MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinibacter ruber M8 chromosome

Total Repeats: 89433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_014032	CTGC	2	8	643160	643167	0 %	25 %	25 %	50 %	294506340
15502	NC_014032	CGT	2	6	643286	643291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506340
15503	NC_014032	TCG	2	6	643300	643305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506340
15504	NC_014032	CGT	2	6	643319	643324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506340
15505	NC_014032	GCG	2	6	643325	643330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506340
15506	NC_014032	CGC	2	6	643349	643354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506340
15507	NC_014032	GGT	2	6	643368	643373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506340
15508	NC_014032	AGG	2	6	643390	643395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506340
15509	NC_014032	GGT	2	6	643400	643405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506340
15510	NC_014032	TCT	2	6	643457	643462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294506340
15511	NC_014032	TGA	2	6	643493	643498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294506340
15512	NC_014032	GGCG	2	8	643535	643542	0 %	0 %	75 %	25 %	294506340
15513	NC_014032	GCG	2	6	643566	643571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506340
15514	NC_014032	GCCGGA	2	12	643614	643625	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	294506340
15515	NC_014032	AGGTCG	2	12	643660	643671	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294506340
15516	NC_014032	TGC	2	6	643687	643692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506340
15517	NC_014032	GGT	2	6	643785	643790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506340
15518	NC_014032	GCGAG	2	10	643834	643843	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15519	NC_014032	CGTC	2	8	643941	643948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15520	NC_014032	CGGG	2	8	643989	643996	0 %	0 %	75 %	25 %	294506341
15521	NC_014032	CGG	2	6	643999	644004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506341
15522	NC_014032	G	7	7	644007	644013	0 %	0 %	100 %	0 %	294506341
15523	NC_014032	GAA	2	6	644019	644024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294506341
15524	NC_014032	CAA	2	6	644032	644037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294506341
15525	NC_014032	C	7	7	644052	644058	0 %	0 %	0 %	100 %	294506341
15526	NC_014032	C	6	6	644067	644072	0 %	0 %	0 %	100 %	294506341
15527	NC_014032	CCT	2	6	644100	644105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294506341
15528	NC_014032	AGG	2	6	644180	644185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506341
15529	NC_014032	GGA	3	9	644208	644216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506341
15530	NC_014032	CGGCC	2	10	644305	644314	0 %	0 %	40 %	60 %	294506341
15531	NC_014032	TCG	2	6	644324	644329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506341
15532	NC_014032	CCCA	2	8	644341	644348	25 %	0 %	0 %	75 %	294506341
15533	NC_014032	GAG	2	6	644422	644427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506341
15534	NC_014032	CGGG	2	8	644471	644478	0 %	0 %	75 %	25 %	294506341
15535	NC_014032	TCG	2	6	644609	644614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506341
15536	NC_014032	ACG	2	6	644686	644691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506341
15537	NC_014032	CCG	2	6	644720	644725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506341
15538	NC_014032	CGA	2	6	644745	644750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506341
15539	NC_014032	CGA	2	6	644757	644762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506341
15540	NC_014032	CAG	2	6	644788	644793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506341
15541	NC_014032	GCA	2	6	644829	644834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506341
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15543	NC_014032	CAA	2	6	644883	644888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294506341
15544	NC_014032	CGG	2	6	644900	644905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506341
15545	NC_014032	CGG	2	6	644943	644948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506341
15546	NC_014032	GACC	2	8	644967	644974	25 %	0 %	25 %	50 %	294506341
15547	NC_014032	CCA	2	6	645078	645083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294506341
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15549	NC_014032	CTG	2	6	645136	645141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506341
15550	NC_014032	CGGA	2	8	645182	645189	25 %	0 %	50 %	25 %	294506341
15551	NC_014032	CCT	2	6	645198	645203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294506341
15552	NC_014032	CGG	2	6	645242	645247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506341
15553	NC_014032	AGCG	2	8	645251	645258	25 %	0 %	50 %	25 %	294506341
15554	NC_014032	GGGC	2	8	645297	645304	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15555	NC_014032	GCA	3	9	645345	645353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506342
15556	NC_014032	CGC	2	6	645354	645359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506342
15557	NC_014032	GGT	2	6	645412	645417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506342
15558	NC_014032	ACC	2	6	645428	645433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294506342
15559	NC_014032	GGC	2	6	645448	645453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506342
15560	NC_014032	GGC	2	6	645472	645477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506342
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15568	NC_014032	C	6	6	645677	645682	0 %	0 %	0 %	100 %	294506342
15569	NC_014032	GCC	2	6	645709	645714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506342
15570	NC_014032	CTGT	2	8	645745	645752	0 %	50 %	25 %	25 %	294506342
15571	NC_014032	TCGA	2	8	645767	645774	25 %	25 %	25 %	25 %	294506342
15572	NC_014032	AGG	2	6	645776	645781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506342
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15574	NC_014032	CCAT	2	8	645900	645907	25 %	25 %	0 %	50 %	294506342
15575	NC_014032	CAG	2	6	645943	645948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506342
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15579	NC_014032	CGA	2	6	646063	646068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506342
