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395104
70024	NC_014168	AAG	2	6	2809409	2809414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296395104
70025	NC_014168	GGC	2	6	2809491	2809496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395104
70026	NC_014168	GAC	2	6	2809506	2809511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395104
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70030	NC_014168	CGC	2	6	2809692	2809697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395104
70031	NC_014168	ACC	2	6	2809810	2809815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296395104
70032	NC_014168	CCG	2	6	2809825	2809830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395104
70033	NC_014168	CG	3	6	2809928	2809933	0 %	0 %	50 %	50 %	296395104
70034	NC_014168	TCA	2	6	2809937	2809942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296395104
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70038	NC_014168	GGC	2	6	2810177	2810182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70039	NC_014168	TGG	2	6	2810283	2810288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296395105
70040	NC_014168	GTG	2	6	2810315	2810320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296395105
70041	NC_014168	TCT	2	6	2810331	2810336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296395105
70042	NC_014168	CGG	2	6	2810355	2810360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395105
70043	NC_014168	GAAG	2	8	2810425	2810432	50 %	0 %	50 %	0 %	296395105
70044	NC_014168	CGA	3	9	2810439	2810447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395105
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70049	NC_014168	GCCT	2	8	2810692	2810699	0 %	25 %	25 %	50 %	296395105
70050	NC_014168	TTG	2	6	2810964	2810969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296395105
70051	NC_014168	CTT	2	6	2810972	2810977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70052	NC_014168	AGC	2	6	2811084	2811089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70053	NC_014168	CGC	2	6	2811097	2811102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70054	NC_014168	GAT	2	6	2811164	2811169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296395106
70055	NC_014168	GC	3	6	2811172	2811177	0 %	0 %	50 %	50 %	296395106
70056	NC_014168	CGT	2	6	2811187	2811192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395106
70057	NC_014168	GGTGC	2	10	2811263	2811272	0 %	20 %	60 %	20 %	296395106
70058	NC_014168	CGG	2	6	2811322	2811327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395106
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70062	NC_014168	GCCT	2	8	2811500	2811507	0 %	25 %	25 %	50 %	296395106
70063	NC_014168	TGA	2	6	2811520	2811525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296395106
70064	NC_014168	TCT	3	9	2811538	2811546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296395106
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70066	NC_014168	GCGGGT	2	12	2811561	2811572	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296395106
70067	NC_014168	TG	4	8	2811618	2811625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70068	NC_014168	TGT	2	6	2811660	2811665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70069	NC_014168	CCGA	2	8	2811719	2811726	25 %	0 %	25 %	50 %	296395107
70070	NC_014168	CTG	2	6	2811752	2811757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395107
70071	NC_014168	GCC	2	6	2811783	2811788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395107
70072	NC_014168	CGT	2	6	2811805	2811810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395107
70073	NC_014168	TGACCG	2	12	2811811	2811822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296395107
70074	NC_014168	GGC	3	9	2811863	2811871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395107
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70081	NC_014168	TCG	2	6	2812290	2812295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395107
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70083	NC_014168	TCG	2	6	2812320	2812325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395107
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70085	NC_014168	GC	3	6	2812387	2812392	0 %	0 %	50 %	50 %	296395107
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70087	NC_014168	AGC	2	6	2812493	2812498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395108
70088	NC_014168	GAC	2	6	2812546	2812551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395108
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70090	NC_014168	GACGAT	2	12	2812564	2812575	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296395108
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70099	NC_014168	GCGG	2	8	2812801	2812808	0 %	0 %	75 %	25 %	296395108
70100	NC_014168	CCT	2	6	2812815	2812820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296395108
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70104	NC_014168	AGC	2	6	2812927	2812932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395108
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70106	NC_014168	T	6	6	2812965	2812970	0 %	100 %	0 %	0 %	296395108
70107	NC_014168	CTT	2	6	2812977	2812982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296395108
70108	NC_014168	CGG	2	6	2813018	2813023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70109	NC_014168	GGCGA	2	10	2813027	2813036	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70110	NC_014168	GCT	2	6	2813089	2813094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70111	NC_014168	CG	3	6	2813233	2813238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70112	NC_014168	CGG	4	12	2813256	2813267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70113	NC_014168	GCGA	2	8	2813293	2813300	25 %	0 %	50 %	25 %	296395109
70114	NC_014168	CTT	2	6	2813313	2813318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296395109
70115	NC_014168	TGG	2	6	2813327	2813332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296395109