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15584	NC_014032	GTG	2	6	646147	646152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_014032	AACAG	2	10	646154	646163	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15586	NC_014032	CGC	2	6	646164	646169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15587	NC_014032	ACG	2	6	646256	646261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15588	NC_014032	GCG	2	6	646265	646270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15589	NC_014032	CAC	2	6	646312	646317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294506343
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15591	NC_014032	CCCG	2	8	646449	646456	0 %	0 %	25 %	75 %	294506343
15592	NC_014032	GAG	2	6	646522	646527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506343
15593	NC_014032	TACG	2	8	646528	646535	25 %	25 %	25 %	25 %	294506343
15594	NC_014032	GC	3	6	646542	646547	0 %	0 %	50 %	50 %	294506343
15595	NC_014032	CGG	2	6	646594	646599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506343
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15599	NC_014032	CG	3	6	646711	646716	0 %	0 %	50 %	50 %	294506343
15600	NC_014032	GCC	2	6	646825	646830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506343
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15603	NC_014032	GAG	3	9	646933	646941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506343
15604	NC_014032	CGGCC	2	10	646960	646969	0 %	0 %	40 %	60 %	294506343
15605	NC_014032	GAG	2	6	647053	647058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506343
15606	NC_014032	GTGG	2	8	647071	647078	0 %	25 %	75 %	0 %	294506343
15607	NC_014032	GAT	2	6	647100	647105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294506343
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15611	NC_014032	GAG	2	6	647218	647223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506343
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15613	NC_014032	AC	3	6	647414	647419	50 %	0 %	0 %	50 %	294506343
15614	NC_014032	GTC	2	6	647472	647477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506344
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15619	NC_014032	GCGG	2	8	647792	647799	0 %	0 %	75 %	25 %	294506344
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15621	NC_014032	CGA	2	6	647825	647830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506344
15622	NC_014032	CCT	2	6	647891	647896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294506344
15623	NC_014032	AGG	2	6	647953	647958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506344
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15626	NC_014032	CGA	2	6	648023	648028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506344
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15630	NC_014032	CCG	2	6	648152	648157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506345
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15635	NC_014032	GACC	2	8	648354	648361	25 %	0 %	25 %	50 %	294506345
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15643	NC_014032	GCAC	2	8	648871	648878	25 %	0 %	25 %	50 %	294506345
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15661	NC_014032	ACTCG	2	10	649384	649393	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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15740	NC_014032	TTC	2	6	652625	652630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294506347
15741	NC_014032	TTC	2	6	652655	652660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294506347
15742	NC_014032	GAG	2	6	652715	652720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506347
15743	NC_014032	ATC	2	6	652742	652747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294506347
15744	NC_014032	GCC	2	6	652749	652754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506347
15745	NC_014032	CAC	2	6	652759	652764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294506347
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15747	NC_014032	CGA	2	6	652789	652794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506347
15748	NC_014032	CGACC	2	10	652798	652807	20 %	0 %	20 %	60 %	294506347
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15750	NC_014032	AGC	2	6	652839	652844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506347
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15752	NC_014032	GGC	2	6	652925	652930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506347
15753	NC_014032	CGC	2	6	652936	652941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506347
15754	NC_014032	GAA	2	6	652945	652950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294506347
15755	NC_014032	GCC	2	6	652955	652960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506347
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15760	NC_014032	GAG	3	9	653111	653119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506347
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15765	NC_014032	CGA	2	6	653293	653298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506347
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15769	NC_014032	CGA	2	6	653449	653454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506347
15770	NC_014032	GAG	2	6	653495	653500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506347
15771	NC_014032	CGA	2	6	653515	653520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506347
15772	NC_014032	TCA	2	6	653523	653528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294506347
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15779	NC_014032	CACGC	2	10	653935	653944	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15780	NC_014032	ACG	2	6	653985	653990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506348
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15787	NC_014032	CGCC	2	8	654271	654278	0 %	0 %	25 %	75 %	294506348
15788	NC_014032	ACA	2	6	654324	654329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294506348
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15790	NC_014032	CGC	2	6	654459	654464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15791	NC_014032	GCC	3	9	654468	654476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15792	NC_014032	GCCG	2	8	654483	654490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15793	NC_014032	GC	3	6	654494	654499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15794	NC_014032	G	7	7	654522	654528	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15795	NC_014032	CGGC	2	8	654566	654573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15796	NC_014032	CAC	2	6	654610	654615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15797	NC_014032	TCG	2	6	654645	654650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506349