70116	NC_014168	CGC	2	6	2813348	2813353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395109
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70118	NC_014168	CCGC	2	8	2813548	2813555	0 %	0 %	25 %	75 %	296395109
70119	NC_014168	CGA	2	6	2813597	2813602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395109
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70132	NC_014168	AC	3	6	2814459	2814464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70133	NC_014168	GA	3	6	2814573	2814578	50 %	0 %	50 %	0 %	296395111
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70199	NC_014168	CCG	2	6	2817399	2817404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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70220	NC_014168	CTT	2	6	2818616	2818621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296395115
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70232	NC_014168	CAG	2	6	2819088	2819093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395115
70233	NC_014168	CGA	2	6	2819098	2819103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395115
70234	NC_014168	GCT	2	6	2819132	2819137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395115
70235	NC_014168	ATC	2	6	2819172	2819177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296395115
70236	NC_014168	CGA	2	6	2819180	2819185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395115
70237	NC_014168	AG	3	6	2819291	2819296	50 %	0 %	50 %	0 %	296395115
70238	NC_014168	TCG	2	6	2819346	2819351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395115
70239	NC_014168	ACG	2	6	2819383	2819388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395115
70240	NC_014168	GAT	2	6	2819393	2819398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296395115
70241	NC_014168	TCT	2	6	2819410	2819415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296395115
70242	NC_014168	CCG	2	6	2819440	2819445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395115
70243	NC_014168	GGC	2	6	2819456	2819461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395115
70244	NC_014168	ACC	2	6	2819511	2819516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296395115
70245	NC_014168	GCA	2	6	2819534	2819539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395115
70246	NC_014168	CTA	2	6	2819678	2819683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296395115
70247	NC_014168	CCG	2	6	2819725	2819730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395115
70248	NC_014168	TCGACG	2	12	2819734	2819745	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296395115
70249	NC_014168	TCA	2	6	2819749	2819754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296395115
70250	NC_014168	TCC	2	6	2819827	2819832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296395115
70251	NC_014168	GCT	2	6	2819855	2819860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395115
70252	NC_014168	CCT	2	6	2819902	2819907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296395115
70253	NC_014168	GC	3	6	2819947	2819952	0 %	0 %	50 %	50 %	296395115
70254	NC_014168	CAC	2	6	2819973	2819978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296395115
70255	NC_014168	AC	3	6	2819977	2819982	50 %	0 %	0 %	50 %	296395115
70256	NC_014168	GC	3	6	2819995	2820000	0 %	0 %	50 %	50 %	296395115
70257	NC_014168	CCG	2	6	2820007	2820012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395115
70258	NC_014168	CG	3	6	2820137	2820142	0 %	0 %	50 %	50 %	296395115
70259	NC_014168	GTG	2	6	2820174	2820179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296395115
70260	NC_014168	TGC	2	6	2820184	2820189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395115
70261	NC_014168	GGC	2	6	2820236	2820241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395115
70262	NC_014168	CGA	2	6	2820257	2820262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395115
70263	NC_014168	GCG	2	6	2820308	2820313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70264	NC_014168	CG	3	6	2820326	2820331	0 %	0 %	50 %	50 %	296395116
70265	NC_014168	G	7	7	2820331	2820337	0 %	0 %	100 %	0 %	296395116
70266	NC_014168	A	6	6	2820357	2820362	100 %	0 %	0 %	0 %	296395116
70267	NC_014168	CGGTC	2	10	2820436	2820445	0 %	20 %	40 %	40 %	296395116
70268	NC_014168	GTG	2	6	2820510	2820515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296395116
70269	NC_014168	CCG	2	6	2820520	2820525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395116
70270	NC_014168	CA	3	6	2820560	2820565	50 %	0 %	0 %	50 %	296395116
70271	NC_014168	TGC	2	6	2820733	2820738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395116
70272	NC_014168	CGC	5	15	2820761	2820775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395116
70273	NC_014168	GCG	2	6	2820862	2820867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395116
70274	NC_014168	GCG	2	6	2820882	2820887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395116
70275	NC_014168	TCG	2	6	2820925	2820930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395116
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70280	NC_014168	GC	3	6	2821051	2821056	0 %	0 %	50 %	50 %	296395116
70281	NC_014168	GGT	2	6	2821112	2821117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296395116
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70283	NC_014168	CGGC	2	8	2821215	2821222	0 %	0 %	50 %	50 %	296395116
70284	NC_014168	CGA	2	6	2821229	2821234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395116
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70288	NC_014168	GTG	2	6	2821296	2821301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296395116
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70292	NC_014168	CGG	2	6	2821428	2821433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395116
70293	NC_014168	CGG	2	6	2821438	2821443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395116