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15801	NC_014032	GAC	2	6	654785	654790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506349
15802	NC_014032	CCA	2	6	654810	654815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294506349
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15805	NC_014032	CCGA	2	8	654902	654909	25 %	0 %	25 %	50 %	294506349
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15836	NC_014032	GC	3	6	656408	656413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15837	NC_014032	CG	3	6	656464	656469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15838	NC_014032	CCAGCG	2	12	656500	656511	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15839	NC_014032	TG	3	6	656571	656576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15840	NC_014032	GAA	2	6	656623	656628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15841	NC_014032	GCG	2	6	656668	656673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15842	NC_014032	AGG	2	6	656837	656842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506352
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15846	NC_014032	ACG	2	6	656928	656933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506352
15847	NC_014032	GAA	2	6	656969	656974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15848	NC_014032	CGAA	2	8	657059	657066	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15849	NC_014032	TCA	2	6	657176	657181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294506353
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15852	NC_014032	CGA	2	6	657380	657385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506353
15853	NC_014032	GAC	3	9	657390	657398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506353
15854	NC_014032	GTG	2	6	657404	657409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506353
15855	NC_014032	CGT	2	6	657431	657436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506353
15856	NC_014032	GAC	2	6	657462	657467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506353
15857	NC_014032	GCA	2	6	657470	657475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506353
15858	NC_014032	TGCG	2	8	657505	657512	0 %	25 %	50 %	25 %	294506353
15859	NC_014032	CAC	2	6	657519	657524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294506353
15860	NC_014032	CTC	2	6	657567	657572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294506353
15861	NC_014032	GTG	2	6	657573	657578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506353
15862	NC_014032	GTC	2	6	657592	657597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506353
15863	NC_014032	GTG	2	6	657627	657632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506353
15864	NC_014032	GCT	2	6	657656	657661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15865	NC_014032	CGT	2	6	657749	657754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15866	NC_014032	CGG	2	6	657759	657764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15867	NC_014032	GTC	2	6	657810	657815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15869	NC_014032	TCG	2	6	658087	658092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506354
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15895	NC_014032	G	6	6	659147	659152	0 %	0 %	100 %	0 %	294506354
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15899	NC_014032	CG	3	6	659352	659357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15900	NC_014032	TC	3	6	659367	659372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15932	NC_014032	GTGGCC	2	12	660525	660536	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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15971	NC_014032	GAG	2	6	662321	662326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506356
15972	NC_014032	GGGC	2	8	662337	662344	0 %	0 %	75 %	25 %	294506356
15973	NC_014032	CCGCA	2	10	662351	662360	20 %	0 %	20 %	60 %	294506356
15974	NC_014032	G	6	6	662430	662435	0 %	0 %	100 %	0 %	294506356
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15979	NC_014032	CGG	2	6	662556	662561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506356
15980	NC_014032	GGA	2	6	662605	662610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506356
15981	NC_014032	CGC	3	9	662699	662707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506356
15982	NC_014032	GC	3	6	662706	662711	0 %	0 %	50 %	50 %	294506356
15983	NC_014032	AGG	2	6	662712	662717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506356
15984	NC_014032	GC	3	6	662719	662724	0 %	0 %	50 %	50 %	294506356
15985	NC_014032	TC	3	6	662766	662771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15986	NC_014032	CGG	2	6	662788	662793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506357
15987	NC_014032	CCT	2	6	662803	662808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294506357
15988	NC_014032	TCC	3	9	662811	662819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294506357
15989	NC_014032	GGCC	2	8	662839	662846	0 %	0 %	50 %	50 %	294506357
15990	NC_014032	CGT	2	6	662911	662916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506357
15991	NC_014032	CG	3	6	662960	662965	0 %	0 %	50 %	50 %	294506357
15992	NC_014032	CGGA	2	8	662982	662989	25 %	0 %	50 %	25 %	294506357
15993	NC_014032	GTC	3	9	663011	663019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506357
15994	NC_014032	AGCTG	2	10	663028	663037	20 %	20 %	40 %	20 %	294506357
15995	NC_014032	CGT	2	6	663064	663069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506357
15996	NC_014032	CAG	2	6	663075	663080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506357
15997	NC_014032	GTC	2	6	663102	663107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506357
15998	NC_014032	CCG	2	6	663118	663123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506357
15999	NC_014032	CCGGA	2	10	663128	663137	20 %	0 %	40 %	40 %	294506357
16000	NC_014032	TCG	2	6	663156	663161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506357

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