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70295	NC_014168	AG	3	6	2821597	2821602	50 %	0 %	50 %	0 %	296395116
70296	NC_014168	TCG	3	9	2821614	2821622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395116
70297	NC_014168	CCG	2	6	2821759	2821764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395117
70298	NC_014168	CCTCCG	2	12	2821858	2821869	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	296395117
70299	NC_014168	GAG	2	6	2821872	2821877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296395117
70300	NC_014168	CGG	2	6	2822011	2822016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395117
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70302	NC_014168	CGC	2	6	2822057	2822062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395117
70303	NC_014168	CGG	2	6	2822126	2822131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395117
70304	NC_014168	CGA	2	6	2822132	2822137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395117
70305	NC_014168	GGA	2	6	2822138	2822143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296395117
70306	NC_014168	GCTC	2	8	2822147	2822154	0 %	25 %	25 %	50 %	296395117
70307	NC_014168	TGA	2	6	2822159	2822164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296395117
70308	NC_014168	TCG	2	6	2822206	2822211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395117
70309	NC_014168	GAG	2	6	2822235	2822240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296395117
70310	NC_014168	CGC	2	6	2822254	2822259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395117
70311	NC_014168	GTCC	2	8	2822271	2822278	0 %	25 %	25 %	50 %	296395117
70312	NC_014168	GTCG	2	8	2822282	2822289	0 %	25 %	50 %	25 %	296395117
70313	NC_014168	CGG	3	9	2822338	2822346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395117
70314	NC_014168	CCA	2	6	2822526	2822531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296395117
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70316	NC_014168	A	6	6	2822592	2822597	100 %	0 %	0 %	0 %	296395117
70317	NC_014168	AGA	2	6	2822600	2822605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296395117
70318	NC_014168	TCG	2	6	2822614	2822619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395117
70319	NC_014168	AGAA	2	8	2822698	2822705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70320	NC_014168	ATC	2	6	2822739	2822744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296395118
70321	NC_014168	CAT	2	6	2822759	2822764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296395118
70322	NC_014168	GAA	2	6	2822766	2822771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296395118
70323	NC_014168	CGA	2	6	2822819	2822824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395118
70324	NC_014168	TGG	2	6	2822848	2822853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296395118
70325	NC_014168	CGA	2	6	2822897	2822902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395118
70326	NC_014168	GACCT	2	10	2822904	2822913	20 %	20 %	20 %	40 %	296395118
70327	NC_014168	CGT	2	6	2822933	2822938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395118
70328	NC_014168	GAA	2	6	2822958	2822963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296395118
70329	NC_014168	CG	3	6	2822991	2822996	0 %	0 %	50 %	50 %	296395118
70330	NC_014168	CGG	2	6	2823008	2823013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395118
70331	NC_014168	CGA	2	6	2823023	2823028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395118
70332	NC_014168	AAG	3	9	2823072	2823080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296395118
70333	NC_014168	GCC	2	6	2823087	2823092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395118
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70335	NC_014168	CGG	2	6	2823135	2823140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395119
70336	NC_014168	TCA	2	6	2823155	2823160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296395119
70337	NC_014168	CGACA	2	10	2823198	2823207	40 %	0 %	20 %	40 %	296395119
70338	NC_014168	AAC	2	6	2823211	2823216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296395119
70339	NC_014168	CAG	2	6	2823336	2823341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395119
70340	NC_014168	CAG	2	6	2823370	2823375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395119
70341	NC_014168	GTC	2	6	2823385	2823390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395119
70342	NC_014168	TCG	2	6	2823452	2823457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395119
70343	NC_014168	CGG	3	9	2823468	2823476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395119
70344	NC_014168	CGG	2	6	2823513	2823518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296395119
70345	NC_014168	A	6	6	2823523	2823528	100 %	0 %	0 %	0 %	296395119
70346	NC_014168	GC	5	10	2823596	2823605	0 %	0 %	50 %	50 %	296395119
70347	NC_014168	GAT	2	6	2823669	2823674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296395119
70348	NC_014168	GGT	2	6	2823706	2823711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296395119
70349	NC_014168	GAT	2	6	2823753	2823758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296395119
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70351	NC_014168	GAT	2	6	2823781	2823786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296395119
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70470	NC_014168	GCT	2	6	2828994	2828999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395125
70471	NC_014168	CGC	2	6	2829074	2829079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296395125
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70492	NC_014168	GCAC	2	8	2829999	2830006	25 %	0 %	25 %	50 %	296395125
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70498	NC_014168	CGT	2	6	2830256	2830261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296395125
70499	NC_014168	CAG	2	6	2830316	2830321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296395125
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